MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 69183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_013766	TTA	2	6	112649	112654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800362
2503	NC_013766	TTGT	2	8	112665	112672	0 %	75 %	25 %	0 %	284800362
2504	NC_013766	CTT	3	9	112689	112697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800362
2505	NC_013766	ACG	2	6	112720	112725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800362
2506	NC_013766	TTG	2	6	112792	112797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800362
2507	NC_013766	GAAC	2	8	112806	112813	50 %	0 %	25 %	25 %	284800362
2508	NC_013766	GAA	2	6	112876	112881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800362
2509	NC_013766	CAT	2	6	112918	112923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800362
2510	NC_013766	TTGTT	2	10	112979	112988	0 %	80 %	20 %	0 %	284800362
2511	NC_013766	TCT	3	9	113009	113017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800362
2512	NC_013766	T	6	6	113037	113042	0 %	100 %	0 %	0 %	284800362
2513	NC_013766	T	6	6	113052	113057	0 %	100 %	0 %	0 %	284800362
2514	NC_013766	TTG	2	6	113092	113097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800362
2515	NC_013766	AAT	2	6	113125	113130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800362
2516	NC_013766	AAT	3	9	113140	113148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800362
2517	NC_013766	TTG	2	6	113194	113199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800362
2518	NC_013766	CAT	2	6	113203	113208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800362
2519	NC_013766	GAT	2	6	113209	113214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800362
2520	NC_013766	ATC	2	6	113281	113286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800362
2521	NC_013766	CAT	2	6	113319	113324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800362
2522	NC_013766	GAA	2	6	113335	113340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800362
2523	NC_013766	GCA	2	6	113441	113446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800362
2524	NC_013766	TCA	2	6	113504	113509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800362
2525	NC_013766	ATTAA	2	10	113522	113531	60 %	40 %	0 %	0 %	284800362
2526	NC_013766	AT	3	6	113567	113572	50 %	50 %	0 %	0 %	284800362
2527	NC_013766	TTTG	2	8	113676	113683	0 %	75 %	25 %	0 %	284800362
2528	NC_013766	CCT	2	6	113705	113710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284800363
2529	NC_013766	TTTC	2	8	113750	113757	0 %	75 %	0 %	25 %	284800363
2530	NC_013766	AGA	2	6	113832	113837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800363
2531	NC_013766	T	6	6	113840	113845	0 %	100 %	0 %	0 %	284800363
2532	NC_013766	AAT	2	6	113850	113855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800363
2533	NC_013766	GTA	2	6	113860	113865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800363
2534	NC_013766	TCA	2	6	113869	113874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800363
2535	NC_013766	CTT	2	6	113891	113896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800363
2536	NC_013766	GTT	2	6	113993	113998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800363
2537	NC_013766	GTT	2	6	114015	114020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800363
2538	NC_013766	TTC	2	6	114108	114113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800363
2539	NC_013766	T	6	6	114126	114131	0 %	100 %	0 %	0 %	284800363
2540	NC_013766	CG	3	6	114174	114179	0 %	0 %	50 %	50 %	284800363
2541	NC_013766	TGC	2	6	114200	114205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800363
2542	NC_013766	TTG	2	6	114217	114222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800363
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2544	NC_013766	ATA	2	6	114247	114252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800363
2545	NC_013766	CAA	2	6	114326	114331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800363
2546	NC_013766	TGAA	2	8	114359	114366	50 %	25 %	25 %	0 %	284800363
2547	NC_013766	CGT	2	6	114395	114400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800363
2548	NC_013766	GTAA	2	8	114465	114472	50 %	25 %	25 %	0 %	284800363
2549	NC_013766	CAT	3	9	114534	114542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800363
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2551	NC_013766	ATA	2	6	114556	114561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800363
2552	NC_013766	CAT	2	6	114567	114572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800363
2553	NC_013766	AGT	2	6	114584	114589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800363
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2555	NC_013766	GAT	2	6	114726	114731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800363
2556	NC_013766	TG	3	6	114732	114737	0 %	50 %	50 %	0 %	284800363
2557	NC_013766	TCT	2	6	114784	114789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800363
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2559	NC_013766	ACA	2	6	114907	114912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800363
2560	NC_013766	AAC	2	6	114918	114923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800363
2561	NC_013766	AAC	2	6	114927	114932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800363
