MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 3679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	TG	3	6	13	18	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013766	GA	3	6	628	633	50 %	0 %	50 %	0 %	284800256
3	NC_013766	AT	3	6	637	642	50 %	50 %	0 %	0 %	284800256
4	NC_013766	TC	3	6	677	682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013766	AT	3	6	1289	1294	50 %	50 %	0 %	0 %	284800258
6	NC_013766	GA	3	6	2312	2317	50 %	0 %	50 %	0 %	284800259
7	NC_013766	GC	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	284800260
8	NC_013766	TA	3	6	4312	4317	50 %	50 %	0 %	0 %	284800262
9	NC_013766	AT	3	6	4964	4969	50 %	50 %	0 %	0 %	284800263
10	NC_013766	GT	3	6	5284	5289	0 %	50 %	50 %	0 %	284800263
11	NC_013766	TG	3	6	6096	6101	0 %	50 %	50 %	0 %	284800264
12	NC_013766	AT	3	6	6236	6241	50 %	50 %	0 %	0 %	284800264
13	NC_013766	GC	3	6	6798	6803	0 %	0 %	50 %	50 %	284800264
14	NC_013766	TG	3	6	6990	6995	0 %	50 %	50 %	0 %	284800264
15	NC_013766	AT	3	6	9692	9697	50 %	50 %	0 %	0 %	284800267
16	NC_013766	GC	3	6	10721	10726	0 %	0 %	50 %	50 %	284800268
17	NC_013766	AT	3	6	11491	11496	50 %	50 %	0 %	0 %	284800269
18	NC_013766	TG	3	6	11585	11590	0 %	50 %	50 %	0 %	284800269
19	NC_013766	TA	3	6	12969	12974	50 %	50 %	0 %	0 %	284800270
20	NC_013766	TA	3	6	13512	13517	50 %	50 %	0 %	0 %	284800270
21	NC_013766	AT	3	6	13636	13641	50 %	50 %	0 %	0 %	284800270
22	NC_013766	AC	3	6	13809	13814	50 %	0 %	0 %	50 %	284800270
23	NC_013766	TA	3	6	14733	14738	50 %	50 %	0 %	0 %	284800271
24	NC_013766	AT	3	6	15197	15202	50 %	50 %	0 %	0 %	284800271
25	NC_013766	TC	3	6	17749	17754	0 %	50 %	0 %	50 %	284800273
26	NC_013766	TA	3	6	18516	18521	50 %	50 %	0 %	0 %	284800274
27	NC_013766	TA	3	6	18680	18685	50 %	50 %	0 %	0 %	284800274
28	NC_013766	AT	3	6	18886	18891	50 %	50 %	0 %	0 %	284800274
29	NC_013766	TA	3	6	19257	19262	50 %	50 %	0 %	0 %	284800274
30	NC_013766	CA	3	6	21317	21322	50 %	0 %	0 %	50 %	284800277
31	NC_013766	CG	3	6	22290	22295	0 %	0 %	50 %	50 %	284800278
32	NC_013766	TG	3	6	22435	22440	0 %	50 %	50 %	0 %	284800278
33	NC_013766	TG	3	6	22593	22598	0 %	50 %	50 %	0 %	284800278
34	NC_013766	CA	3	6	23474	23479	50 %	0 %	0 %	50 %	284800279
35	NC_013766	TC	3	6	25085	25090	0 %	50 %	0 %	50 %	284800279
36	NC_013766	AT	3	6	27188	27193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013766	GA	3	6	28655	28660	50 %	0 %	50 %	0 %	284800284
38	NC_013766	TA	3	6	29388	29393	50 %	50 %	0 %	0 %	284800286
39	NC_013766	AT	3	6	30038	30043	50 %	50 %	0 %	0 %	284800286
40	NC_013766	TG	3	6	30682	30687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013766	GA	3	6	30831	30836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013766	CT	3	6	30921	30926	0 %	50 %	0 %	50 %	284800287
43	NC_013766	AC	3	6	31543	31548	50 %	0 %	0 %	50 %	284800287
44	NC_013766	CG	3	6	32470	32475	0 %	0 %	50 %	50 %	284800288
45	NC_013766	CG	3	6	32543	32548	0 %	0 %	50 %	50 %	284800288
46	NC_013766	GC	3	6	33299	33304	0 %	0 %	50 %	50 %	284800289
47	NC_013766	TA	3	6	33396	33401	50 %	50 %	0 %	0 %	284800289
48	NC_013766	TA	3	6	33819	33824	50 %	50 %	0 %	0 %	284800289
