MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 40902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013504	AATA	2	8	151847	151854	75 %	25 %	0 %	0 %	268318705
3502	NC_013504	AGAAA	2	10	151909	151918	80 %	0 %	20 %	0 %	268318705
3503	NC_013504	AGA	2	6	151924	151929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013504	AGA	2	6	152004	152009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_013504	GAT	2	6	152051	152056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318706
3506	NC_013504	CTT	2	6	152075	152080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318706
3507	NC_013504	GCTG	2	8	152228	152235	0 %	25 %	50 %	25 %	268318706
3508	NC_013504	ATT	2	6	152267	152272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3509	NC_013504	GCT	2	6	152312	152317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318706
3510	NC_013504	GGC	2	6	152369	152374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318706
3511	NC_013504	TTAA	2	8	152387	152394	50 %	50 %	0 %	0 %	268318706
3512	NC_013504	ATTT	2	8	152447	152454	25 %	75 %	0 %	0 %	268318706
3513	NC_013504	ATT	2	6	152508	152513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3514	NC_013504	ATTA	2	8	152576	152583	50 %	50 %	0 %	0 %	268318706
3515	NC_013504	ATT	2	6	152591	152596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3516	NC_013504	AGAA	2	8	152608	152615	75 %	0 %	25 %	0 %	268318706
3517	NC_013504	CTG	2	6	152661	152666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318706
3518	NC_013504	ACT	2	6	152696	152701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318706
3519	NC_013504	TA	3	6	152784	152789	50 %	50 %	0 %	0 %	268318706
3520	NC_013504	ATT	2	6	152816	152821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3521	NC_013504	TCA	2	6	152875	152880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318706
3522	NC_013504	AGT	2	6	152881	152886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318706
3523	NC_013504	TGCC	2	8	153006	153013	0 %	25 %	25 %	50 %	268318706
3524	NC_013504	TTG	2	6	153153	153158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318706
3525	NC_013504	ATG	2	6	153176	153181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318706
3526	NC_013504	ATT	2	6	153188	153193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3527	NC_013504	TTA	2	6	153260	153265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013504	TCT	2	6	153296	153301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013504	TATAA	2	10	153321	153330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013504	GCA	2	6	153477	153482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318707
3531	NC_013504	CTG	2	6	153490	153495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318707
3532	NC_013504	ACA	2	6	153501	153506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318707
3533	NC_013504	TTG	2	6	153508	153513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318707
3534	NC_013504	TTA	2	6	153621	153626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318707
3535	NC_013504	ACT	2	6	153654	153659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318707
3536	NC_013504	TG	3	6	153673	153678	0 %	50 %	50 %	0 %	268318707
3537	NC_013504	ATCA	2	8	153691	153698	50 %	25 %	0 %	25 %	268318707
3538	NC_013504	ATG	2	6	153715	153720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3539	NC_013504	TTACT	2	10	153741	153750	20 %	60 %	0 %	20 %	268318707
3540	NC_013504	TGA	2	6	153767	153772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3541	NC_013504	AAG	2	6	153786	153791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3542	NC_013504	TTG	2	6	153796	153801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318707
3543	NC_013504	ATT	2	6	153851	153856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318707
3544	NC_013504	ATG	2	6	153862	153867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3545	NC_013504	TGA	2	6	153875	153880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3546	NC_013504	GAA	2	6	153936	153941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3547	NC_013504	ATG	2	6	153958	153963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3548	NC_013504	ACA	2	6	154024	154029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318707
3549	NC_013504	TGT	2	6	154031	154036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318707
3550	NC_013504	AAG	3	9	154045	154053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3551	NC_013504	ATT	2	6	154061	154066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318707
3552	NC_013504	GAA	2	6	154067	154072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3553	NC_013504	AT	3	6	154097	154102	50 %	50 %	0 %	0 %	268318707
3554	NC_013504	AGA	2	6	154127	154132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3555	NC_013504	GAA	2	6	154158	154163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3556	NC_013504	TGC	2	6	154229	154234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318707
3557	NC_013504	GAAA	2	8	154276	154283	75 %	0 %	25 %	0 %	268318707
3558	NC_013504	ATG	2	6	154300	154305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3559	NC_013504	GAA	2	6	154347	154352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3560	NC_013504	TAA	2	6	154353	154358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318707
3561	NC_013504	T	7	7	154399	154405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013504	A	6	6	154434	154439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013504	AATAA	2	10	154452	154461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013504	A	6	6	154460	154465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013504	GTT	2	6	154469	154474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013504	GGA	2	6	154480	154485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013504	A	6	6	154485	154490	100 %	0 %	0 %	0 %	268318708
3568	NC_013504	TGC	2	6	154522	154527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3569	NC_013504	TAA	2	6	154555	154560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3570	NC_013504	A	7	7	154654	154660	100 %	0 %	0 %	0 %	268318708