2562	NC_013766	AAT	2	6	114939	114944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800363
2563	NC_013766	CCA	2	6	114948	114953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284800363
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2565	NC_013766	GTTT	2	8	115065	115072	0 %	75 %	25 %	0 %	284800363
2566	NC_013766	AAC	2	6	115077	115082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800363
2567	NC_013766	TGAA	2	8	115115	115122	50 %	25 %	25 %	0 %	284800363
2568	NC_013766	GATG	2	8	115254	115261	25 %	25 %	50 %	0 %	284800363
2569	NC_013766	ATG	2	6	115285	115290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800363
2570	NC_013766	ACT	2	6	115345	115350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800363
2571	NC_013766	T	7	7	115386	115392	0 %	100 %	0 %	0 %	284800363
2572	NC_013766	TCC	2	6	115421	115426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_013766	TTCTAC	2	12	115588	115599	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284800364
2574	NC_013766	ATTA	2	8	115615	115622	50 %	50 %	0 %	0 %	284800364
2575	NC_013766	CA	3	6	115625	115630	50 %	0 %	0 %	50 %	284800364
2576	NC_013766	T	7	7	115651	115657	0 %	100 %	0 %	0 %	284800364
2577	NC_013766	T	6	6	115682	115687	0 %	100 %	0 %	0 %	284800364
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2581	NC_013766	T	6	6	115841	115846	0 %	100 %	0 %	0 %	284800364
2582	NC_013766	AAAT	2	8	115888	115895	75 %	25 %	0 %	0 %	284800364
2583	NC_013766	TAA	2	6	115993	115998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800364
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2587	NC_013766	TTGT	2	8	116100	116107	0 %	75 %	25 %	0 %	284800364
2588	NC_013766	TTCGG	2	10	116125	116134	0 %	40 %	40 %	20 %	284800364
2589	NC_013766	TCG	2	6	116181	116186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800364
2590	NC_013766	AGC	2	6	116233	116238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800364
2591	NC_013766	CCA	2	6	116261	116266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284800364
2592	NC_013766	GAG	2	6	116376	116381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800364
2593	NC_013766	TCT	2	6	116384	116389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800364
2594	NC_013766	AAT	2	6	116398	116403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800364
2595	NC_013766	GC	3	6	116424	116429	0 %	0 %	50 %	50 %	284800364
2596	NC_013766	AGG	2	6	116485	116490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800364
2597	NC_013766	ATC	2	6	116585	116590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800364
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2599	NC_013766	T	6	6	116651	116656	0 %	100 %	0 %	0 %	284800364
2600	NC_013766	CGA	2	6	116699	116704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800364
2601	NC_013766	AGA	2	6	116732	116737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800364
2602	NC_013766	TTCC	2	8	116740	116747	0 %	50 %	0 %	50 %	284800364
2603	NC_013766	A	6	6	116752	116757	100 %	0 %	0 %	0 %	284800364
2604	NC_013766	TTG	2	6	116793	116798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800364
2605	NC_013766	CTG	2	6	116830	116835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800364
2606	NC_013766	GAA	2	6	116858	116863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800364
2607	NC_013766	GTT	2	6	116866	116871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800364
2608	NC_013766	CAG	2	6	116922	116927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800364
2609	NC_013766	AG	3	6	116992	116997	50 %	0 %	50 %	0 %	284800364
2610	NC_013766	CCAAA	2	10	117050	117059	60 %	0 %	0 %	40 %	284800364
2611	NC_013766	T	7	7	117082	117088	0 %	100 %	0 %	0 %	284800364
2612	NC_013766	GAA	2	6	117189	117194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800364
2613	NC_013766	TAA	2	6	117271	117276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800364
2614	NC_013766	CGG	2	6	117422	117427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800365
2615	NC_013766	TGT	2	6	117450	117455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800365
2616	NC_013766	CAAA	2	8	117512	117519	75 %	0 %	0 %	25 %	284800365
2617	NC_013766	CAC	2	6	117576	117581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284800365
2618	NC_013766	A	6	6	117592	117597	100 %	0 %	0 %	0 %	284800365
2619	NC_013766	TGA	2	6	117610	117615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800365
2620	NC_013766	TAG	2	6	117654	117659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800365
2621	NC_013766	CCTGGT	2	12	117691	117702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800365
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2623	NC_013766	A	6	6	117793	117798	100 %	0 %	0 %	0 %	284800365
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2996	NC_013766	AAT	2	6	135036	135041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800381
2997	NC_013766	AGT	2	6	135049	135054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800381
2998	NC_013766	AAT	2	6	135078	135083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800381
2999	NC_013766	GAA	2	6	135144	135149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800381
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