MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014334	CGTT	2	8	282068	282075	0 %	50 %	25 %	25 %	301065406
5502	NC_014334	T	6	6	282142	282147	0 %	100 %	0 %	0 %	301065406
5503	NC_014334	GGT	2	6	282163	282168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065406
5504	NC_014334	CGGT	2	8	282249	282256	0 %	25 %	50 %	25 %	301065406
5505	NC_014334	TTA	2	6	282309	282314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065406
5506	NC_014334	TAT	3	9	282394	282402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065406
5507	NC_014334	ATTCG	2	10	282444	282453	20 %	40 %	20 %	20 %	301065406
5508	NC_014334	TTC	2	6	282554	282559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065406
5509	NC_014334	AGG	2	6	282571	282576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_014334	GTG	2	6	282589	282594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065407
5511	NC_014334	TTA	2	6	282602	282607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065407
5512	NC_014334	GAT	2	6	282700	282705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065407
5513	NC_014334	GTT	2	6	282724	282729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065407
5514	NC_014334	GAT	2	6	282751	282756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065407
5515	NC_014334	TG	3	6	282789	282794	0 %	50 %	50 %	0 %	301065407
5516	NC_014334	T	6	6	282800	282805	0 %	100 %	0 %	0 %	301065407
5517	NC_014334	GC	3	6	282806	282811	0 %	0 %	50 %	50 %	301065407
5518	NC_014334	TCA	2	6	282828	282833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065407
5519	NC_014334	GGT	2	6	282943	282948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065407
5520	NC_014334	CCG	2	6	283119	283124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_014334	T	6	6	283234	283239	0 %	100 %	0 %	0 %	301065408
5522	NC_014334	GACT	2	8	283256	283263	25 %	25 %	25 %	25 %	301065408
5523	NC_014334	TAA	2	6	283287	283292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065408
5524	NC_014334	TTA	2	6	283295	283300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065408
5525	NC_014334	TCA	2	6	283363	283368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065408
5526	NC_014334	A	6	6	283395	283400	100 %	0 %	0 %	0 %	301065408
5527	NC_014334	AACC	2	8	283448	283455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_014334	AGG	2	6	283469	283474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_014334	TTG	3	9	283543	283551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_014334	CCGA	2	8	283563	283570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_014334	T	6	6	283658	283663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_014334	GAA	2	6	283720	283725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065409
5533	NC_014334	CGC	2	6	283762	283767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065409
5534	NC_014334	CAG	2	6	283892	283897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065409
5535	NC_014334	GGT	2	6	283940	283945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065409
5536	NC_014334	A	7	7	283967	283973	100 %	0 %	0 %	0 %	301065409
5537	NC_014334	CGG	2	6	283977	283982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065409
5538	NC_014334	ACA	2	6	283992	283997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065409
5539	NC_014334	GCG	2	6	284010	284015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065409
5540	NC_014334	GGC	2	6	284119	284124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065409
5541	NC_014334	TGCT	2	8	284206	284213	0 %	50 %	25 %	25 %	301065409
5542	NC_014334	GCG	2	6	284240	284245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065409
5543	NC_014334	ATT	2	6	284285	284290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065409
5544	NC_014334	AAG	3	9	284336	284344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065409
5545	NC_014334	GAC	2	6	284362	284367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065409
5546	NC_014334	TAT	2	6	284372	284377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065409
5547	NC_014334	ATGCT	2	10	284400	284409	20 %	40 %	20 %	20 %	301065409
5548	NC_014334	TAT	2	6	284456	284461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065409
5549	NC_014334	TCA	2	6	284478	284483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065409
5550	NC_014334	ATGGC	2	10	284529	284538	20 %	20 %	40 %	20 %	301065409
5551	NC_014334	TTA	2	6	284587	284592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065409
5552	NC_014334	CAC	2	6	284593	284598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065409
5553	NC_014334	CAG	2	6	284623	284628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065409
5554	NC_014334	GAA	2	6	284638	284643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065409
5555	NC_014334	AAG	2	6	284660	284665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065409
5556	NC_014334	CAAG	2	8	284725	284732	50 %	0 %	25 %	25 %	301065409
5557	NC_014334	GCT	2	6	284750	284755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065409
5558	NC_014334	CAGC	2	8	284760	284767	25 %	0 %	25 %	50 %	301065409
5559	NC_014334	A	7	7	284792	284798	100 %	0 %	0 %	0 %	301065409
5560	NC_014334	CTG	2	6	284802	284807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065409
5561	NC_014334	CAC	2	6	284815	284820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065409
5562	NC_014334	GAG	2	6	284933	284938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_014334	CAA	2	6	284962	284967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065410
5564	NC_014334	ATC	2	6	285037	285042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065410
5565	NC_014334	TAT	2	6	285097	285102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065410
5566	NC_014334	ATTA	2	8	285106	285113	50 %	50 %	0 %	0 %	301065410
5567	NC_014334	TTG	2	6	285139	285144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065410
5568	NC_014334	TTGA	2	8	285178	285185	25 %	50 %	25 %	0 %	301065410
5569	NC_014334	GCG	2	6	285226	285231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065410
5570	NC_014334	TCA	2	6	285317	285322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065410
5571	NC_014334	TGC	2	6	285407	285412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065410
5572	NC_014334	AAC	2	6	285429	285434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065410
5573	NC_014334	GCGG	2	8	285450	285457	0 %	0 %	75 %	25 %	301065410
