MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013198	CTG	2	6	183406	183411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507168
3502	NC_013198	CAT	2	6	183418	183423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507168
3503	NC_013198	GAT	2	6	183535	183540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507168
3504	NC_013198	CAT	2	6	183624	183629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507168
3505	NC_013198	TTG	2	6	183644	183649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507168
3506	NC_013198	TGAAC	2	10	183675	183684	40 %	20 %	20 %	20 %	258507168
3507	NC_013198	GGCCAC	2	12	183733	183744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258507168
3508	NC_013198	CTG	2	6	183809	183814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507168
3509	NC_013198	CAAG	2	8	183819	183826	50 %	0 %	25 %	25 %	258507168
3510	NC_013198	GAT	2	6	183861	183866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507168
3511	NC_013198	ATG	2	6	183875	183880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507168
3512	NC_013198	TCCT	2	8	183891	183898	0 %	50 %	0 %	50 %	258507169
3513	NC_013198	TGA	2	6	183906	183911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507169
3514	NC_013198	CAG	2	6	184092	184097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507169
3515	NC_013198	ATA	2	6	184112	184117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507169
3516	NC_013198	ATACG	2	10	184137	184146	40 %	20 %	20 %	20 %	258507169
3517	NC_013198	GGC	2	6	184180	184185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507169
3518	NC_013198	GGT	2	6	184244	184249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507169
3519	NC_013198	TAAG	2	8	184308	184315	50 %	25 %	25 %	0 %	258507169
3520	NC_013198	GAA	2	6	184344	184349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507169
3521	NC_013198	GTG	2	6	184410	184415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507169
3522	NC_013198	CAACTG	2	12	184437	184448	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258507169
3523	NC_013198	AAT	2	6	184470	184475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507169
3524	NC_013198	GCT	2	6	184523	184528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507169
3525	NC_013198	CCA	2	6	184591	184596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507169
3526	NC_013198	CTG	2	6	184611	184616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507169
3527	NC_013198	ATG	2	6	184664	184669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507169
3528	NC_013198	TCC	2	6	184673	184678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_013198	ACC	2	6	184712	184717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_013198	AAG	2	6	184835	184840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507170
3531	NC_013198	TGT	2	6	184851	184856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507170
3532	NC_013198	CTT	2	6	184904	184909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507170
3533	NC_013198	TCA	2	6	184955	184960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507170
3534	NC_013198	GAT	2	6	185002	185007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507170
3535	NC_013198	TCA	2	6	185024	185029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507170
3536	NC_013198	CCA	2	6	185127	185132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507170
3537	NC_013198	GTTG	2	8	185171	185178	0 %	50 %	50 %	0 %	258507170
3538	NC_013198	AAT	2	6	185239	185244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507170
3539	NC_013198	GAC	2	6	185502	185507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507170
3540	NC_013198	GTTG	2	8	185570	185577	0 %	50 %	50 %	0 %	258507170
3541	NC_013198	TTTG	2	8	185636	185643	0 %	75 %	25 %	0 %	258507170
3542	NC_013198	TTG	2	6	185695	185700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507170
3543	NC_013198	ATG	2	6	185735	185740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507170
3544	NC_013198	T	6	6	185847	185852	0 %	100 %	0 %	0 %	258507170
3545	NC_013198	TGG	2	6	185880	185885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507170
3546	NC_013198	ACC	2	6	185926	185931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507170
3547	NC_013198	CCG	3	9	185969	185977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507170
3548	NC_013198	GTC	2	6	186034	186039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507170
3549	NC_013198	ATC	2	6	186127	186132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507170
3550	NC_013198	ATATT	2	10	186233	186242	40 %	60 %	0 %	0 %	258507170
3551	NC_013198	CAC	2	6	186411	186416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507170
3552	NC_013198	AAT	2	6	186436	186441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507170
3553	NC_013198	TCC	2	6	186462	186467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507171
3554	NC_013198	AGC	2	6	186536	186541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507171
3555	NC_013198	GC	3	6	186607	186612	0 %	0 %	50 %	50 %	258507171
3556	NC_013198	CAC	2	6	186658	186663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507171
3557	NC_013198	CAA	2	6	186751	186756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507171
3558	NC_013198	CCG	2	6	186777	186782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507171
3559	NC_013198	GTGAA	2	10	186832	186841	40 %	20 %	40 %	0 %	258507171
