MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 69183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013766	ATT	2	6	180443	180448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800427
4002	NC_013766	ATT	2	6	180485	180490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800427
4003	NC_013766	ATGT	2	8	180521	180528	25 %	50 %	25 %	0 %	284800427
4004	NC_013766	TTA	2	6	180548	180553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800427
4005	NC_013766	GAT	2	6	180670	180675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800427
4006	NC_013766	TTG	2	6	180759	180764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800427
4007	NC_013766	TGT	2	6	180774	180779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800427
4008	NC_013766	TTTA	2	8	180784	180791	25 %	75 %	0 %	0 %	284800427
4009	NC_013766	AATT	2	8	180807	180814	50 %	50 %	0 %	0 %	284800427
4010	NC_013766	TGA	2	6	180828	180833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800427
4011	NC_013766	TTC	2	6	180844	180849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800427
4012	NC_013766	AGTT	2	8	180871	180878	25 %	50 %	25 %	0 %	284800427
4013	NC_013766	CATT	2	8	180948	180955	25 %	50 %	0 %	25 %	284800427
4014	NC_013766	TGG	2	6	180961	180966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800427
4015	NC_013766	GTGCT	2	10	180969	180978	0 %	40 %	40 %	20 %	284800427
4016	NC_013766	ATT	2	6	181013	181018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800427
4017	NC_013766	AGA	2	6	181039	181044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800427
4018	NC_013766	GTC	2	6	181052	181057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_013766	AAT	2	6	181060	181065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013766	AT	3	6	181114	181119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013766	GAAAC	2	10	181185	181194	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4022	NC_013766	GA	3	6	181205	181210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013766	ATGAA	2	10	181211	181220	60 %	20 %	20 %	0 %	284800428
4024	NC_013766	ATTTTT	2	12	181224	181235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800428
4025	NC_013766	TAT	2	6	181251	181256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800428
4026	NC_013766	AAG	2	6	181319	181324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800428
4027	NC_013766	AGAA	2	8	181367	181374	75 %	0 %	25 %	0 %	284800428
4028	NC_013766	GTG	2	6	181499	181504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800428
4029	NC_013766	TA	3	6	181505	181510	50 %	50 %	0 %	0 %	284800428
4030	NC_013766	GGTAAA	2	12	181546	181557	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800428
4031	NC_013766	A	6	6	181612	181617	100 %	0 %	0 %	0 %	284800428
4032	NC_013766	TAAA	2	8	181743	181750	75 %	25 %	0 %	0 %	284800428
4033	NC_013766	TA	3	6	181782	181787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013766	A	7	7	181865	181871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_013766	TA	3	6	181984	181989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_013766	AAG	2	6	181995	182000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013766	ATTC	2	8	182029	182036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_013766	AATA	2	8	182037	182044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_013766	CTAA	2	8	182079	182086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_013766	A	8	8	182105	182112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013766	AGA	2	6	182158	182163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013766	A	7	7	182163	182169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013766	ACA	2	6	182182	182187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_013766	T	6	6	182193	182198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_013766	TTAT	2	8	182204	182211	25 %	75 %	0 %	0 %	284800429
4046	NC_013766	CAA	2	6	182224	182229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800429
4047	NC_013766	TTTC	2	8	182230	182237	0 %	75 %	0 %	25 %	284800429
4048	NC_013766	CATT	2	8	182260	182267	25 %	50 %	0 %	25 %	284800429
4049	NC_013766	T	6	6	182308	182313	0 %	100 %	0 %	0 %	284800429
4050	NC_013766	ATG	2	6	182351	182356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800429
4051	NC_013766	AGT	2	6	182364	182369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800429
4052	NC_013766	T	6	6	182417	182422	0 %	100 %	0 %	0 %	284800429
4053	NC_013766	ACC	2	6	182462	182467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284800429
4054	NC_013766	ATA	2	6	182484	182489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800429
4055	NC_013766	ATT	2	6	182542	182547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800430
4056	NC_013766	CAG	2	6	182548	182553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800430
4057	NC_013766	CAG	2	6	182563	182568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800430
4058	NC_013766	CTT	2	6	182575	182580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800430
4059	NC_013766	ACG	2	6	182585	182590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800430
4060	NC_013766	GGAA	2	8	182622	182629	50 %	0 %	50 %	0 %	284800430
4061	NC_013766	GATA	2	8	182636	182643	50 %	25 %	25 %	0 %	284800430
4062	NC_013766	TGG	2	6	182711	182716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800430
4063	NC_013766	CCAA	2	8	182753	182760	50 %	0 %	0 %	50 %	284800430
4064	NC_013766	TACAAG	2	12	182786	182797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800430
4065	NC_013766	CAT	2	6	182855	182860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800430
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4067	NC_013766	AAT	2	6	183159	183164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800430
4068	NC_013766	GCT	2	6	183168	183173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800430
4069	NC_013766	AGAA	2	8	183220	183227	75 %	0 %	25 %	0 %	284800430
