MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013199	TGA	2	6	261733	261738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538450
5002	NC_013199	CAT	3	9	261836	261844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538450
5003	NC_013199	AAC	2	6	261862	261867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538450
5004	NC_013199	TTTG	2	8	261919	261926	0 %	75 %	25 %	0 %	258538450
5005	NC_013199	CTTC	2	8	262060	262067	0 %	50 %	0 %	50 %	258538450
5006	NC_013199	AGCAAA	2	12	262192	262203	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	258538450
5007	NC_013199	CAA	2	6	262319	262324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538451
5008	NC_013199	GCA	2	6	262354	262359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538451
5009	NC_013199	TTGG	2	8	262389	262396	0 %	50 %	50 %	0 %	258538451
5010	NC_013199	ATT	2	6	262435	262440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538451
5011	NC_013199	ATT	2	6	262459	262464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538451
5012	NC_013199	GCTA	2	8	262492	262499	25 %	25 %	25 %	25 %	258538451
5013	NC_013199	GAA	2	6	262642	262647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538451
5014	NC_013199	CGA	2	6	262662	262667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538451
5015	NC_013199	AGT	2	6	262668	262673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538451
5016	NC_013199	CAT	2	6	262690	262695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538451
5017	NC_013199	GCA	2	6	262819	262824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538451
5018	NC_013199	GCT	2	6	262882	262887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538451
5019	NC_013199	GCC	2	6	262891	262896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538451
5020	NC_013199	TGA	2	6	262941	262946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538451
5021	NC_013199	ATCAAT	2	12	262984	262995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258538451
5022	NC_013199	GGCA	2	8	263082	263089	25 %	0 %	50 %	25 %	258538451
5023	NC_013199	AAT	2	6	263171	263176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538451
5024	NC_013199	TAA	2	6	263222	263227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013199	GAG	2	6	263258	263263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_013199	CCA	2	6	263400	263405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538452
5027	NC_013199	TGG	2	6	263423	263428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538452
5028	NC_013199	GGT	2	6	263466	263471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538452
5029	NC_013199	TGC	2	6	263816	263821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_013199	CAG	2	6	263976	263981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538453
5031	NC_013199	T	6	6	263997	264002	0 %	100 %	0 %	0 %	258538453
5032	NC_013199	GCT	2	6	264015	264020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538453
5033	NC_013199	TCA	2	6	264026	264031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538453
5034	NC_013199	AAT	2	6	264168	264173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538453
5035	NC_013199	TGA	2	6	264305	264310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538453
5036	NC_013199	GCT	2	6	264348	264353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538453
5037	NC_013199	TCT	2	6	264484	264489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538453
5038	NC_013199	TTTG	2	8	264656	264663	0 %	75 %	25 %	0 %	258538453
5039	NC_013199	ATT	2	6	264685	264690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538453
5040	NC_013199	ACCA	2	8	264726	264733	50 %	0 %	0 %	50 %	258538453
5041	NC_013199	CAG	2	6	264744	264749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538453
5042	NC_013199	TGA	2	6	264874	264879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538454
5043	NC_013199	GGTTA	2	10	264888	264897	20 %	40 %	40 %	0 %	258538454
5044	NC_013199	CGC	2	6	264920	264925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538454
5045	NC_013199	A	6	6	264982	264987	100 %	0 %	0 %	0 %	258538454
5046	NC_013199	TCG	2	6	265016	265021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538454
5047	NC_013199	TCT	2	6	265043	265048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538454
5048	NC_013199	TGA	2	6	265051	265056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538454
5049	NC_013199	A	7	7	265221	265227	100 %	0 %	0 %	0 %	258538454
5050	NC_013199	AATCT	2	10	265272	265281	40 %	40 %	0 %	20 %	258538454
5051	NC_013199	TTGGAT	2	12	265307	265318	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	258538454
5052	NC_013199	GC	3	6	265341	265346	0 %	0 %	50 %	50 %	258538454
5053	NC_013199	GAC	2	6	265361	265366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538454
5054	NC_013199	CAG	2	6	265385	265390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538454
5055	NC_013199	TAT	2	6	265471	265476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538454
5056	NC_013199	GAG	2	6	265527	265532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538454
5057	NC_013199	ATC	2	6	265586	265591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538454
5058	NC_013199	CAA	2	6	265594	265599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538454
5059	NC_013199	CAAT	2	8	265649	265656	50 %	25 %	0 %	25 %	258538454
5060	NC_013199	T	6	6	265721	265726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013199	ATG	2	6	265782	265787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_013199	TGT	2	6	265804	265809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013199	TGG	2	6	265838	265843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538455
5064	NC_013199	TTC	2	6	265968	265973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538455
5065	NC_013199	CAA	2	6	265982	265987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538455
5066	NC_013199	GGC	2	6	265989	265994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538455
5067	NC_013199	TGA	2	6	266033	266038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538455
5068	NC_013199	T	6	6	266059	266064	0 %	100 %	0 %	0 %	258538455
