MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4719

Total Repeats: 303

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014133	ATA	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014133	ATA	2	6	212	217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014133	AAG	2	6	226	231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014133	TCA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014133	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014133	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100282
7	NC_014133	CTA	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
8	NC_014133	TTG	2	6	592	597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100282
9	NC_014133	CAT	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
10	NC_014133	CTA	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100282
11	NC_014133	ACA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100282
12	NC_014133	ATC	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100283
13	NC_014133	TTG	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100283
14	NC_014133	AGC	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100283
15	NC_014133	ATC	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100284
16	NC_014133	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100284
17	NC_014133	TTG	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014133	TCT	2	6	1420	1425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014133	TCT	2	6	1441	1446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014133	AGC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014133	ATT	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014133	CTT	2	6	1504	1509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014133	TAA	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014133	GAA	2	6	1621	1626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100285
25	NC_014133	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100285
26	NC_014133	ATG	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100285
27	NC_014133	GAC	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100285
28	NC_014133	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100285
29	NC_014133	GTT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100285
30	NC_014133	GAA	2	6	2019	2024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100285
31	NC_014133	TAA	2	6	2262	2267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100285
32	NC_014133	TGC	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014133	CGA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014133	GAT	2	6	2809	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014133	CAG	2	6	2899	2904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014133	CCG	2	6	2990	2995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014133	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014133	GAG	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014133	GAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100286
40	NC_014133	ACC	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100286
41	NC_014133	GTT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100286
42	NC_014133	ATA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100286
43	NC_014133	AAG	2	6	3626	3631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100286
44	NC_014133	TGC	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100287
45	NC_014133	GAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
46	NC_014133	TGA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100287
47	NC_014133	TGA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100287
48	NC_014133	GAA	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
49	NC_014133	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100287
50	NC_014133	CAG	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100287
51	NC_014133	ATT	2	6	4326	4331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100288
52	NC_014133	ACA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100288
53	NC_014133	ATC	2	6	4417	4422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014133	TAA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014133	TGA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014133	TGG	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014133	GAA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014133	AAT	2	6	4802	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014133	AAT	2	6	4871	4876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014133	CAG	2	6	4890	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014133	GTT	2	6	4911	4916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014133	ATT	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014133	GAT	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014133	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014133	GGA	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014133	ATG	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
67	NC_014133	GTG	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100289
68	NC_014133	AAC	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
69	NC_014133	CAG	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
70	NC_014133	ATG	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
71	NC_014133	AGT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
72	NC_014133	TGG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100289
73	NC_014133	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296100289
74	NC_014133	CAG	3	9	5737	5745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
75	NC_014133	AGC	2	6	5750	5755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
76	NC_014133	GCG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
77	NC_014133	GCA	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
78	NC_014133	AGC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
79	NC_014133	GGC	2	6	5810	5815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
80	NC_014133	AGC	3	9	5825	5833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
81	NC_014133	GGC	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
82	NC_014133	AGC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
83	NC_014133	GCG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
84	NC_014133	AGC	3	9	5885	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
85	NC_014133	AGC	2	6	5900	5905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
86	NC_014133	GCG	2	6	5919	5924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
87	NC_014133	GCA	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
88	NC_014133	AGC	3	9	5945	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
89	NC_014133	GGC	2	6	5960	5965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100289
90	NC_014133	AGC	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
91	NC_014133	AAG	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100289
92	NC_014133	ACA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
93	NC_014133	GAT	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
94	NC_014133	ATG	2	6	6087	6092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100289
95	NC_014133	CAA	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
96	NC_014133	GTT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100289
97	NC_014133	CAA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100289
98	NC_014133	ACG	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
99	NC_014133	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100289
100	NC_014133	CTA	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100289
101	NC_014133	CTA	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100289
102	NC_014133	CAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100289
103	NC_014133	AAG	2	6	6597	6602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100289
104	NC_014133	CGA	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100290
105	NC_014133	GTC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100290
106	NC_014133	ATT	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100290
107	NC_014133	TAT	2	6	7010	7015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100290
108	NC_014133	CGT	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100290
109	NC_014133	TCA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
110	NC_014133	CAT	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
111	NC_014133	TCA	3	9	7178	7186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
