MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 69183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013766	GCA	2	6	202304	202309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4502	NC_013766	TGG	2	6	202333	202338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800449
4503	NC_013766	TGG	2	6	202343	202348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800449
4504	NC_013766	CAT	2	6	202366	202371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800449
4505	NC_013766	CAGA	2	8	202398	202405	50 %	0 %	25 %	25 %	284800449
4506	NC_013766	AGA	2	6	202420	202425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800449
4507	NC_013766	CAG	2	6	202467	202472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4508	NC_013766	GGTT	2	8	202495	202502	0 %	50 %	50 %	0 %	284800449
4509	NC_013766	ATG	3	9	202589	202597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800449
4510	NC_013766	GCA	2	6	202805	202810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4511	NC_013766	GTA	2	6	202949	202954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800449
4512	NC_013766	TTC	2	6	202974	202979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4513	NC_013766	CTT	2	6	203018	203023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4514	NC_013766	ATG	2	6	203057	203062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800449
4515	NC_013766	CTT	2	6	203125	203130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4516	NC_013766	TC	3	6	203151	203156	0 %	50 %	0 %	50 %	284800449
4517	NC_013766	AGA	2	6	203198	203203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013766	AGC	2	6	203221	203226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800450
4519	NC_013766	AAT	2	6	203240	203245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800450
4520	NC_013766	TAA	2	6	203247	203252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800450
4521	NC_013766	TGA	2	6	203266	203271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800450
4522	NC_013766	CTG	2	6	203373	203378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800450
4523	NC_013766	ATT	2	6	203490	203495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800450
4524	NC_013766	TGG	2	6	203535	203540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800450
4525	NC_013766	TGT	2	6	203572	203577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800450
4526	NC_013766	CAA	2	6	203587	203592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800450
4527	NC_013766	GAT	2	6	203632	203637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800450
4528	NC_013766	CTT	2	6	203750	203755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800450
4529	NC_013766	A	6	6	203795	203800	100 %	0 %	0 %	0 %	284800450
4530	NC_013766	CG	3	6	203809	203814	0 %	0 %	50 %	50 %	284800450
4531	NC_013766	A	6	6	203845	203850	100 %	0 %	0 %	0 %	284800450
4532	NC_013766	GAA	2	6	203959	203964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800450
4533	NC_013766	A	6	6	203963	203968	100 %	0 %	0 %	0 %	284800450
4534	NC_013766	GAA	2	6	204017	204022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800450
4535	NC_013766	AAG	2	6	204189	204194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800450
4536	NC_013766	AG	3	6	204215	204220	50 %	0 %	50 %	0 %	284800450
4537	NC_013766	TGA	2	6	204237	204242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800450
4538	NC_013766	AGT	2	6	204278	204283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800451
4539	NC_013766	GAA	2	6	204327	204332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800451
4540	NC_013766	CAA	2	6	204427	204432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800451
4541	NC_013766	AAC	2	6	204527	204532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800451
4542	NC_013766	TATT	2	8	204554	204561	25 %	75 %	0 %	0 %	284800451
4543	NC_013766	TCG	2	6	204593	204598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800451
4544	NC_013766	GCAA	2	8	204611	204618	50 %	0 %	25 %	25 %	284800451
4545	NC_013766	AGC	3	9	204692	204700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800451
4546	NC_013766	A	6	6	204742	204747	100 %	0 %	0 %	0 %	284800451
4547	NC_013766	ATT	2	6	204800	204805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800451
4548	NC_013766	AGA	2	6	204926	204931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800451
4549	NC_013766	GAA	2	6	205034	205039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800451
4550	NC_013766	A	6	6	205038	205043	100 %	0 %	0 %	0 %	284800451
4551	NC_013766	GAAAA	2	10	205074	205083	80 %	0 %	20 %	0 %	284800451
4552	NC_013766	TGA	2	6	205091	205096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800451
4553	NC_013766	TAT	2	6	205103	205108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800451
4554	NC_013766	TCT	2	6	205152	205157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800451
4555	NC_013766	ACTT	2	8	205174	205181	25 %	50 %	0 %	25 %	284800451
4556	NC_013766	GAAAT	2	10	205270	205279	60 %	20 %	20 %	0 %	284800451
4557	NC_013766	TAA	2	6	205299	205304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800451
4558	NC_013766	GGA	2	6	205306	205311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_013766	A	6	6	205323	205328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_013766	A	7	7	205333	205339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013766	AGT	2	6	205389	205394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_013766	A	7	7	205466	205472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_013766	CGG	2	6	205522	205527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800452
