MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 40902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013504	TTC	2	6	129531	129536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318683
3002	NC_013504	GAA	2	6	129631	129636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318683
3003	NC_013504	GA	3	6	129655	129660	50 %	0 %	50 %	0 %	268318683
3004	NC_013504	TCCT	2	8	129815	129822	0 %	50 %	0 %	50 %	268318683
3005	NC_013504	TTAC	2	8	129849	129856	25 %	50 %	0 %	25 %	268318683
3006	NC_013504	AAG	2	6	129862	129867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318683
3007	NC_013504	CTTA	2	8	129875	129882	25 %	50 %	0 %	25 %	268318683
3008	NC_013504	TAC	2	6	129900	129905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318683
3009	NC_013504	AGC	2	6	129957	129962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318683
3010	NC_013504	AAAT	2	8	129963	129970	75 %	25 %	0 %	0 %	268318683
3011	NC_013504	AACAA	2	10	130089	130098	80 %	0 %	0 %	20 %	268318683
3012	NC_013504	ACT	2	6	130105	130110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318683
3013	NC_013504	GAT	2	6	130150	130155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318683
3014	NC_013504	TATT	2	8	130268	130275	25 %	75 %	0 %	0 %	268318684
3015	NC_013504	ATA	2	6	130311	130316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318684
3016	NC_013504	ATG	2	6	130334	130339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318684
3017	NC_013504	CTT	2	6	130372	130377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318684
3018	NC_013504	ATT	2	6	130385	130390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318684
3019	NC_013504	GAA	2	6	130412	130417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318684
3020	NC_013504	CGC	2	6	130480	130485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318684
3021	NC_013504	TGC	2	6	130504	130509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318684
3022	NC_013504	GCT	2	6	130538	130543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318684
3023	NC_013504	TGC	2	6	130588	130593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318684
3024	NC_013504	TTC	2	6	130610	130615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318684
3025	NC_013504	GA	3	6	130672	130677	50 %	0 %	50 %	0 %	268318684
3026	NC_013504	TGC	2	6	130699	130704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318684
3027	NC_013504	TGGT	2	8	130725	130732	0 %	50 %	50 %	0 %	268318684
3028	NC_013504	TAG	2	6	130737	130742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318684
3029	NC_013504	AAC	2	6	130808	130813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318684
3030	NC_013504	TTG	2	6	130851	130856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318684
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3032	NC_013504	GGTGTT	2	12	130943	130954	0 %	50 %	50 %	0 %	268318684
3033	NC_013504	GAA	2	6	131035	131040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318685
3034	NC_013504	A	7	7	131044	131050	100 %	0 %	0 %	0 %	268318685
3035	NC_013504	GTA	2	6	131089	131094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318685
3036	NC_013504	AGA	2	6	131106	131111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318685
3037	NC_013504	AGA	2	6	131118	131123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318685
3038	NC_013504	GAA	2	6	131164	131169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318685
3039	NC_013504	ATTG	2	8	131284	131291	25 %	50 %	25 %	0 %	268318685
3040	NC_013504	ATG	2	6	131315	131320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318685
3041	NC_013504	GCT	2	6	131332	131337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318685
3042	NC_013504	TGCT	2	8	131369	131376	0 %	50 %	25 %	25 %	268318685
3043	NC_013504	GAA	2	6	131382	131387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318685
3044	NC_013504	T	6	6	131448	131453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_013504	A	6	6	131542	131547	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3046	NC_013504	A	6	6	131550	131555	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3047	NC_013504	TGA	2	6	131588	131593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318686
3048	NC_013504	A	6	6	131650	131655	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3049	NC_013504	AAG	2	6	131687	131692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318686
3050	NC_013504	ATT	2	6	131748	131753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318686
3051	NC_013504	CAG	2	6	131809	131814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318686
3052	NC_013504	TGG	2	6	131828	131833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318686
3053	NC_013504	ACTA	2	8	131843	131850	50 %	25 %	0 %	25 %	268318686
3054	NC_013504	CTG	2	6	131851	131856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318686
3055	NC_013504	A	6	6	131861	131866	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3056	NC_013504	CAA	2	6	131872	131877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318686
3057	NC_013504	AAC	2	6	131878	131883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318686
