MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 5361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013504	AGTA	2	8	358	365	50 %	25 %	25 %	0 %	268318563
2	NC_013504	ATGC	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	268318563
3	NC_013504	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013504	GATC	2	8	1751	1758	25 %	25 %	25 %	25 %	268318564
5	NC_013504	AAAG	2	8	1828	1835	75 %	0 %	25 %	0 %	268318564
6	NC_013504	CAAA	2	8	1840	1847	75 %	0 %	0 %	25 %	268318564
7	NC_013504	GAAA	2	8	3034	3041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013504	ATTT	2	8	3086	3093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013504	ATTT	2	8	3231	3238	25 %	75 %	0 %	0 %	268318565
10	NC_013504	AACA	2	8	3263	3270	75 %	0 %	0 %	25 %	268318565
11	NC_013504	AATT	2	8	3280	3287	50 %	50 %	0 %	0 %	268318565
12	NC_013504	AATG	2	8	3434	3441	50 %	25 %	25 %	0 %	268318565
13	NC_013504	AATT	2	8	3527	3534	50 %	50 %	0 %	0 %	268318565
14	NC_013504	TAAA	2	8	4258	4265	75 %	25 %	0 %	0 %	268318566
15	NC_013504	GTAT	2	8	4354	4361	25 %	50 %	25 %	0 %	268318566
16	NC_013504	ACGA	2	8	4426	4433	50 %	0 %	25 %	25 %	268318566
17	NC_013504	GAAA	2	8	4693	4700	75 %	0 %	25 %	0 %	268318566
18	NC_013504	AAAG	2	8	4914	4921	75 %	0 %	25 %	0 %	268318566
19	NC_013504	TCGA	2	8	5338	5345	25 %	25 %	25 %	25 %	268318566
20	NC_013504	TTAT	2	8	5550	5557	25 %	75 %	0 %	0 %	268318566
21	NC_013504	ATTG	2	8	6646	6653	25 %	50 %	25 %	0 %	268318567
22	NC_013504	GCAA	2	8	7194	7201	50 %	0 %	25 %	25 %	268318567
23	NC_013504	GAAT	2	8	7208	7215	50 %	25 %	25 %	0 %	268318567
24	NC_013504	AATT	2	8	7442	7449	50 %	50 %	0 %	0 %	268318567
25	NC_013504	GCAA	2	8	7557	7564	50 %	0 %	25 %	25 %	268318567
26	NC_013504	AAAG	2	8	7920	7927	75 %	0 %	25 %	0 %	268318567
27	NC_013504	GTTC	2	8	8248	8255	0 %	50 %	25 %	25 %	268318567
28	NC_013504	TTAC	2	8	8906	8913	25 %	50 %	0 %	25 %	268318568
29	NC_013504	AAAG	2	8	8943	8950	75 %	0 %	25 %	0 %	268318568
30	NC_013504	GATC	2	8	8955	8962	25 %	25 %	25 %	25 %	268318568
31	NC_013504	TTTA	2	8	10604	10611	25 %	75 %	0 %	0 %	268318571
32	NC_013504	TGCT	2	8	11005	11012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013504	AAGC	2	8	11026	11033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013504	AGGA	2	8	11098	11105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013504	ATTA	2	8	11225	11232	50 %	50 %	0 %	0 %	268318572
36	NC_013504	TATT	2	8	12349	12356	25 %	75 %	0 %	0 %	268318572
37	NC_013504	ATTA	2	8	12470	12477	50 %	50 %	0 %	0 %	268318572
38	NC_013504	GAAA	2	8	12758	12765	75 %	0 %	25 %	0 %	268318572
39	NC_013504	TTAC	2	8	13901	13908	25 %	50 %	0 %	25 %	268318574
40	NC_013504	AATT	2	8	14207	14214	50 %	50 %	0 %	0 %	268318574
41	NC_013504	ACTG	2	8	14397	14404	25 %	25 %	25 %	25 %	268318574
42	NC_013504	CCTT	2	8	14774	14781	0 %	50 %	0 %	50 %	268318574
43	NC_013504	ATTA	2	8	14995	15002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013504	AAAT	2	8	15078	15085	75 %	25 %	0 %	0 %	268318575
45	NC_013504	TGGT	2	8	15324	15331	0 %	50 %	50 %	0 %	268318575
46	NC_013504	AAAT	2	8	15603	15610	75 %	25 %	0 %	0 %	268318575
47	NC_013504	GAAG	2	8	15643	15650	50 %	0 %	50 %	0 %	268318575
48	NC_013504	AAAG	2	8	16280	16287	75 %	0 %	25 %	0 %	268318576
49	NC_013504	AAAT	2	8	16336	16343	75 %	25 %	0 %	0 %	268318576
