MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 40902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013504	TTG	2	6	172123	172128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318718
4002	NC_013504	TTA	2	6	172129	172134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318718
4003	NC_013504	TGC	2	6	172145	172150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318718
4004	NC_013504	TTG	2	6	172157	172162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318718
4005	NC_013504	GCA	2	6	172180	172185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318718
4006	NC_013504	GTTAGA	2	12	172230	172241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318718
4007	NC_013504	GTT	2	6	172248	172253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318718
4008	NC_013504	TAT	2	6	172259	172264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318718
4009	NC_013504	TGA	2	6	172272	172277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318718
4010	NC_013504	AGT	2	6	172311	172316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318718
4011	NC_013504	TCA	2	6	172327	172332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318718
4012	NC_013504	TTC	2	6	172420	172425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318718
4013	NC_013504	CTT	2	6	172431	172436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318718
4014	NC_013504	ATA	2	6	172437	172442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318718
4015	NC_013504	TTG	2	6	172636	172641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318718
4016	NC_013504	GCT	2	6	172642	172647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318718
4017	NC_013504	TCT	2	6	172693	172698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318718
4018	NC_013504	CAT	2	6	172760	172765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318718
4019	NC_013504	TTC	2	6	172782	172787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318718
4020	NC_013504	AGC	2	6	172812	172817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318718
4021	NC_013504	GGT	2	6	172839	172844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318718
4022	NC_013504	ATT	2	6	172872	172877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318718
4023	NC_013504	TGA	2	6	172878	172883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318718
4024	NC_013504	GAA	2	6	172917	172922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318718
4025	NC_013504	TCA	2	6	172955	172960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318718
4026	NC_013504	T	6	6	172961	172966	0 %	100 %	0 %	0 %	268318718
4027	NC_013504	CCT	2	6	172967	172972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_013504	CTTA	2	8	172989	172996	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_013504	TTG	2	6	173025	173030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_013504	T	6	6	173045	173050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_013504	A	7	7	173101	173107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013504	ATT	2	6	173123	173128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_013504	ATTT	2	8	173146	173153	25 %	75 %	0 %	0 %	268318719
4034	NC_013504	ATCA	2	8	173160	173167	50 %	25 %	0 %	25 %	268318719
4035	NC_013504	A	7	7	173223	173229	100 %	0 %	0 %	0 %	268318719
4036	NC_013504	AAG	2	6	173234	173239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013504	GAA	2	6	173252	173257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013504	TCATAT	2	12	173327	173338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268318720
4039	NC_013504	ATAA	2	8	173360	173367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_013504	A	6	6	173386	173391	100 %	0 %	0 %	0 %	268318721
4041	NC_013504	ACT	3	9	173394	173402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318721
4042	NC_013504	ATCT	2	8	173449	173456	25 %	50 %	0 %	25 %	268318721
4043	NC_013504	GCA	2	6	173466	173471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318721
4044	NC_013504	TG	3	6	173515	173520	0 %	50 %	50 %	0 %	268318721
4045	NC_013504	GAA	2	6	173541	173546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318721
4046	NC_013504	TGA	2	6	173609	173614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318721
4047	NC_013504	T	6	6	173638	173643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013504	TTA	2	6	173665	173670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_013504	T	6	6	173745	173750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_013504	TGTT	2	8	173760	173767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013504	GGAG	2	8	173818	173825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_013504	TGA	2	6	173832	173837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318722
4053	NC_013504	A	6	6	173837	173842	100 %	0 %	0 %	0 %	268318722
4054	NC_013504	CAA	2	6	173902	173907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318722
4055	NC_013504	CAA	2	6	173966	173971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318722
4056	NC_013504	GCT	2	6	173996	174001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318722
4057	NC_013504	CAT	2	6	174009	174014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318722
4058	NC_013504	TGCT	2	8	174042	174049	0 %	50 %	25 %	25 %	268318722
4059	NC_013504	TAA	3	9	174100	174108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318722
4060	NC_013504	GTCA	2	8	174138	174145	25 %	25 %	25 %	25 %	268318722
4061	NC_013504	TGG	2	6	174175	174180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318722
4062	NC_013504	TAC	2	6	174182	174187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318722
4063	NC_013504	ACT	2	6	174188	174193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318722
4064	NC_013504	CAT	2	6	174216	174221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318722
4065	NC_013504	TTA	2	6	174251	174256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318722
4066	NC_013504	ATT	2	6	174273	174278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318722
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4069	NC_013504	GC	3	6	174577	174582	0 %	0 %	50 %	50 %	268318722
4070	NC_013504	TAA	2	6	174631	174636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318722
4071	NC_013504	ACT	2	6	174638	174643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318722
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4074	NC_013504	ACT	2	6	174680	174685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318722
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4077	NC_013504	AGT	2	6	174718	174723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318722
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4081	NC_013504	AGC	2	6	174889	174894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318722
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4083	NC_013504	A	6	6	174920	174925	100 %	0 %	0 %	0 %	268318722
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4087	NC_013504	AGT	2	6	175072	175077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318722
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4092	NC_013504	A	6	6	175178	175183	100 %	0 %	0 %	0 %	268318722
4093	NC_013504	AAC	2	6	175186	175191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318722
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4104	NC_013504	TAT	2	6	175601	175606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318722
4105	NC_013504	TAC	2	6	175642	175647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318722
4106	NC_013504	AAG	2	6	175650	175655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318722
4107	NC_013504	TGG	2	6	175828	175833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318722
4108	NC_013504	GGA	3	9	175910	175918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013504	T	6	6	175921	175926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_013504	CAA	2	6	175935	175940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318723
4111	NC_013504	TTA	2	6	175950	175955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318723
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4113	NC_013504	CAA	2	6	176111	176116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318723
4114	NC_013504	ATA	2	6	176214	176219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318723
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4117	NC_013504	CAA	2	6	176306	176311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318723
4118	NC_013504	AAT	2	6	176366	176371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318723
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4121	NC_013504	TAA	2	6	176494	176499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318723
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4498	NC_013504	T	8	8	190536	190543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_013504	TCT	2	6	190575	190580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318739
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