112	NC_014133	AGT	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100290
113	NC_014133	ACT	2	6	7235	7240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100290
114	NC_014133	CAA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100290
115	NC_014133	TTG	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100290
116	NC_014133	TAA	2	6	7367	7372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014133	CTT	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014133	GTT	2	6	7484	7489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014133	TAA	2	6	7500	7505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014133	AAT	2	6	7622	7627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014133	TAT	2	6	7649	7654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014133	ATT	2	6	7724	7729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100291
123	NC_014133	TTG	2	6	7810	7815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
124	NC_014133	TCA	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100291
125	NC_014133	ATC	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100291
126	NC_014133	AAC	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100291
127	NC_014133	TGA	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
128	NC_014133	TGA	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
129	NC_014133	TGT	2	6	8318	8323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
130	NC_014133	ATT	2	6	8325	8330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100291
131	NC_014133	GCA	2	6	8421	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100291
132	NC_014133	GTT	2	6	8433	8438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
133	NC_014133	TGA	2	6	8465	8470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100291
134	NC_014133	AAG	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100291
135	NC_014133	GTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100291
136	NC_014133	GCA	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100291
137	NC_014133	TGA	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100292
138	NC_014133	TAT	2	6	8652	8657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
139	NC_014133	TAT	2	6	8720	8725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
140	NC_014133	ACT	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100292
141	NC_014133	TAT	3	9	8804	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100292
142	NC_014133	TGT	2	6	8908	8913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100292
143	NC_014133	TGA	2	6	9100	9105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100292
144	NC_014133	AGC	2	6	9131	9136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100292
145	NC_014133	TGA	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100292
146	NC_014133	TGT	2	6	9268	9273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100292
147	NC_014133	TAA	2	6	9393	9398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100292
148	NC_014133	TAA	2	6	9441	9446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014133	TCG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014133	AAT	2	6	9670	9675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014133	AAG	2	6	9703	9708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014133	TTC	2	6	9750	9755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014133	AAC	2	6	9833	9838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014133	CTT	2	6	9869	9874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014133	TAA	2	6	9890	9895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014133	TAA	2	6	9937	9942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
157	NC_014133	AAT	2	6	9968	9973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
158	NC_014133	TGG	2	6	9998	10003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100293
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160	NC_014133	AAT	2	6	10260	10265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
161	NC_014133	AAT	2	6	10476	10481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100293
162	NC_014133	GAG	2	6	10529	10534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100293
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169	NC_014133	CAA	2	6	11046	11051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100294
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172	NC_014133	CAA	2	6	11559	11564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100295
173	NC_014133	ATA	2	6	11586	11591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100295
174	NC_014133	TAA	2	6	11629	11634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100295
175	NC_014133	TAT	2	6	11838	11843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014133	CCG	2	6	11948	11953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_014133	ATA	2	6	11971	11976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014133	GAC	2	6	12346	12351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100296
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186	NC_014133	TGA	2	6	12909	12914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100296
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190	NC_014133	TAA	2	6	13476	13481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014133	TAT	2	6	13612	13617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014133	ATA	2	6	13802	13807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014133	CAA	2	6	13855	13860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_014133	AGA	2	6	13898	13903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100297
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252	NC_014133	ACT	2	6	18569	18574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100299
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254	NC_014133	TCA	2	6	18611	18616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_014133	CAG	2	6	18643	18648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100300
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257	NC_014133	CAA	2	6	18975	18980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100300
258	NC_014133	GAC	2	6	19011	19016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100300
259	NC_014133	CGC	2	6	19201	19206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296100300
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261	NC_014133	ATG	2	6	19333	19338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100300
262	NC_014133	AAG	2	6	19369	19374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100300
263	NC_014133	ACC	2	6	19383	19388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100300
264	NC_014133	TGA	2	6	19411	19416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100300
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266	NC_014133	GTT	2	6	19700	19705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100300
267	NC_014133	GTG	2	6	19708	19713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100300
268	NC_014133	ATT	2	6	19815	19820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100300
269	NC_014133	GAC	2	6	19841	19846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100300
270	NC_014133	TGA	2	6	19847	19852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100300
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272	NC_014133	ATA	2	6	19897	19902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100300
273	NC_014133	AAG	2	6	19915	19920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100300
274	NC_014133	GAA	3	9	20049	20057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100300
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281	NC_014133	TAA	2	6	20475	20480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100301
282	NC_014133	AGA	2	6	20580	20585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100301
283	NC_014133	CTA	2	6	20672	20677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100301
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292	NC_014133	ACA	2	6	21305	21310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100301
293	NC_014133	TCA	2	6	21321	21326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100301
294	NC_014133	TTG	2	6	21340	21345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100301
295	NC_014133	TAT	2	6	21392	21397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_014133	AGA	2	6	21403	21408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.