MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 1148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013200	ACCA	2	8	56386	56393	50 %	0 %	0 %	50 %	258510010
1002	NC_013200	TGT	2	6	56456	56461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510010
1003	NC_013200	ACG	2	6	56470	56475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510010
1004	NC_013200	ATG	2	6	56528	56533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510010
1005	NC_013200	TCT	2	6	56566	56571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510011
1006	NC_013200	TCTT	2	8	56659	56666	0 %	75 %	0 %	25 %	258510011
1007	NC_013200	CTT	2	6	56687	56692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510011
1008	NC_013200	TTG	3	9	56787	56795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510011
1009	NC_013200	CTT	2	6	56819	56824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510011
1010	NC_013200	TA	3	6	56837	56842	50 %	50 %	0 %	0 %	258510011
1011	NC_013200	AAT	2	6	56850	56855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510011
1012	NC_013200	GAT	2	6	56952	56957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510011
1013	NC_013200	GTCA	2	8	56958	56965	25 %	25 %	25 %	25 %	258510011
1014	NC_013200	ACT	2	6	57007	57012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510011
1015	NC_013200	TCA	4	12	57013	57024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510011
1016	NC_013200	TTA	2	6	57097	57102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510011
1017	NC_013200	CAT	2	6	57110	57115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510011
1018	NC_013200	TAA	2	6	57219	57224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013200	TC	3	6	57233	57238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_013200	ATG	2	6	57305	57310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013200	AT	3	6	57314	57319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013200	GGA	2	6	57324	57329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013200	AT	3	6	57342	57347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013200	TCTG	2	8	57371	57378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_013200	ACC	2	6	57439	57444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_013200	A	6	6	57456	57461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013200	AG	3	6	57508	57513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013200	CGC	2	6	57595	57600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510012
1029	NC_013200	CAC	2	6	57813	57818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510012
1030	NC_013200	AC	3	6	57817	57822	50 %	0 %	0 %	50 %	258510012
1031	NC_013200	AGA	2	6	57899	57904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510012
1032	NC_013200	GCT	2	6	58025	58030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510012
1033	NC_013200	ACGA	2	8	58262	58269	50 %	0 %	25 %	25 %	258510012
1034	NC_013200	CTA	2	6	58291	58296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510012
1035	NC_013200	GGT	2	6	58431	58436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510012
1036	NC_013200	TAT	2	6	58442	58447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013200	ATG	2	6	58512	58517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013200	GAA	2	6	58528	58533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013200	CGC	2	6	58625	58630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_013200	TCA	2	6	58678	58683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013200	CTT	2	6	58727	58732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_013200	A	7	7	58838	58844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013200	AAT	2	6	58896	58901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013200	T	8	8	58916	58923	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
1045	NC_013200	AT	3	6	58927	58932	50 %	50 %	0 %	0 %	258510013
1046	NC_013200	CAGAA	2	10	58965	58974	60 %	0 %	20 %	20 %	258510013
1047	NC_013200	A	6	6	59008	59013	100 %	0 %	0 %	0 %	258510013
1048	NC_013200	GAT	2	6	59101	59106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510013
1049	NC_013200	CCA	2	6	59113	59118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510013
1050	NC_013200	TAT	2	6	59162	59167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510013
1051	NC_013200	TTGATT	2	12	59267	59278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258510013
1052	NC_013200	AGTT	2	8	59280	59287	25 %	50 %	25 %	0 %	258510013
1053	NC_013200	ATTG	2	8	59321	59328	25 %	50 %	25 %	0 %	258510013
1054	NC_013200	TAG	2	6	59471	59476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510013
1055	NC_013200	ACC	2	6	59496	59501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510013
1056	NC_013200	TAA	2	6	59519	59524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510013
1057	NC_013200	CAA	2	6	59582	59587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510013
1058	NC_013200	TGT	2	6	59612	59617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510013
1059	NC_013200	CTG	2	6	59620	59625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510013
1060	NC_013200	T	7	7	59650	59656	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
1061	NC_013200	CTG	2	6	59759	59764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510013
1062	NC_013200	ATT	2	6	59796	59801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510013
1063	NC_013200	ATG	2	6	59803	59808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510013
1064	NC_013200	CAA	2	6	59937	59942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510013
1065	NC_013200	CTG	2	6	60032	60037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510013
1066	NC_013200	AAC	2	6	60096	60101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510013
1067	NC_013200	TGC	2	6	60159	60164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510013
1068	NC_013200	ATAA	2	8	60246	60253	75 %	25 %	0 %	0 %	258510013
1069	NC_013200	T	6	6	60313	60318	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
1070	NC_013200	TCC	2	6	60447	60452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510013
1071	NC_013200	CAAT	2	8	60467	60474	50 %	25 %	0 %	25 %	258510013
1072	NC_013200	ATT	2	6	60522	60527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510013
