MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 39082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506996
2	NC_013198	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506996
3	NC_013198	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506996
4	NC_013198	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
5	NC_013198	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
6	NC_013198	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258506996
7	NC_013198	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
8	NC_013198	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
9	NC_013198	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
10	NC_013198	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
11	NC_013198	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258506996
12	NC_013198	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
13	NC_013198	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
14	NC_013198	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506996
15	NC_013198	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506996
16	NC_013198	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013198	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013198	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506997
19	NC_013198	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
20	NC_013198	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
21	NC_013198	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506997
22	NC_013198	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
23	NC_013198	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506997
24	NC_013198	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258506997
25	NC_013198	CTG	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
26	NC_013198	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
27	NC_013198	GTG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506997
28	NC_013198	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506997
29	NC_013198	ATC	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013198	TGG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013198	CGA	3	9	3149	3157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506998
32	NC_013198	CAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506998
33	NC_013198	GCG	2	6	3230	3235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506998
34	NC_013198	CGT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506998
35	NC_013198	CAA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
36	NC_013198	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
37	NC_013198	GCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
38	NC_013198	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
39	NC_013198	TGC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
40	NC_013198	CAA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
41	NC_013198	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
42	NC_013198	AGC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
43	NC_013198	GAT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
44	NC_013198	CAG	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
45	NC_013198	CAC	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506999
46	NC_013198	GAT	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
47	NC_013198	ATC	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
48	NC_013198	GAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013198	GAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
50	NC_013198	GCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507000
51	NC_013198	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
52	NC_013198	CAT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
53	NC_013198	GAT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
54	NC_013198	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
55	NC_013198	GGT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
56	NC_013198	CGG	2	6	4890	4895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
57	NC_013198	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
58	NC_013198	CGG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
59	NC_013198	TGA	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
60	NC_013198	GCG	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
61	NC_013198	GGC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
62	NC_013198	GAA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
63	NC_013198	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
64	NC_013198	GGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
65	NC_013198	GAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
66	NC_013198	GTT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
67	NC_013198	GGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
68	NC_013198	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507000
69	NC_013198	GCT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
70	NC_013198	AAG	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
71	NC_013198	ACA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
72	NC_013198	GAA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
73	NC_013198	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
74	NC_013198	GTT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
75	NC_013198	GCC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
76	NC_013198	ATG	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
77	NC_013198	GCC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
78	NC_013198	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507000
79	NC_013198	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
80	NC_013198	GAA	2	6	6433	6438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
81	NC_013198	TTG	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
82	NC_013198	AAC	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
83	NC_013198	GAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013198	GAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
85	NC_013198	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
86	NC_013198	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
87	NC_013198	GCG	3	9	6891	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
88	NC_013198	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507001
89	NC_013198	GTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507001
90	NC_013198	CTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
91	NC_013198	ACC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
92	NC_013198	CCG	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507001
93	NC_013198	ATC	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507001
94	NC_013198	CCA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
95	NC_013198	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
96	NC_013198	TGG	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
97	NC_013198	TGA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
98	NC_013198	CCG	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507001
99	NC_013198	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507001
100	NC_013198	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
101	NC_013198	CGG	3	9	7626	7634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
102	NC_013198	GAA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
103	NC_013198	ATT	2	6	7725	7730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
104	NC_013198	ATT	2	6	7938	7943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
105	NC_013198	ATG	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
106	NC_013198	CTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
107	NC_013198	AAG	2	6	8047	8052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
108	NC_013198	GGT	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
109	NC_013198	GAT	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
110	NC_013198	TCG	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
111	NC_013198	ATG	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
112	NC_013198	CTT	2	6	8213	8218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507001
113	NC_013198	CAA	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507001
114	NC_013198	GCA	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
115	NC_013198	ATG	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
116	NC_013198	GCA	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
117	NC_013198	CGG	2	6	8741	8746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
118	NC_013198	GAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
119	NC_013198	TGA	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
120	NC_013198	CGA	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
121	NC_013198	CGA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
122	NC_013198	CAG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
123	NC_013198	TGA	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
124	NC_013198	CAT	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013198	CTG	3	9	9428	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507002
126	NC_013198	AAC	2	6	9578	9583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013198	GTT	2	6	9605	9610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013198	TTA	2	6	9719	9724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013198	TAT	2	6	9737	9742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013198	TTA	2	6	9779	9784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013198	ATG	2	6	9845	9850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507003
132	NC_013198	TGG	2	6	9907	9912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
133	NC_013198	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507003
134	NC_013198	TTG	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507003
135	NC_013198	TGG	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
136	NC_013198	GGT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
137	NC_013198	TGG	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
138	NC_013198	GTA	2	6	10077	10082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013198	AGA	2	6	10131	10136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013198	AAT	2	6	10211	10216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013198	CTT	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013198	GAC	2	6	10505	10510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507004
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147	NC_013198	ATT	2	6	10748	10753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_013198	TTC	2	6	18429	18434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_013198	GTA	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_013198	TGA	2	6	18474	18479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_013198	ATT	2	6	18489	18494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_013198	AAT	2	6	18611	18616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_013198	ACG	2	6	18657	18662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_013198	GTT	2	6	18756	18761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_013198	ATT	2	6	18993	18998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013198	AAG	2	6	19058	19063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_013198	AGA	2	6	19314	19319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507016
260	NC_013198	TAT	2	6	19336	19341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507016
261	NC_013198	TTG	2	6	19344	19349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507016
262	NC_013198	GTA	2	6	19398	19403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507016
263	NC_013198	GTA	2	6	19446	19451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507016
264	NC_013198	TGG	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507016
265	NC_013198	AAT	2	6	19620	19625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507016
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267	NC_013198	TTC	2	6	19672	19677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507016
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269	NC_013198	TGG	2	6	19814	19819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507016
270	NC_013198	ATT	2	6	19827	19832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507016
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275	NC_013198	TTG	2	6	20317	20322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_013198	TGT	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_013198	GTC	2	6	20398	20403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_013198	AGG	3	9	20611	20619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507017
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284	NC_013198	GCG	2	6	21276	21281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507017
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287	NC_013198	CTT	2	6	21615	21620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507017
288	NC_013198	TCG	2	6	21676	21681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507017
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291	NC_013198	TCC	2	6	21931	21936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_013198	TTA	2	6	22005	22010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013198	TAT	2	6	22034	22039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_013198	TAT	2	6	22082	22087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_013198	TAC	2	6	22129	22134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507018
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385	NC_013198	TTG	2	6	28334	28339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507024
386	NC_013198	GCA	2	6	28383	28388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507024
387	NC_013198	ATG	2	6	28403	28408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507024
388	NC_013198	GTT	2	6	28453	28458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507024
389	NC_013198	TGA	2	6	28463	28468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507024
390	NC_013198	TGA	2	6	28625	28630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507024
391	NC_013198	ATG	2	6	28683	28688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507025
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411	NC_013198	GTT	2	6	29911	29916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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