MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 08-5923

Total Repeats: 2246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013768	ATATG	2	10	690	699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013768	TGAAG	2	10	1334	1343	40 %	20 %	40 %	0 %	284993443
3	NC_013768	AAACA	2	10	1790	1799	80 %	0 %	0 %	20 %	284993444
4	NC_013768	ATTAC	2	10	2113	2122	40 %	40 %	0 %	20 %	284993444
5	NC_013768	AAGAA	2	10	2299	2308	80 %	0 %	20 %	0 %	284993444
6	NC_013768	GGTTC	2	10	3000	3009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013768	GTATG	2	10	4274	4283	20 %	40 %	40 %	0 %	284993447
8	NC_013768	CTTTA	2	10	5051	5060	20 %	60 %	0 %	20 %	284993448
9	NC_013768	GTGAA	2	10	6517	6526	40 %	20 %	40 %	0 %	284993449
10	NC_013768	ACTTA	2	10	7628	7637	40 %	40 %	0 %	20 %	284993450
11	NC_013768	AAATC	2	10	9711	9720	60 %	20 %	0 %	20 %	284993452
12	NC_013768	CGCTG	2	10	9995	10004	0 %	20 %	40 %	40 %	284993453
13	NC_013768	AAACA	2	10	12102	12111	80 %	0 %	0 %	20 %	284993455
14	NC_013768	TTTTA	2	10	12301	12310	20 %	80 %	0 %	0 %	284993455
15	NC_013768	TTGAA	2	10	12606	12615	40 %	40 %	20 %	0 %	284993455
16	NC_013768	GTTTT	2	10	18564	18573	0 %	80 %	20 %	0 %	284993459
17	NC_013768	TCAAA	2	10	26175	26184	60 %	20 %	0 %	20 %	284993465
18	NC_013768	AAAGA	2	10	27942	27951	80 %	0 %	20 %	0 %	284993468
19	NC_013768	AAGAC	2	10	29333	29342	60 %	0 %	20 %	20 %	284993471
20	NC_013768	GGTTA	2	10	30219	30228	20 %	40 %	40 %	0 %	284993471
21	NC_013768	AGAAC	2	10	30720	30729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013768	TTTCT	2	10	31679	31688	0 %	80 %	0 %	20 %	284993472
23	NC_013768	GAACT	2	10	32315	32324	40 %	20 %	20 %	20 %	284993473
24	NC_013768	AATTT	2	10	33912	33921	40 %	60 %	0 %	0 %	284993474
25	NC_013768	GAATG	2	10	34647	34656	40 %	20 %	40 %	0 %	284993475
26	NC_013768	TGTAG	2	10	36445	36454	20 %	40 %	40 %	0 %	284993476
27	NC_013768	TTATT	2	10	36677	36686	20 %	80 %	0 %	0 %	284993476
28	NC_013768	TGAAA	2	10	40501	40510	60 %	20 %	20 %	0 %	284993478
29	NC_013768	AAAGT	2	10	41888	41897	60 %	20 %	20 %	0 %	284993479
30	NC_013768	TAAAT	2	10	43920	43929	60 %	40 %	0 %	0 %	284993480
31	NC_013768	ATACA	2	10	47699	47708	60 %	20 %	0 %	20 %	284993485
32	NC_013768	AAAAT	2	10	47990	47999	80 %	20 %	0 %	0 %	284993485
33	NC_013768	GCTAT	2	10	51639	51648	20 %	40 %	20 %	20 %	284993488
34	NC_013768	TCCAA	2	10	53299	53308	40 %	20 %	0 %	40 %	284993490
35	NC_013768	CCATT	2	10	60529	60538	20 %	40 %	0 %	40 %	284993500
36	NC_013768	CAAGC	2	10	62100	62109	40 %	0 %	20 %	40 %	284993502
37	NC_013768	AATCA	2	10	62285	62294	60 %	20 %	0 %	20 %	284993503
38	NC_013768	AAAGT	2	10	63631	63640	60 %	20 %	20 %	0 %	284993504
39	NC_013768	AAGAT	2	10	64171	64180	60 %	20 %	20 %	0 %	284993505
40	NC_013768	GTGCT	2	10	64288	64297	0 %	40 %	40 %	20 %	284993505
41	NC_013768	CCAAA	2	10	64723	64732	60 %	0 %	0 %	40 %	284993505
42	NC_013768	GATTT	2	10	65264	65273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013768	ACGAA	2	10	65383	65392	60 %	0 %	20 %	20 %	284993507
44	NC_013768	TAGAA	2	10	66279	66288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013768	AATAA	2	10	68553	68562	80 %	20 %	0 %	0 %	284993511
46	NC_013768	TGCTT	2	10	68678	68687	0 %	60 %	20 %	20 %	284993511
