MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 65023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013891	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013891	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013891	ATC	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013891	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013891	G	6	6	307	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013891	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	289433374
7	NC_013891	A	8	8	364	371	100 %	0 %	0 %	0 %	289433374
8	NC_013891	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433374
9	NC_013891	TCAT	2	8	417	424	25 %	50 %	0 %	25 %	289433374
10	NC_013891	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
11	NC_013891	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433374
12	NC_013891	TGA	2	6	612	617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
13	NC_013891	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433374
14	NC_013891	CT	3	6	752	757	0 %	50 %	0 %	50 %	289433374
15	NC_013891	AT	3	6	760	765	50 %	50 %	0 %	0 %	289433374
16	NC_013891	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289433374
17	NC_013891	ATGC	2	8	796	803	25 %	25 %	25 %	25 %	289433374
18	NC_013891	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433374
19	NC_013891	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
20	NC_013891	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433374
21	NC_013891	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
22	NC_013891	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
23	NC_013891	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
24	NC_013891	AAG	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
25	NC_013891	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	289433374
26	NC_013891	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
27	NC_013891	AACAAA	2	12	1031	1042	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289433374
28	NC_013891	TTA	2	6	1043	1048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
29	NC_013891	CCA	2	6	1063	1068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289433374
30	NC_013891	TAA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433374
31	NC_013891	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	289433374
32	NC_013891	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
33	NC_013891	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433374
34	NC_013891	TAAA	2	8	1301	1308	75 %	25 %	0 %	0 %	289433374
35	NC_013891	ATC	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433374
36	NC_013891	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433374
37	NC_013891	ACGT	2	8	1418	1425	25 %	25 %	25 %	25 %	289433374
38	NC_013891	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433374
39	NC_013891	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	289433374
40	NC_013891	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	289433374
41	NC_013891	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433374
42	NC_013891	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433374
43	NC_013891	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	289433374
44	NC_013891	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433374
45	NC_013891	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	289433374
46	NC_013891	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013891	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013891	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013891	AT	4	8	1845	1852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013891	AAC	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433375
51	NC_013891	ATG	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
52	NC_013891	ATG	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
53	NC_013891	TTG	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433375
54	NC_013891	TGG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433375
55	NC_013891	TTC	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433375
56	NC_013891	TCG	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433375
57	NC_013891	GAA	2	6	2139	2144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433375
58	NC_013891	ACT	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433375
59	NC_013891	ATT	2	6	2301	2306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433375
60	NC_013891	TACT	2	8	2350	2357	25 %	50 %	0 %	25 %	289433375
61	NC_013891	ATT	2	6	2370	2375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433375
62	NC_013891	TGA	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
63	NC_013891	TAAA	2	8	2500	2507	75 %	25 %	0 %	0 %	289433375
64	NC_013891	GAT	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
65	NC_013891	GCTA	2	8	2543	2550	25 %	25 %	25 %	25 %	289433375
66	NC_013891	TTAAA	2	10	2566	2575	60 %	40 %	0 %	0 %	289433375
67	NC_013891	TATTC	2	10	2584	2593	20 %	60 %	0 %	20 %	289433375
68	NC_013891	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433375
69	NC_013891	TCT	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433375
70	NC_013891	GAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433375
71	NC_013891	AT	3	6	2867	2872	50 %	50 %	0 %	0 %	289433375
72	NC_013891	TGA	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433375
73	NC_013891	CAA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433375
74	NC_013891	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013891	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013891	CTT	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013891	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433376
78	NC_013891	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433376
79	NC_013891	CAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433376
80	NC_013891	AATT	2	8	3155	3162	50 %	50 %	0 %	0 %	289433376
81	NC_013891	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	289433376
82	NC_013891	TGAT	2	8	3218	3225	25 %	50 %	25 %	0 %	289433376
83	NC_013891	T	6	6	3294	3299	0 %	100 %	0 %	0 %	289433376
84	NC_013891	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
85	NC_013891	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433376
86	NC_013891	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	289433376
87	NC_013891	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
88	NC_013891	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433376
89	NC_013891	TCT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
90	NC_013891	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289433376
91	NC_013891	TA	3	6	3560	3565	50 %	50 %	0 %	0 %	289433376
92	NC_013891	GGC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289433376
93	NC_013891	TTC	2	6	3581	3586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
94	NC_013891	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	289433376
95	NC_013891	TCT	2	6	3631	3636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
96	NC_013891	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	289433376
97	NC_013891	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433376
98	NC_013891	GCG	2	6	3730	3735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289433376
99	NC_013891	T	6	6	3746	3751	0 %	100 %	0 %	0 %	289433376
100	NC_013891	ATT	2	6	3813	3818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
101	NC_013891	CTTC	2	8	3841	3848	0 %	50 %	0 %	50 %	289433376
102	NC_013891	TCAT	2	8	3862	3869	25 %	50 %	0 %	25 %	289433376
103	NC_013891	TAAT	2	8	3899	3906	50 %	50 %	0 %	0 %	289433376
104	NC_013891	TCT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433376
105	NC_013891	AGC	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433376
106	NC_013891	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433376
107	NC_013891	TTA	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
108	NC_013891	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433376
109	NC_013891	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433376
110	NC_013891	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433376
111	NC_013891	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433376
112	NC_013891	CAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433376
113	NC_013891	GAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433376
114	NC_013891	A	6	6	4438	4443	100 %	0 %	0 %	0 %	289433376
115	NC_013891	A	6	6	4477	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013891	ATTTT	2	10	4499	4508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013891	T	8	8	4505	4512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013891	AATA	2	8	4513	4520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013891	A	7	7	4543	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013891	AT	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013891	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013891	ATA	2	6	4619	4624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013891	TGAT	2	8	4703	4710	25 %	50 %	25 %	0 %	289433377
124	NC_013891	GA	3	6	4958	4963	50 %	0 %	50 %	0 %	289433378
125	NC_013891	AACC	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	289433378
126	NC_013891	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433378
127	NC_013891	AGA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433378
128	NC_013891	GAC	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433378
129	NC_013891	T	6	6	5268	5273	0 %	100 %	0 %	0 %	289433378
130	NC_013891	ATTT	2	8	5302	5309	25 %	75 %	0 %	0 %	289433378
131	NC_013891	CAA	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433378
132	NC_013891	ATT	2	6	5354	5359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433378
133	NC_013891	TTCA	2	8	5464	5471	25 %	50 %	0 %	25 %	289433378
134	NC_013891	AATC	2	8	5612	5619	50 %	25 %	0 %	25 %	289433378
135	NC_013891	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433378
136	NC_013891	ACA	2	6	5724	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433378
137	NC_013891	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433378
138	NC_013891	CTG	2	6	5803	5808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433378
139	NC_013891	TGA	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433378
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