MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_013199	A	6	6	235032	235037	100 %	0 %	0 %	0 %	258538424
4503	NC_013199	CGC	2	6	235039	235044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538424
4504	NC_013199	CG	3	6	235074	235079	0 %	0 %	50 %	50 %	258538424
4505	NC_013199	GGC	2	6	235082	235087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538424
4506	NC_013199	AGC	2	6	235126	235131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538424
4507	NC_013199	GCC	2	6	235155	235160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538424
4508	NC_013199	GAA	2	6	235170	235175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538424
4509	NC_013199	AATA	2	8	235302	235309	75 %	25 %	0 %	0 %	258538424
4510	NC_013199	AAC	2	6	235336	235341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538424
4511	NC_013199	T	6	6	235374	235379	0 %	100 %	0 %	0 %	258538425
4512	NC_013199	CAA	2	6	235413	235418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538425
4513	NC_013199	CAAT	2	8	235442	235449	50 %	25 %	0 %	25 %	258538425
4514	NC_013199	GCT	2	6	235494	235499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538425
4515	NC_013199	TTG	2	6	235518	235523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538425
4516	NC_013199	ATT	2	6	235530	235535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538425
4517	NC_013199	ATT	2	6	235566	235571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538425
4518	NC_013199	ACG	2	6	235580	235585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538425
4519	NC_013199	GATG	2	8	235640	235647	25 %	25 %	50 %	0 %	258538425
4520	NC_013199	ATG	3	9	235645	235653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538425
4521	NC_013199	GAA	2	6	235710	235715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538425
4522	NC_013199	TGA	2	6	235735	235740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538425
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4524	NC_013199	TTG	2	6	235798	235803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538425
4525	NC_013199	GCT	2	6	235817	235822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538425
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4527	NC_013199	AGCG	2	8	235869	235876	25 %	0 %	50 %	25 %	258538425
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4533	NC_013199	ATC	2	6	236160	236165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538425
4534	NC_013199	AGAGA	2	10	236177	236186	60 %	0 %	40 %	0 %	258538425
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4536	NC_013199	CCAA	2	8	236221	236228	50 %	0 %	0 %	50 %	258538426
4537	NC_013199	ACA	2	6	236247	236252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538426
4538	NC_013199	GATGCT	2	12	236310	236321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258538426
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4540	NC_013199	CGATT	2	10	236621	236630	20 %	40 %	20 %	20 %	258538426
4541	NC_013199	ATG	2	6	236755	236760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538426
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4543	NC_013199	GGCT	2	8	236851	236858	0 %	25 %	50 %	25 %	258538426
4544	NC_013199	AGG	2	6	236938	236943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538426
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4553	NC_013199	GGCAAG	2	12	237745	237756	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258538427
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4562	NC_013199	TCAT	2	8	238256	238263	25 %	50 %	0 %	25 %	258538429
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4609	NC_013199	AGA	2	6	240083	240088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_013199	TCT	2	6	240102	240107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_013199	T	6	6	240116	240121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013199	TGC	2	6	240125	240130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013199	AAT	2	6	240186	240191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013199	TTTC	2	8	240293	240300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_013199	A	7	7	240330	240336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4623	NC_013199	TGA	2	6	240665	240670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538431
4624	NC_013199	TTC	2	6	240717	240722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538431
4625	NC_013199	CTG	2	6	240727	240732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538431
4626	NC_013199	TGA	2	6	240760	240765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538431
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4631	NC_013199	TGAT	2	8	240982	240989	25 %	50 %	25 %	0 %	258538431
4632	NC_013199	TCA	2	6	241012	241017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538431
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4639	NC_013199	TGC	2	6	241481	241486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538431
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4653	NC_013199	CAA	2	6	242627	242632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538433
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4675	NC_013199	TTGA	2	8	244300	244307	25 %	50 %	25 %	0 %	258538435
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4678	NC_013199	AAAGC	2	10	244366	244375	60 %	0 %	20 %	20 %	258538435
4679	NC_013199	TCCGG	2	10	244443	244452	0 %	20 %	40 %	40 %	258538435
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4687	NC_013199	CAT	2	6	244815	244820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538435
4688	NC_013199	AAAC	2	8	244918	244925	75 %	0 %	0 %	25 %	258538435
4689	NC_013199	GAA	2	6	244958	244963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538435
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4692	NC_013199	GGT	2	6	245010	245015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538436
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4702	NC_013199	TTAA	2	8	245574	245581	50 %	50 %	0 %	0 %	258538436
4703	NC_013199	ATC	2	6	245584	245589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538436
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4708	NC_013199	TGA	2	6	245843	245848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538436
4709	NC_013199	TGA	2	6	245860	245865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538436
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4711	NC_013199	GCCGTT	2	12	245991	246002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538436
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4713	NC_013199	AAG	2	6	246166	246171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538436
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4722	NC_013199	ATG	2	6	246582	246587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538437
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4733	NC_013199	AGTC	2	8	247106	247113	25 %	25 %	25 %	25 %	258538438
4734	NC_013199	AGC	2	6	247115	247120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538438
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4736	NC_013199	AGA	2	6	247201	247206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4737	NC_013199	TCA	2	6	247229	247234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4738	NC_013199	AGC	2	6	247317	247322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4739	NC_013199	TAT	2	6	247354	247359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538439
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4741	NC_013199	GAT	2	6	247644	247649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538439
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4866	NC_013199	TTA	2	6	253937	253942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538444
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4974	NC_013199	TTCG	2	8	260194	260201	0 %	50 %	25 %	25 %	258538448
4975	NC_013199	A	6	6	260302	260307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4981	NC_013199	GCG	2	6	260706	260711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538449
4982	NC_013199	TGA	2	6	260715	260720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538449
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