MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 44792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_014106	AAAAG	2	10	226090	226099	80 %	0 %	20 %	0 %	295692081
5003	NC_014106	AGA	2	6	226157	226162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692081
5004	NC_014106	ATT	2	6	226189	226194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692081
5005	NC_014106	T	6	6	226330	226335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014106	AATA	2	8	226347	226354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014106	AGT	2	6	226407	226412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014106	TAT	2	6	226461	226466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692082
5009	NC_014106	ATT	2	6	226483	226488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692082
5010	NC_014106	AAT	2	6	226498	226503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692082
5011	NC_014106	AGA	2	6	226575	226580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692082
5012	NC_014106	GAG	2	6	226600	226605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295692082
5013	NC_014106	GAAAA	2	10	226630	226639	80 %	0 %	20 %	0 %	295692082
5014	NC_014106	GA	3	6	226667	226672	50 %	0 %	50 %	0 %	295692082
5015	NC_014106	AT	3	6	226692	226697	50 %	50 %	0 %	0 %	295692082
5016	NC_014106	TAGTCA	2	12	226860	226871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295692082
5017	NC_014106	CAA	2	6	226915	226920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692082
5018	NC_014106	GAA	2	6	226927	226932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692082
5019	NC_014106	ATT	2	6	227053	227058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692082
5020	NC_014106	AG	3	6	227081	227086	50 %	0 %	50 %	0 %	295692082
5021	NC_014106	GTTT	2	8	227100	227107	0 %	75 %	25 %	0 %	295692082
5022	NC_014106	ATC	2	6	227182	227187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692082
5023	NC_014106	AAGA	2	8	227218	227225	75 %	0 %	25 %	0 %	295692082
5024	NC_014106	TGA	2	6	227229	227234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692082
5025	NC_014106	GCA	2	6	227253	227258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692082
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5027	NC_014106	A	7	7	227290	227296	100 %	0 %	0 %	0 %	295692082
5028	NC_014106	TGAT	2	8	227411	227418	25 %	50 %	25 %	0 %	295692082
5029	NC_014106	TCG	2	6	227475	227480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692082
5030	NC_014106	GCT	2	6	227537	227542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692082
5031	NC_014106	ATC	2	6	227552	227557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692082
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5034	NC_014106	GAA	2	6	227713	227718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692082
5035	NC_014106	AAGA	2	8	227745	227752	75 %	0 %	25 %	0 %	295692082
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5038	NC_014106	AAAT	2	8	227837	227844	75 %	25 %	0 %	0 %	295692082
5039	NC_014106	TAT	2	6	227938	227943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014106	AT	3	6	227942	227947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014106	TGT	2	6	227974	227979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014106	AGT	2	6	228045	228050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692083
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5044	NC_014106	AAT	2	6	228145	228150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692083
5045	NC_014106	ACTA	2	8	228183	228190	50 %	25 %	0 %	25 %	295692083
5046	NC_014106	TGA	3	9	228210	228218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692083
5047	NC_014106	ATTT	2	8	228267	228274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014106	T	8	8	228288	228295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014106	ATTA	2	8	228310	228317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014106	TGG	2	6	228368	228373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692084
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5055	NC_014106	GGT	2	6	228640	228645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692084
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5059	NC_014106	TTC	2	6	228870	228875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692084
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5067	NC_014106	TGT	2	6	229330	229335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692085
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5095	NC_014106	ATA	2	6	230677	230682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014106	TAA	3	9	230707	230715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_014106	AGGT	2	8	230726	230733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014106	AGTT	2	8	230756	230763	25 %	50 %	25 %	0 %	295692086
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5106	NC_014106	AAG	2	6	231115	231120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692086
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5109	NC_014106	AAG	2	6	231154	231159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692086
5110	NC_014106	A	6	6	231181	231186	100 %	0 %	0 %	0 %	295692086
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5113	NC_014106	ACT	2	6	231250	231255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692086
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5117	NC_014106	A	6	6	231351	231356	100 %	0 %	0 %	0 %	295692086
5118	NC_014106	ATT	2	6	231455	231460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692086
5119	NC_014106	TAA	2	6	231490	231495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692086
