MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	GTTA	2	8	85	92	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013657	TCTT	2	8	494	501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013657	GAAA	2	8	511	518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013657	AATA	2	8	950	957	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
5	NC_013657	TGAT	2	8	1057	1064	25 %	50 %	25 %	0 %	281427969
6	NC_013657	AAAT	2	8	1811	1818	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
7	NC_013657	AATG	2	8	1907	1914	50 %	25 %	25 %	0 %	281427969
8	NC_013657	TAAA	2	8	1928	1935	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
9	NC_013657	TAAG	2	8	2103	2110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013657	AATT	2	8	2119	2126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013657	TGGT	2	8	2516	2523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013657	ATAA	2	8	2667	2674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013657	TTGA	2	8	2793	2800	25 %	50 %	25 %	0 %	281427970
14	NC_013657	ATTC	2	8	2995	3002	25 %	50 %	0 %	25 %	281427970
15	NC_013657	ATCA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	0 %	25 %	281427970
16	NC_013657	ATTG	2	8	3665	3672	25 %	50 %	25 %	0 %	281427971
17	NC_013657	CTCG	2	8	3817	3824	0 %	25 %	25 %	50 %	281427971
18	NC_013657	TTGA	2	8	4158	4165	25 %	50 %	25 %	0 %	281427971
19	NC_013657	TTTA	2	8	4206	4213	25 %	75 %	0 %	0 %	281427972
20	NC_013657	ATTT	2	8	4321	4328	25 %	75 %	0 %	0 %	281427972
21	NC_013657	AAAG	2	8	4753	4760	75 %	0 %	25 %	0 %	281427973
22	NC_013657	TTGC	2	8	4957	4964	0 %	50 %	25 %	25 %	281427973
23	NC_013657	GTTT	2	8	5228	5235	0 %	75 %	25 %	0 %	281427973
24	NC_013657	GCAA	2	8	5377	5384	50 %	0 %	25 %	25 %	281427973
25	NC_013657	TCCT	2	8	6145	6152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013657	GAAT	2	8	6243	6250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013657	AGTA	2	8	6396	6403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013657	AAAT	2	8	6920	6927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013657	TTAT	2	8	7091	7098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013657	GAAT	2	8	8372	8379	50 %	25 %	25 %	0 %	281427975
31	NC_013657	AAAT	2	8	8381	8388	75 %	25 %	0 %	0 %	281427975
32	NC_013657	ATTA	2	8	8622	8629	50 %	50 %	0 %	0 %	281427975
33	NC_013657	CAAA	2	8	8985	8992	75 %	0 %	0 %	25 %	281427976
34	NC_013657	TAAT	2	8	9103	9110	50 %	50 %	0 %	0 %	281427976
35	NC_013657	CAAA	2	8	9394	9401	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013657	AATT	2	8	9571	9578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013657	TACA	2	8	9703	9710	50 %	25 %	0 %	25 %	281427977
38	NC_013657	TTTA	2	8	10109	10116	25 %	75 %	0 %	0 %	281427977
39	NC_013657	GCTT	2	8	10466	10473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013657	CTTT	2	8	10930	10937	0 %	75 %	0 %	25 %	281427978
41	NC_013657	ATTA	2	8	10940	10947	50 %	50 %	0 %	0 %	281427978
42	NC_013657	AGGA	2	8	11381	11388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013657	AGTT	2	8	11389	11396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013657	TTGA	2	8	11717	11724	25 %	50 %	25 %	0 %	281427979
45	NC_013657	TTTA	2	8	11934	11941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013657	TAAT	2	8	12436	12443	50 %	50 %	0 %	0 %	281427980
47	NC_013657	ATAA	2	8	12576	12583	75 %	25 %	0 %	0 %	281427980
48	NC_013657	AATA	2	8	12629	12636	75 %	25 %	0 %	0 %	281427980
49	NC_013657	TTCT	2	8	12857	12864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013657	GTTT	2	8	13300	13307	0 %	75 %	25 %	0 %	281427981
51	NC_013657	AACT	2	8	13411	13418	50 %	25 %	0 %	25 %	281427981
52	NC_013657	AAAT	2	8	13998	14005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013657	TTTG	2	8	14533	14540	0 %	75 %	25 %	0 %	281427983
54	NC_013657	TATT	2	8	14948	14955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013657	GAGT	2	8	15170	15177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013657	TTAT	2	8	15431	15438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013657	TTCT	2	8	15464	15471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013657	TTGA	2	8	15582	15589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013657	GATT	2	8	15701	15708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013657	AAAC	2	8	16128	16135	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013657	TAAA	2	8	16226	16233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013657	TTTC	2	8	16318	16325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013657	AAAT	2	8	16372	16379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013657	TTAT	2	8	16423	16430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013657	TCGT	2	8	16480	16487	0 %	50 %	25 %	25 %	281427985
66	NC_013657	ATCA	2	8	16618	16625	50 %	25 %	0 %	25 %	281427985
67	NC_013657	CTTT	2	8	17095	17102	0 %	75 %	0 %	25 %	281427985
68	NC_013657	TCTA	2	8	17637	17644	25 %	50 %	0 %	25 %	281427985
