MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013199	ACC	2	6	52225	52230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538237
1002	NC_013199	GCA	2	6	52233	52238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538237
1003	NC_013199	GTT	2	6	52252	52257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538237
1004	NC_013199	TGA	2	6	52291	52296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538237
1005	NC_013199	AGA	2	6	52327	52332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538237
1006	NC_013199	CG	3	6	52353	52358	0 %	0 %	50 %	50 %	258538237
1007	NC_013199	CATCG	2	10	52412	52421	20 %	20 %	20 %	40 %	258538237
1008	NC_013199	CTT	2	6	52618	52623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538237
1009	NC_013199	CCA	2	6	52674	52679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538237
1010	NC_013199	AAG	2	6	52689	52694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538237
1011	NC_013199	GTT	2	6	52702	52707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538237
1012	NC_013199	TTC	2	6	52716	52721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538237
1013	NC_013199	AAG	2	6	52723	52728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538237
1014	NC_013199	CTG	2	6	52750	52755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538237
1015	NC_013199	AGT	2	6	52774	52779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538237
1016	NC_013199	GCTG	2	8	52892	52899	0 %	25 %	50 %	25 %	258538237
1017	NC_013199	ATC	2	6	52901	52906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538237
1018	NC_013199	GGT	2	6	52907	52912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538237
1019	NC_013199	CG	4	8	52946	52953	0 %	0 %	50 %	50 %	258538237
1020	NC_013199	T	6	6	53000	53005	0 %	100 %	0 %	0 %	258538237
1021	NC_013199	GAA	2	6	53039	53044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538237
1022	NC_013199	CATCGC	2	12	53134	53145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258538237
1023	NC_013199	TGA	2	6	53149	53154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538237
1024	NC_013199	TTC	2	6	53156	53161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538237
1025	NC_013199	AAT	2	6	53297	53302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538237
1026	NC_013199	CAG	2	6	53311	53316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538237
1027	NC_013199	TGA	2	6	53322	53327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538237
1028	NC_013199	ATC	2	6	53363	53368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538237
1029	NC_013199	A	6	6	53373	53378	100 %	0 %	0 %	0 %	258538237
1030	NC_013199	GGC	2	6	53469	53474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538238
1031	NC_013199	CTT	2	6	53610	53615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538238
1032	NC_013199	TGA	2	6	53619	53624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538238
1033	NC_013199	T	6	6	53662	53667	0 %	100 %	0 %	0 %	258538238
1034	NC_013199	GAT	2	6	53680	53685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538238
1035	NC_013199	GTT	2	6	53698	53703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538238
1036	NC_013199	CATG	2	8	53757	53764	25 %	25 %	25 %	25 %	258538238
1037	NC_013199	AAT	2	6	53770	53775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538238
1038	NC_013199	CG	3	6	53823	53828	0 %	0 %	50 %	50 %	258538238
1039	NC_013199	ATC	2	6	53833	53838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538238
1040	NC_013199	CAT	2	6	53859	53864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538238
1041	NC_013199	ATG	2	6	53882	53887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538238
1042	NC_013199	GAA	2	6	53994	53999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538238
1043	NC_013199	GTT	2	6	54013	54018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538238
1044	NC_013199	ATA	2	6	54032	54037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538238
1045	NC_013199	TCT	2	6	54092	54097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538238
1046	NC_013199	TTC	2	6	54305	54310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538238
1047	NC_013199	T	6	6	54321	54326	0 %	100 %	0 %	0 %	258538238
1048	NC_013199	TTG	2	6	54376	54381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538238
1049	NC_013199	AAT	2	6	54698	54703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538239
1050	NC_013199	ATC	2	6	54736	54741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538239
1051	NC_013199	GCT	2	6	54795	54800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538239
1052	NC_013199	AGT	2	6	54825	54830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538239
1053	NC_013199	CTT	2	6	54949	54954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538239
1054	NC_013199	TCT	2	6	54992	54997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538239
1055	NC_013199	CAG	2	6	55047	55052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538239
1056	NC_013199	AGG	2	6	55070	55075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538239
1057	NC_013199	CAAG	2	8	55111	55118	50 %	0 %	25 %	25 %	258538239
1058	NC_013199	GAC	2	6	55194	55199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538239
1059	NC_013199	TTC	2	6	55237	55242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538239
1060	NC_013199	GT	3	6	55278	55283	0 %	50 %	50 %	0 %	258538239
1061	NC_013199	TGG	2	6	55290	55295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538239
1062	NC_013199	ATCA	2	8	55360	55367	50 %	25 %	0 %	25 %	258538239
1063	NC_013199	AGCCC	2	10	55441	55450	20 %	0 %	20 %	60 %	258538239
1064	NC_013199	TTGGC	2	10	55524	55533	0 %	40 %	40 %	20 %	258538239
1065	NC_013199	GC	3	6	55561	55566	0 %	0 %	50 %	50 %	258538239
1066	NC_013199	GTC	2	6	55583	55588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538239
1067	NC_013199	CAT	2	6	55590	55595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538239
1068	NC_013199	GTCA	2	8	55648	55655	25 %	25 %	25 %	25 %	258538239
1069	NC_013199	TTG	2	6	55751	55756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538239
1070	NC_013199	GGCA	2	8	55861	55868	25 %	0 %	50 %	25 %	258538239
1071	NC_013199	CAT	2	6	55875	55880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538239
1072	NC_013199	CAA	2	6	55890	55895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538239
