MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_013199	ATA	3	9	2040172	2040180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540211
38003	NC_013199	CGG	2	6	2040197	2040202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540211
38004	NC_013199	GAT	2	6	2040237	2040242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540211
38005	NC_013199	GCTG	2	8	2040251	2040258	0 %	25 %	50 %	25 %	258540211
38006	NC_013199	TGT	2	6	2040407	2040412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540211
38007	NC_013199	GCC	2	6	2040425	2040430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540211
38008	NC_013199	CCT	2	6	2040439	2040444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38009	NC_013199	AAT	2	6	2040493	2040498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38010	NC_013199	CAA	2	6	2040519	2040524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38011	NC_013199	ACT	2	6	2040565	2040570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38012	NC_013199	GACAAC	2	12	2040585	2040596	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258540212
38013	NC_013199	ATG	2	6	2040713	2040718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540212
38014	NC_013199	GC	3	6	2040892	2040897	0 %	0 %	50 %	50 %	258540212
38015	NC_013199	AAG	2	6	2040992	2040997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540212
38016	NC_013199	GGC	2	6	2041081	2041086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540212
38017	NC_013199	TTGA	2	8	2041087	2041094	25 %	50 %	25 %	0 %	258540212
38018	NC_013199	GCA	2	6	2041187	2041192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540212
38019	NC_013199	ACC	3	9	2041274	2041282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540212
38020	NC_013199	GTCGA	2	10	2041309	2041318	20 %	20 %	40 %	20 %	258540212
38021	NC_013199	AGC	3	9	2041541	2041549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38022	NC_013199	T	6	6	2041552	2041557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38023	NC_013199	TGC	2	6	2041561	2041566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38024	NC_013199	GGC	2	6	2041654	2041659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540213
38025	NC_013199	GAC	2	6	2041758	2041763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540213
38026	NC_013199	GCT	2	6	2041837	2041842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540213
38027	NC_013199	GATC	2	8	2041853	2041860	25 %	25 %	25 %	25 %	258540213
38028	NC_013199	GCC	2	6	2041947	2041952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540213
38029	NC_013199	TCG	2	6	2041966	2041971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540213
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38031	NC_013199	AAG	2	6	2042007	2042012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540213
38032	NC_013199	CAAT	2	8	2042018	2042025	50 %	25 %	0 %	25 %	258540213
38033	NC_013199	TTA	2	6	2042089	2042094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540213
38034	NC_013199	AAACGC	2	12	2042100	2042111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258540213
38035	NC_013199	ATCA	2	8	2042187	2042194	50 %	25 %	0 %	25 %	258540213
38036	NC_013199	TCA	2	6	2042216	2042221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540213
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38038	NC_013199	GTC	2	6	2042335	2042340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540213
38039	NC_013199	TGA	2	6	2042347	2042352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540213
38040	NC_013199	GTC	2	6	2042358	2042363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540213
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38042	NC_013199	T	6	6	2042436	2042441	0 %	100 %	0 %	0 %	258540213
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38045	NC_013199	TCA	2	6	2042521	2042526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540213
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38048	NC_013199	TGA	2	6	2042677	2042682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540213
38049	NC_013199	GCC	3	9	2042683	2042691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540213
38050	NC_013199	TCA	2	6	2042728	2042733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540213
38051	NC_013199	ATA	2	6	2042739	2042744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540213
38052	NC_013199	TGC	2	6	2042768	2042773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540213
38053	NC_013199	GC	3	6	2042772	2042777	0 %	0 %	50 %	50 %	258540213
38054	NC_013199	ACC	2	6	2042859	2042864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540213
38055	NC_013199	TTA	2	6	2042986	2042991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540213
38056	NC_013199	GGC	2	6	2043152	2043157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540213
38057	NC_013199	CACCG	2	10	2043309	2043318	20 %	0 %	20 %	60 %	258540213
38058	NC_013199	GTT	2	6	2043343	2043348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540213
38059	NC_013199	TGAA	2	8	2043383	2043390	50 %	25 %	25 %	0 %	258540213
38060	NC_013199	TCC	2	6	2043410	2043415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38061	NC_013199	CAT	2	6	2043440	2043445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540214
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38063	NC_013199	ATA	2	6	2043783	2043788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540214
38064	NC_013199	ATC	2	6	2043831	2043836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540214
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38067	NC_013199	TGA	2	6	2044088	2044093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540214
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38069	NC_013199	T	7	7	2044424	2044430	0 %	100 %	0 %	0 %	258540214
38070	NC_013199	TTA	2	6	2044498	2044503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540214
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38072	NC_013199	TAAG	2	8	2044611	2044618	50 %	25 %	25 %	0 %	258540214
