MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 40902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_013504	TAA	2	6	190703	190708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318739
4503	NC_013504	TTG	2	6	190745	190750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318739
4504	NC_013504	TTG	2	6	190765	190770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318739
4505	NC_013504	CAG	2	6	190777	190782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318739
4506	NC_013504	ATA	2	6	190872	190877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318739
4507	NC_013504	AAT	2	6	190933	190938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318740
4508	NC_013504	TAA	2	6	191013	191018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318740
4509	NC_013504	AATA	2	8	191090	191097	75 %	25 %	0 %	0 %	268318740
4510	NC_013504	ATA	2	6	191111	191116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318740
4511	NC_013504	ATCA	2	8	191122	191129	50 %	25 %	0 %	25 %	268318740
4512	NC_013504	TTTAAA	2	12	191174	191185	50 %	50 %	0 %	0 %	268318740
4513	NC_013504	AAT	2	6	191233	191238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318740
4514	NC_013504	AAT	2	6	191249	191254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318740
4515	NC_013504	CCA	2	6	191307	191312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318740
4516	NC_013504	AAT	2	6	191338	191343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318740
4517	NC_013504	T	6	6	191384	191389	0 %	100 %	0 %	0 %	268318740
4518	NC_013504	CTA	2	6	191415	191420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318740
4519	NC_013504	TGC	2	6	191539	191544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4521	NC_013504	AAT	2	6	191671	191676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318741
4522	NC_013504	TTG	2	6	191716	191721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318741
4523	NC_013504	TGT	2	6	191722	191727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318741
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4525	NC_013504	CAA	2	6	191928	191933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318741
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4529	NC_013504	A	6	6	192008	192013	100 %	0 %	0 %	0 %	268318741
4530	NC_013504	A	6	6	192036	192041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013504	TCT	2	6	192044	192049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_013504	GTAA	2	8	192051	192058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_013504	T	6	6	192059	192064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013504	A	6	6	192121	192126	100 %	0 %	0 %	0 %	268318742
4535	NC_013504	TCT	2	6	192162	192167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318742
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4537	NC_013504	AGAT	2	8	192231	192238	50 %	25 %	25 %	0 %	268318742
4538	NC_013504	T	6	6	192247	192252	0 %	100 %	0 %	0 %	268318742
4539	NC_013504	TTG	2	6	192254	192259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318742
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4541	NC_013504	TTGCT	2	10	192401	192410	0 %	60 %	20 %	20 %	268318742
4542	NC_013504	TTGGA	2	10	192420	192429	20 %	40 %	40 %	0 %	268318742
4543	NC_013504	AAT	2	6	192445	192450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318742
4544	NC_013504	A	7	7	192464	192470	100 %	0 %	0 %	0 %	268318742
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4547	NC_013504	TG	3	6	192611	192616	0 %	50 %	50 %	0 %	268318742
4548	NC_013504	TAT	2	6	192619	192624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318742
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4553	NC_013504	AAAAG	2	10	192812	192821	80 %	0 %	20 %	0 %	268318742
4554	NC_013504	AATT	2	8	192866	192873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_013504	GA	3	6	192888	192893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_013504	TGC	2	6	193010	193015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318743
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4558	NC_013504	CTT	2	6	193076	193081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318743
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4561	NC_013504	A	6	6	193144	193149	100 %	0 %	0 %	0 %	268318743
4562	NC_013504	TTG	2	6	193207	193212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318743
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4571	NC_013504	GAAA	2	8	193517	193524	75 %	0 %	25 %	0 %	268318743
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4592	NC_013504	TAT	2	6	194706	194711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318744
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4594	NC_013504	TATG	2	8	194805	194812	25 %	50 %	25 %	0 %	268318744
4595	NC_013504	A	6	6	194867	194872	100 %	0 %	0 %	0 %	268318744
4596	NC_013504	CTT	2	6	194884	194889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318744
4597	NC_013504	CA	3	6	194905	194910	50 %	0 %	0 %	50 %	268318744
4598	NC_013504	CAA	3	9	194916	194924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318744
4599	NC_013504	T	7	7	194971	194977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013504	ATA	2	6	195072	195077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318745
4601	NC_013504	AGTTG	2	10	195103	195112	20 %	40 %	40 %	0 %	268318745
4602	NC_013504	ATA	2	6	195126	195131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318745
4603	NC_013504	A	8	8	195134	195141	100 %	0 %	0 %	0 %	268318745
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4605	NC_013504	TAGTTT	2	12	195162	195173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268318745
4606	NC_013504	TTTA	2	8	195207	195214	25 %	75 %	0 %	0 %	268318745
4607	NC_013504	A	6	6	195220	195225	100 %	0 %	0 %	0 %	268318745
4608	NC_013504	CAG	2	6	195255	195260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318745
4609	NC_013504	CAAG	2	8	195262	195269	50 %	0 %	25 %	25 %	268318745
4610	NC_013504	TGT	2	6	195303	195308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318745
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4612	NC_013504	CTTT	2	8	195401	195408	0 %	75 %	0 %	25 %	268318745
4613	NC_013504	GAT	2	6	195439	195444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318745
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4619	NC_013504	GTC	2	6	195741	195746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318745
4620	NC_013504	GCAC	2	8	195784	195791	25 %	0 %	25 %	50 %	268318745
4621	NC_013504	CTA	2	6	195840	195845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318745
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4749	NC_013504	GTT	2	6	201698	201703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318749
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4751	NC_013504	TGC	2	6	201711	201716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318749
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4862	NC_013504	GGTAA	2	10	206197	206206	40 %	20 %	40 %	0 %	268318754
4863	NC_013504	CTT	2	6	206272	206277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318754
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4867	NC_013504	TCTT	2	8	206398	206405	0 %	75 %	0 %	25 %	268318754
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4996	NC_013504	CAG	2	6	212242	212247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318760
4997	NC_013504	AGCT	2	8	212312	212319	25 %	25 %	25 %	25 %	268318760
4998	NC_013504	ACT	2	6	212322	212327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318760
4999	NC_013504	TAC	2	6	212329	212334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318760
5000	NC_013504	CCG	2	6	212394	212399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318760

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