49	NC_013766	GC	3	6	35471	35476	0 %	0 %	50 %	50 %	284800291
50	NC_013766	GA	3	6	35591	35596	50 %	0 %	50 %	0 %	284800291
51	NC_013766	AT	3	6	36387	36392	50 %	50 %	0 %	0 %	284800291
52	NC_013766	TG	3	6	36397	36402	0 %	50 %	50 %	0 %	284800291
53	NC_013766	TG	3	6	36404	36409	0 %	50 %	50 %	0 %	284800291
54	NC_013766	GC	4	8	36816	36823	0 %	0 %	50 %	50 %	284800291
55	NC_013766	GT	3	6	37217	37222	0 %	50 %	50 %	0 %	284800291
56	NC_013766	GA	3	6	37894	37899	50 %	0 %	50 %	0 %	284800292
57	NC_013766	GT	3	6	38133	38138	0 %	50 %	50 %	0 %	284800292
58	NC_013766	AT	3	6	39002	39007	50 %	50 %	0 %	0 %	284800292
59	NC_013766	AG	3	6	39637	39642	50 %	0 %	50 %	0 %	284800292
60	NC_013766	GT	3	6	39710	39715	0 %	50 %	50 %	0 %	284800292
61	NC_013766	GA	3	6	41316	41321	50 %	0 %	50 %	0 %	284800293
62	NC_013766	AT	3	6	41808	41813	50 %	50 %	0 %	0 %	284800294
63	NC_013766	TG	3	6	42259	42264	0 %	50 %	50 %	0 %	284800294
64	NC_013766	GC	3	6	42308	42313	0 %	0 %	50 %	50 %	284800294
65	NC_013766	TG	3	6	44890	44895	0 %	50 %	50 %	0 %	284800296
66	NC_013766	CA	3	6	46262	46267	50 %	0 %	0 %	50 %	284800298
67	NC_013766	AG	3	6	46689	46694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013766	TA	3	6	47000	47005	50 %	50 %	0 %	0 %	284800299
69	NC_013766	AG	3	6	47448	47453	50 %	0 %	50 %	0 %	284800300
70	NC_013766	AT	3	6	47734	47739	50 %	50 %	0 %	0 %	284800300
71	NC_013766	CG	3	6	49625	49630	0 %	0 %	50 %	50 %	284800302
72	NC_013766	AC	3	6	50950	50955	50 %	0 %	0 %	50 %	284800303
73	NC_013766	CG	3	6	51294	51299	0 %	0 %	50 %	50 %	284800303
74	NC_013766	AT	3	6	52449	52454	50 %	50 %	0 %	0 %	284800303
75	NC_013766	TG	3	6	52663	52668	0 %	50 %	50 %	0 %	284800304
76	NC_013766	GA	3	6	53663	53668	50 %	0 %	50 %	0 %	284800306
77	NC_013766	TA	3	6	53878	53883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013766	TA	4	8	54720	54727	50 %	50 %	0 %	0 %	284800308
79	NC_013766	AT	3	6	56254	56259	50 %	50 %	0 %	0 %	284800310
80	NC_013766	AC	3	6	58182	58187	50 %	0 %	0 %	50 %	284800313
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82	NC_013766	CA	3	6	59531	59536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013766	GT	3	6	61153	61158	0 %	50 %	50 %	0 %	284800316
84	NC_013766	AG	3	6	61807	61812	50 %	0 %	50 %	0 %	284800317
85	NC_013766	AT	3	6	61855	61860	50 %	50 %	0 %	0 %	284800317
86	NC_013766	CA	3	6	61889	61894	50 %	0 %	0 %	50 %	284800317
87	NC_013766	TG	3	6	62258	62263	0 %	50 %	50 %	0 %	284800318
88	NC_013766	TG	3	6	62348	62353	0 %	50 %	50 %	0 %	284800318
89	NC_013766	TA	3	6	65007	65012	50 %	50 %	0 %	0 %	284800321
90	NC_013766	AT	4	8	65937	65944	50 %	50 %	0 %	0 %	284800322
91	NC_013766	TC	3	6	66642	66647	0 %	50 %	0 %	50 %	284800323
92	NC_013766	AT	3	6	67541	67546	50 %	50 %	0 %	0 %	284800324
93	NC_013766	AG	3	6	68341	68346	50 %	0 %	50 %	0 %	284800326
94	NC_013766	TA	3	6	69888	69893	50 %	50 %	0 %	0 %	284800327
95	NC_013766	AT	3	6	70412	70417	50 %	50 %	0 %	0 %	284800327
96	NC_013766	TA	4	8	72152	72159	50 %	50 %	0 %	0 %	284800328
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98	NC_013766	TC	3	6	72232	72237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013766	TA	3	6	72310	72315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013766	AT	3	6	74892	74897	50 %	50 %	0 %	0 %	284800330
