MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 40739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013891	ATC	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013891	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433374
3	NC_013891	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
4	NC_013891	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433374
5	NC_013891	TGA	2	6	612	617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
6	NC_013891	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433374
7	NC_013891	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289433374
8	NC_013891	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433374
9	NC_013891	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
10	NC_013891	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433374
11	NC_013891	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
12	NC_013891	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
13	NC_013891	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
14	NC_013891	AAG	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
15	NC_013891	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
16	NC_013891	TTA	2	6	1043	1048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
17	NC_013891	CCA	2	6	1063	1068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289433374
18	NC_013891	TAA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433374
19	NC_013891	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
20	NC_013891	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433374
21	NC_013891	ATC	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433374
22	NC_013891	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
23	NC_013891	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
24	NC_013891	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
25	NC_013891	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433374
26	NC_013891	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433374
27	NC_013891	AAC	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433375
28	NC_013891	ATG	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
29	NC_013891	ATG	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
30	NC_013891	TTG	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433375
31	NC_013891	TGG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433375
32	NC_013891	TTC	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433375
33	NC_013891	TCG	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433375
34	NC_013891	GAA	2	6	2139	2144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433375
35	NC_013891	ACT	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433375
36	NC_013891	ATT	2	6	2301	2306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433375
37	NC_013891	ATT	2	6	2370	2375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433375
38	NC_013891	TGA	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
39	NC_013891	GAT	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
40	NC_013891	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433375
41	NC_013891	TCT	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433375
42	NC_013891	GAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433375
43	NC_013891	TGA	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
44	NC_013891	CAA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433375
45	NC_013891	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013891	CTT	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013891	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433376
48	NC_013891	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433376
49	NC_013891	CAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433376
50	NC_013891	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
51	NC_013891	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433376
52	NC_013891	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
53	NC_013891	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433376
54	NC_013891	TCT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
55	NC_013891	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289433376
56	NC_013891	GGC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289433376
57	NC_013891	TTC	2	6	3581	3586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
58	NC_013891	TCT	2	6	3631	3636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
59	NC_013891	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433376
60	NC_013891	GCG	2	6	3730	3735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289433376
61	NC_013891	ATT	2	6	3813	3818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
62	NC_013891	TCT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
63	NC_013891	AGC	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433376
64	NC_013891	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433376
65	NC_013891	TTA	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
66	NC_013891	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
67	NC_013891	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433376
68	NC_013891	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433376
69	NC_013891	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433376
70	NC_013891	CAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433376
71	NC_013891	GAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433376
72	NC_013891	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013891	ATA	2	6	4619	4624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013891	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433378
75	NC_013891	AGA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433378
76	NC_013891	GAC	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433378
77	NC_013891	CAA	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433378
78	NC_013891	ATT	2	6	5354	5359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433378
79	NC_013891	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433378
80	NC_013891	ACA	2	6	5724	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433378
81	NC_013891	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433378
82	NC_013891	CTG	2	6	5803	5808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433378
83	NC_013891	TGA	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433378
84	NC_013891	GAT	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433378
85	NC_013891	AAC	3	9	5892	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433378
86	NC_013891	ATA	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433378
87	NC_013891	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433378
88	NC_013891	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013891	AGA	2	6	6034	6039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433379
90	NC_013891	TGA	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433379
91	NC_013891	ATA	2	6	6255	6260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433379
92	NC_013891	GTC	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433379
93	NC_013891	GGC	3	9	6371	6379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289433379
94	NC_013891	TGT	2	6	6505	6510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433379
95	NC_013891	GAA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433379
96	NC_013891	ACA	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433379
97	NC_013891	GAA	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433379
98	NC_013891	CCA	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289433379
99	NC_013891	TGA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433379
100	NC_013891	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433379
101	NC_013891	ATG	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433379
102	NC_013891	GTG	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433379
103	NC_013891	GCT	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433379
104	NC_013891	TTC	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433379
105	NC_013891	TGG	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433379
106	NC_013891	GAA	2	6	7457	7462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433379
107	NC_013891	TGG	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433379
108	NC_013891	ATT	2	6	7541	7546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433379
109	NC_013891	CTT	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433379
110	NC_013891	AGA	2	6	7717	7722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433379
111	NC_013891	AAC	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433379
112	NC_013891	TAC	2	6	7810	7815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433379
113	NC_013891	TCG	2	6	7915	7920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433379
114	NC_013891	GAA	2	6	7931	7936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433379
115	NC_013891	TAA	2	6	7967	7972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433379
116	NC_013891	TAA	2	6	7985	7990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013891	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433380
118	NC_013891	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433380
119	NC_013891	CGT	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433380
120	NC_013891	TTG	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433380
121	NC_013891	CAG	2	6	8315	8320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433380
122	NC_013891	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289433380
123	NC_013891	ATG	2	6	8513	8518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433380
124	NC_013891	TCA	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433380
125	NC_013891	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433380
126	NC_013891	TCG	2	6	8754	8759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433380
127	NC_013891	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433380
128	NC_013891	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433380
129	NC_013891	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433380
130	NC_013891	CTT	2	6	8933	8938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433380
131	NC_013891	ATG	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433380
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257	NC_013891	ATT	2	6	18025	18030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433387
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