MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 44792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014106	CTAGA	2	10	161337	161346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3502	NC_014106	GA	3	6	161349	161354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014106	AAG	2	6	161364	161369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014106	AG	3	6	161373	161378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014106	GCACA	2	10	161386	161395	40 %	0 %	20 %	40 %	295692021
3506	NC_014106	AAC	2	6	161401	161406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692021
3507	NC_014106	TGA	2	6	161411	161416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692021
3508	NC_014106	CTT	2	6	161433	161438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692021
3509	NC_014106	ATTT	2	8	161579	161586	25 %	75 %	0 %	0 %	295692021
3510	NC_014106	GCT	2	6	161637	161642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692021
3511	NC_014106	CTA	2	6	161761	161766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692021
3512	NC_014106	ATT	2	6	161866	161871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692021
3513	NC_014106	TAT	2	6	161881	161886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692021
3514	NC_014106	ATT	2	6	161931	161936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692021
3515	NC_014106	AAG	2	6	161994	161999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692021
3516	NC_014106	T	6	6	162048	162053	0 %	100 %	0 %	0 %	295692021
3517	NC_014106	ATT	2	6	162174	162179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692021
3518	NC_014106	ATT	2	6	162458	162463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692021
3519	NC_014106	TGG	2	6	162464	162469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692021
3520	NC_014106	TGC	2	6	162512	162517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692021
3521	NC_014106	ATGC	2	8	162555	162562	25 %	25 %	25 %	25 %	295692021
3522	NC_014106	A	6	6	162573	162578	100 %	0 %	0 %	0 %	295692021
3523	NC_014106	ATT	2	6	162584	162589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692021
3524	NC_014106	TAAAA	2	10	162592	162601	80 %	20 %	0 %	0 %	295692021
3525	NC_014106	ACA	2	6	162602	162607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_014106	T	7	7	162620	162626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014106	T	6	6	162656	162661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_014106	CGG	2	6	162698	162703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295692022
3529	NC_014106	GATC	2	8	162833	162840	25 %	25 %	25 %	25 %	295692022
3530	NC_014106	TGC	2	6	162881	162886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692022
3531	NC_014106	AAG	2	6	162891	162896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3532	NC_014106	AAG	2	6	162921	162926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3533	NC_014106	GCA	2	6	163050	163055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692022
3534	NC_014106	GAA	2	6	163112	163117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3535	NC_014106	TGG	2	6	163142	163147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692022
3536	NC_014106	ACT	2	6	163173	163178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692022
3537	NC_014106	GCT	2	6	163191	163196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692022
3538	NC_014106	GTT	2	6	163235	163240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692022
3539	NC_014106	TGA	2	6	163256	163261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692022
3540	NC_014106	AGA	2	6	163271	163276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3541	NC_014106	GTT	2	6	163320	163325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692022
3542	NC_014106	GAA	2	6	163335	163340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3543	NC_014106	CTT	2	6	163421	163426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692022
3544	NC_014106	ATT	2	6	163433	163438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692022
3545	NC_014106	AAG	2	6	163443	163448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3546	NC_014106	GAA	2	6	163494	163499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3547	NC_014106	TTG	2	6	163500	163505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692022
3548	NC_014106	GAA	2	6	163509	163514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3549	NC_014106	TTA	2	6	163552	163557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692022
3550	NC_014106	CATAT	2	10	163660	163669	40 %	40 %	0 %	20 %	295692022
3551	NC_014106	AGT	2	6	163691	163696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692022
3552	NC_014106	CTA	2	6	163703	163708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692022
3553	NC_014106	ACTT	2	8	163716	163723	25 %	50 %	0 %	25 %	295692022
3554	NC_014106	GC	3	6	163847	163852	0 %	0 %	50 %	50 %	295692022
3555	NC_014106	GAA	2	6	163887	163892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3556	NC_014106	CTA	2	6	164125	164130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692022
3557	NC_014106	TGG	2	6	164135	164140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692022
3558	NC_014106	GTT	2	6	164148	164153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692022
