MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 7611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	258506996
2	NC_013198	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	258506996
3	NC_013198	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	258506996
4	NC_013198	TAAT	2	8	3078	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013198	TGAT	2	8	3221	3228	25 %	50 %	25 %	0 %	258506998
6	NC_013198	AATT	2	8	3616	3623	50 %	50 %	0 %	0 %	258506999
7	NC_013198	TTTG	2	8	3707	3714	0 %	75 %	25 %	0 %	258506999
8	NC_013198	AAGA	2	8	4525	4532	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
9	NC_013198	AAGA	2	8	4546	4553	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
10	NC_013198	GCCA	2	8	6295	6302	25 %	0 %	25 %	50 %	258507000
11	NC_013198	ACGT	2	8	6649	6656	25 %	25 %	25 %	25 %	258507001
12	NC_013198	ATGA	2	8	6696	6703	50 %	25 %	25 %	0 %	258507001
13	NC_013198	GATT	2	8	6968	6975	25 %	50 %	25 %	0 %	258507001
14	NC_013198	TATT	2	8	8376	8383	25 %	75 %	0 %	0 %	258507001
15	NC_013198	GCAC	2	8	8533	8540	25 %	0 %	25 %	50 %	258507001
16	NC_013198	CCGG	2	8	8887	8894	0 %	0 %	50 %	50 %	258507001
17	NC_013198	AAAT	2	8	9494	9501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013198	GAAA	2	8	9756	9763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013198	CGAA	2	8	9930	9937	50 %	0 %	25 %	25 %	258507003
20	NC_013198	GCCG	2	8	11225	11232	0 %	0 %	50 %	50 %	258507005
21	NC_013198	CTGG	2	8	11308	11315	0 %	25 %	50 %	25 %	258507005
22	NC_013198	TTCA	2	8	11970	11977	25 %	50 %	0 %	25 %	258507007
23	NC_013198	TTGG	2	8	12097	12104	0 %	50 %	50 %	0 %	258507007
24	NC_013198	AGCG	2	8	12762	12769	25 %	0 %	50 %	25 %	258507008
25	NC_013198	GGTA	2	8	12881	12888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013198	TGAA	2	8	13380	13387	50 %	25 %	25 %	0 %	258507010
27	NC_013198	TCAA	2	8	13605	13612	50 %	25 %	0 %	25 %	258507010
28	NC_013198	TCGG	2	8	14191	14198	0 %	25 %	50 %	25 %	258507011
29	NC_013198	CTGG	2	8	15229	15236	0 %	25 %	50 %	25 %	258507011
30	NC_013198	CAAT	2	8	15810	15817	50 %	25 %	0 %	25 %	258507012
31	NC_013198	TGTT	2	8	15857	15864	0 %	75 %	25 %	0 %	258507012
32	NC_013198	TTTA	2	8	16291	16298	25 %	75 %	0 %	0 %	258507012
33	NC_013198	CTAA	2	8	16778	16785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013198	GTTT	2	8	17002	17009	0 %	75 %	25 %	0 %	258507014
35	NC_013198	GCTA	2	8	17206	17213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013198	AAGA	2	8	18439	18446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013198	TTTA	2	8	18586	18593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013198	ATAC	2	8	20016	20023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013198	ATCA	2	8	20988	20995	50 %	25 %	0 %	25 %	258507017
40	NC_013198	CGGT	2	8	21691	21698	0 %	25 %	50 %	25 %	258507017
41	NC_013198	GATT	2	8	22235	22242	25 %	50 %	25 %	0 %	258507018
42	NC_013198	TTAT	2	8	22709	22716	25 %	75 %	0 %	0 %	258507018
43	NC_013198	TAAT	2	8	22913	22920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013198	TGCT	2	8	23000	23007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013198	TTTA	2	8	23019	23026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013198	TACA	2	8	23641	23648	50 %	25 %	0 %	25 %	258507020
47	NC_013198	AACT	2	8	24049	24056	50 %	25 %	0 %	25 %	258507020