3571	NC_013504	TAA	2	6	154666	154671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3572	NC_013504	CAAG	2	8	154676	154683	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3573	NC_013504	CAA	2	6	154734	154739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3574	NC_013504	CAA	2	6	154757	154762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3575	NC_013504	GAT	2	6	154793	154798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3576	NC_013504	AAGC	2	8	154799	154806	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3577	NC_013504	AGCA	2	8	154815	154822	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3578	NC_013504	AGTGCA	2	12	154838	154849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268318708
3579	NC_013504	AGCAA	2	10	154852	154861	60 %	0 %	20 %	20 %	268318708
3580	NC_013504	TGC	2	6	154900	154905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3581	NC_013504	GCT	2	6	154925	154930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3582	NC_013504	AAG	2	6	155034	155039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3583	NC_013504	CTG	2	6	155052	155057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3584	NC_013504	ATA	2	6	155058	155063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3585	NC_013504	GCT	2	6	155081	155086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3586	NC_013504	CAAAA	2	10	155112	155121	80 %	0 %	0 %	20 %	268318708
3587	NC_013504	GCT	2	6	155201	155206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3588	NC_013504	TAA	3	9	155239	155247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3589	NC_013504	TAG	2	6	155271	155276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3590	NC_013504	CAAG	2	8	155351	155358	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3591	NC_013504	AGC	2	6	155362	155367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3592	NC_013504	AGA	2	6	155419	155424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3593	NC_013504	ATA	2	6	155439	155444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3594	NC_013504	TCA	2	6	155445	155450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318708
3595	NC_013504	CCAT	2	8	155608	155615	25 %	25 %	0 %	50 %	268318708
3596	NC_013504	TGA	2	6	155674	155679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3597	NC_013504	ATC	2	6	155685	155690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318708
3598	NC_013504	TTA	2	6	155696	155701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318708
3599	NC_013504	AGTA	2	8	155705	155712	50 %	25 %	25 %	0 %	268318708
3600	NC_013504	GAA	2	6	155732	155737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3601	NC_013504	AT	3	6	155739	155744	50 %	50 %	0 %	0 %	268318708
3602	NC_013504	AT	3	6	155803	155808	50 %	50 %	0 %	0 %	268318708
3603	NC_013504	GCT	2	6	155828	155833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3604	NC_013504	TA	3	6	155910	155915	50 %	50 %	0 %	0 %	268318708
3605	NC_013504	ATG	2	6	155993	155998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3606	NC_013504	AAT	2	6	155999	156004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3607	NC_013504	AATGG	2	10	156041	156050	40 %	20 %	40 %	0 %	268318708
3608	NC_013504	AAG	2	6	156102	156107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3609	NC_013504	GCA	2	6	156161	156166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3610	NC_013504	A	6	6	156229	156234	100 %	0 %	0 %	0 %	268318708
3611	NC_013504	CTA	2	6	156240	156245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318708
3612	NC_013504	GCT	2	6	156275	156280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3613	NC_013504	CAA	2	6	156311	156316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3614	NC_013504	AAC	2	6	156318	156323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3615	NC_013504	GGA	2	6	156388	156393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318708
3616	NC_013504	CTG	3	9	156462	156470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3617	NC_013504	ATG	2	6	156507	156512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3618	NC_013504	ATA	2	6	156525	156530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3619	NC_013504	GCT	2	6	156548	156553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3620	NC_013504	TCAA	2	8	156595	156602	50 %	25 %	0 %	25 %	268318708
3621	NC_013504	GCT	2	6	156611	156616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
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3623	NC_013504	CTG	2	6	156651	156656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
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3747	NC_013504	CTTAA	2	10	161661	161670	40 %	40 %	0 %	20 %	268318712
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3750	NC_013504	TGT	2	6	161753	161758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318712
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3759	NC_013504	ATT	2	6	162081	162086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318712
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3835	NC_013504	TTTA	2	8	165176	165183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3863	NC_013504	A	7	7	166292	166298	100 %	0 %	0 %	0 %	268318714
3864	NC_013504	AAT	2	6	166326	166331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318714
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3992	NC_013504	GTT	2	6	171696	171701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318717
3993	NC_013504	ACT	2	6	171749	171754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318717
3994	NC_013504	TTC	2	6	171760	171765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318717
3995	NC_013504	TTC	2	6	171788	171793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318717
3996	NC_013504	GTA	2	6	171937	171942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318718
3997	NC_013504	AGC	2	6	171954	171959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318718
3998	NC_013504	CAA	2	6	171974	171979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318718
3999	NC_013504	ATC	2	6	172075	172080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318718
4000	NC_013504	TGA	2	6	172101	172106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318718

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