5120	NC_014106	A	7	7	231556	231562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014106	AT	3	6	231578	231583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014106	CAG	2	6	231654	231659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692087
5123	NC_014106	TGA	2	6	231666	231671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692087
5124	NC_014106	GCT	2	6	231719	231724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692087
5125	NC_014106	AAG	2	6	231728	231733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5126	NC_014106	ACT	2	6	231734	231739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5127	NC_014106	GCA	2	6	231749	231754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692087
5128	NC_014106	CAA	2	6	231757	231762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
5129	NC_014106	ACT	2	6	231842	231847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5130	NC_014106	TAC	2	6	231905	231910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5131	NC_014106	TGG	3	9	231916	231924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692087
5132	NC_014106	TCA	2	6	231965	231970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5133	NC_014106	TCA	2	6	231974	231979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5134	NC_014106	GTTT	2	8	232003	232010	0 %	75 %	25 %	0 %	295692087
5135	NC_014106	ACT	2	6	232094	232099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5136	NC_014106	AAG	2	6	232124	232129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5137	NC_014106	AAG	2	6	232145	232150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5138	NC_014106	ATC	2	6	232207	232212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5139	NC_014106	ATG	2	6	232221	232226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692087
5140	NC_014106	A	6	6	232238	232243	100 %	0 %	0 %	0 %	295692087
5141	NC_014106	ACT	2	6	232248	232253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5142	NC_014106	AGA	2	6	232260	232265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5143	NC_014106	ATA	2	6	232281	232286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692087
5144	NC_014106	CAA	2	6	232300	232305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
5145	NC_014106	TAC	2	6	232382	232387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5146	NC_014106	GAA	3	9	232465	232473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5147	NC_014106	AAG	3	9	232505	232513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5148	NC_014106	AAG	2	6	232520	232525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5149	NC_014106	TAC	2	6	232574	232579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5150	NC_014106	GCT	2	6	232607	232612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692087
5151	NC_014106	TGC	2	6	232666	232671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692087
5152	NC_014106	ATA	2	6	232689	232694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692087
5153	NC_014106	ACA	2	6	232746	232751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
5154	NC_014106	CAA	2	6	232799	232804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
5155	NC_014106	AT	3	6	232819	232824	50 %	50 %	0 %	0 %	295692087
5156	NC_014106	ATT	2	6	232852	232857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692087
5157	NC_014106	AGA	2	6	232954	232959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
5158	NC_014106	AAC	2	6	233108	233113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
5159	NC_014106	CTA	2	6	233124	233129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5160	NC_014106	TGC	2	6	233152	233157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692087
5161	NC_014106	AG	3	6	233190	233195	50 %	0 %	50 %	0 %	295692087
5162	NC_014106	TAT	2	6	233242	233247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692087
5163	NC_014106	GCTAAT	2	12	233258	233269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295692087
5164	NC_014106	ACT	2	6	233297	233302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
5165	NC_014106	AAC	2	6	233384	233389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
5166	NC_014106	AT	3	6	233395	233400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_014106	GTA	2	6	233411	233416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_014106	T	6	6	233439	233444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_014106	AT	3	6	233475	233480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_014106	T	6	6	233487	233492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5171	NC_014106	TAGT	2	8	233502	233509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_014106	T	6	6	233512	233517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_014106	GGA	2	6	233610	233615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_014106	ATG	2	6	233638	233643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692088
5175	NC_014106	TGA	2	6	233760	233765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692088
5176	NC_014106	TTG	2	6	233836	233841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692088
5177	NC_014106	CGT	2	6	233860	233865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
5178	NC_014106	TAC	2	6	233899	233904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692088
5179	NC_014106	CTCGTG	2	12	233930	233941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
5180	NC_014106	CAC	2	6	234020	234025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692088
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5182	NC_014106	TGT	2	6	234120	234125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692088
5183	NC_014106	GGT	2	6	234142	234147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692088