48	NC_013198	TGGG	2	8	24440	24447	0 %	25 %	75 %	0 %	258507021
49	NC_013198	CAAG	2	8	24492	24499	50 %	0 %	25 %	25 %	258507021
50	NC_013198	ACCG	2	8	24511	24518	25 %	0 %	25 %	50 %	258507021
51	NC_013198	GATG	2	8	25422	25429	25 %	25 %	50 %	0 %	258507021
52	NC_013198	TAAA	2	8	25879	25886	75 %	25 %	0 %	0 %	258507022
53	NC_013198	GAAA	2	8	26099	26106	75 %	0 %	25 %	0 %	258507023
54	NC_013198	GCTG	2	8	26489	26496	0 %	25 %	50 %	25 %	258507023
55	NC_013198	ATCA	2	8	26666	26673	50 %	25 %	0 %	25 %	258507023
56	NC_013198	GGAA	2	8	26943	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013198	GGGC	2	8	27216	27223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013198	TGCG	2	8	27257	27264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013198	TTTG	2	8	27484	27491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013198	TTGT	2	8	27581	27588	0 %	75 %	25 %	0 %	258507024
61	NC_013198	GTTG	2	8	27710	27717	0 %	50 %	50 %	0 %	258507024
62	NC_013198	GGCA	2	8	28134	28141	25 %	0 %	50 %	25 %	258507024
63	NC_013198	AGTT	2	8	28586	28593	25 %	50 %	25 %	0 %	258507024
64	NC_013198	GACG	2	8	29436	29443	25 %	0 %	50 %	25 %	258507025
65	NC_013198	GGGT	2	8	29988	29995	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013198	TGCC	2	8	30282	30289	0 %	25 %	25 %	50 %	258507026
67	NC_013198	GTTG	2	8	30433	30440	0 %	50 %	50 %	0 %	258507026
68	NC_013198	CTTT	2	8	30909	30916	0 %	75 %	0 %	25 %	258507026
69	NC_013198	TGTT	2	8	31070	31077	0 %	75 %	25 %	0 %	258507026
70	NC_013198	TTAA	3	12	31266	31277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013198	TTGG	2	8	32207	32214	0 %	50 %	50 %	0 %	258507027
72	NC_013198	GGTT	2	8	32384	32391	0 %	50 %	50 %	0 %	258507027
73	NC_013198	TGAA	2	8	32584	32591	50 %	25 %	25 %	0 %	258507027
74	NC_013198	TTGC	2	8	33148	33155	0 %	50 %	25 %	25 %	258507027
75	NC_013198	GGCA	2	8	33215	33222	25 %	0 %	50 %	25 %	258507027
76	NC_013198	CAGG	2	8	33430	33437	25 %	0 %	50 %	25 %	258507027
77	NC_013198	GATT	2	8	33691	33698	25 %	50 %	25 %	0 %	258507027
78	NC_013198	TGAC	2	8	33793	33800	25 %	25 %	25 %	25 %	258507027
79	NC_013198	AGCC	2	8	34408	34415	25 %	0 %	25 %	50 %	258507028
80	NC_013198	ATCC	2	8	34568	34575	25 %	25 %	0 %	50 %	258507028
81	NC_013198	ATTA	2	8	35491	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013198	GAAA	2	8	35502	35509	75 %	0 %	25 %	0 %	258507030
83	NC_013198	TCAA	2	8	35606	35613	50 %	25 %	0 %	25 %	258507030
84	NC_013198	CCGG	2	8	36003	36010	0 %	0 %	50 %	50 %	258507030
85	NC_013198	CGGT	2	8	36182	36189	0 %	25 %	50 %	25 %	258507030
86	NC_013198	TTGC	2	8	36785	36792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013198	CAAT	2	8	37320	37327	50 %	25 %	0 %	25 %	258507032
88	NC_013198	AACC	2	8	37428	37435	50 %	0 %	0 %	50 %	258507032
89	NC_013198	ATTT	2	8	38137	38144	25 %	75 %	0 %	0 %	258507033
90	NC_013198	GCGA	2	8	38163	38170	25 %	0 %	50 %	25 %	258507033
91	NC_013198	TTAT	2	8	38244	38251	25 %	75 %	0 %	0 %	258507033
92	NC_013198	TTCA	2	8	38813	38820	25 %	50 %	0 %	25 %	258507034
93	NC_013198	GATT	2	8	40435	40442	25 %	50 %	25 %	0 %	258507036
94	NC_013198	TGGC	2	8	40865	40872	0 %	25 %	50 %	25 %	258507036
95	NC_013198	TTAT	2	8	41651	41658	25 %	75 %	0 %	0 %	258507037
