MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 69183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013766	AAT	2	6	247729	247734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800504
5502	NC_013766	TA	3	6	247755	247760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_013766	TAA	2	6	247813	247818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_013766	AGG	2	6	247822	247827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_013766	TCG	2	6	247887	247892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800505
5506	NC_013766	AAACAA	2	12	247933	247944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284800505
5507	NC_013766	AGG	2	6	247952	247957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_013766	AAAC	2	8	248047	248054	75 %	0 %	0 %	25 %	284800506
5509	NC_013766	AAG	2	6	248060	248065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800506
5510	NC_013766	TACTCG	2	12	248094	248105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284800506
5511	NC_013766	GAA	2	6	248116	248121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800506
5512	NC_013766	TCG	2	6	248175	248180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800506
5513	NC_013766	CGT	2	6	248242	248247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800506
5514	NC_013766	A	6	6	248274	248279	100 %	0 %	0 %	0 %	284800506
5515	NC_013766	ATA	2	6	248331	248336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800506
5516	NC_013766	AGG	2	6	248341	248346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_013766	TAGT	2	8	248347	248354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013766	CA	3	6	248418	248423	50 %	0 %	0 %	50 %	284800507
5519	NC_013766	TAA	2	6	248437	248442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800507
5520	NC_013766	AC	3	6	248463	248468	50 %	0 %	0 %	50 %	284800507
5521	NC_013766	GCA	2	6	248564	248569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800507
5522	NC_013766	AGC	2	6	248659	248664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800507
5523	NC_013766	GTC	2	6	248718	248723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800507
5524	NC_013766	CGT	2	6	248732	248737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800507
5525	NC_013766	TAG	2	6	248768	248773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_013766	AG	3	6	248800	248805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013766	AGG	2	6	248840	248845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_013766	GAT	2	6	248901	248906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800508
5529	NC_013766	TGT	2	6	248924	248929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800508
5530	NC_013766	CGT	2	6	248976	248981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800508
5531	NC_013766	TAT	2	6	248986	248991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800508
5532	NC_013766	GCA	2	6	249006	249011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800508
5533	NC_013766	GTA	2	6	249066	249071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800508
5534	NC_013766	AAC	2	6	249080	249085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800508
5535	NC_013766	A	6	6	249102	249107	100 %	0 %	0 %	0 %	284800508
5536	NC_013766	TGA	2	6	249128	249133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800508
5537	NC_013766	A	6	6	249136	249141	100 %	0 %	0 %	0 %	284800508
5538	NC_013766	GTA	2	6	249171	249176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800508
5539	NC_013766	ATTA	2	8	249189	249196	50 %	50 %	0 %	0 %	284800508
5540	NC_013766	TCGTGG	2	12	249284	249295	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284800508
5541	NC_013766	AC	3	6	249298	249303	50 %	0 %	0 %	50 %	284800508
5542	NC_013766	CTG	2	6	249304	249309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800508
5543	NC_013766	T	6	6	249361	249366	0 %	100 %	0 %	0 %	284800508
5544	NC_013766	AGA	2	6	249473	249478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800508
5545	NC_013766	TTCT	2	8	249502	249509	0 %	75 %	0 %	25 %	284800508
5546	NC_013766	TTAAC	2	10	249529	249538	40 %	40 %	0 %	20 %	284800508
5547	NC_013766	AGA	2	6	249575	249580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800508
5548	NC_013766	GAA	2	6	249615	249620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800508
5549	NC_013766	GTTC	2	8	249633	249640	0 %	50 %	25 %	25 %	284800508
5550	NC_013766	TACAG	2	10	249671	249680	40 %	20 %	20 %	20 %	284800508
5551	NC_013766	ATG	2	6	249708	249713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800508
5552	NC_013766	AGG	2	6	249804	249809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_013766	TAC	2	6	249863	249868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800509
5554	NC_013766	ACA	2	6	249910	249915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800509
5555	NC_013766	GTT	2	6	249943	249948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800509
5556	NC_013766	A	6	6	249970	249975	100 %	0 %	0 %	0 %	284800509
5557	NC_013766	TCG	2	6	249990	249995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800509
5558	NC_013766	AGC	2	6	249999	250004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800509
5559	NC_013766	AGT	2	6	250032	250037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800509
5560	NC_013766	GAA	2	6	250074	250079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800509
5561	NC_013766	TGA	2	6	250113	250118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800509
5562	NC_013766	GGT	2	6	250147	250152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800509
5563	NC_013766	A	6	6	250168	250173	100 %	0 %	0 %	0 %	284800509
5564	NC_013766	TTA	2	6	250205	250210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800509
5565	NC_013766	TAA	3	9	250222	250230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800509
5566	NC_013766	T	7	7	250331	250337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_013766	AGG	2	6	250419	250424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_013766	ACT	2	6	250485	250490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800510
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5570	NC_013766	GA	3	6	250565	250570	50 %	0 %	50 %	0 %	284800510
5571	NC_013766	TTTA	2	8	250575	250582	25 %	75 %	0 %	0 %	284800510
5572	NC_013766	GAAA	2	8	250602	250609	75 %	0 %	25 %	0 %	284800510
5573	NC_013766	A	6	6	250630	250635	100 %	0 %	0 %	0 %	284800510
5574	NC_013766	TGA	2	6	250686	250691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800510
5575	NC_013766	ATG	2	6	250706	250711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800510
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5580	NC_013766	TGGGG	2	10	250876	250885	0 %	20 %	80 %	0 %	284800510
5581	NC_013766	TTCA	2	8	250888	250895	25 %	50 %	0 %	25 %	284800510
5582	NC_013766	TG	3	6	250921	250926	0 %	50 %	50 %	0 %	284800510
5583	NC_013766	GAA	2	6	250987	250992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800510
5584	NC_013766	GATC	2	8	251034	251041	25 %	25 %	25 %	25 %	284800510
5585	NC_013766	GAC	2	6	251118	251123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800510
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5588	NC_013766	GAAA	2	8	251292	251299	75 %	0 %	25 %	0 %	284800510
5589	NC_013766	ATA	2	6	251344	251349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800510
5590	NC_013766	A	7	7	251434	251440	100 %	0 %	0 %	0 %	284800510
5591	NC_013766	GCA	2	6	251504	251509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800510
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5593	NC_013766	GTAA	2	8	251710	251717	50 %	25 %	25 %	0 %	284800511
5594	NC_013766	T	6	6	251738	251743	0 %	100 %	0 %	0 %	284800511
5595	NC_013766	GAT	2	6	251799	251804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800511
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5598	NC_013766	TTG	2	6	251963	251968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800511
5599	NC_013766	AGT	2	6	251995	252000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800511
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5603	NC_013766	GAATAT	2	12	252074	252085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284800511
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5605	NC_013766	TAA	2	6	252144	252149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800511
5606	NC_013766	ATC	2	6	252150	252155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800511
5607	NC_013766	T	6	6	252212	252217	0 %	100 %	0 %	0 %	284800511
5608	NC_013766	TAA	2	6	252231	252236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800511
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5610	NC_013766	TTTTTA	2	12	252356	252367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800511
5611	NC_013766	TTTCA	2	10	252450	252459	20 %	60 %	0 %	20 %	284800511
5612	NC_013766	T	6	6	252582	252587	0 %	100 %	0 %	0 %	284800512
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5615	NC_013766	AATA	2	8	252789	252796	75 %	25 %	0 %	0 %	284800512
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5620	NC_013766	ATA	2	6	252977	252982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800512
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