MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013199	GTT	2	6	77438	77443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013199	GGCT	3	12	77532	77543	0 %	25 %	50 %	25 %	258538257
1503	NC_013199	GTGGC	2	10	77566	77575	0 %	20 %	60 %	20 %	258538257
1504	NC_013199	GGT	2	6	77626	77631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538257
1505	NC_013199	GTT	2	6	77642	77647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538257
1506	NC_013199	GCT	2	6	77659	77664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538257
1507	NC_013199	CAA	2	6	77668	77673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538257
1508	NC_013199	TAA	2	6	77740	77745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013199	CAGT	2	8	77756	77763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_013199	TGAT	2	8	77778	77785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013199	GAA	2	6	77884	77889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013199	A	6	6	77917	77922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013199	A	6	6	77934	77939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013199	GAC	2	6	77940	77945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013199	GAT	2	6	78125	78130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538258
1516	NC_013199	CCG	2	6	78141	78146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538258
1517	NC_013199	ATG	2	6	78213	78218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538258
1518	NC_013199	GGC	2	6	78284	78289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538258
1519	NC_013199	TGA	2	6	78337	78342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538258
1520	NC_013199	CAA	2	6	78347	78352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538258
1521	NC_013199	ATG	3	9	78408	78416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538258
1522	NC_013199	ACA	2	6	78418	78423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538258
1523	NC_013199	GCCAA	2	10	78501	78510	40 %	0 %	20 %	40 %	258538258
1524	NC_013199	TGC	2	6	78621	78626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538258
1525	NC_013199	GTC	2	6	78649	78654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538259
1526	NC_013199	AAT	2	6	78666	78671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538259
1527	NC_013199	TCG	2	6	78722	78727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538259
1528	NC_013199	AGTTC	2	10	78735	78744	20 %	40 %	20 %	20 %	258538259
1529	NC_013199	TTC	2	6	78809	78814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538259
1530	NC_013199	TGT	2	6	78822	78827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538259
1531	NC_013199	GAA	2	6	78856	78861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538259
1532	NC_013199	ATC	2	6	78868	78873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538259
1533	NC_013199	CCGT	2	8	78908	78915	0 %	25 %	25 %	50 %	258538259
1534	NC_013199	CGT	2	6	78957	78962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538259
1535	NC_013199	AAACC	2	10	78963	78972	60 %	0 %	0 %	40 %	258538259
1536	NC_013199	CTTT	2	8	79092	79099	0 %	75 %	0 %	25 %	258538259
1537	NC_013199	CTT	2	6	79126	79131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538259
1538	NC_013199	CTT	3	9	79134	79142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538259
1539	NC_013199	T	6	6	79207	79212	0 %	100 %	0 %	0 %	258538259
1540	NC_013199	CAT	2	6	79320	79325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538259
1541	NC_013199	ATC	2	6	79331	79336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538259
1542	NC_013199	ACC	2	6	79346	79351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538259
1543	NC_013199	GTT	2	6	79366	79371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538259
1544	NC_013199	GTC	2	6	79379	79384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538259
1545	NC_013199	ACC	2	6	79513	79518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538259
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1547	NC_013199	AGT	2	6	79553	79558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538259
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1549	NC_013199	GC	3	6	79591	79596	0 %	0 %	50 %	50 %	258538260
1550	NC_013199	GGT	2	6	79613	79618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538260
1551	NC_013199	CAA	2	6	79643	79648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538260
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1555	NC_013199	CGA	2	6	79967	79972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538260
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1558	NC_013199	CCT	2	6	80224	80229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258538261
1559	NC_013199	GTG	2	6	80262	80267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538261
1560	NC_013199	GTC	2	6	80268	80273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538261
1561	NC_013199	CTGA	2	8	80284	80291	25 %	25 %	25 %	25 %	258538261
1562	NC_013199	GCA	2	6	80307	80312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538261
1563	NC_013199	ATC	2	6	80321	80326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538261
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1565	NC_013199	T	6	6	80477	80482	0 %	100 %	0 %	0 %	258538261
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1567	NC_013199	CAG	2	6	80597	80602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538261
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1578	NC_013199	AGATC	2	10	80977	80986	40 %	20 %	20 %	20 %	258538261
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1585	NC_013199	TG	3	6	81178	81183	0 %	50 %	50 %	0 %	258538261
1586	NC_013199	CGC	2	6	81222	81227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538261
1587	NC_013199	CCG	2	6	81279	81284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538261
1588	NC_013199	ATC	2	6	81306	81311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538261
1589	NC_013199	TTA	2	6	81369	81374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538261
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1591	NC_013199	TCC	2	6	81475	81480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_013199	TTTG	2	8	81481	81488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013199	TAA	2	6	81499	81504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_013199	T	6	6	81521	81526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013199	A	7	7	81586	81592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013199	TTGA	2	8	81614	81621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013199	AAT	2	6	81646	81651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013199	GGGA	2	8	81678	81685	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013199	AAG	2	6	81717	81722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538262
1600	NC_013199	CGG	2	6	81733	81738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538262
1601	NC_013199	GCG	2	6	81749	81754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538262
1602	NC_013199	GATT	2	8	81756	81763	25 %	50 %	25 %	0 %	258538262
1603	NC_013199	TCAG	2	8	81765	81772	25 %	25 %	25 %	25 %	258538262
1604	NC_013199	TGG	2	6	81798	81803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538262
1605	NC_013199	TGA	2	6	81897	81902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538262
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1607	NC_013199	CTGG	2	8	81955	81962	0 %	25 %	50 %	25 %	258538262
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1610	NC_013199	GAC	2	6	82045	82050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538262
1611	NC_013199	TGGC	2	8	82095	82102	0 %	25 %	50 %	25 %	258538262
1612	NC_013199	A	6	6	82257	82262	100 %	0 %	0 %	0 %	258538262
1613	NC_013199	ACA	2	6	82269	82274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538262
1614	NC_013199	CAG	2	6	82283	82288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538262
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1616	NC_013199	TGG	2	6	82395	82400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538262
1617	NC_013199	GATT	2	8	82401	82408	25 %	50 %	25 %	0 %	258538262
1618	NC_013199	GGC	2	6	82535	82540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538262
1619	NC_013199	TTG	2	6	82716	82721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538262
1620	NC_013199	CAG	2	6	82859	82864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538262
1621	NC_013199	GTG	2	6	82890	82895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538262
1622	NC_013199	CTTGGT	2	12	82900	82911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258538262
1623	NC_013199	GAC	2	6	82919	82924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538262
1624	NC_013199	CGGA	2	8	82961	82968	25 %	0 %	50 %	25 %	258538262
1625	NC_013199	AAG	2	6	83006	83011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538262
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