47	NC_013768	GAATC	2	10	74168	74177	40 %	20 %	20 %	20 %	284993515
48	NC_013768	ATTAT	2	10	74303	74312	40 %	60 %	0 %	0 %	284993515
49	NC_013768	GCATT	2	10	74980	74989	20 %	40 %	20 %	20 %	284993515
50	NC_013768	GCACC	2	10	75658	75667	20 %	0 %	20 %	60 %	284993515
51	NC_013768	TAAAA	2	10	82411	82420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013768	AGTTA	2	10	83910	83919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013768	TATTT	2	10	84483	84492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013768	GGCTT	2	10	84796	84805	0 %	40 %	40 %	20 %	284993525
55	NC_013768	CAAAA	2	10	87200	87209	80 %	0 %	0 %	20 %	284993526
56	NC_013768	GGGGC	2	10	87530	87539	0 %	0 %	80 %	20 %	284993527
57	NC_013768	AGGAA	2	10	87789	87798	60 %	0 %	40 %	0 %	284993527
58	NC_013768	TTGAT	2	10	88745	88754	20 %	60 %	20 %	0 %	284993527
59	NC_013768	ATTGG	2	10	88927	88936	20 %	40 %	40 %	0 %	284993527
60	NC_013768	AACGA	2	10	91030	91039	60 %	0 %	20 %	20 %	284993528
61	NC_013768	GCTAA	2	10	91843	91852	40 %	20 %	20 %	20 %	284993529
62	NC_013768	TTTTA	2	10	92738	92747	20 %	80 %	0 %	0 %	284993530
63	NC_013768	TTATC	2	10	92873	92882	20 %	60 %	0 %	20 %	284993530
64	NC_013768	TTTTA	2	10	93461	93470	20 %	80 %	0 %	0 %	284993530
65	NC_013768	GTGAA	2	10	94574	94583	40 %	20 %	40 %	0 %	284993532
66	NC_013768	TAAAT	2	10	95628	95637	60 %	40 %	0 %	0 %	284993534
67	NC_013768	ATTTC	2	10	96184	96193	20 %	60 %	0 %	20 %	284993534
68	NC_013768	GGAAT	2	10	96486	96495	40 %	20 %	40 %	0 %	284993535
69	NC_013768	TAATA	2	10	100270	100279	60 %	40 %	0 %	0 %	284993538
70	NC_013768	AAATA	2	10	105914	105923	80 %	20 %	0 %	0 %	284993542
71	NC_013768	AAAAC	2	10	107317	107326	80 %	0 %	0 %	20 %	284993543
72	NC_013768	CAAGG	2	10	107503	107512	40 %	0 %	40 %	20 %	284993543
73	NC_013768	AAATG	2	10	108840	108849	60 %	20 %	20 %	0 %	284993544
74	NC_013768	GCATC	2	10	110238	110247	20 %	20 %	20 %	40 %	284993545
75	NC_013768	TTGTT	2	10	112979	112988	0 %	80 %	20 %	0 %	284993547
76	NC_013768	ATTAA	2	10	113522	113531	60 %	40 %	0 %	0 %	284993547
77	NC_013768	GTAAA	2	10	114962	114971	60 %	20 %	20 %	0 %	284993548
78	NC_013768	TTCGG	2	10	116125	116134	0 %	40 %	40 %	20 %	284993549
79	NC_013768	CCAAA	2	10	117050	117059	60 %	0 %	0 %	40 %	284993549
80	NC_013768	CTAAA	2	10	118913	118922	60 %	20 %	0 %	20 %	284993552
81	NC_013768	AATAT	2	10	122375	122384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013768	GCGAG	2	10	125691	125700	20 %	0 %	60 %	20 %	284993559
83	NC_013768	TGAAG	2	10	127702	127711	40 %	20 %	40 %	0 %	284993561
84	NC_013768	CGTCA	2	10	129558	129567	20 %	20 %	20 %	40 %	284993563
85	NC_013768	ATTTT	2	10	134455	134464	20 %	80 %	0 %	0 %	284993565
86	NC_013768	ATTTT	2	10	134539	134548	20 %	80 %	0 %	0 %	284993566
87	NC_013768	TAATT	2	10	135213	135222	40 %	60 %	0 %	0 %	284993566
88	NC_013768	TATGA	2	10	138348	138357	40 %	40 %	20 %	0 %	284993569
89	NC_013768	AACGT	2	10	138796	138805	40 %	20 %	20 %	20 %	284993570
90	NC_013768	AAGTC	2	10	139014	139023	40 %	20 %	20 %	20 %	284993571
91	NC_013768	CTATT	2	10	139418	139427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013768	CTATA	2	10	140459	140468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013768	ATCCA	2	10	146647	146656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013768	TCTTA	2	10	148429	148438	20 %	60 %	0 %	20 %	284993582
