MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 1148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013200	CCTT	2	8	28058	28065	0 %	50 %	0 %	50 %	258509976
502	NC_013200	C	6	6	28068	28073	0 %	0 %	0 %	100 %	258509976
503	NC_013200	ACG	2	6	28259	28264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509976
504	NC_013200	TAAG	2	8	28273	28280	50 %	25 %	25 %	0 %	258509976
505	NC_013200	ATC	2	6	28333	28338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509976
506	NC_013200	ATTC	2	8	28363	28370	25 %	50 %	0 %	25 %	258509976
507	NC_013200	GTC	2	6	28385	28390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509976
508	NC_013200	TGT	2	6	28439	28444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509976
509	NC_013200	GAACCA	2	12	28463	28474	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258509976
510	NC_013200	CTG	2	6	28476	28481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509976
511	NC_013200	ATAG	2	8	28486	28493	50 %	25 %	25 %	0 %	258509976
512	NC_013200	AAT	2	6	28543	28548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509976
513	NC_013200	T	6	6	28585	28590	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
514	NC_013200	TGA	2	6	28652	28657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509976
515	NC_013200	GTT	2	6	28713	28718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509976
516	NC_013200	TAC	2	6	28740	28745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509976
517	NC_013200	AGAT	2	8	28789	28796	50 %	25 %	25 %	0 %	258509976
518	NC_013200	A	6	6	29073	29078	100 %	0 %	0 %	0 %	258509976
519	NC_013200	TAA	2	6	29086	29091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509976
520	NC_013200	GTT	2	6	29177	29182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509976
521	NC_013200	T	6	6	29181	29186	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
522	NC_013200	GCC	2	6	29248	29253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509977
523	NC_013200	GCT	2	6	29334	29339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509977
524	NC_013200	ATG	2	6	29369	29374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509977
525	NC_013200	GT	3	6	29394	29399	0 %	50 %	50 %	0 %	258509977
526	NC_013200	GCT	2	6	29421	29426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509977
527	NC_013200	T	7	7	29461	29467	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
528	NC_013200	CCA	2	6	29494	29499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509977
529	NC_013200	TTG	2	6	29564	29569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509977
530	NC_013200	AATT	2	8	29594	29601	50 %	50 %	0 %	0 %	258509977
531	NC_013200	GTTGCG	2	12	29608	29619	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258509977
532	NC_013200	TCA	2	6	29721	29726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509977
533	NC_013200	AATT	2	8	29738	29745	50 %	50 %	0 %	0 %	258509977
534	NC_013200	ATAATC	2	12	29753	29764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258509977
535	NC_013200	GAC	2	6	29771	29776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509977
536	NC_013200	TTC	2	6	29813	29818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509977
537	NC_013200	CCG	2	6	29848	29853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509977
538	NC_013200	TTG	2	6	29966	29971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509977
539	NC_013200	GCC	2	6	30033	30038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509977
540	NC_013200	CTG	2	6	30098	30103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509977
541	NC_013200	ATG	2	6	30117	30122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509977
542	NC_013200	TA	3	6	30145	30150	50 %	50 %	0 %	0 %	258509977
543	NC_013200	CAA	2	6	30295	30300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509977
544	NC_013200	TAA	2	6	30335	30340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509977
545	NC_013200	CCG	2	6	30341	30346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509977
546	NC_013200	CAC	2	6	30347	30352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509977
547	NC_013200	ATTT	2	8	30362	30369	25 %	75 %	0 %	0 %	258509977
548	NC_013200	TGG	2	6	30499	30504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509977
549	NC_013200	AGT	2	6	30599	30604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509977
550	NC_013200	ATA	2	6	30629	30634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509977
551	NC_013200	AAC	2	6	30731	30736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509977
552	NC_013200	TCA	2	6	30750	30755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509977
553	NC_013200	TTC	2	6	30785	30790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509977
554	NC_013200	CTTGG	2	10	30818	30827	0 %	40 %	40 %	20 %	258509977
555	NC_013200	TCA	2	6	30837	30842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509977
556	NC_013200	CAG	2	6	30851	30856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509977
557	NC_013200	ACG	2	6	30872	30877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509977
558	NC_013200	TTA	2	6	30916	30921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509977
559	NC_013200	TCG	2	6	30937	30942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509977
560	NC_013200	CTC	2	6	31028	31033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509977
561	NC_013200	GCT	2	6	31060	31065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509977
562	NC_013200	CAA	2	6	31177	31182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509977
563	NC_013200	AGA	2	6	31183	31188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509977
564	NC_013200	T	7	7	31252	31258	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
565	NC_013200	TTG	2	6	31310	31315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509977
566	NC_013200	ATC	2	6	31364	31369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509977
567	NC_013200	CCG	2	6	31418	31423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509977
568	NC_013200	AAG	2	6	31431	31436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509977
569	NC_013200	CAAA	2	8	31521	31528	75 %	0 %	0 %	25 %	258509977
570	NC_013200	GCA	2	6	31813	31818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509977
571	NC_013200	T	7	7	31898	31904	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
572	NC_013200	ATTA	2	8	31931	31938	50 %	50 %	0 %	0 %	258509977
573	NC_013200	CAC	2	6	32012	32017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509977
574	NC_013200	ACC	2	6	32033	32038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509977
575	NC_013200	AAC	2	6	32058	32063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509977
576	NC_013200	CAT	2	6	32089	32094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509977
577	NC_013200	CGG	2	6	32128	32133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509977
578	NC_013200	GCT	2	6	32145	32150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509977
579	NC_013200	GTTATT	2	12	32234	32245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258509977
580	NC_013200	ATTG	2	8	32314	32321	25 %	50 %	25 %	0 %	258509977
581	NC_013200	AAC	2	6	32342	32347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509977
582	NC_013200	TAT	2	6	32415	32420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013200	A	6	6	32497	32502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013200	A	7	7	32583	32589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013200	GAC	2	6	32622	32627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013200	GCTA	2	8	32665	32672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_013200	CAA	2	6	32726	32731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509978
588	NC_013200	GCT	2	6	32771	32776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509978
589	NC_013200	CTCGA	2	10	32864	32873	20 %	20 %	20 %	40 %	258509978
590	NC_013200	TTC	2	6	32978	32983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509978
