MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_014334	TCT	2	6	2826921	2826926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54502	NC_014334	TCAC	2	8	2826941	2826948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54503	NC_014334	ATC	2	6	2826968	2826973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54504	NC_014334	CGG	2	6	2827143	2827148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54505	NC_014334	A	6	6	2827180	2827185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54506	NC_014334	CTG	2	6	2827191	2827196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54507	NC_014334	AGA	2	6	2827222	2827227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54508	NC_014334	ATATCG	2	12	2827229	2827240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54509	NC_014334	CAAG	2	8	2827262	2827269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54510	NC_014334	TTA	2	6	2827299	2827304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54511	NC_014334	TCGCC	2	10	2827364	2827373	0 %	20 %	20 %	60 %	301067899
54512	NC_014334	ACC	2	6	2827377	2827382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067899
54513	NC_014334	CT	3	6	2827388	2827393	0 %	50 %	0 %	50 %	301067899
54514	NC_014334	CT	3	6	2827396	2827401	0 %	50 %	0 %	50 %	301067899
54515	NC_014334	CTG	2	6	2827462	2827467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067899
54516	NC_014334	CTT	2	6	2827470	2827475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067899
54517	NC_014334	AAG	2	6	2827477	2827482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067899
54518	NC_014334	GCA	2	6	2827495	2827500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067899
54519	NC_014334	AG	3	6	2827528	2827533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54520	NC_014334	GGT	2	6	2827684	2827689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54521	NC_014334	ACC	2	6	2827748	2827753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54522	NC_014334	TGC	2	6	2827756	2827761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54523	NC_014334	TGTC	2	8	2827765	2827772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54524	NC_014334	ATA	2	6	2827791	2827796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54525	NC_014334	T	6	6	2827834	2827839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54526	NC_014334	CTGC	2	8	2827859	2827866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54527	NC_014334	TCA	2	6	2827876	2827881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54528	NC_014334	TCG	2	6	2827900	2827905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54529	NC_014334	GTT	2	6	2827942	2827947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54530	NC_014334	A	7	7	2828083	2828089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54531	NC_014334	CGC	2	6	2828099	2828104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54532	NC_014334	GATT	2	8	2828143	2828150	25 %	50 %	25 %	0 %	301067900
54533	NC_014334	GACC	2	8	2828186	2828193	25 %	0 %	25 %	50 %	301067900
54534	NC_014334	GATCT	2	10	2828196	2828205	20 %	40 %	20 %	20 %	301067900
54535	NC_014334	TGA	2	6	2828249	2828254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067900
54536	NC_014334	GTGG	2	8	2828313	2828320	0 %	25 %	75 %	0 %	301067900
54537	NC_014334	TCA	2	6	2828401	2828406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067900
54538	NC_014334	CAA	2	6	2828471	2828476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067900
54539	NC_014334	TTC	2	6	2828496	2828501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067900
54540	NC_014334	CTT	2	6	2828574	2828579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067900
54541	NC_014334	GTG	2	6	2828598	2828603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067900
54542	NC_014334	CCAT	2	8	2828686	2828693	25 %	25 %	0 %	50 %	301067900
54543	NC_014334	CAA	2	6	2828708	2828713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067900
54544	NC_014334	GC	3	6	2828739	2828744	0 %	0 %	50 %	50 %	301067900
54545	NC_014334	ATA	2	6	2828769	2828774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067900
54546	NC_014334	CGCC	2	8	2828805	2828812	0 %	0 %	25 %	75 %	301067900
54547	NC_014334	AAT	2	6	2829025	2829030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067900
54548	NC_014334	AGC	2	6	2829162	2829167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54549	NC_014334	CAG	2	6	2829172	2829177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54550	NC_014334	CCG	2	6	2829193	2829198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54551	NC_014334	TTA	2	6	2829283	2829288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067901
54552	NC_014334	CCG	2	6	2829308	2829313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067901
54553	NC_014334	CGC	2	6	2829337	2829342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067901
54554	NC_014334	CG	3	6	2829360	2829365	0 %	0 %	50 %	50 %	301067901
54555	NC_014334	GGCAT	2	10	2829438	2829447	20 %	20 %	40 %	20 %	301067901
54556	NC_014334	A	6	6	2829505	2829510	100 %	0 %	0 %	0 %	301067901
54557	NC_014334	GAT	2	6	2829607	2829612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067901
54558	NC_014334	GGCT	2	8	2829652	2829659	0 %	25 %	50 %	25 %	301067901
54559	NC_014334	ATT	2	6	2829671	2829676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067901
54560	NC_014334	CTG	2	6	2829724	2829729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067901
54561	NC_014334	GTG	2	6	2829749	2829754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067901
54562	NC_014334	TGG	2	6	2829767	2829772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067901
54563	NC_014334	TACT	2	8	2829853	2829860	25 %	50 %	0 %	25 %	301067901
54564	NC_014334	CCA	2	6	2829880	2829885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067901
54565	NC_014334	GGTTA	2	10	2829926	2829935	20 %	40 %	40 %	0 %	301067901
54566	NC_014334	CAC	2	6	2830217	2830222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54567	NC_014334	GCA	2	6	2830260	2830265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54568	NC_014334	TCA	2	6	2830283	2830288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067902