3559	NC_014106	GAA	2	6	164219	164224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3560	NC_014106	TGG	2	6	164226	164231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692022
3561	NC_014106	TGA	2	6	164234	164239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692022
3562	NC_014106	AAG	2	6	164256	164261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3563	NC_014106	GGT	2	6	164358	164363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692022
3564	NC_014106	CTG	3	9	164368	164376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692022
3565	NC_014106	TAA	2	6	164384	164389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692022
3566	NC_014106	AAG	2	6	164406	164411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3567	NC_014106	TCAA	2	8	164472	164479	50 %	25 %	0 %	25 %	295692022
3568	NC_014106	AAG	2	6	164545	164550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692022
3569	NC_014106	ATG	2	6	164581	164586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692022
3570	NC_014106	AG	3	6	164608	164613	50 %	0 %	50 %	0 %	295692022
3571	NC_014106	GTAA	2	8	164624	164631	50 %	25 %	25 %	0 %	295692022
3572	NC_014106	TAA	2	6	164684	164689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014106	TGC	2	6	164702	164707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_014106	TAC	2	6	164708	164713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_014106	TTA	2	6	164732	164737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014106	TAA	2	6	164743	164748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_014106	T	6	6	164750	164755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_014106	A	6	6	164761	164766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_014106	T	7	7	164784	164790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014106	AAT	2	6	164816	164821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692023
3581	NC_014106	GGAT	2	8	164847	164854	25 %	25 %	50 %	0 %	295692023
3582	NC_014106	GAT	2	6	164886	164891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
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3585	NC_014106	CGTCC	2	10	165044	165053	0 %	20 %	20 %	60 %	295692023
3586	NC_014106	GTG	2	6	165061	165066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692023
3587	NC_014106	CTT	2	6	165150	165155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692023
3588	NC_014106	TGA	2	6	165317	165322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3589	NC_014106	TTG	2	6	165466	165471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692023
3590	NC_014106	ACAT	2	8	165484	165491	50 %	25 %	0 %	25 %	295692023
3591	NC_014106	ACC	2	6	165531	165536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692023
3592	NC_014106	GAA	2	6	165588	165593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692023
3593	NC_014106	AAG	2	6	165598	165603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692023
3594	NC_014106	TTC	2	6	165628	165633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692023
3595	NC_014106	GCT	2	6	165700	165705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692023
3596	NC_014106	TAG	2	6	165746	165751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3597	NC_014106	GGAA	2	8	165774	165781	50 %	0 %	50 %	0 %	295692023
3598	NC_014106	TGAA	2	8	165866	165873	50 %	25 %	25 %	0 %	295692023
3599	NC_014106	CAG	2	6	165902	165907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692023
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3602	NC_014106	GTT	2	6	166005	166010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692023
3603	NC_014106	AGT	2	6	166034	166039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3604	NC_014106	AAT	2	6	166077	166082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692023
3605	NC_014106	AGT	2	6	166131	166136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3606	NC_014106	GACT	2	8	166184	166191	25 %	25 %	25 %	25 %	295692023
3607	NC_014106	AAT	2	6	166192	166197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692023
3608	NC_014106	GATT	2	8	166214	166221	25 %	50 %	25 %	0 %	295692023
3609	NC_014106	A	6	6	166273	166278	100 %	0 %	0 %	0 %	295692023
3610	NC_014106	T	6	6	166334	166339	0 %	100 %	0 %	0 %	295692023
3611	NC_014106	GCC	2	6	166413	166418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295692023
3612	NC_014106	TGTAAC	2	12	166452	166463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295692023
3613	NC_014106	CCA	2	6	166501	166506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692023
3614	NC_014106	TAA	2	6	166626	166631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692023
3615	NC_014106	GCC	2	6	166695	166700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295692023
3616	NC_014106	CATAA	2	10	166722	166731	60 %	20 %	0 %	20 %	295692023
3617	NC_014106	AGCC	2	8	166781	166788	25 %	0 %	25 %	50 %	295692023
3618	NC_014106	TAT	2	6	166808	166813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692023
3619	NC_014106	TCA	2	6	166814	166819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692023
3620	NC_014106	CAA	2	6	166835	166840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_014106	TAA	2	6	166852	166857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_014106	A	7	7	166856	166862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3624	NC_014106	TGA	2	6	166962	166967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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