MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538192
2	NC_013199	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538192
3	NC_013199	GCATCA	2	12	267	278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258538192
4	NC_013199	CGATGA	2	12	285	296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258538192
5	NC_013199	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538192
6	NC_013199	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538192
7	NC_013199	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	258538192
8	NC_013199	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538192
9	NC_013199	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538192
10	NC_013199	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	258538192
11	NC_013199	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	258538192
12	NC_013199	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538192
13	NC_013199	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
14	NC_013199	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
15	NC_013199	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538192
16	NC_013199	GCCT	2	8	746	753	0 %	25 %	25 %	50 %	258538192
17	NC_013199	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538192
18	NC_013199	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
19	NC_013199	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
20	NC_013199	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538192
21	NC_013199	GA	3	6	1184	1189	50 %	0 %	50 %	0 %	258538192
22	NC_013199	A	6	6	1265	1270	100 %	0 %	0 %	0 %	258538192
23	NC_013199	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538192
24	NC_013199	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013199	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013199	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013199	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013199	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013199	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538193
30	NC_013199	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
31	NC_013199	GC	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	258538193
32	NC_013199	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538193
33	NC_013199	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538193
34	NC_013199	CGTTGC	2	12	2042	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538193
35	NC_013199	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
36	NC_013199	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538193
37	NC_013199	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538193
38	NC_013199	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
39	NC_013199	CGT	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538193
40	NC_013199	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538193
41	NC_013199	CAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538193
42	NC_013199	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013199	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013199	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538194
45	NC_013199	ATG	2	6	2878	2883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538194
46	NC_013199	ATAG	2	8	2895	2902	50 %	25 %	25 %	0 %	258538194
47	NC_013199	TCC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013199	GCAA	2	8	2987	2994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013199	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013199	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013199	TTTA	2	8	3045	3052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013199	TAAAA	2	10	3091	3100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013199	GAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013199	T	6	6	3176	3181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013199	TAGGC	2	10	3302	3311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013199	G	6	6	3371	3376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013199	T	6	6	3428	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013199	TAAT	2	8	3450	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013199	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013199	CGA	3	9	3521	3529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538195
61	NC_013199	CAC	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538195
62	NC_013199	TGAT	2	8	3593	3600	25 %	50 %	25 %	0 %	258538195
63	NC_013199	GCG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538195
64	NC_013199	CGT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538195
65	NC_013199	GAT	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538195
66	NC_013199	A	6	6	3761	3766	100 %	0 %	0 %	0 %	258538196
67	NC_013199	GCAAG	2	10	3836	3845	40 %	0 %	40 %	20 %	258538196
68	NC_013199	GC	3	6	3882	3887	0 %	0 %	50 %	50 %	258538196
69	NC_013199	CAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538196
70	NC_013199	GC	3	6	3939	3944	0 %	0 %	50 %	50 %	258538196
71	NC_013199	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538196
72	NC_013199	TCA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538196
73	NC_013199	GATCG	2	10	4026	4035	20 %	20 %	40 %	20 %	258538196
74	NC_013199	TTTG	2	8	4079	4086	0 %	75 %	25 %	0 %	258538196
75	NC_013199	CGG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538196
76	NC_013199	GGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538196
77	NC_013199	TGC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538196
78	NC_013199	TGC	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538196
79	NC_013199	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538196
80	NC_013199	AGC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
81	NC_013199	GAT	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538196
82	NC_013199	CAG	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
83	NC_013199	CAC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538196
84	NC_013199	GAC	3	9	4763	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
85	NC_013199	ATC	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538196
86	NC_013199	GAG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013199	AAGA	2	8	4897	4904	75 %	0 %	25 %	0 %	258538197
88	NC_013199	GAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
89	NC_013199	AAGA	2	8	4918	4925	75 %	0 %	25 %	0 %	258538197
90	NC_013199	GCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538197
91	NC_013199	ATG	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
92	NC_013199	CAT	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538197
93	NC_013199	TTGAAG	2	12	5102	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
94	NC_013199	GTC	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
