MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_013199	TTG	2	6	129415	129420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538309
2503	NC_013199	ATC	3	9	129503	129511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538309
2504	NC_013199	CCAA	2	8	129610	129617	50 %	0 %	0 %	50 %	258538309
2505	NC_013199	TGC	2	6	129717	129722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538309
2506	NC_013199	CTG	2	6	129769	129774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538309
2507	NC_013199	TGAT	2	8	129812	129819	25 %	50 %	25 %	0 %	258538309
2508	NC_013199	TCA	2	6	129947	129952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538309
2509	NC_013199	GCG	2	6	129965	129970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538309
2510	NC_013199	CCGC	2	8	129983	129990	0 %	0 %	25 %	75 %	258538309
2511	NC_013199	TTA	2	6	130016	130021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538309
2512	NC_013199	GCG	3	9	130034	130042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538309
2513	NC_013199	CGC	2	6	130056	130061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538309
2514	NC_013199	TTGC	2	8	130105	130112	0 %	50 %	25 %	25 %	258538309
2515	NC_013199	TGA	2	6	130158	130163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538310
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2518	NC_013199	AAGA	2	8	130325	130332	75 %	0 %	25 %	0 %	258538310
2519	NC_013199	GAA	2	6	130339	130344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538310
2520	NC_013199	GAC	2	6	130379	130384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538310
2521	NC_013199	GTT	2	6	130391	130396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538310
2522	NC_013199	TTCG	2	8	130527	130534	0 %	50 %	25 %	25 %	258538310
2523	NC_013199	AAT	2	6	130611	130616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538310
2524	NC_013199	CGG	2	6	130640	130645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_013199	T	7	7	130649	130655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_013199	AGCC	2	8	130787	130794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_013199	AGCC	2	8	130909	130916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_013199	ATG	2	6	131091	131096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_013199	AGG	2	6	131187	131192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_013199	CAG	2	6	131220	131225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538311
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2534	NC_013199	ACAATC	2	12	131422	131433	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	258538311
2535	NC_013199	TGG	2	6	131473	131478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538311
2536	NC_013199	TAT	2	6	131508	131513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538311
2537	NC_013199	GCA	2	6	131525	131530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538311
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2542	NC_013199	GATC	2	8	131714	131721	25 %	25 %	25 %	25 %	258538311
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2549	NC_013199	GAA	3	9	132006	132014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538311
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2553	NC_013199	ATT	2	6	132394	132399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538311
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2555	NC_013199	GCG	2	6	132439	132444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538311
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2557	NC_013199	TGAAGT	2	12	132467	132478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538311
2558	NC_013199	CAT	2	6	132479	132484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538311
2559	NC_013199	GAA	2	6	132488	132493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538311
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2561	NC_013199	CTG	2	6	132692	132697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538312
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2574	NC_013199	GAT	2	6	133067	133072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538312
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2589	NC_013199	TGG	2	6	133837	133842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2591	NC_013199	CAT	2	6	133955	133960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538313
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2599	NC_013199	A	6	6	134318	134323	100 %	0 %	0 %	0 %	258538313
2600	NC_013199	CGG	2	6	134336	134341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538313
2601	NC_013199	GTG	2	6	134383	134388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538313
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2603	NC_013199	GAA	2	6	134508	134513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538313
2604	NC_013199	TGG	2	6	134575	134580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538313
2605	NC_013199	GCT	2	6	134602	134607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538313
2606	NC_013199	ACCGC	2	10	134656	134665	20 %	0 %	20 %	60 %	258538313
2607	NC_013199	GCC	3	9	134670	134678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538313
2608	NC_013199	CA	3	6	134679	134684	50 %	0 %	0 %	50 %	258538313
2609	NC_013199	CGCCAA	2	12	134738	134749	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258538313
2610	NC_013199	AATC	2	8	134775	134782	50 %	25 %	0 %	25 %	258538313
2611	NC_013199	GCA	2	6	134827	134832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538313
2612	NC_013199	GCC	3	9	134841	134849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538313
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2617	NC_013199	CAG	2	6	135087	135092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538313
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2620	NC_013199	GAT	2	6	135192	135197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538313
2621	NC_013199	GCC	2	6	135198	135203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538313
2622	NC_013199	GCT	2	6	135211	135216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538313
2623	NC_013199	GTGA	2	8	135225	135232	25 %	25 %	50 %	0 %	258538313
2624	NC_013199	CAA	2	6	135257	135262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538313
