MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 69183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_013766	A	6	6	224934	224939	100 %	0 %	0 %	0 %	284800471
5003	NC_013766	AAC	2	6	224972	224977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800471
5004	NC_013766	AGA	2	6	225002	225007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800471
5005	NC_013766	ATT	2	6	225040	225045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800471
5006	NC_013766	TGC	2	6	225056	225061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800471
5007	NC_013766	CAA	2	6	225100	225105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800471
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5009	NC_013766	ATA	2	6	225157	225162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800471
5010	NC_013766	AGA	2	6	225167	225172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800471
5011	NC_013766	ATGG	2	8	225240	225247	25 %	25 %	50 %	0 %	284800471
5012	NC_013766	TGA	2	6	225281	225286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800471
5013	NC_013766	CAA	2	6	225294	225299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800471
5014	NC_013766	AT	3	6	225415	225420	50 %	50 %	0 %	0 %	284800471
5015	NC_013766	AGC	2	6	225437	225442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800471
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5017	NC_013766	T	6	6	225525	225530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013766	ATT	2	6	225531	225536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800472
5019	NC_013766	ATA	2	6	225548	225553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800472
5020	NC_013766	GAA	2	6	225668	225673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800472
5021	NC_013766	T	6	6	225706	225711	0 %	100 %	0 %	0 %	284800472
5022	NC_013766	CAT	2	6	225761	225766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800472
5023	NC_013766	TAT	2	6	225784	225789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800472
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5025	NC_013766	ATCA	2	8	226067	226074	50 %	25 %	0 %	25 %	284800472
5026	NC_013766	TTG	2	6	226076	226081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800472
5027	NC_013766	TAAT	2	8	226086	226093	50 %	50 %	0 %	0 %	284800472
5028	NC_013766	CAT	2	6	226114	226119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800472
5029	NC_013766	ATG	2	6	226136	226141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800472
5030	NC_013766	ACT	2	6	226184	226189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800472
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5037	NC_013766	T	6	6	226517	226522	0 %	100 %	0 %	0 %	284800472
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5039	NC_013766	T	6	6	226543	226548	0 %	100 %	0 %	0 %	284800472
5040	NC_013766	GTT	2	6	226553	226558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800472
5041	NC_013766	CGC	2	6	226567	226572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284800472
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5043	NC_013766	GTCT	2	8	226586	226593	0 %	50 %	25 %	25 %	284800472
5044	NC_013766	A	6	6	226614	226619	100 %	0 %	0 %	0 %	284800472
5045	NC_013766	CGT	2	6	226730	226735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800472
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5047	NC_013766	A	6	6	226853	226858	100 %	0 %	0 %	0 %	284800472
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5050	NC_013766	T	7	7	227059	227065	0 %	100 %	0 %	0 %	284800473
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5053	NC_013766	AATA	2	8	227214	227221	75 %	25 %	0 %	0 %	284800473
5054	NC_013766	CGT	2	6	227286	227291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800473
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5058	NC_013766	AAT	2	6	227399	227404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800473
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5062	NC_013766	GAAT	2	8	227624	227631	50 %	25 %	25 %	0 %	284800473
5063	NC_013766	ATC	2	6	227659	227664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800473
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5070	NC_013766	T	6	6	227948	227953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_013766	TGC	2	6	227968	227973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800474
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5077	NC_013766	TAACGC	2	12	228168	228179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284800474
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5084	NC_013766	T	6	6	228491	228496	0 %	100 %	0 %	0 %	284800474
5085	NC_013766	CTAT	2	8	228514	228521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5090	NC_013766	AGTG	2	8	228777	228784	25 %	25 %	50 %	0 %	284800475
5091	NC_013766	TAT	2	6	228803	228808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800475
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5093	NC_013766	T	7	7	228834	228840	0 %	100 %	0 %	0 %	284800475
5094	NC_013766	TAG	2	6	228845	228850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800475
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5096	NC_013766	ATA	4	12	228922	228933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800475
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5099	NC_013766	ATA	2	6	229029	229034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013766	CAA	2	6	229053	229058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_013766	ATA	2	6	229059	229064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_013766	CCT	2	6	229077	229082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_013766	TTTA	2	8	229118	229125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_013766	TAAC	2	8	229132	229139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5107	NC_013766	CCAA	2	8	229294	229301	50 %	0 %	0 %	50 %	284800476
5108	NC_013766	CTA	2	6	229371	229376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800476
5109	NC_013766	CAA	2	6	229401	229406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800476
5110	NC_013766	AACC	2	8	229475	229482	50 %	0 %	0 %	50 %	284800476
5111	NC_013766	AGT	2	6	229504	229509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800476
5112	NC_013766	GCA	2	6	229520	229525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800476
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5114	NC_013766	AGC	2	6	229567	229572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800476
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5116	NC_013766	TACT	2	8	229665	229672	25 %	50 %	0 %	25 %	284800476
5117	NC_013766	AACC	2	8	229724	229731	50 %	0 %	0 %	50 %	284800476
5118	NC_013766	GAA	2	6	229749	229754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800476
5119	NC_013766	GAA	2	6	229819	229824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800476
5120	NC_013766	ATA	2	6	229832	229837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800476
5121	NC_013766	GTA	2	6	229849	229854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800476
5122	NC_013766	GAA	2	6	229870	229875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800476
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5124	NC_013766	AACC	2	8	229913	229920	50 %	0 %	0 %	50 %	284800476
5125	NC_013766	ATGC	2	8	229927	229934	25 %	25 %	25 %	25 %	284800476
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5182	NC_013766	T	7	7	232482	232488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_013766	GTGGA	2	10	235237	235246	20 %	20 %	60 %	0 %	284800480
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5244	NC_013766	TCT	2	6	235576	235581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_013766	T	6	6	235614	235619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_013766	TAC	2	6	235635	235640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_013766	ATA	2	6	235654	235659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5493	NC_013766	ATC	2	6	247261	247266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5496	NC_013766	T	7	7	247425	247431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_013766	AAG	2	6	247495	247500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_013766	GTA	2	6	247548	247553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800504
5499	NC_013766	GCAT	2	8	247636	247643	25 %	25 %	25 %	25 %	284800504
5500	NC_013766	GAA	2	6	247708	247713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800504

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