95	NC_013199	GGT	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538197
96	NC_013199	TGGCGG	2	12	5238	5249	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258538197
97	NC_013199	CGG	2	6	5262	5267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
98	NC_013199	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
99	NC_013199	CGG	2	6	5334	5339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
100	NC_013199	GAGCAT	2	12	5410	5421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258538197
101	NC_013199	CCGGAT	2	12	5443	5454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258538197
102	NC_013199	TGA	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
103	NC_013199	GCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
104	NC_013199	GGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
105	NC_013199	GAA	3	9	5628	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
106	NC_013199	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
107	NC_013199	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
108	NC_013199	GTT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
109	NC_013199	AGACCA	2	12	5942	5953	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258538197
110	NC_013199	GGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538197
111	NC_013199	CAA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
112	NC_013199	ATT	2	6	6049	6054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538197
113	NC_013199	GCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
114	NC_013199	AAG	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
115	NC_013199	ACA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
116	NC_013199	GGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
117	NC_013199	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
118	NC_013199	ATC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538197
119	NC_013199	CCGATG	2	12	6425	6436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258538197
120	NC_013199	GTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
121	NC_013199	ATG	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
122	NC_013199	GCC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538197
123	NC_013199	GCCA	2	8	6667	6674	25 %	0 %	25 %	50 %	258538197
124	NC_013199	ACC	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538197
125	NC_013199	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
126	NC_013199	GAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
127	NC_013199	TTG	2	6	6821	6826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
128	NC_013199	AAC	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
129	NC_013199	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013199	GAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
131	NC_013199	ACGT	2	8	7021	7028	25 %	25 %	25 %	25 %	258538198
132	NC_013199	ATGA	2	8	7068	7075	50 %	25 %	25 %	0 %	258538198
133	NC_013199	AAG	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
134	NC_013199	TCG	2	6	7120	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
135	NC_013199	TGACGG	2	12	7250	7261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258538198
136	NC_013199	GCG	3	9	7263	7271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538198
137	NC_013199	CAA	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538198
138	NC_013199	GATT	2	8	7340	7347	25 %	50 %	25 %	0 %	258538198
139	NC_013199	GTT	2	6	7383	7388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538198
140	NC_013199	GC	3	6	7395	7400	0 %	0 %	50 %	50 %	258538198
141	NC_013199	CTG	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
142	NC_013199	ACC	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538198
143	NC_013199	CCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538198
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150	NC_013199	TGG	2	6	7729	7734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
151	NC_013199	GAAAA	2	10	7758	7767	80 %	0 %	20 %	0 %	258538198
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158	NC_013199	TGA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
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189	NC_013199	AAAAT	2	10	10024	10033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_013199	AGG	2	6	12931	12936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
248	NC_013199	CAA	2	6	12950	12955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538205
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250	NC_013199	CGT	4	12	12968	12979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538205
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253	NC_013199	AGCG	2	8	13134	13141	25 %	0 %	50 %	25 %	258538205
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256	NC_013199	T	7	7	13226	13232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013199	ATT	2	6	13472	13477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538206
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261	NC_013199	GTG	2	6	13609	13614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538206
262	NC_013199	TGAA	2	8	13651	13658	50 %	25 %	25 %	0 %	258538206
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398	NC_013199	T	6	6	20320	20325	0 %	100 %	0 %	0 %	258538213
399	NC_013199	TTC	2	6	20330	20335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538213
400	NC_013199	GAA	2	6	20345	20350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538213
401	NC_013199	AAG	2	6	20372	20377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538213
402	NC_013199	CAT	2	6	20380	20385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538213
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405	NC_013199	GCTG	2	8	20663	20670	0 %	25 %	50 %	25 %	258538213
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412	NC_013199	T	6	6	21085	21090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_013199	TCT	2	6	21195	21200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_013199	AAC	2	6	21322	21327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_013199	CTG	2	6	21370	21375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_013199	TCC	2	6	21452	21457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_013199	ATG	2	6	21475	21480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_013199	CAA	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_013199	TTG	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_013199	TTTG	2	8	21652	21659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
430	NC_013199	GGC	2	6	21696	21701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_013199	GTT	2	6	25111	25116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538216
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