MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 65023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013891	AGA	2	6	257030	257035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433611
6002	NC_013891	AAT	2	6	257054	257059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433611
6003	NC_013891	TAA	2	6	257085	257090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433611
6004	NC_013891	AAG	2	6	257092	257097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_013891	CTT	3	9	257120	257128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_013891	G	6	6	257152	257157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_013891	TGT	2	6	257162	257167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_013891	T	6	6	257200	257205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_013891	TTA	2	6	257217	257222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_013891	A	6	6	257234	257239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_013891	TAAA	2	8	257268	257275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_013891	AT	3	6	257296	257301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_013891	CTTT	2	8	257313	257320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_013891	AGC	2	6	257329	257334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_013891	T	6	6	257337	257342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_013891	TGA	2	6	257430	257435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_013891	TTAAAC	2	12	257485	257496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6018	NC_013891	G	6	6	257506	257511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_013891	T	6	6	257557	257562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_013891	AATT	2	8	257563	257570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_013891	ATG	2	6	257605	257610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433612
6022	NC_013891	CTT	2	6	257698	257703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433612
6023	NC_013891	AGA	2	6	257828	257833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433612
6024	NC_013891	CAA	2	6	257891	257896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433612
6025	NC_013891	AAG	2	6	257920	257925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433612
6026	NC_013891	GTTC	2	8	258009	258016	0 %	50 %	25 %	25 %	289433612
6027	NC_013891	A	6	6	258057	258062	100 %	0 %	0 %	0 %	289433612
6028	NC_013891	GCTTG	2	10	258096	258105	0 %	40 %	40 %	20 %	289433612
6029	NC_013891	ATT	2	6	258213	258218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433612
6030	NC_013891	ACT	2	6	258238	258243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433612
6031	NC_013891	AC	3	6	258250	258255	50 %	0 %	0 %	50 %	289433612
6032	NC_013891	ACA	2	6	258265	258270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433612
6033	NC_013891	ACC	2	6	258326	258331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289433612
6034	NC_013891	CAA	2	6	258419	258424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433612
6035	NC_013891	A	6	6	258423	258428	100 %	0 %	0 %	0 %	289433612
6036	NC_013891	TAG	2	6	258475	258480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433612
6037	NC_013891	TCG	2	6	258527	258532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6038	NC_013891	ATT	2	6	258546	258551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433612
6039	NC_013891	ATG	2	6	258652	258657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433612
6040	NC_013891	AAGAAA	2	12	258658	258669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433612
6041	NC_013891	CAT	2	6	258674	258679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433612
6042	NC_013891	GAA	2	6	258696	258701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433612
6043	NC_013891	CTT	2	6	258749	258754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433612
6044	NC_013891	TGC	2	6	258760	258765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6045	NC_013891	TCG	2	6	258806	258811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6046	NC_013891	CAA	2	6	258924	258929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433612
6047	NC_013891	AGT	2	6	258947	258952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433612
6048	NC_013891	CAAA	2	8	259005	259012	75 %	0 %	0 %	25 %	289433612
6049	NC_013891	CGT	2	6	259038	259043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6050	NC_013891	TGG	2	6	259061	259066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433612
6051	NC_013891	ACGTG	2	10	259097	259106	20 %	20 %	40 %	20 %	289433612
6052	NC_013891	TTAA	2	8	259167	259174	50 %	50 %	0 %	0 %	289433612
6053	NC_013891	TTC	2	6	259181	259186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289433612
6054	NC_013891	TAAA	2	8	259198	259205	75 %	25 %	0 %	0 %	289433612
6055	NC_013891	CCG	2	6	259229	259234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289433612
6056	NC_013891	GATT	2	8	259268	259275	25 %	50 %	25 %	0 %	289433612
6057	NC_013891	GTA	2	6	259305	259310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433612
6058	NC_013891	AGA	3	9	259352	259360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433612
6059	NC_013891	GAT	2	6	259482	259487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433612
6060	NC_013891	TTG	2	6	259558	259563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433612
6061	NC_013891	TGC	2	6	259601	259606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6062	NC_013891	TCG	2	6	259664	259669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6063	NC_013891	AAG	2	6	259690	259695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433612
6064	NC_013891	GTTC	2	8	259734	259741	0 %	50 %	25 %	25 %	289433612
6065	NC_013891	GTT	2	6	259794	259799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433612
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6067	NC_013891	ATC	2	6	259911	259916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433612
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6071	NC_013891	TAC	2	6	260167	260172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289433612
6072	NC_013891	CGG	4	12	260231	260242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289433612
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6074	NC_013891	GAA	2	6	260409	260414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433612
6075	NC_013891	GCT	2	6	260523	260528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
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6083	NC_013891	TGG	2	6	260798	260803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289433612
6084	NC_013891	TGC	2	6	260849	260854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6085	NC_013891	TGGT	2	8	260896	260903	0 %	50 %	50 %	0 %	289433612
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6090	NC_013891	ATG	2	6	261085	261090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433612
6091	NC_013891	GCT	2	6	261120	261125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433612
6092	NC_013891	T	6	6	261188	261193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_013891	A	6	6	261232	261237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_013891	AGG	2	6	261300	261305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_013891	TAA	2	6	261325	261330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433613
6096	NC_013891	A	6	6	261398	261403	100 %	0 %	0 %	0 %	289433613
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6107	NC_013891	TCG	2	6	262087	262092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433613
6108	NC_013891	AAC	2	6	262106	262111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433613
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6110	NC_013891	GTC	2	6	262209	262214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433613
6111	NC_013891	GTC	2	6	262218	262223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433613
6112	NC_013891	ATT	2	6	262323	262328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433613
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6114	NC_013891	TTG	2	6	262434	262439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433613
6115	NC_013891	CA	3	6	262452	262457	50 %	0 %	0 %	50 %	289433613
6116	NC_013891	AGA	2	6	262516	262521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433613
6117	NC_013891	TGTA	2	8	262636	262643	25 %	50 %	25 %	0 %	289433613
6118	NC_013891	AAC	2	6	262968	262973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433613
6119	NC_013891	ATT	2	6	262981	262986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433613
6120	NC_013891	ACA	3	9	263105	263113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289433613
6121	NC_013891	AAG	2	6	263159	263164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433613
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6123	NC_013891	CGT	2	6	263375	263380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433613
6124	NC_013891	GAT	2	6	263393	263398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433613
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6239	NC_013891	ACTA	2	8	268361	268368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6240	NC_013891	ACTAA	2	10	268424	268433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6241	NC_013891	AGG	2	6	268444	268449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_013891	GAA	2	6	268470	268475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433617
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6496	NC_013891	CTTT	2	8	280158	280165	0 %	75 %	0 %	25 %	289433627
6497	NC_013891	TCG	2	6	280192	280197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289433627
6498	NC_013891	GAA	2	6	280203	280208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433627
6499	NC_013891	CGAGC	2	10	280240	280249	20 %	0 %	40 %	40 %	289433627
6500	NC_013891	AGA	2	6	280280	280285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289433627

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