MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 69183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013766	TC	3	6	158528	158533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_013766	A	6	6	158535	158540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013766	TAA	2	6	158598	158603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013766	ACA	2	6	158638	158643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013766	TAA	2	6	158657	158662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013766	TAG	3	9	158666	158674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_013766	TGG	2	6	158689	158694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013766	GGT	2	6	158792	158797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013766	TCG	2	6	158809	158814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013766	TGA	2	6	158815	158820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013766	A	7	7	158840	158846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013766	ATT	2	6	158895	158900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013766	GCC	2	6	158909	158914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_013766	CT	3	6	158961	158966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_013766	A	7	7	158996	159002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013766	ATTA	2	8	159036	159043	50 %	50 %	0 %	0 %	284800405
3517	NC_013766	TTTTC	2	10	159051	159060	0 %	80 %	0 %	20 %	284800405
3518	NC_013766	TCT	2	6	159072	159077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800405
3519	NC_013766	TTC	2	6	159079	159084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800405
3520	NC_013766	ATC	2	6	159106	159111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800405
3521	NC_013766	T	6	6	159136	159141	0 %	100 %	0 %	0 %	284800405
3522	NC_013766	T	6	6	159155	159160	0 %	100 %	0 %	0 %	284800405
3523	NC_013766	CTTAT	2	10	159220	159229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3524	NC_013766	CTTA	2	8	159288	159295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_013766	T	6	6	159301	159306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_013766	TG	3	6	159313	159318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013766	AAGA	2	8	159337	159344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013766	TA	3	6	159367	159372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013766	GAG	2	6	159451	159456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013766	GTTT	2	8	159498	159505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013766	TAAA	2	8	159604	159611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013766	A	6	6	159609	159614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013766	GGA	2	6	159623	159628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013766	AGC	2	6	159679	159684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800406
3535	NC_013766	CAA	2	6	159735	159740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800406
3536	NC_013766	T	6	6	159785	159790	0 %	100 %	0 %	0 %	284800406
3537	NC_013766	ACTG	2	8	159803	159810	25 %	25 %	25 %	25 %	284800406
3538	NC_013766	ATT	2	6	159896	159901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800406
3539	NC_013766	G	6	6	159959	159964	0 %	0 %	100 %	0 %	284800406
3540	NC_013766	TGC	2	6	159976	159981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800406
3541	NC_013766	ACTGTT	2	12	159998	160009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284800406
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3543	NC_013766	ATT	2	6	160199	160204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800406
3544	NC_013766	CCA	2	6	160226	160231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284800406
3545	NC_013766	GTAA	2	8	160235	160242	50 %	25 %	25 %	0 %	284800406
3546	NC_013766	ATT	2	6	160256	160261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800406
3547	NC_013766	TGT	2	6	160282	160287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800406
3548	NC_013766	TAT	2	6	160291	160296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800406
3549	NC_013766	TTC	2	6	160307	160312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800406
3550	NC_013766	TTA	2	6	160332	160337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800406
3551	NC_013766	TAT	2	6	160368	160373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800406
3552	NC_013766	ACT	2	6	160423	160428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800406
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3554	NC_013766	GTAT	2	8	160570	160577	25 %	50 %	25 %	0 %	284800406
3555	NC_013766	AATGGT	2	12	160765	160776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800406
3556	NC_013766	CAA	2	6	160794	160799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800406
3557	NC_013766	AGT	2	6	160831	160836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800406
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3559	NC_013766	CTT	2	6	160864	160869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800406
3560	NC_013766	GTC	2	6	160919	160924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800406
3561	NC_013766	TTA	2	6	160950	160955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800406
3562	NC_013766	AGA	3	9	160978	160986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800406
3563	NC_013766	ATA	2	6	161003	161008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013766	AAG	2	6	161087	161092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013766	AGG	2	6	161119	161124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013766	T	7	7	161125	161131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013766	ATT	2	6	161137	161142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800407
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3569	NC_013766	A	7	7	161215	161221	100 %	0 %	0 %	0 %	284800407
3570	NC_013766	GAA	2	6	161269	161274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800407
3571	NC_013766	GCA	2	6	161278	161283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800407
3572	NC_013766	TATT	2	8	161377	161384	25 %	75 %	0 %	0 %	284800408
3573	NC_013766	TTA	4	12	161398	161409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800408
3574	NC_013766	CTT	2	6	161419	161424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800408
3575	NC_013766	GATGG	2	10	161433	161442	20 %	20 %	60 %	0 %	284800408
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3577	NC_013766	AAGA	2	8	161523	161530	75 %	0 %	25 %	0 %	284800408
3578	NC_013766	CA	3	6	161566	161571	50 %	0 %	0 %	50 %	284800409
3579	NC_013766	TA	3	6	161577	161582	50 %	50 %	0 %	0 %	284800409
3580	NC_013766	ATG	2	6	161628	161633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800409
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3582	NC_013766	ACA	2	6	161720	161725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800409
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3584	NC_013766	ACG	3	9	161792	161800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800409
3585	NC_013766	TAAA	2	8	161874	161881	75 %	25 %	0 %	0 %	284800409
3586	NC_013766	AAT	2	6	161885	161890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800409
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3589	NC_013766	A	6	6	161924	161929	100 %	0 %	0 %	0 %	284800409
3590	NC_013766	TTA	2	6	161967	161972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800409
3591	NC_013766	AAGCAG	2	12	161981	161992	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800409
3592	NC_013766	GCT	2	6	162002	162007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800409
3593	NC_013766	T	7	7	162058	162064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013766	TGG	4	12	162086	162097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_013766	ATC	2	6	162191	162196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_013766	GAA	2	6	162217	162222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013766	TTC	2	6	162252	162257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_013766	TAA	2	6	162270	162275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013766	ACT	2	6	162277	162282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_013766	TGT	2	6	162363	162368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800410
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3602	NC_013766	GCG	2	6	162472	162477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800410
3603	NC_013766	AATG	2	8	162532	162539	50 %	25 %	25 %	0 %	284800410
3604	NC_013766	ACG	2	6	162556	162561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800410
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3608	NC_013766	TA	3	6	162677	162682	50 %	50 %	0 %	0 %	284800410
3609	NC_013766	CTA	2	6	162727	162732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800410
3610	NC_013766	GAA	2	6	162742	162747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800410
3611	NC_013766	CCG	2	6	162748	162753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284800410
3612	NC_013766	CAA	2	6	162776	162781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800410
3613	NC_013766	ATT	2	6	162808	162813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800410
3614	NC_013766	ATT	2	6	162859	162864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800410
3615	NC_013766	ATTT	2	8	162876	162883	25 %	75 %	0 %	0 %	284800410
3616	NC_013766	GAA	3	9	162886	162894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800410
3617	NC_013766	A	6	6	162893	162898	100 %	0 %	0 %	0 %	284800410
3618	NC_013766	TGA	2	6	162920	162925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800410
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3621	NC_013766	GGA	2	6	163014	163019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800410
3622	NC_013766	TTAC	2	8	163054	163061	25 %	50 %	0 %	25 %	284800410
3623	NC_013766	GCA	2	6	163075	163080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800410
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3625	NC_013766	TGA	3	9	163242	163250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800410
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