MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_013199	CAG	2	6	2948561	2948566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541082
55003	NC_013199	GTT	3	9	2948602	2948610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258541082
55004	NC_013199	TGC	2	6	2948619	2948624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541082
55005	NC_013199	GAT	2	6	2948659	2948664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541082
55006	NC_013199	TCT	2	6	2948710	2948715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258541082
55007	NC_013199	CTG	2	6	2948738	2948743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541082
55008	NC_013199	TGCT	2	8	2948786	2948793	0 %	50 %	25 %	25 %	258541082
55009	NC_013199	AGC	2	6	2948862	2948867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541082
55010	NC_013199	ACT	2	6	2948880	2948885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541082
55011	NC_013199	AGC	2	6	2948889	2948894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541082
55012	NC_013199	GTT	2	6	2948908	2948913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258541082
55013	NC_013199	GGCT	2	8	2948919	2948926	0 %	25 %	50 %	25 %	258541082
55014	NC_013199	GT	3	6	2948927	2948932	0 %	50 %	50 %	0 %	258541082
55015	NC_013199	CTG	2	6	2948960	2948965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541082
55016	NC_013199	GACT	2	8	2948974	2948981	25 %	25 %	25 %	25 %	258541082
55017	NC_013199	CCT	2	6	2949023	2949028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258541082
55018	NC_013199	AAT	3	9	2949055	2949063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541082
55019	NC_013199	CTT	2	6	2949087	2949092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258541082
55020	NC_013199	TGTT	2	8	2949123	2949130	0 %	75 %	25 %	0 %	258541082
55021	NC_013199	AGC	2	6	2949141	2949146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541082
55022	NC_013199	CCGT	2	8	2949149	2949156	0 %	25 %	25 %	50 %	258541082
55023	NC_013199	CCT	2	6	2949183	2949188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55024	NC_013199	A	7	7	2949212	2949218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55025	NC_013199	ATTT	2	8	2949257	2949264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55026	NC_013199	TCA	2	6	2949304	2949309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55027	NC_013199	TTA	2	6	2949312	2949317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55028	NC_013199	TAACAT	2	12	2949367	2949378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55029	NC_013199	A	6	6	2949390	2949395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55030	NC_013199	CCG	2	6	2949468	2949473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258541083
55031	NC_013199	CCAA	2	8	2949664	2949671	50 %	0 %	0 %	50 %	258541083
55032	NC_013199	GGT	2	6	2949676	2949681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258541083
55033	NC_013199	GAG	2	6	2949751	2949756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258541083
55034	NC_013199	GAT	2	6	2949804	2949809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541083
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55036	NC_013199	GCT	2	6	2949933	2949938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541083
55037	NC_013199	GC	3	6	2949975	2949980	0 %	0 %	50 %	50 %	258541083
55038	NC_013199	CTG	2	6	2950009	2950014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541083
55039	NC_013199	TCGTC	2	10	2950032	2950041	0 %	40 %	20 %	40 %	258541083
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55042	NC_013199	ATT	2	6	2950153	2950158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258541083
55043	NC_013199	CGG	2	6	2950161	2950166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258541083
55044	NC_013199	CG	3	6	2950191	2950196	0 %	0 %	50 %	50 %	258541083
55045	NC_013199	GATA	2	8	2950211	2950218	50 %	25 %	25 %	0 %	258541083
55046	NC_013199	GCT	2	6	2950373	2950378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541083
55047	NC_013199	TGCT	2	8	2950438	2950445	0 %	50 %	25 %	25 %	258541083
55048	NC_013199	A	6	6	2950558	2950563	100 %	0 %	0 %	0 %	258541083
55049	NC_013199	TAA	2	6	2950625	2950630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55050	NC_013199	TAA	2	6	2950676	2950681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541084
55051	NC_013199	CCGG	2	8	2950686	2950693	0 %	0 %	50 %	50 %	258541084
55052	NC_013199	CTG	2	6	2950714	2950719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541084
55053	NC_013199	GC	3	6	2950720	2950725	0 %	0 %	50 %	50 %	258541084
55054	NC_013199	ACC	2	6	2950811	2950816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258541084
55055	NC_013199	TTCA	2	8	2951092	2951099	25 %	50 %	0 %	25 %	258541084
55056	NC_013199	GCT	2	6	2951192	2951197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541084
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55058	NC_013199	GAT	2	6	2951223	2951228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541084
55059	NC_013199	CTG	2	6	2951230	2951235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541084
55060	NC_013199	GGT	3	9	2951284	2951292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258541084
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55085	NC_013199	GGCT	2	8	2952570	2952577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55086	NC_013199	A	7	7	2952588	2952594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55087	NC_013199	CTG	2	6	2952599	2952604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55089	NC_013199	CAG	2	6	2952621	2952626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55093	NC_013199	ATG	2	6	2952830	2952835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55094	NC_013199	TCA	2	6	2952838	2952843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55108	NC_013199	GTC	2	6	2953937	2953942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541087
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55348	NC_013199	CATGA	2	10	2966638	2966647	40 %	20 %	20 %	20 %	258541101
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55355	NC_013199	ATG	2	6	2966952	2966957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541101
55356	NC_013199	AACGAC	2	12	2967072	2967083	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55357	NC_013199	CAA	2	6	2967084	2967089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55358	NC_013199	TCAT	2	8	2967151	2967158	25 %	50 %	0 %	25 %	258541102
55359	NC_013199	GATT	2	8	2967248	2967255	25 %	50 %	25 %	0 %	258541102
55360	NC_013199	CT	3	6	2967268	2967273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55361	NC_013199	GCTCT	2	10	2967675	2967684	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55362	NC_013199	A	8	8	2967685	2967692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55363	NC_013199	ATA	2	6	2967721	2967726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541104
55364	NC_013199	TTGG	2	8	2967826	2967833	0 %	50 %	50 %	0 %	258541104
55365	NC_013199	GAC	2	6	2967855	2967860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55366	NC_013199	CCT	2	6	2967862	2967867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55367	NC_013199	TTA	2	6	2967886	2967891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55368	NC_013199	CAT	2	6	2967912	2967917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55369	NC_013199	AAGC	2	8	2967934	2967941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55370	NC_013199	GCA	2	6	2968001	2968006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55371	NC_013199	TG	3	6	2968026	2968031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55372	NC_013199	ATC	2	6	2968221	2968226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55373	NC_013199	T	6	6	2968271	2968276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55374	NC_013199	CTAA	2	8	2968373	2968380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55375	NC_013199	AAT	2	6	2968394	2968399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55376	NC_013199	TTG	2	6	2968413	2968418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55377	NC_013199	TTA	2	6	2968579	2968584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55378	NC_013199	GAG	2	6	2968585	2968590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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