1073	NC_013200	CCA	2	6	60589	60594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510013
1074	NC_013200	GTA	2	6	60727	60732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510013
1075	NC_013200	TAA	2	6	60797	60802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510013
1076	NC_013200	A	6	6	60806	60811	100 %	0 %	0 %	0 %	258510013
1077	NC_013200	A	6	6	60909	60914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013200	TTCC	2	8	60924	60931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_013200	AAG	2	6	60959	60964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013200	TTGCT	2	10	61032	61041	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_013200	CGT	2	6	61061	61066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013200	A	7	7	61118	61124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013200	A	7	7	61209	61215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013200	TA	3	6	61280	61285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013200	A	7	7	61297	61303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013200	T	6	6	61307	61312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013200	TTAATT	2	12	61335	61346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013200	TAA	2	6	61348	61353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013200	TAA	3	9	61382	61390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_013200	TA	3	6	61414	61419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013200	A	6	6	61452	61457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013200	T	6	6	61465	61470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013200	AGAA	2	8	61502	61509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013200	T	6	6	61519	61524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013200	GGT	2	6	61536	61541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510014
1096	NC_013200	CA	3	6	61648	61653	50 %	0 %	0 %	50 %	258510014
1097	NC_013200	GCT	2	6	61669	61674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510014
1098	NC_013200	TCC	2	6	61682	61687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510014
1099	NC_013200	AGTA	2	8	61690	61697	50 %	25 %	25 %	0 %	258510014
1100	NC_013200	CAAG	2	8	61747	61754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_013200	CAG	2	6	61781	61786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013200	AGG	2	6	61790	61795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013200	GGT	2	6	61918	61923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510015
1104	NC_013200	CAT	2	6	61924	61929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510015
1105	NC_013200	TTGG	2	8	62017	62024	0 %	50 %	50 %	0 %	258510016
1106	NC_013200	GTC	2	6	62027	62032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510016
1107	NC_013200	CAAAG	2	10	62083	62092	60 %	0 %	20 %	20 %	258510016
1108	NC_013200	TAT	2	6	62453	62458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510017
1109	NC_013200	A	7	7	62521	62527	100 %	0 %	0 %	0 %	258510017
1110	NC_013200	CAG	2	6	62615	62620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013200	ATG	2	6	62633	62638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013200	CAC	2	6	62712	62717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510018
1113	NC_013200	GCT	2	6	62740	62745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510018
1114	NC_013200	GGC	2	6	62806	62811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510018
1115	NC_013200	TCA	2	6	62864	62869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510018
1116	NC_013200	TGGC	2	8	62937	62944	0 %	25 %	50 %	25 %	258510018
1117	NC_013200	ATG	2	6	63001	63006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510018
1118	NC_013200	TTC	2	6	63020	63025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510018
1119	NC_013200	AC	3	6	63075	63080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_013200	ATT	2	6	63135	63140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013200	ATT	3	9	63165	63173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013200	GTT	2	6	63287	63292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510019
1123	NC_013200	CTTCT	2	10	63432	63441	0 %	60 %	0 %	40 %	258510019
1124	NC_013200	AGC	2	6	63499	63504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510019
1125	NC_013200	T	6	6	63507	63512	0 %	100 %	0 %	0 %	258510019
1126	NC_013200	ATG	2	6	63549	63554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510019
1127	NC_013200	CCT	2	6	63582	63587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_013200	CCCA	2	8	63645	63652	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1129	NC_013200	TGT	2	6	63660	63665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013200	TGTCA	2	10	63676	63685	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_013200	TTC	2	6	63733	63738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_013200	ATTG	2	8	63767	63774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013200	GA	3	6	63797	63802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013200	TCG	2	6	63842	63847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_013200	TCT	2	6	63855	63860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_013200	A	6	6	63940	63945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_013200	TCG	2	6	63969	63974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_013200	AAG	2	6	64034	64039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_013200	GTCC	2	8	64068	64075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1140	NC_013200	TAA	2	6	64114	64119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_013200	TGC	2	6	64177	64182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_013200	TGA	2	6	64203	64208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_013200	TTC	2	6	64213	64218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_013200	CTT	2	6	64294	64299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_013200	TAC	2	6	64326	64331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1146	NC_013200	AAT	2	6	64435	64440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_013200	TAAA	2	8	64441	64448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_013200	TTA	2	6	64493	64498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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