MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	AT	3	6	516	521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013505	AG	3	6	1364	1369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013505	TA	4	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013505	TA	3	6	2250	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013505	TA	4	8	2507	2514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013505	AT	4	8	3011	3018	50 %	50 %	0 %	0 %	268318541
7	NC_013505	TG	3	6	4422	4427	0 %	50 %	50 %	0 %	268318542
8	NC_013505	AT	3	6	4769	4774	50 %	50 %	0 %	0 %	268318542
9	NC_013505	AT	3	6	4936	4941	50 %	50 %	0 %	0 %	268318542
10	NC_013505	AT	3	6	5069	5074	50 %	50 %	0 %	0 %	268318542
11	NC_013505	AT	3	6	5207	5212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013505	TA	3	6	5469	5474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013505	TA	3	6	5730	5735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013505	TA	3	6	5887	5892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013505	TA	3	6	5992	5997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013505	TA	3	6	6041	6046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013505	AT	3	6	6075	6080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013505	TA	3	6	6451	6456	50 %	50 %	0 %	0 %	268318543
19	NC_013505	TA	3	6	7117	7122	50 %	50 %	0 %	0 %	268318544
20	NC_013505	TC	3	6	7319	7324	0 %	50 %	0 %	50 %	268318544
21	NC_013505	TC	3	6	7691	7696	0 %	50 %	0 %	50 %	268318545
22	NC_013505	GA	3	6	8913	8918	50 %	0 %	50 %	0 %	268318546
23	NC_013505	TA	3	6	9091	9096	50 %	50 %	0 %	0 %	268318546
24	NC_013505	TA	3	6	9401	9406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013505	AG	3	6	10144	10149	50 %	0 %	50 %	0 %	268318547
26	NC_013505	AT	3	6	10272	10277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013505	TC	3	6	11262	11267	0 %	50 %	0 %	50 %	268318549
28	NC_013505	TA	3	6	12576	12581	50 %	50 %	0 %	0 %	268318550
29	NC_013505	TA	3	6	12595	12600	50 %	50 %	0 %	0 %	268318550
30	NC_013505	TC	3	6	13353	13358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013505	AG	3	6	13461	13466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013505	TC	3	6	13711	13716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013505	AT	3	6	14078	14083	50 %	50 %	0 %	0 %	268318551
34	NC_013505	AT	3	6	14226	14231	50 %	50 %	0 %	0 %	268318551
35	NC_013505	TA	3	6	14827	14832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013505	AT	3	6	15367	15372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013505	AG	3	6	15570	15575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013505	AG	3	6	15734	15739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013505	GA	3	6	15903	15908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013505	CG	3	6	16568	16573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013505	AT	4	8	16575	16582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013505	GC	3	6	16640	16645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013505	CA	3	6	16782	16787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013505	TA	3	6	16927	16932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013505	GT	3	6	17383	17388	0 %	50 %	50 %	0 %	268318552
46	NC_013505	AT	3	6	17474	17479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013505	AT	3	6	18827	18832	50 %	50 %	0 %	0 %	268318555
48	NC_013505	TA	3	6	19635	19640	50 %	50 %	0 %	0 %	268318555
49	NC_013505	AT	3	6	20417	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	268318556
50	NC_013505	GA	3	6	20874	20879	50 %	0 %	50 %	0 %	268318556
51	NC_013505	AT	3	6	21356	21361	50 %	50 %	0 %	0 %	268318556
52	NC_013505	TA	3	6	21704	21709	50 %	50 %	0 %	0 %	268318557
53	NC_013505	CG	3	6	22277	22282	0 %	0 %	50 %	50 %	268318557
54	NC_013505	AT	3	6	22350	22355	50 %	50 %	0 %	0 %	268318557
55	NC_013505	TA	3	6	23007	23012	50 %	50 %	0 %	0 %	268318558
56	NC_013505	AT	3	6	23495	23500	50 %	50 %	0 %	0 %	268318558
57	NC_013505	TA	3	6	23527	23532	50 %	50 %	0 %	0 %	268318559
58	NC_013505	TA	3	6	23649	23654	50 %	50 %	0 %	0 %	268318559
59	NC_013505	TA	3	6	23863	23868	50 %	50 %	0 %	0 %	268318559
60	NC_013505	AT	3	6	24919	24924	50 %	50 %	0 %	0 %	268318560

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.