MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 40902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013504	AAT	2	6	42928	42933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318602
1002	NC_013504	AGTA	2	8	42960	42967	50 %	25 %	25 %	0 %	268318602
1003	NC_013504	ATT	2	6	43008	43013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318602
1004	NC_013504	CTT	2	6	43022	43027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318602
1005	NC_013504	ATTT	2	8	43044	43051	25 %	75 %	0 %	0 %	268318602
1006	NC_013504	GAA	2	6	43207	43212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1007	NC_013504	AT	3	6	43233	43238	50 %	50 %	0 %	0 %	268318602
1008	NC_013504	AAG	2	6	43361	43366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1009	NC_013504	ACT	2	6	43393	43398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318602
1010	NC_013504	AGA	2	6	43491	43496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1011	NC_013504	TAA	2	6	43506	43511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318602
1012	NC_013504	GCT	2	6	43522	43527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318602
1013	NC_013504	AAT	2	6	43531	43536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318602
1014	NC_013504	GTT	2	6	43576	43581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318602
1015	NC_013504	A	6	6	43681	43686	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1016	NC_013504	AG	3	6	43692	43697	50 %	0 %	50 %	0 %	268318602
1017	NC_013504	TTA	2	6	43738	43743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318602
1018	NC_013504	TAA	2	6	43764	43769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318602
1019	NC_013504	TGA	2	6	43857	43862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318602
1020	NC_013504	A	6	6	43892	43897	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1021	NC_013504	AGA	2	6	44064	44069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1022	NC_013504	A	6	6	44112	44117	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1023	NC_013504	A	6	6	44182	44187	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1024	NC_013504	AAG	3	9	44216	44224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1025	NC_013504	ATT	2	6	44241	44246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318602
1026	NC_013504	AAG	2	6	44317	44322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1027	NC_013504	AT	4	8	44343	44350	50 %	50 %	0 %	0 %	268318602
1028	NC_013504	TAT	2	6	44430	44435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318602
1029	NC_013504	CAA	2	6	44443	44448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318602
1030	NC_013504	TTA	2	6	44579	44584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318602
1031	NC_013504	AAAGT	2	10	44588	44597	60 %	20 %	20 %	0 %	268318602
1032	NC_013504	CAA	2	6	44618	44623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318602
1033	NC_013504	A	6	6	44669	44674	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1034	NC_013504	GC	3	6	44736	44741	0 %	0 %	50 %	50 %	268318602
1035	NC_013504	AAC	2	6	44772	44777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318602
1036	NC_013504	T	6	6	44826	44831	0 %	100 %	0 %	0 %	268318602
1037	NC_013504	GTT	2	6	44901	44906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318602
1038	NC_013504	ATT	2	6	44928	44933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318602
1039	NC_013504	A	6	6	45000	45005	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1040	NC_013504	ATG	2	6	45017	45022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318602
1041	NC_013504	T	6	6	45061	45066	0 %	100 %	0 %	0 %	268318602
1042	NC_013504	A	6	6	45091	45096	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1043	NC_013504	CTAT	2	8	45141	45148	25 %	50 %	0 %	25 %	268318602
1044	NC_013504	CAA	2	6	45256	45261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318602
1045	NC_013504	AGA	3	9	45401	45409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1046	NC_013504	ATA	2	6	45425	45430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318602
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1050	NC_013504	TTA	2	6	45573	45578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318602
1051	NC_013504	AGA	2	6	45615	45620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318602
1052	NC_013504	A	6	6	45620	45625	100 %	0 %	0 %	0 %	268318602
1053	NC_013504	GAAT	2	8	45653	45660	50 %	25 %	25 %	0 %	268318602
1054	NC_013504	TTAG	2	8	45707	45714	25 %	50 %	25 %	0 %	268318602
1055	NC_013504	ATA	2	6	45751	45756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013504	ATT	2	6	45757	45762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013504	GGA	2	6	45787	45792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013504	TAG	2	6	45834	45839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318603