50	NC_013504	TTTC	2	8	16570	16577	0 %	75 %	0 %	25 %	268318576
51	NC_013504	TGAA	2	8	16976	16983	50 %	25 %	25 %	0 %	268318576
52	NC_013504	TAGC	2	8	17469	17476	25 %	25 %	25 %	25 %	268318577
53	NC_013504	AGGA	2	8	17632	17639	50 %	0 %	50 %	0 %	268318577
54	NC_013504	TGAT	2	8	17830	17837	25 %	50 %	25 %	0 %	268318577
55	NC_013504	TCAA	2	8	18659	18666	50 %	25 %	0 %	25 %	268318577
56	NC_013504	CCAA	2	8	19119	19126	50 %	0 %	0 %	50 %	268318577
57	NC_013504	TAAA	2	8	19431	19438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013504	ATAA	2	8	19495	19502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013504	ATTT	2	8	19638	19645	25 %	75 %	0 %	0 %	268318578
60	NC_013504	TAGG	2	8	19697	19704	25 %	25 %	50 %	0 %	268318578
61	NC_013504	ATAA	2	8	19771	19778	75 %	25 %	0 %	0 %	268318578
62	NC_013504	CATC	2	8	20688	20695	25 %	25 %	0 %	50 %	268318579
63	NC_013504	TAAT	2	8	21238	21245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013504	TGAA	2	8	21511	21518	50 %	25 %	25 %	0 %	268318580
65	NC_013504	TCAA	2	8	21847	21854	50 %	25 %	0 %	25 %	268318580
66	NC_013504	TTTC	2	8	22211	22218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013504	ATCA	2	8	22241	22248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013504	GGAA	2	8	22254	22261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013504	TCAT	2	8	22300	22307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013504	CTTA	2	8	22501	22508	25 %	50 %	0 %	25 %	268318581
71	NC_013504	TAAT	2	8	22849	22856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013504	CAGC	2	8	23777	23784	25 %	0 %	25 %	50 %	268318582
73	NC_013504	TAAT	2	8	24291	24298	50 %	50 %	0 %	0 %	268318582
74	NC_013504	AATA	2	8	24323	24330	75 %	25 %	0 %	0 %	268318582
75	NC_013504	ACTT	2	8	24392	24399	25 %	50 %	0 %	25 %	268318582
76	NC_013504	GAAC	2	8	25243	25250	50 %	0 %	25 %	25 %	268318582
77	NC_013504	CTTT	2	8	27766	27773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013504	TTGT	2	8	27886	27893	0 %	75 %	25 %	0 %	268318583
79	NC_013504	GATT	2	8	28235	28242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013504	TAAA	2	8	28798	28805	75 %	25 %	0 %	0 %	268318586
81	NC_013504	CTAG	2	8	28941	28948	25 %	25 %	25 %	25 %	268318586
82	NC_013504	CTTG	2	8	29298	29305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013504	CATT	2	8	29346	29353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013504	TTTA	2	8	29464	29471	25 %	75 %	0 %	0 %	268318587
85	NC_013504	AAAG	2	8	30696	30703	75 %	0 %	25 %	0 %	268318589
86	NC_013504	AATG	2	8	30791	30798	50 %	25 %	25 %	0 %	268318590
87	NC_013504	AGTA	2	8	31314	31321	50 %	25 %	25 %	0 %	268318590
88	NC_013504	AATT	2	8	31609	31616	50 %	50 %	0 %	0 %	268318591
89	NC_013504	TGCA	2	8	31669	31676	25 %	25 %	25 %	25 %	268318591
90	NC_013504	ATGA	2	8	31857	31864	50 %	25 %	25 %	0 %	268318591
91	NC_013504	GGAT	2	8	32135	32142	25 %	25 %	50 %	0 %	268318591
92	NC_013504	ACCA	2	8	32351	32358	50 %	0 %	0 %	50 %	268318592
93	NC_013504	TTTC	2	8	32446	32453	0 %	75 %	0 %	25 %	268318592
94	NC_013504	AGTT	2	8	32680	32687	25 %	50 %	25 %	0 %	268318592
95	NC_013504	TTTC	2	8	33209	33216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013504	TAAT	2	8	33450	33457	50 %	50 %	0 %	0 %	268318593