4070	NC_013766	GCT	2	6	183249	183254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800430
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4073	NC_013766	ACC	2	6	183452	183457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284800430
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4075	NC_013766	ACT	2	6	183522	183527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800430
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4079	NC_013766	GTT	2	6	183701	183706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800430
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4081	NC_013766	CTA	2	6	183772	183777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800430
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4083	NC_013766	CATT	2	8	183844	183851	25 %	50 %	0 %	25 %	284800430
4084	NC_013766	T	6	6	183850	183855	0 %	100 %	0 %	0 %	284800430
4085	NC_013766	T	6	6	183863	183868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013766	TTA	2	6	183924	183929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_013766	T	6	6	183944	183949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_013766	TCA	2	6	184030	184035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800431
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4091	NC_013766	TAA	2	6	184133	184138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800431
4092	NC_013766	GCT	2	6	184164	184169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800431
4093	NC_013766	GCT	2	6	184218	184223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800431
4094	NC_013766	CTG	2	6	184261	184266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800431
4095	NC_013766	ATT	2	6	184293	184298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_013766	TCC	2	6	184299	184304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_013766	TTAT	2	8	184326	184333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013766	AT	3	6	184332	184337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013766	T	6	6	184388	184393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013766	T	7	7	184408	184414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013766	GT	3	6	184415	184420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_013766	AC	3	6	184428	184433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_013766	TTG	2	6	184495	184500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013766	GTG	2	6	184510	184515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013766	GTT	2	6	184552	184557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013766	ATC	2	6	184573	184578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_013766	TTG	2	6	184588	184593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013766	TATT	2	8	184597	184604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013766	TGT	2	6	184610	184615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_013766	T	6	6	184659	184664	0 %	100 %	0 %	0 %	284800432
4111	NC_013766	TTG	2	6	184671	184676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800432
4112	NC_013766	TGA	2	6	184717	184722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800432
4113	NC_013766	GTGA	2	8	184791	184798	25 %	25 %	50 %	0 %	284800432
4114	NC_013766	TTTGTA	2	12	184857	184868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284800432
4115	NC_013766	CGG	2	6	184951	184956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800432
4116	NC_013766	CGG	2	6	185056	185061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800432
4117	NC_013766	GAA	2	6	185108	185113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800432
4118	NC_013766	ATTT	2	8	185143	185150	25 %	75 %	0 %	0 %	284800432
4119	NC_013766	TAC	2	6	185170	185175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800432
4120	NC_013766	CTT	2	6	185196	185201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800432
4121	NC_013766	GTG	2	6	185217	185222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800432
4122	NC_013766	ATT	2	6	185236	185241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800432
4123	NC_013766	CAG	2	6	185293	185298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800432
4124	NC_013766	GGC	3	9	185334	185342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800432
4125	NC_013766	TTG	2	6	185437	185442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800432
4126	NC_013766	CG	3	6	185481	185486	0 %	0 %	50 %	50 %	284800432
4127	NC_013766	GAT	3	9	185498	185506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800432
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4236	NC_013766	ATTT	2	8	190589	190596	25 %	75 %	0 %	0 %	284800435
4237	NC_013766	CCGTT	2	10	190599	190608	0 %	40 %	20 %	40 %	284800435
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4249	NC_013766	CTG	2	6	190990	190995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800435
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4251	NC_013766	CAT	2	6	191034	191039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800435
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4253	NC_013766	GAT	2	6	191119	191124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800435
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4255	NC_013766	AGA	2	6	191217	191222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800435
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4262	NC_013766	GGCTT	2	10	191540	191549	0 %	40 %	40 %	20 %	284800435
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4360	NC_013766	AAGA	2	8	196045	196052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_013766	CAG	3	9	202164	202172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4498	NC_013766	GCA	2	6	202199	202204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4499	NC_013766	TTC	2	6	202247	202252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4500	NC_013766	TTGATA	2	12	202269	202280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284800449

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