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1060	NC_013504	GCA	2	6	45890	45895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318603
1061	NC_013504	A	6	6	45912	45917	100 %	0 %	0 %	0 %	268318603
1062	NC_013504	ATT	2	6	45955	45960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318603
1063	NC_013504	TGG	2	6	45967	45972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318603
1064	NC_013504	GAGAA	2	10	45990	45999	60 %	0 %	40 %	0 %	268318603
1065	NC_013504	GCT	2	6	46010	46015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318603
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1081	NC_013504	TCT	2	6	46717	46722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013504	T	7	7	46722	46728	0 %	100 %	0 %	0 %	268318604
1083	NC_013504	TTA	2	6	46734	46739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318604
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1091	NC_013504	TAT	2	6	46992	46997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013504	TTAA	2	8	47011	47018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013504	TGC	2	6	47024	47029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013504	TAA	2	6	47057	47062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013504	AG	3	6	47072	47077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_013504	TTAA	2	8	47355	47362	50 %	50 %	0 %	0 %	268318605
1101	NC_013504	ATCA	2	8	47401	47408	50 %	25 %	0 %	25 %	268318605
1102	NC_013504	GAT	2	6	47409	47414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318605
1103	NC_013504	CATTA	2	10	47442	47451	40 %	40 %	0 %	20 %	268318605
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1107	NC_013504	T	6	6	47706	47711	0 %	100 %	0 %	0 %	268318605
1108	NC_013504	AAT	2	6	47738	47743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318605
1109	NC_013504	ATT	2	6	47751	47756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318605
1110	NC_013504	TATT	2	8	47794	47801	25 %	75 %	0 %	0 %	268318605
1111	NC_013504	TTA	2	6	47827	47832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318605
1112	NC_013504	TGATTA	2	12	47905	47916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268318605
1113	NC_013504	GCAA	2	8	47958	47965	50 %	0 %	25 %	25 %	268318605
1114	NC_013504	GTT	2	6	47994	47999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318605
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1116	NC_013504	AAAAAG	2	12	48096	48107	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	268318605
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1118	NC_013504	AGC	2	6	48141	48146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013504	GCT	2	6	48154	48159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013504	AT	3	6	48188	48193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013504	ATTA	2	8	48231	48238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013504	AAT	2	6	48243	48248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013504	T	6	6	48253	48258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013504	T	7	7	48260	48266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013504	A	6	6	48353	48358	100 %	0 %	0 %	0 %	268318606
1126	NC_013504	TA	3	6	48365	48370	50 %	50 %	0 %	0 %	268318606
1127	NC_013504	ACA	2	6	48421	48426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318606
1128	NC_013504	GTTT	2	8	48453	48460	0 %	75 %	25 %	0 %	268318606
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1130	NC_013504	AGC	2	6	48511	48516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318606
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1386	NC_013504	AAAT	2	8	58821	58828	75 %	25 %	0 %	0 %	268318613
1387	NC_013504	AGA	2	6	58860	58865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318613
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1392	NC_013504	CTAT	2	8	58965	58972	25 %	50 %	0 %	25 %	268318613
1393	NC_013504	GGT	2	6	59011	59016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318613
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1443	NC_013504	ATGCA	2	10	62022	62031	40 %	20 %	20 %	20 %	268318615
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1474	NC_013504	AT	3	6	63373	63378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1478	NC_013504	AGTA	2	8	63519	63526	50 %	25 %	25 %	0 %	268318617
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1483	NC_013504	CCTTG	2	10	63654	63663	0 %	40 %	20 %	40 %	268318617
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1495	NC_013504	AGT	2	6	64491	64496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318618
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1498	NC_013504	ATA	2	6	64564	64569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318618
1499	NC_013504	CAA	2	6	64580	64585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318618
1500	NC_013504	TAA	2	6	64631	64636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318618

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