5069	NC_013199	TCTTTG	2	12	266089	266100	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	258538455
5070	NC_013199	ATC	2	6	266119	266124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538455
5071	NC_013199	GCA	2	6	266131	266136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538455
5072	NC_013199	CCG	2	6	266174	266179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538455
5073	NC_013199	AGC	2	6	266307	266312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538455
5074	NC_013199	TGC	3	9	266575	266583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538455
5075	NC_013199	AAT	2	6	266585	266590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538455
5076	NC_013199	T	8	8	266598	266605	0 %	100 %	0 %	0 %	258538455
5077	NC_013199	ATT	2	6	266681	266686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013199	CAT	2	6	266691	266696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_013199	ATT	2	6	266712	266717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_013199	ATT	2	6	266744	266749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013199	TACA	2	8	266751	266758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_013199	AAGA	2	8	266773	266780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_013199	GAA	2	6	266791	266796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013199	GTT	2	6	266803	266808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_013199	CGG	2	6	266825	266830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_013199	AAT	2	6	266855	266860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013199	GATT	2	8	266881	266888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013199	CGCA	2	8	266920	266927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_013199	AGG	2	6	266929	266934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013199	TGGT	2	8	266956	266963	0 %	50 %	50 %	0 %	258538456
5091	NC_013199	GAAT	2	8	266977	266984	50 %	25 %	25 %	0 %	258538456
5092	NC_013199	TTTGA	2	10	267027	267036	20 %	60 %	20 %	0 %	258538456
5093	NC_013199	GC	3	6	267045	267050	0 %	0 %	50 %	50 %	258538456
5094	NC_013199	ATT	2	6	267126	267131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538456
5095	NC_013199	AACC	2	8	267154	267161	50 %	0 %	0 %	50 %	258538456
5096	NC_013199	CAG	2	6	267174	267179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538456
5097	NC_013199	TTA	2	6	267230	267235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538456
5098	NC_013199	GTT	2	6	267260	267265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538456
5099	NC_013199	GCG	2	6	267267	267272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538456
5100	NC_013199	GGC	2	6	267306	267311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538456
5101	NC_013199	TGA	3	9	267350	267358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538456
5102	NC_013199	CCGGT	2	10	267424	267433	0 %	20 %	40 %	40 %	258538456
5103	NC_013199	ATT	2	6	267445	267450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538456
5104	NC_013199	ATG	2	6	267483	267488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538456
5105	NC_013199	GCG	2	6	267546	267551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538456
5106	NC_013199	GAA	2	6	267690	267695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538456
5107	NC_013199	GC	3	6	267733	267738	0 %	0 %	50 %	50 %	258538456
5108	NC_013199	ATG	2	6	267741	267746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538456
5109	NC_013199	AGA	2	6	267758	267763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538456
5110	NC_013199	TGG	2	6	267812	267817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538456
5111	NC_013199	GAT	3	9	268026	268034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538457
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5113	NC_013199	GTT	2	6	268084	268089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538457
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5115	NC_013199	GGA	2	6	268167	268172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538457
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5118	NC_013199	GGT	2	6	268255	268260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538457
5119	NC_013199	GATG	2	8	268296	268303	25 %	25 %	50 %	0 %	258538457
5120	NC_013199	GCG	2	6	268354	268359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538457
5121	NC_013199	GTT	2	6	268398	268403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538457
5122	NC_013199	ATG	2	6	268463	268468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538457
5123	NC_013199	CGC	2	6	268639	268644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538457
5124	NC_013199	TGC	2	6	268704	268709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538457
5125	NC_013199	TGT	2	6	268857	268862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538457
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5137	NC_013199	CGG	2	6	269573	269578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538457
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5139	NC_013199	ATG	2	6	269675	269680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5141	NC_013199	TTGG	2	8	269777	269784	0 %	50 %	50 %	0 %	258538458
5142	NC_013199	GAG	2	6	270164	270169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5231	NC_013199	T	6	6	275538	275543	0 %	100 %	0 %	0 %	258538465
5232	NC_013199	GGC	2	6	275578	275583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538465
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5244	NC_013199	ATC	2	6	276319	276324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538465
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5496	NC_013199	GCA	2	6	290150	290155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5497	NC_013199	CGC	2	6	290197	290202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5498	NC_013199	GTGA	2	8	290203	290210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_013199	TGT	2	6	290236	290241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_013199	GAA	2	6	290246	290251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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