38073	NC_013199	ATCA	2	8	2044656	2044663	50 %	25 %	0 %	25 %	258540214
38074	NC_013199	CGAT	2	8	2044705	2044712	25 %	25 %	25 %	25 %	258540214
38075	NC_013199	TGGT	2	8	2044798	2044805	0 %	50 %	50 %	0 %	258540214
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38090	NC_013199	ATGT	2	8	2045707	2045714	25 %	50 %	25 %	0 %	258540214
38091	NC_013199	CAA	2	6	2045721	2045726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540214
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38102	NC_013199	TCT	2	6	2046574	2046579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540215
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38104	NC_013199	TTTG	2	8	2046710	2046717	0 %	75 %	25 %	0 %	258540215
38105	NC_013199	TCA	2	6	2046856	2046861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540215
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38107	NC_013199	ATGG	2	8	2046936	2046943	25 %	25 %	50 %	0 %	258540215
38108	NC_013199	TG	3	6	2047017	2047022	0 %	50 %	50 %	0 %	258540215
38109	NC_013199	ATGA	2	8	2047035	2047042	50 %	25 %	25 %	0 %	258540215
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38113	NC_013199	ATA	2	6	2047170	2047175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540215
38114	NC_013199	GC	3	6	2047394	2047399	0 %	0 %	50 %	50 %	258540215
38115	NC_013199	TTC	2	6	2047492	2047497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540216
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38117	NC_013199	GTTCTT	2	12	2047744	2047755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	258540216
38118	NC_013199	TA	3	6	2047776	2047781	50 %	50 %	0 %	0 %	258540216
38119	NC_013199	TCT	2	6	2047802	2047807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540216
38120	NC_013199	CTT	2	6	2048022	2048027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540216
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38128	NC_013199	CTG	2	6	2048520	2048525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540216
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38146	NC_013199	CTT	3	9	2049764	2049772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540218
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38148	NC_013199	T	6	6	2049794	2049799	0 %	100 %	0 %	0 %	258540218
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38176	NC_013199	T	7	7	2051948	2051954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38177	NC_013199	ACC	2	6	2051962	2051967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38178	NC_013199	TCC	2	6	2051990	2051995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38199	NC_013199	CAAA	2	8	2053338	2053345	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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38217	NC_013199	TTAT	2	8	2054407	2054414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38218	NC_013199	ATA	2	6	2054422	2054427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38219	NC_013199	ATA	2	6	2054432	2054437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38220	NC_013199	GGTTTT	2	12	2054441	2054452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38221	NC_013199	T	6	6	2054449	2054454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38222	NC_013199	CAA	2	6	2054556	2054561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38223	NC_013199	A	7	7	2054560	2054566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38224	NC_013199	ATG	2	6	2054604	2054609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38225	NC_013199	TAC	2	6	2054651	2054656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540221
38226	NC_013199	ACG	2	6	2054752	2054757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540221
38227	NC_013199	GCC	2	6	2054790	2054795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540221
38228	NC_013199	ATG	2	6	2054872	2054877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540221
38229	NC_013199	T	6	6	2054886	2054891	0 %	100 %	0 %	0 %	258540221
38230	NC_013199	TCGTGA	2	12	2054930	2054941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258540221
38231	NC_013199	TAACA	2	10	2055021	2055030	60 %	20 %	0 %	20 %	258540221
38232	NC_013199	GCG	2	6	2055065	2055070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540221
38233	NC_013199	CGT	2	6	2055075	2055080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540221
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38474	NC_013199	CCT	2	6	2068042	2068047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540231
38475	NC_013199	CTT	2	6	2068051	2068056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540231
38476	NC_013199	TTC	2	6	2068092	2068097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540231
38477	NC_013199	GCC	2	6	2068218	2068223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540231
38478	NC_013199	GTG	2	6	2068345	2068350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540231
38479	NC_013199	ATAC	2	8	2068397	2068404	50 %	25 %	0 %	25 %	258540231
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38489	NC_013199	CAA	2	6	2068962	2068967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38490	NC_013199	CAA	2	6	2068978	2068983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38491	NC_013199	CAT	2	6	2068987	2068992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38492	NC_013199	A	7	7	2069019	2069025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38493	NC_013199	A	6	6	2069048	2069053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38494	NC_013199	AC	3	6	2069099	2069104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38495	NC_013199	TTG	2	6	2069119	2069124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540232
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38497	NC_013199	TGCA	2	8	2069314	2069321	25 %	25 %	25 %	25 %	258540232
38498	NC_013199	TCA	2	6	2069360	2069365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540232
38499	NC_013199	AGG	2	6	2069443	2069448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258540232
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