96	NC_013198	GTTT	2	8	42292	42299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013198	AAGT	2	8	43100	43107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013198	TGGG	2	8	43559	43566	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013198	AGAA	2	8	43658	43665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013198	AAAT	2	8	43884	43891	75 %	25 %	0 %	0 %	258507039
101	NC_013198	ATGA	2	8	44053	44060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013198	TCTA	2	8	44096	44103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013198	CCTT	2	8	44370	44377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013198	AGTC	2	8	44393	44400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013198	TATT	2	8	44470	44477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013198	ATTT	2	8	45059	45066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013198	AGCT	2	8	45591	45598	25 %	25 %	25 %	25 %	258507040
108	NC_013198	ATGA	2	8	45613	45620	50 %	25 %	25 %	0 %	258507040
109	NC_013198	AAGA	2	8	46800	46807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013198	AAAT	2	8	46823	46830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013198	GAAA	2	8	47210	47217	75 %	0 %	25 %	0 %	258507042
112	NC_013198	TCCA	2	8	47610	47617	25 %	25 %	0 %	50 %	258507042
113	NC_013198	ATTG	2	8	47708	47715	25 %	50 %	25 %	0 %	258507042
114	NC_013198	AAGT	2	8	47885	47892	50 %	25 %	25 %	0 %	258507042
115	NC_013198	CGAC	2	8	48017	48024	25 %	0 %	25 %	50 %	258507042
116	NC_013198	ATGA	2	8	48547	48554	50 %	25 %	25 %	0 %	258507043
117	NC_013198	GACG	2	8	48870	48877	25 %	0 %	50 %	25 %	258507043
118	NC_013198	GATC	2	8	49096	49103	25 %	25 %	25 %	25 %	258507043
119	NC_013198	CTGT	2	8	49215	49222	0 %	50 %	25 %	25 %	258507043
120	NC_013198	CTGC	2	8	49472	49479	0 %	25 %	25 %	50 %	258507044
121	NC_013198	CTTT	2	8	49658	49665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013198	TGGA	2	8	49880	49887	25 %	25 %	50 %	0 %	258507045
123	NC_013198	GCCG	2	8	50262	50269	0 %	0 %	50 %	50 %	258507045
124	NC_013198	AAAG	2	8	50772	50779	75 %	0 %	25 %	0 %	258507045
125	NC_013198	CTGG	2	8	51239	51246	0 %	25 %	50 %	25 %	258507045
126	NC_013198	GGCT	2	8	51282	51289	0 %	25 %	50 %	25 %	258507045
127	NC_013198	AAGT	2	8	51631	51638	50 %	25 %	25 %	0 %	258507045
128	NC_013198	TGCG	2	8	51746	51753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013198	AAAC	2	8	52596	52603	75 %	0 %	0 %	25 %	258507046
130	NC_013198	GCAG	2	8	53036	53043	25 %	0 %	50 %	25 %	258507046
131	NC_013198	AGTA	2	8	53420	53427	50 %	25 %	25 %	0 %	258507046
132	NC_013198	TCAA	2	8	53612	53619	50 %	25 %	0 %	25 %	258507046
133	NC_013198	CGGG	2	8	53982	53989	0 %	0 %	75 %	25 %	258507046
134	NC_013198	CAGT	3	12	54193	54204	25 %	25 %	25 %	25 %	258507046
135	NC_013198	GGCA	2	8	55356	55363	25 %	0 %	50 %	25 %	258507046
136	NC_013198	GGCA	2	8	55572	55579	25 %	0 %	50 %	25 %	258507046
137	NC_013198	ACCA	2	8	55754	55761	50 %	0 %	0 %	50 %	258507046
138	NC_013198	AGCA	2	8	56235	56242	50 %	0 %	25 %	25 %	258507046
139	NC_013198	TAAA	2	8	56610	56617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013198	TTAC	2	8	56879	56886	25 %	50 %	0 %	25 %	258507047
141	NC_013198	TTAA	2	8	57495	57502	50 %	50 %	0 %	0 %	258507047
142	NC_013198	GGCT	2	8	57721	57728	0 %	25 %	50 %	25 %	258507048
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144	NC_013198	CGAT	2	8	57997	58004	25 %	25 %	25 %	25 %	258507048
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