95	NC_013768	ATTAC	2	10	149414	149423	40 %	40 %	0 %	20 %	284993583
96	NC_013768	TTTTG	2	10	152524	152533	0 %	80 %	20 %	0 %	284993585
97	NC_013768	CATTC	2	10	153618	153627	20 %	40 %	0 %	40 %	284993586
98	NC_013768	AAAAC	2	10	154096	154105	80 %	0 %	0 %	20 %	284993586
99	NC_013768	AGCCC	2	10	155545	155554	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013768	AAAAG	2	10	157153	157162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013768	TTTTC	2	10	159051	159060	0 %	80 %	0 %	20 %	284993591
102	NC_013768	CTTAT	2	10	159220	159229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013768	GATGG	2	10	161433	161442	20 %	20 %	60 %	0 %	284993594
104	NC_013768	CATCA	2	10	163830	163839	40 %	20 %	0 %	40 %	284993596
105	NC_013768	TTTTA	2	10	165398	165407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013768	TCATT	2	10	166249	166258	20 %	60 %	0 %	20 %	284993600
107	NC_013768	TTTAA	2	10	173098	173107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013768	ATTTA	2	10	174089	174098	40 %	60 %	0 %	0 %	284993609
109	NC_013768	TATTT	2	10	177007	177016	20 %	80 %	0 %	0 %	284993611
110	NC_013768	ACGAA	2	10	177840	177849	60 %	0 %	20 %	20 %	284993611
111	NC_013768	GCACT	2	10	179284	179293	20 %	20 %	20 %	40 %	284993612
112	NC_013768	ATTTT	2	10	179716	179725	20 %	80 %	0 %	0 %	284993612
113	NC_013768	TCGCT	2	10	180238	180247	0 %	40 %	20 %	40 %	284993613
114	NC_013768	GTGCT	2	10	180969	180978	0 %	40 %	40 %	20 %	284993613
115	NC_013768	GAAAC	2	10	181185	181194	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013768	ATGAA	2	10	181211	181220	60 %	20 %	20 %	0 %	284993614
117	NC_013768	TATGA	2	10	185868	185877	40 %	40 %	20 %	0 %	284993618
118	NC_013768	TTGCT	2	10	187092	187101	0 %	60 %	20 %	20 %	284993619
119	NC_013768	TTAAT	2	10	188139	188148	40 %	60 %	0 %	0 %	284993619
120	NC_013768	TGCGA	2	10	189642	189651	20 %	20 %	40 %	20 %	284993621
121	NC_013768	CCGTT	2	10	190599	190608	0 %	40 %	20 %	40 %	284993621
122	NC_013768	AAAGA	2	10	190969	190978	80 %	0 %	20 %	0 %	284993621
123	NC_013768	GGCTT	2	10	191540	191549	0 %	40 %	40 %	20 %	284993621
124	NC_013768	CGTAG	2	10	192415	192424	20 %	20 %	40 %	20 %	284993623
125	NC_013768	TGAGC	2	10	192981	192990	20 %	20 %	40 %	20 %	284993623
126	NC_013768	AATTC	2	10	195425	195434	40 %	40 %	0 %	20 %	284993626
127	NC_013768	GAGCG	2	10	197402	197411	20 %	0 %	60 %	20 %	284993630
128	NC_013768	GAAAA	2	10	198559	198568	80 %	0 %	20 %	0 %	284993631
129	NC_013768	ACCTG	2	10	199137	199146	20 %	20 %	20 %	40 %	284993632
130	NC_013768	GAAAA	2	10	205074	205083	80 %	0 %	20 %	0 %	284993637
131	NC_013768	GAAAT	2	10	205270	205279	60 %	20 %	20 %	0 %	284993637
132	NC_013768	TGCCA	2	10	208098	208107	20 %	20 %	20 %	40 %	284993640
133	NC_013768	CCGCA	2	10	208939	208948	20 %	0 %	20 %	60 %	284993641
134	NC_013768	AAATG	2	10	209935	209944	60 %	20 %	20 %	0 %	284993643
135	NC_013768	ATTTT	2	10	211455	211464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013768	ACGTG	2	10	211997	212006	20 %	20 %	40 %	20 %	284993645
137	NC_013768	TATTT	2	10	216335	216344	20 %	80 %	0 %	0 %	284993648
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