1073	NC_013199	ATT	2	6	55918	55923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538239
1074	NC_013199	AGC	2	6	55953	55958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538239
1075	NC_013199	GCC	3	9	55969	55977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538239
1076	NC_013199	CAG	2	6	56067	56072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538239
1077	NC_013199	TCG	2	6	56087	56092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538239
1078	NC_013199	ATG	2	6	56108	56113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013199	CCT	2	6	56116	56121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_013199	TA	3	6	56122	56127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013199	AT	3	6	56131	56136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013199	CA	3	6	56143	56148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_013199	A	6	6	56213	56218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013199	A	6	6	56245	56250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013199	CAA	2	6	56264	56269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013199	GTT	2	6	56281	56286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013199	GTC	2	6	56346	56351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538240
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1089	NC_013199	TTG	2	6	56494	56499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538240
1090	NC_013199	CGG	2	6	56507	56512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538240
1091	NC_013199	AGC	2	6	56547	56552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538240
1092	NC_013199	TGG	2	6	56621	56626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538240
1093	NC_013199	AAC	2	6	56649	56654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538240
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1095	NC_013199	GTA	2	6	56679	56684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538240
1096	NC_013199	TG	3	6	56712	56717	0 %	50 %	50 %	0 %	258538240
1097	NC_013199	ATCA	2	8	56799	56806	50 %	25 %	0 %	25 %	258538240
1098	NC_013199	ATA	2	6	56851	56856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538240
1099	NC_013199	TCT	2	6	56866	56871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538240
1100	NC_013199	TTC	2	6	56877	56882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538240
1101	NC_013199	GCG	2	6	56892	56897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538240
1102	NC_013199	TCA	2	6	57004	57009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538240
1103	NC_013199	TGGC	2	8	57164	57171	0 %	25 %	50 %	25 %	258538240
1104	NC_013199	TTC	2	6	57240	57245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538240
1105	NC_013199	TTG	2	6	57307	57312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538240
1106	NC_013199	GCC	2	6	57336	57341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538240
1107	NC_013199	AAC	2	6	57435	57440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538240
1108	NC_013199	TTCACC	2	12	57486	57497	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258538240
1109	NC_013199	CAT	2	6	57521	57526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538240
1110	NC_013199	CAT	3	9	57542	57550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538240
1111	NC_013199	TAA	2	6	57556	57561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538240
1112	NC_013199	CTGG	2	8	57568	57575	0 %	25 %	50 %	25 %	258538240
1113	NC_013199	CTT	2	6	57617	57622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538240
1114	NC_013199	GTT	2	6	57656	57661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538240
1115	NC_013199	TGC	3	9	57687	57695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538240
1116	NC_013199	GGC	2	6	57705	57710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538240
1117	NC_013199	CAG	2	6	57740	57745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538240
1118	NC_013199	ATCA	2	8	57747	57754	50 %	25 %	0 %	25 %	258538240
1119	NC_013199	CAA	2	6	57925	57930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013199	GGC	2	6	57950	57955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538241
1121	NC_013199	AAG	2	6	57960	57965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538241
1122	NC_013199	GAT	2	6	57971	57976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538241
1123	NC_013199	CAA	2	6	58024	58029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538241
1124	NC_013199	CAG	2	6	58102	58107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538241
1125	NC_013199	AGA	2	6	58112	58117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538241
1126	NC_013199	GCA	2	6	58120	58125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538241
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1132	NC_013199	GAA	2	6	58322	58327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538241
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1135	NC_013199	CAT	2	6	58495	58500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538241
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1155	NC_013199	CG	3	6	59444	59449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1156	NC_013199	AT	3	6	59474	59479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1158	NC_013199	GAAG	2	8	59622	59629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1238	NC_013199	AGC	2	6	64754	64759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1240	NC_013199	ATGA	2	8	64802	64809	50 %	25 %	25 %	0 %	258538246
1241	NC_013199	AAG	2	6	65096	65101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538246
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1245	NC_013199	CAA	2	6	65225	65230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_013199	T	7	7	65293	65299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_013199	A	7	7	65306	65312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_013199	AGC	2	6	65444	65449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538247
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1251	NC_013199	GAT	2	6	65665	65670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538247
1252	NC_013199	GTGA	2	8	65704	65711	25 %	25 %	50 %	0 %	258538247
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