97	NC_013504	TGAT	2	8	33836	33843	25 %	50 %	25 %	0 %	268318594
98	NC_013504	TCTA	2	8	33861	33868	25 %	50 %	0 %	25 %	268318594
99	NC_013504	ATCC	2	8	34065	34072	25 %	25 %	0 %	50 %	268318594
100	NC_013504	AAAC	2	8	35241	35248	75 %	0 %	0 %	25 %	268318594
101	NC_013504	AGAT	2	8	35285	35292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013504	TAAT	2	8	35520	35527	50 %	50 %	0 %	0 %	268318595
103	NC_013504	TACT	2	8	35599	35606	25 %	50 %	0 %	25 %	268318595
104	NC_013504	GAAT	2	8	35664	35671	50 %	25 %	25 %	0 %	268318595
105	NC_013504	ATCT	2	8	35816	35823	25 %	50 %	0 %	25 %	268318595
106	NC_013504	TTTC	2	8	36000	36007	0 %	75 %	0 %	25 %	268318595
107	NC_013504	TTTA	2	8	36145	36152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013504	TTAA	2	8	36831	36838	50 %	50 %	0 %	0 %	268318596
109	NC_013504	AAAG	2	8	36841	36848	75 %	0 %	25 %	0 %	268318596
110	NC_013504	AATT	2	8	36880	36887	50 %	50 %	0 %	0 %	268318596
111	NC_013504	CAGA	2	8	37326	37333	50 %	0 %	25 %	25 %	268318596
112	NC_013504	ACTC	2	8	37520	37527	25 %	25 %	0 %	50 %	268318596
113	NC_013504	TTTA	2	8	37789	37796	25 %	75 %	0 %	0 %	268318596
114	NC_013504	GTAA	2	8	38424	38431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013504	TTGC	2	8	38452	38459	0 %	50 %	25 %	25 %	268318597
116	NC_013504	TAAT	2	8	38850	38857	50 %	50 %	0 %	0 %	268318597
117	NC_013504	TAAT	2	8	39684	39691	50 %	50 %	0 %	0 %	268318597
118	NC_013504	AAGA	2	8	39976	39983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013504	TTGT	2	8	40046	40053	0 %	75 %	25 %	0 %	268318598
120	NC_013504	AAGA	2	8	40352	40359	75 %	0 %	25 %	0 %	268318598
121	NC_013504	GTTA	2	8	40798	40805	25 %	50 %	25 %	0 %	268318598
122	NC_013504	GCTT	2	8	40842	40849	0 %	50 %	25 %	25 %	268318598
123	NC_013504	TTGT	2	8	40964	40971	0 %	75 %	25 %	0 %	268318598
124	NC_013504	TAAA	2	8	41034	41041	75 %	25 %	0 %	0 %	268318598
125	NC_013504	AATC	2	8	41287	41294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013504	TAGC	2	8	41318	41325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013504	AATC	2	8	41328	41335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013504	TCAT	2	8	41829	41836	25 %	50 %	0 %	25 %	268318600
129	NC_013504	AATT	2	8	42790	42797	50 %	50 %	0 %	0 %	268318601
130	NC_013504	AGTA	2	8	42960	42967	50 %	25 %	25 %	0 %	268318602
131	NC_013504	ATTT	2	8	43044	43051	25 %	75 %	0 %	0 %	268318602
132	NC_013504	CTAT	2	8	45141	45148	25 %	50 %	0 %	25 %	268318602
133	NC_013504	GAAT	2	8	45653	45660	50 %	25 %	25 %	0 %	268318602
134	NC_013504	TTAG	2	8	45707	45714	25 %	50 %	25 %	0 %	268318602
135	NC_013504	AAAC	2	8	45868	45875	75 %	0 %	0 %	25 %	268318603
136	NC_013504	CAAA	2	8	46470	46477	75 %	0 %	0 %	25 %	268318603
137	NC_013504	CATA	2	8	46906	46913	50 %	25 %	0 %	25 %	268318604
138	NC_013504	AATA	2	8	46927	46934	75 %	25 %	0 %	0 %	268318604
139	NC_013504	TTAA	2	8	47011	47018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013504	GCTC	2	8	47178	47185	0 %	25 %	25 %	50 %	268318605
141	NC_013504	TTAA	2	8	47355	47362	50 %	50 %	0 %	0 %	268318605
142	NC_013504	ATCA	2	8	47401	47408	50 %	25 %	0 %	25 %	268318605
143	NC_013504	TATT	2	8	47794	47801	25 %	75 %	0 %	0 %	268318605
144	NC_013504	GCAA	2	8	47958	47965	50 %	0 %	25 %	25 %	268318605
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