101	NC_013766	TG	3	6	75341	75346	0 %	50 %	50 %	0 %	284800330
102	NC_013766	AG	3	6	75937	75942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013766	TA	3	6	77104	77109	50 %	50 %	0 %	0 %	284800331
104	NC_013766	GC	3	6	77267	77272	0 %	0 %	50 %	50 %	284800331
105	NC_013766	GC	3	6	78235	78240	0 %	0 %	50 %	50 %	284800333
106	NC_013766	AG	3	6	78413	78418	50 %	0 %	50 %	0 %	284800333
107	NC_013766	AG	3	6	78857	78862	50 %	0 %	50 %	0 %	284800333
108	NC_013766	TA	4	8	80433	80440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013766	GT	3	6	81576	81581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013766	AT	4	8	81704	81711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013766	AG	3	6	81765	81770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013766	AT	3	6	83902	83907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013766	AT	3	6	83925	83930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013766	AT	3	6	84187	84192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013766	TG	3	6	84666	84671	0 %	50 %	50 %	0 %	284800339
116	NC_013766	CA	4	8	85226	85233	50 %	0 %	0 %	50 %	284800340
117	NC_013766	CG	3	6	86153	86158	0 %	0 %	50 %	50 %	284800341
118	NC_013766	GT	3	6	86674	86679	0 %	50 %	50 %	0 %	284800341
119	NC_013766	TA	3	6	86782	86787	50 %	50 %	0 %	0 %	284800341
120	NC_013766	CA	3	6	87645	87650	50 %	0 %	0 %	50 %	284800342
121	NC_013766	TA	3	6	88592	88597	50 %	50 %	0 %	0 %	284800342
122	NC_013766	GC	3	6	90635	90640	0 %	0 %	50 %	50 %	284800343
123	NC_013766	AT	3	6	91135	91140	50 %	50 %	0 %	0 %	284800343
124	NC_013766	TA	3	6	91456	91461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013766	AG	3	6	91665	91670	50 %	0 %	50 %	0 %	284800344
126	NC_013766	AT	3	6	91765	91770	50 %	50 %	0 %	0 %	284800344
127	NC_013766	AT	3	6	92930	92935	50 %	50 %	0 %	0 %	284800345
128	NC_013766	TA	3	6	93280	93285	50 %	50 %	0 %	0 %	284800345
129	NC_013766	GC	3	6	94050	94055	0 %	0 %	50 %	50 %	284800346
130	NC_013766	TA	3	6	95148	95153	50 %	50 %	0 %	0 %	284800348
131	NC_013766	AG	4	8	98049	98056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013766	GC	3	6	98307	98312	0 %	0 %	50 %	50 %	284800352
133	NC_013766	GA	3	6	99879	99884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013766	AC	3	6	101430	101435	50 %	0 %	0 %	50 %	284800353
135	NC_013766	TA	3	6	102475	102480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013766	GC	3	6	102709	102714	0 %	0 %	50 %	50 %	284800356
137	NC_013766	TA	3	6	103488	103493	50 %	50 %	0 %	0 %	284800356
138	NC_013766	TA	3	6	104478	104483	50 %	50 %	0 %	0 %	284800357
139	NC_013766	AT	3	6	105277	105282	50 %	50 %	0 %	0 %	284800357
140	NC_013766	AT	3	6	105763	105768	50 %	50 %	0 %	0 %	284800357
141	NC_013766	TG	3	6	105798	105803	0 %	50 %	50 %	0 %	284800357
142	NC_013766	AT	3	6	105805	105810	50 %	50 %	0 %	0 %	284800357
143	NC_013766	AG	3	6	105926	105931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013766	AT	3	6	107133	107138	50 %	50 %	0 %	0 %	284800358
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