3058	NC_013504	GCT	2	6	131886	131891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318686
3059	NC_013504	A	6	6	131913	131918	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3060	NC_013504	A	6	6	131925	131930	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3061	NC_013504	AGC	2	6	131939	131944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318686
3062	NC_013504	AAG	2	6	131954	131959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318686
3063	NC_013504	GTA	2	6	132028	132033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318686
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3067	NC_013504	TGC	2	6	132230	132235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318686
3068	NC_013504	A	7	7	132248	132254	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3069	NC_013504	A	7	7	132265	132271	100 %	0 %	0 %	0 %	268318686
3070	NC_013504	GAT	2	6	132336	132341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318686
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3072	NC_013504	T	6	6	132425	132430	0 %	100 %	0 %	0 %	268318686
3073	NC_013504	TGA	2	6	132527	132532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318686
3074	NC_013504	T	6	6	132613	132618	0 %	100 %	0 %	0 %	268318686
3075	NC_013504	TTG	2	6	132646	132651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318686
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3080	NC_013504	TAA	2	6	132798	132803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_013504	T	7	7	132814	132820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_013504	AAATTG	2	12	132846	132857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	268318687
3083	NC_013504	AATAT	2	10	132906	132915	60 %	40 %	0 %	0 %	268318687
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3088	NC_013504	GCT	2	6	133144	133149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318687
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3090	NC_013504	GAA	2	6	133238	133243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318687
3091	NC_013504	A	6	6	133242	133247	100 %	0 %	0 %	0 %	268318687
3092	NC_013504	A	7	7	133300	133306	100 %	0 %	0 %	0 %	268318687
3093	NC_013504	CAA	2	6	133332	133337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318687
3094	NC_013504	A	6	6	133340	133345	100 %	0 %	0 %	0 %	268318687
3095	NC_013504	A	6	6	133446	133451	100 %	0 %	0 %	0 %	268318688
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3100	NC_013504	TGA	2	6	133719	133724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318688
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3102	NC_013504	ACTA	2	8	133770	133777	50 %	25 %	0 %	25 %	268318688
3103	NC_013504	GTA	2	6	133804	133809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318688
3104	NC_013504	CTT	2	6	133817	133822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318688
3105	NC_013504	TGAAA	2	10	133857	133866	60 %	20 %	20 %	0 %	268318688
3106	NC_013504	CCA	2	6	133906	133911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318688
3107	NC_013504	GCT	2	6	133915	133920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318688
3108	NC_013504	TTCA	2	8	133928	133935	25 %	50 %	0 %	25 %	268318688
3109	NC_013504	ATTTA	2	10	134052	134061	40 %	60 %	0 %	0 %	268318688
3110	NC_013504	AG	3	6	134066	134071	50 %	0 %	50 %	0 %	268318688
3111	NC_013504	AGA	2	6	134103	134108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318688
3112	NC_013504	TATT	2	8	134133	134140	25 %	75 %	0 %	0 %	268318688
3113	NC_013504	AGA	2	6	134155	134160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318688
3114	NC_013504	CAAA	2	8	134162	134169	75 %	0 %	0 %	25 %	268318688
3115	NC_013504	TAT	2	6	134207	134212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318688
3116	NC_013504	T	6	6	134275	134280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_013504	TTA	2	6	134283	134288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318689
3118	NC_013504	CAT	2	6	134300	134305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318689
3119	NC_013504	TCA	2	6	134384	134389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318689
3120	NC_013504	ATTG	2	8	134391	134398	25 %	50 %	25 %	0 %	268318689
3121	NC_013504	TCA	2	6	134413	134418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318689
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3493	NC_013504	GAA	3	9	151355	151363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318705
3494	NC_013504	TGAT	2	8	151377	151384	25 %	50 %	25 %	0 %	268318705
3495	NC_013504	GAA	2	6	151397	151402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318705
3496	NC_013504	TGA	2	6	151615	151620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318705
3497	NC_013504	TGA	2	6	151744	151749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318705
3498	NC_013504	TCA	2	6	151753	151758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318705
3499	NC_013504	A	6	6	151763	151768	100 %	0 %	0 %	0 %	268318705
3500	NC_013504	TACTTA	2	12	151811	151822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268318705

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