69	NC_013657	TTTA	2	8	17785	17792	25 %	75 %	0 %	0 %	281427985
70	NC_013657	CAAA	2	8	17912	17919	75 %	0 %	0 %	25 %	281427985
71	NC_013657	CAAA	2	8	18314	18321	75 %	0 %	0 %	25 %	281427985
72	NC_013657	ACGA	2	8	18671	18678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013657	AGAA	2	8	19057	19064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013657	TAAT	2	8	19479	19486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013657	TATT	2	8	20372	20379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013657	TAAA	2	8	20672	20679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013657	TATT	2	8	20689	20696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013657	ACTT	2	8	20707	20714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013657	TCAT	2	8	20907	20914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013657	GAAA	2	8	21862	21869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013657	AAAT	2	8	22076	22083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013657	ATCT	2	8	22284	22291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013657	GTTT	2	8	23111	23118	0 %	75 %	25 %	0 %	281427987
84	NC_013657	TAGA	2	8	23212	23219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013657	ATTG	2	8	23408	23415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013657	ATAA	2	8	23455	23462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013657	TAAA	2	8	23553	23560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013657	CTAT	2	8	23703	23710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013657	TAAA	2	8	23714	23721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013657	ATGT	2	8	23949	23956	25 %	50 %	25 %	0 %	281427988
91	NC_013657	CAGT	2	8	24396	24403	25 %	25 %	25 %	25 %	281427988
92	NC_013657	AATT	2	8	24461	24468	50 %	50 %	0 %	0 %	281427988
93	NC_013657	TTTG	2	8	24858	24865	0 %	75 %	25 %	0 %	281427988
94	NC_013657	TCCA	2	8	25484	25491	25 %	25 %	0 %	50 %	281427988
95	NC_013657	ATTT	2	8	25615	25622	25 %	75 %	0 %	0 %	281427988
96	NC_013657	TAAA	2	8	25710	25717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013657	AAAT	2	8	26356	26363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013657	ACCC	2	8	26501	26508	25 %	0 %	0 %	75 %	281427989
99	NC_013657	TCTT	2	8	27088	27095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013657	TTAA	2	8	27201	27208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013657	CGCT	2	8	27470	27477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013657	GTTT	2	8	27780	27787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013657	TACT	2	8	28507	28514	25 %	50 %	0 %	25 %	281427990
104	NC_013657	TTGT	2	8	28748	28755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013657	TTAC	2	8	28881	28888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013657	ATTT	2	8	28970	28977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013657	TAAC	2	8	29066	29073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013657	TCAT	2	8	29112	29119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013657	GTTT	2	8	29125	29132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013657	CATT	2	8	29536	29543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013657	TAAA	2	8	30520	30527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013657	TTGC	2	8	30571	30578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013657	AAAG	2	8	30711	30718	75 %	0 %	25 %	0 %	281427992
114	NC_013657	TATT	2	8	31294	31301	25 %	75 %	0 %	0 %	281427992
115	NC_013657	ATTA	2	8	31638	31645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013657	GCGG	2	8	31765	31772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013657	AAGA	2	8	31794	31801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013657	AATG	2	8	32169	32176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013657	AATT	2	8	32993	33000	50 %	50 %	0 %	0 %	281427995
120	NC_013657	AGTC	2	8	33406	33413	25 %	25 %	25 %	25 %	281427995
121	NC_013657	ATTA	2	8	33846	33853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013657	AATC	2	8	34031	34038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013657	CATC	2	8	34096	34103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013657	ATGT	2	8	34175	34182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013657	CTAT	2	8	34217	34224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013657	AAAC	2	8	34486	34493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013657	GTTT	2	8	34507	34514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013657	CAAT	2	8	35224	35231	50 %	25 %	0 %	25 %	281427997
129	NC_013657	ATCA	2	8	35366	35373	50 %	25 %	0 %	25 %	281427997
130	NC_013657	AAGC	2	8	36645	36652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013657	ATTT	2	8	36811	36818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013657	TTTC	2	8	37025	37032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013657	GAAA	2	8	37449	37456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.