2625	NC_013199	CCG	2	6	135283	135288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538313
2626	NC_013199	CCG	2	6	135370	135375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538313
2627	NC_013199	TGA	2	6	135395	135400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538313
2628	NC_013199	CAT	2	6	135435	135440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538313
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2630	NC_013199	GTTT	2	8	135547	135554	0 %	75 %	25 %	0 %	258538313
2631	NC_013199	CGG	2	6	135584	135589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538313
2632	NC_013199	TTC	2	6	135741	135746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538313
2633	NC_013199	T	6	6	135774	135779	0 %	100 %	0 %	0 %	258538313
2634	NC_013199	CCAC	2	8	135868	135875	25 %	0 %	0 %	75 %	258538313
2635	NC_013199	TCT	2	6	135923	135928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538313
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2637	NC_013199	TTGA	2	8	135976	135983	25 %	50 %	25 %	0 %	258538314
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2645	NC_013199	GCTG	2	8	136311	136318	0 %	25 %	50 %	25 %	258538314
2646	NC_013199	AGGCT	2	10	136338	136347	20 %	20 %	40 %	20 %	258538314
2647	NC_013199	GCG	2	6	136355	136360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538314
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2650	NC_013199	CAAT	2	8	136536	136543	50 %	25 %	0 %	25 %	258538314
2651	NC_013199	A	6	6	136635	136640	100 %	0 %	0 %	0 %	258538314
2652	NC_013199	GGC	2	6	136641	136646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538314
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2654	NC_013199	CTTT	2	8	136854	136861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2655	NC_013199	CAT	2	6	136897	136902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538315
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2659	NC_013199	CGGGGA	2	12	137077	137088	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258538315
2660	NC_013199	TGGCG	2	10	137106	137115	0 %	20 %	60 %	20 %	258538315
2661	NC_013199	GGC	2	6	137171	137176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538315
2662	NC_013199	GATC	2	8	137306	137313	25 %	25 %	25 %	25 %	258538315
2663	NC_013199	GCA	2	6	137338	137343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538315
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2669	NC_013199	ATCA	2	8	137568	137575	50 %	25 %	0 %	25 %	258538315
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2682	NC_013199	CTT	2	6	138218	138223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538316
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2684	NC_013199	GATA	2	8	138594	138601	50 %	25 %	25 %	0 %	258538316
2685	NC_013199	AATCA	2	10	138644	138653	60 %	20 %	0 %	20 %	258538316
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2693	NC_013199	GTA	2	6	139042	139047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2694	NC_013199	TGC	2	6	139098	139103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2699	NC_013199	GAT	2	6	139261	139266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538317
2700	NC_013199	CTGA	2	8	139267	139274	25 %	25 %	25 %	25 %	258538317
2701	NC_013199	CTG	2	6	139389	139394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538317
2702	NC_013199	TTAA	2	8	139430	139437	50 %	50 %	0 %	0 %	258538317
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2711	NC_013199	A	6	6	139933	139938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2712	NC_013199	GAT	2	6	139985	139990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2713	NC_013199	ATT	2	6	140007	140012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2714	NC_013199	T	6	6	140011	140016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2715	NC_013199	GGAT	2	8	140196	140203	25 %	25 %	50 %	0 %	258538318
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2721	NC_013199	GAAT	2	8	140424	140431	50 %	25 %	25 %	0 %	258538318
2722	NC_013199	CAGCT	2	10	140439	140448	20 %	20 %	20 %	40 %	258538318
2723	NC_013199	TGG	2	6	140452	140457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538318
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2728	NC_013199	A	7	7	140751	140757	100 %	0 %	0 %	0 %	258538319
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2731	NC_013199	GCA	2	6	141208	141213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538319
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2736	NC_013199	A	7	7	141538	141544	100 %	0 %	0 %	0 %	258538319
2737	NC_013199	TGA	2	6	141548	141553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538319
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2741	NC_013199	AGC	2	6	141713	141718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538319
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2746	NC_013199	AGC	2	6	141899	141904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538319
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2987	NC_013199	GCT	2	6	154468	154473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2988	NC_013199	GAA	2	6	154478	154483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2989	NC_013199	AGC	2	6	154498	154503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2990	NC_013199	GAAT	2	8	154520	154527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2991	NC_013199	GCT	2	6	154555	154560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2992	NC_013199	ATG	2	6	154600	154605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2993	NC_013199	TA	3	6	154615	154620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_013199	AGG	2	6	154729	154734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_013199	CG	3	6	154857	154862	0 %	0 %	50 %	50 %	258538331
2996	NC_013199	ATG	3	9	154923	154931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538331
2997	NC_013199	GCC	2	6	154976	154981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538331
2998	NC_013199	GC	3	6	155036	155041	0 %	0 %	50 %	50 %	258538331
2999	NC_013199	CGT	2	6	155098	155103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538331
3000	NC_013199	CGGTG	2	10	155161	155170	0 %	20 %	60 %	20 %	258538331

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