54569	NC_014334	GCTG	2	8	2830417	2830424	0 %	25 %	50 %	25 %	301067902
54570	NC_014334	GCA	2	6	2830457	2830462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067902
54571	NC_014334	GCC	2	6	2830510	2830515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067902
54572	NC_014334	GGT	2	6	2830569	2830574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067902
54573	NC_014334	GCA	2	6	2830583	2830588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067902
54574	NC_014334	CAG	2	6	2830641	2830646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067902
54575	NC_014334	CCA	2	6	2830689	2830694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067902
54576	NC_014334	TGAAAT	2	12	2830698	2830709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	301067902
54577	NC_014334	GCC	2	6	2830783	2830788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067902
54578	NC_014334	CAAC	2	8	2830852	2830859	50 %	0 %	0 %	50 %	301067902
54579	NC_014334	GCA	2	6	2830908	2830913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067902
54580	NC_014334	AAT	2	6	2830965	2830970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067902
54581	NC_014334	GCC	3	9	2831002	2831010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067902
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54586	NC_014334	CAG	2	6	2831088	2831093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067902
54587	NC_014334	CG	3	6	2831166	2831171	0 %	0 %	50 %	50 %	301067902
54588	NC_014334	GCCT	2	8	2831188	2831195	0 %	25 %	25 %	50 %	301067902
54589	NC_014334	TCA	2	6	2831213	2831218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067902
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54593	NC_014334	CAT	2	6	2831475	2831480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
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54603	NC_014334	CAA	2	6	2832051	2832056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067903
54604	NC_014334	CTT	2	6	2832094	2832099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067903
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54606	NC_014334	TTG	2	6	2832158	2832163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067903
54607	NC_014334	GGT	2	6	2832235	2832240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067903
54608	NC_014334	TCT	3	9	2832324	2832332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067903
54609	NC_014334	GCT	2	6	2832341	2832346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067903
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54612	NC_014334	CAT	2	6	2832493	2832498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
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54619	NC_014334	GGCC	2	8	2832867	2832874	0 %	0 %	50 %	50 %	301067904
54620	NC_014334	CTT	2	6	2832885	2832890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067904
54621	NC_014334	TCA	2	6	2832942	2832947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067904
54622	NC_014334	T	7	7	2832964	2832970	0 %	100 %	0 %	0 %	301067904
54623	NC_014334	TCAT	2	8	2832975	2832982	25 %	50 %	0 %	25 %	301067904
54624	NC_014334	TGA	2	6	2832994	2832999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067905
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54633	NC_014334	TCA	2	6	2833554	2833559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067905
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54720	NC_014334	A	7	7	2837866	2837872	100 %	0 %	0 %	0 %	301067907
54721	NC_014334	TGT	3	9	2837931	2837939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067907
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54724	NC_014334	TTTC	2	8	2837987	2837994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54725	NC_014334	T	7	7	2838034	2838040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54726	NC_014334	AGC	2	6	2838079	2838084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54727	NC_014334	TGA	2	6	2838093	2838098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54729	NC_014334	GGA	2	6	2838263	2838268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54735	NC_014334	GCA	2	6	2838435	2838440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067908
54736	NC_014334	TGC	2	6	2838461	2838466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067908
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54738	NC_014334	GCA	2	6	2838555	2838560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067908
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54742	NC_014334	TGT	2	6	2838812	2838817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067908
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54842	NC_014334	A	7	7	2843409	2843415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54843	NC_014334	T	6	6	2843441	2843446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54844	NC_014334	TACTGC	2	12	2843456	2843467	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54845	NC_014334	CAT	2	6	2843497	2843502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067915
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54848	NC_014334	TGA	2	6	2843617	2843622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067915
54849	NC_014334	GCA	2	6	2843831	2843836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067915
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54852	NC_014334	ATG	2	6	2843941	2843946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067915
54853	NC_014334	CAT	2	6	2844005	2844010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067915
54854	NC_014334	T	6	6	2844014	2844019	0 %	100 %	0 %	0 %	301067915
54855	NC_014334	CATT	2	8	2844074	2844081	25 %	50 %	0 %	25 %	301067915
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54969	NC_014334	TCA	2	6	2849855	2849860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54970	NC_014334	CCTG	2	8	2849890	2849897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54971	NC_014334	CAC	2	6	2849914	2849919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54975	NC_014334	GTTT	2	8	2850026	2850033	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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