4564	NC_013766	CGT	2	6	205623	205628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800452
4565	NC_013766	AGA	2	6	205633	205638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800452
4566	NC_013766	AGT	2	6	205651	205656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800452
4567	NC_013766	TGC	2	6	205741	205746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800452
4568	NC_013766	GTT	2	6	205748	205753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800452
4569	NC_013766	CTA	2	6	205776	205781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800452
4570	NC_013766	ATA	3	9	205788	205796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800452
4571	NC_013766	TTG	2	6	205851	205856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800452
4572	NC_013766	CGC	2	6	205898	205903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284800452
4573	NC_013766	GAAA	2	8	205925	205932	75 %	0 %	25 %	0 %	284800452
4574	NC_013766	TG	3	6	205970	205975	0 %	50 %	50 %	0 %	284800453
4575	NC_013766	TGA	2	6	205995	206000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800453
4576	NC_013766	CTG	2	6	206018	206023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800453
4577	NC_013766	ACT	2	6	206031	206036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800453
4578	NC_013766	AAT	2	6	206068	206073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800453
4579	NC_013766	ACAT	2	8	206132	206139	50 %	25 %	0 %	25 %	284800453
4580	NC_013766	CTA	2	6	206144	206149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800453
4581	NC_013766	AT	3	6	206163	206168	50 %	50 %	0 %	0 %	284800453
4582	NC_013766	AT	3	6	206196	206201	50 %	50 %	0 %	0 %	284800453
4583	NC_013766	ATC	2	6	206239	206244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800453
4584	NC_013766	ATCG	2	8	206274	206281	25 %	25 %	25 %	25 %	284800453
4585	NC_013766	GAT	2	6	206326	206331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800453
4586	NC_013766	ATG	2	6	206347	206352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800453
4587	NC_013766	TAA	2	6	206475	206480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800453
4588	NC_013766	TAA	2	6	206617	206622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800453
4589	NC_013766	A	7	7	206656	206662	100 %	0 %	0 %	0 %	284800454
4590	NC_013766	TAGA	2	8	206666	206673	50 %	25 %	25 %	0 %	284800454
4591	NC_013766	TTCG	2	8	206690	206697	0 %	50 %	25 %	25 %	284800454
4592	NC_013766	AGC	2	6	206754	206759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800454
4593	NC_013766	CAG	2	6	206846	206851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800454
4594	NC_013766	ATTT	2	8	206885	206892	25 %	75 %	0 %	0 %	284800454
4595	NC_013766	ATG	2	6	206897	206902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800454
4596	NC_013766	GGA	2	6	206910	206915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800454
4597	NC_013766	GGC	2	6	207057	207062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800454
4598	NC_013766	AACC	2	8	207070	207077	50 %	0 %	0 %	50 %	284800454
4599	NC_013766	TAT	2	6	207197	207202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800454
4600	NC_013766	GCA	2	6	207259	207264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800454
4601	NC_013766	AGA	2	6	207303	207308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800454
4602	NC_013766	CAA	2	6	207312	207317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800454
4603	NC_013766	AGC	2	6	207321	207326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800454
4604	NC_013766	A	6	6	207335	207340	100 %	0 %	0 %	0 %	284800454
4605	NC_013766	CAA	2	6	207413	207418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800454
4606	NC_013766	AAG	2	6	207461	207466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800454
4607	NC_013766	AGA	2	6	207498	207503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800454
4608	NC_013766	ATT	2	6	207533	207538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800454
4609	NC_013766	GC	3	6	207553	207558	0 %	0 %	50 %	50 %	284800454
4610	NC_013766	TGCT	2	8	207590	207597	0 %	50 %	25 %	25 %	284800454
4611	NC_013766	A	6	6	207604	207609	100 %	0 %	0 %	0 %	284800454
4612	NC_013766	AGC	2	6	207660	207665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800454
4613	NC_013766	CTG	2	6	207782	207787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800454
4614	NC_013766	TCT	2	6	207956	207961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800454
4615	NC_013766	GCT	2	6	207991	207996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800454
4616	NC_013766	TGCCA	2	10	208098	208107	20 %	20 %	20 %	40 %	284800454
4617	NC_013766	CG	3	6	208145	208150	0 %	0 %	50 %	50 %	284800454
4618	NC_013766	TAT	2	6	208199	208204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800454
4619	NC_013766	AAG	3	9	208238	208246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800454
4620	NC_013766	AT	3	6	208272	208277	50 %	50 %	0 %	0 %	284800454
4621	NC_013766	A	6	6	208372	208377	100 %	0 %	0 %	0 %	284800454
4622	NC_013766	A	6	6	208424	208429	100 %	0 %	0 %	0 %	284800454
4623	NC_013766	AAAG	2	8	208444	208451	75 %	0 %	25 %	0 %	284800454
4624	NC_013766	AAG	2	6	208463	208468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800454
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4997	NC_013766	GA	3	6	224779	224784	50 %	0 %	50 %	0 %	284800471
4998	NC_013766	TACT	2	8	224849	224856	25 %	50 %	0 %	25 %	284800471
4999	NC_013766	TTA	3	9	224868	224876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800471
5000	NC_013766	CAA	2	6	224890	224895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800471

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