5574	NC_014334	TGG	2	6	285485	285490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065410
5575	NC_014334	CTGG	2	8	285541	285548	0 %	25 %	50 %	25 %	301065410
5576	NC_014334	CGC	2	6	285630	285635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065410
5577	NC_014334	GTT	2	6	285637	285642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065410
5578	NC_014334	GATCG	2	10	285648	285657	20 %	20 %	40 %	20 %	301065410
5579	NC_014334	CTT	2	6	285681	285686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065410
5580	NC_014334	GCG	2	6	285742	285747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065410
5581	NC_014334	ATC	2	6	285763	285768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065410
5582	NC_014334	CTG	2	6	285785	285790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065410
5583	NC_014334	ATT	2	6	285792	285797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065410
5584	NC_014334	CGA	2	6	285867	285872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065411
5585	NC_014334	ATT	2	6	285965	285970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065411
5586	NC_014334	TTA	2	6	285990	285995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065411
5587	NC_014334	ATC	2	6	286064	286069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065411
5588	NC_014334	CGC	2	6	286086	286091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065411
5589	NC_014334	ATT	2	6	286229	286234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065411
5590	NC_014334	AAT	2	6	286235	286240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065411
5591	NC_014334	CTG	2	6	286260	286265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065411
5592	NC_014334	TG	3	6	286317	286322	0 %	50 %	50 %	0 %	301065411
5593	NC_014334	ACT	2	6	286325	286330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065411
5594	NC_014334	TTCA	2	8	286346	286353	25 %	50 %	0 %	25 %	301065411
5595	NC_014334	CGGG	2	8	286358	286365	0 %	0 %	75 %	25 %	301065411
5596	NC_014334	CG	3	6	286367	286372	0 %	0 %	50 %	50 %	301065411
5597	NC_014334	TGA	3	9	286387	286395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065411
5598	NC_014334	CAT	2	6	286531	286536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065411
5599	NC_014334	TTGCT	2	10	286545	286554	0 %	60 %	20 %	20 %	301065411
5600	NC_014334	TCG	2	6	286560	286565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065411
5601	NC_014334	GTA	2	6	286581	286586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065411
5602	NC_014334	CGG	2	6	286605	286610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065411
5603	NC_014334	CAT	2	6	286621	286626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065411
5604	NC_014334	TGC	2	6	286635	286640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065411
5605	NC_014334	TTA	2	6	286715	286720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065411
5606	NC_014334	CAAGCG	2	12	286741	286752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065411
5607	NC_014334	AGC	2	6	286768	286773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065411
5608	NC_014334	CAA	2	6	286783	286788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065412
5609	NC_014334	ACA	2	6	286906	286911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065412
5610	NC_014334	CGT	2	6	286943	286948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065412
5611	NC_014334	AAAG	2	8	286998	287005	75 %	0 %	25 %	0 %	301065412
5612	NC_014334	TGC	2	6	287135	287140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065412
5613	NC_014334	AGG	2	6	287162	287167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065412
5614	NC_014334	CGA	2	6	287187	287192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065412
5615	NC_014334	T	7	7	287202	287208	0 %	100 %	0 %	0 %	301065412
5616	NC_014334	CGG	2	6	287263	287268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065412
5617	NC_014334	CTG	2	6	287305	287310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065412
5618	NC_014334	AGA	2	6	287343	287348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065412
5619	NC_014334	GGT	2	6	287403	287408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065412
5620	NC_014334	ACATG	2	10	287418	287427	40 %	20 %	20 %	20 %	301065412
5621	NC_014334	TGA	2	6	287435	287440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065412
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5623	NC_014334	TTG	2	6	287640	287645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065413
5624	NC_014334	TTG	2	6	287702	287707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065413
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5874	NC_014334	CAG	2	6	301533	301538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065428
5875	NC_014334	CGC	2	6	301881	301886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065428
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5884	NC_014334	ATTG	2	8	302300	302307	25 %	50 %	25 %	0 %	301065428
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5886	NC_014334	CAG	2	6	302339	302344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065428
5887	NC_014334	TCA	2	6	302422	302427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065428
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5895	NC_014334	A	7	7	302689	302695	100 %	0 %	0 %	0 %	301065428
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5917	NC_014334	CCGG	2	8	303891	303898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5984	NC_014334	CAA	2	6	307108	307113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065431
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5993	NC_014334	GAT	2	6	307498	307503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065431
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5995	NC_014334	GCC	2	6	307609	307614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065431
5996	NC_014334	TGCCG	2	10	307620	307629	0 %	20 %	40 %	40 %	301065431
5997	NC_014334	TGT	2	6	307689	307694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065431
5998	NC_014334	GCC	2	6	307804	307809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065431
5999	NC_014334	GCG	2	6	307867	307872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065431
6000	NC_014334	TGC	2	6	307875	307880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065431

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