5184	NC_014106	CGT	2	6	234208	234213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
5185	NC_014106	ATC	2	6	234274	234279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692088
5186	NC_014106	TGA	2	6	234282	234287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692088
5187	NC_014106	TGAT	2	8	234290	234297	25 %	50 %	25 %	0 %	295692088
5188	NC_014106	CTG	2	6	234299	234304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
5189	NC_014106	GCT	2	6	234319	234324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
5190	NC_014106	TCAA	3	12	234445	234456	50 %	25 %	0 %	25 %	295692088
5191	NC_014106	CAG	2	6	234458	234463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692088
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5193	NC_014106	ATA	2	6	234606	234611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5194	NC_014106	A	6	6	234611	234616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5195	NC_014106	ATTTT	2	10	234638	234647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5196	NC_014106	TAA	2	6	234679	234684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5197	NC_014106	AGAT	2	8	234728	234735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5198	NC_014106	AAG	2	6	234823	234828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692089
5199	NC_014106	TGG	2	6	234989	234994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692089
5200	NC_014106	AGA	2	6	235025	235030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692089
5201	NC_014106	A	6	6	235041	235046	100 %	0 %	0 %	0 %	295692089
5202	NC_014106	ATG	2	6	235048	235053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692089
5203	NC_014106	ATG	2	6	235072	235077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692089
5204	NC_014106	AGC	2	6	235082	235087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692089
5205	NC_014106	CTG	2	6	235156	235161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692089
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5208	NC_014106	GCT	2	6	235269	235274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692089
5209	NC_014106	GTT	2	6	235288	235293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692089
5210	NC_014106	A	6	6	235311	235316	100 %	0 %	0 %	0 %	295692089
5211	NC_014106	ATT	2	6	235479	235484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692089
5212	NC_014106	GAA	2	6	235518	235523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692089
5213	NC_014106	CAAT	2	8	235529	235536	50 %	25 %	0 %	25 %	295692089
5214	NC_014106	AAT	2	6	235554	235559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692089
5215	NC_014106	AAT	2	6	235569	235574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692089
5216	NC_014106	GCT	2	6	235599	235604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692089
5217	NC_014106	GAA	2	6	235668	235673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692089
5218	NC_014106	A	6	6	235695	235700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5219	NC_014106	T	6	6	235718	235723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_014106	ATA	2	6	235735	235740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_014106	ATGA	2	8	235857	235864	50 %	25 %	25 %	0 %	295692090
5222	NC_014106	TCT	2	6	235966	235971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692090
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5224	NC_014106	CTT	2	6	236056	236061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692091
5225	NC_014106	TCT	2	6	236077	236082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692091
5226	NC_014106	AT	3	6	236108	236113	50 %	50 %	0 %	0 %	295692091
5227	NC_014106	GAA	3	9	236185	236193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692091
5228	NC_014106	TGC	2	6	236262	236267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692091
5229	NC_014106	GTC	2	6	236269	236274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692091
5230	NC_014106	CAT	2	6	236325	236330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692091
5231	NC_014106	GCTT	2	8	236384	236391	0 %	50 %	25 %	25 %	295692091
5232	NC_014106	TTC	2	6	236428	236433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692091
5233	NC_014106	CTAG	2	8	236447	236454	25 %	25 %	25 %	25 %	295692091
5234	NC_014106	CAT	2	6	236544	236549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692091
5235	NC_014106	AAT	2	6	236559	236564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692091
5236	NC_014106	GCAT	2	8	236750	236757	25 %	25 %	25 %	25 %	295692091
5237	NC_014106	TTG	2	6	236762	236767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692091
5238	NC_014106	ATCC	2	8	236872	236879	25 %	25 %	0 %	50 %	295692091
5239	NC_014106	GTCAGC	2	12	236881	236892	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295692091
5240	NC_014106	T	6	6	237036	237041	0 %	100 %	0 %	0 %	295692091
5241	NC_014106	TG	3	6	237070	237075	0 %	50 %	50 %	0 %	295692091
5242	NC_014106	ATC	2	6	237136	237141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692091
5243	NC_014106	T	6	6	237178	237183	0 %	100 %	0 %	0 %	295692091
5244	NC_014106	TTC	2	6	237201	237206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692091
5245	NC_014106	AAC	2	6	237337	237342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692091
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5284	NC_014106	T	6	6	238630	238635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5359	NC_014106	TAAA	2	8	241716	241723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_014106	T	6	6	241861	241866	0 %	100 %	0 %	0 %	295692096
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