591	NC_013200	CG	3	6	33015	33020	0 %	0 %	50 %	50 %	258509978
592	NC_013200	GCT	2	6	33112	33117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509978
593	NC_013200	ACA	2	6	33126	33131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509978
594	NC_013200	AAG	2	6	33143	33148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509978
595	NC_013200	CGC	2	6	33155	33160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509978
596	NC_013200	AAG	2	6	33197	33202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509978
597	NC_013200	TGA	2	6	33301	33306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509978
598	NC_013200	ATC	2	6	33350	33355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509978
599	NC_013200	CGA	2	6	33412	33417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509978
600	NC_013200	TTG	2	6	33486	33491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013200	TTC	2	6	33572	33577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013200	TC	3	6	33590	33595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_013200	TAC	2	6	33686	33691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013200	ATC	2	6	33735	33740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013200	ACTTG	2	10	33746	33755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
606	NC_013200	A	7	7	33771	33777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013200	CTTG	2	8	33792	33799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_013200	CAA	2	6	33845	33850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013200	A	6	6	33916	33921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013200	CTA	2	6	33932	33937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013200	T	6	6	33962	33967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013200	T	6	6	33969	33974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013200	ATG	2	6	34044	34049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013200	TCAA	2	8	34052	34059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_013200	TTG	2	6	34076	34081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013200	AAC	2	6	34088	34093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013200	T	6	6	34130	34135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013200	TCTA	2	8	34230	34237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_013200	TTAT	2	8	34300	34307	25 %	75 %	0 %	0 %	258509979
620	NC_013200	ATTC	2	8	34312	34319	25 %	50 %	0 %	25 %	258509979
621	NC_013200	TGAT	2	8	34349	34356	25 %	50 %	25 %	0 %	258509979
622	NC_013200	AGG	2	6	34416	34421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509979
623	NC_013200	AAC	2	6	34494	34499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509979
624	NC_013200	CAA	2	6	34552	34557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509979
625	NC_013200	ACA	2	6	34608	34613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509979
626	NC_013200	TGA	2	6	34616	34621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509979
627	NC_013200	TTA	2	6	34761	34766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509979
628	NC_013200	GAC	2	6	34792	34797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509979
629	NC_013200	TTG	2	6	34820	34825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509979
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631	NC_013200	TGG	2	6	34932	34937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509979
632	NC_013200	CCCATC	2	12	34943	34954	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	258509979
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762	NC_013200	TCG	2	6	42387	42392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509990
763	NC_013200	GGCG	2	8	42438	42445	0 %	0 %	75 %	25 %	258509990
764	NC_013200	GAC	2	6	42545	42550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509990
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768	NC_013200	AC	3	6	42851	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
769	NC_013200	CATGCA	2	12	42916	42927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258509990
770	NC_013200	CA	3	6	42958	42963	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
771	NC_013200	ACA	2	6	42981	42986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509990
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775	NC_013200	CATAT	2	10	43179	43188	40 %	40 %	0 %	20 %	258509990
776	NC_013200	CATT	2	8	43222	43229	25 %	50 %	0 %	25 %	258509990
777	NC_013200	AATT	2	8	43236	43243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
778	NC_013200	GAT	2	6	43300	43305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
779	NC_013200	TTTG	2	8	43436	43443	0 %	75 %	25 %	0 %	258509991
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783	NC_013200	CT	3	6	43602	43607	0 %	50 %	0 %	50 %	258509991
784	NC_013200	AACT	2	8	43631	43638	50 %	25 %	0 %	25 %	258509991
785	NC_013200	TGC	2	6	43644	43649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509991
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792	NC_013200	GAG	2	6	44397	44402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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796	NC_013200	CGT	2	6	44718	44723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509992
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820	NC_013200	T	6	6	46366	46371	0 %	100 %	0 %	0 %	258509995
821	NC_013200	ATT	2	6	46482	46487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509995
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823	NC_013200	CTT	2	6	46543	46548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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831	NC_013200	AGTCA	2	10	46821	46830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
832	NC_013200	TACT	2	8	46872	46879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
833	NC_013200	TAA	2	6	46882	46887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
834	NC_013200	ATT	3	9	46944	46952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509996
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863	NC_013200	TAAA	2	8	48547	48554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
864	NC_013200	CGTGT	2	10	48658	48667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
865	NC_013200	TTTG	2	8	48727	48734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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867	NC_013200	GAG	2	6	48847	48852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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878	NC_013200	CAA	2	6	49656	49661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510001
879	NC_013200	GCA	2	6	49706	49711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510001
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883	NC_013200	A	6	6	50058	50063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
884	NC_013200	TGGA	2	8	50079	50086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
885	NC_013200	GAAAAA	2	12	50094	50105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
886	NC_013200	ATAAA	2	10	50134	50143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
887	NC_013200	TTTG	2	8	50174	50181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
888	NC_013200	T	6	6	50268	50273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
889	NC_013200	TGA	2	6	50289	50294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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891	NC_013200	AGA	2	6	50396	50401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510002
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893	NC_013200	AGA	2	6	50435	50440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510002
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899	NC_013200	AAG	2	6	50855	50860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510002
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