3560	NC_013198	AAC	2	6	186852	186857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507171
3561	NC_013198	GTG	2	6	186891	186896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507171
3562	NC_013198	TTA	2	6	186909	186914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507171
3563	NC_013198	GCA	2	6	186936	186941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507171
3564	NC_013198	TCC	2	6	186956	186961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507171
3565	NC_013198	AAT	2	6	186987	186992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507171
3566	NC_013198	T	6	6	187103	187108	0 %	100 %	0 %	0 %	258507171
3567	NC_013198	TAG	2	6	187148	187153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507171
3568	NC_013198	AT	3	6	187188	187193	50 %	50 %	0 %	0 %	258507171
3569	NC_013198	GAA	2	6	187283	187288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507171
3570	NC_013198	GCCA	2	8	187355	187362	25 %	0 %	25 %	50 %	258507171
3571	NC_013198	AGC	2	6	187493	187498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507171
3572	NC_013198	TGA	2	6	187519	187524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507171
3573	NC_013198	TAG	2	6	187547	187552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507171
3574	NC_013198	CGC	2	6	187597	187602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507171
3575	NC_013198	TA	3	6	187631	187636	50 %	50 %	0 %	0 %	258507171
3576	NC_013198	TGA	2	6	187679	187684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507171
3577	NC_013198	CA	3	6	187704	187709	50 %	0 %	0 %	50 %	258507171
3578	NC_013198	C	6	6	187795	187800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3579	NC_013198	TAT	2	6	187824	187829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_013198	GAT	2	6	187900	187905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013198	ACACA	2	10	187916	187925	60 %	0 %	0 %	40 %	258507172
3582	NC_013198	ATT	2	6	187948	187953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507172
3583	NC_013198	CGG	2	6	187970	187975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507172
3584	NC_013198	AAT	2	6	188128	188133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507172
3585	NC_013198	ATA	2	6	188138	188143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507172
3586	NC_013198	A	6	6	188162	188167	100 %	0 %	0 %	0 %	258507172
3587	NC_013198	ATC	2	6	188246	188251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507172
3588	NC_013198	T	6	6	188357	188362	0 %	100 %	0 %	0 %	258507172
3589	NC_013198	TTA	2	6	188376	188381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507172
3590	NC_013198	TTTA	2	8	188402	188409	25 %	75 %	0 %	0 %	258507172
3591	NC_013198	GCT	2	6	188476	188481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507172
3592	NC_013198	AT	3	6	188499	188504	50 %	50 %	0 %	0 %	258507172
3593	NC_013198	TTCA	2	8	188595	188602	25 %	50 %	0 %	25 %	258507172
3594	NC_013198	CGC	2	6	188664	188669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507172
3595	NC_013198	ACA	2	6	188774	188779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507172
3596	NC_013198	TGA	2	6	188786	188791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013198	GCT	2	6	188883	188888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_013198	CTT	2	6	188949	188954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013198	GGA	2	6	188973	188978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_013198	GTG	2	6	188991	188996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013198	CTT	2	6	189109	189114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507173
3602	NC_013198	AGA	2	6	189224	189229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507173
3603	NC_013198	GTC	2	6	189281	189286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507173
3604	NC_013198	GGT	2	6	189301	189306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507173
3605	NC_013198	CCA	2	6	189312	189317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507173
3606	NC_013198	GAT	2	6	189356	189361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507173
3607	NC_013198	GCC	2	6	189377	189382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507173
3608	NC_013198	GTT	2	6	189383	189388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507173
3609	NC_013198	CAAG	2	8	189394	189401	50 %	0 %	25 %	25 %	258507173
3610	NC_013198	GT	3	6	189402	189407	0 %	50 %	50 %	0 %	258507173
3611	NC_013198	TCA	2	6	189465	189470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507173
3612	NC_013198	CCG	2	6	189504	189509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507173
3613	NC_013198	CAT	2	6	189655	189660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507173
3614	NC_013198	ATC	2	6	189674	189679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507173
3615	NC_013198	GCA	2	6	189705	189710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507173
3616	NC_013198	GTT	2	6	189746	189751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507173
3617	NC_013198	AAAG	2	8	189785	189792	75 %	0 %	25 %	0 %	258507173
3618	NC_013198	TTGA	2	8	189857	189864	25 %	50 %	25 %	0 %	258507173
3619	NC_013198	T	7	7	189868	189874	0 %	100 %	0 %	0 %	258507173
3620	NC_013198	GTG	2	6	189919	189924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507173
3621	NC_013198	GAT	2	6	189946	189951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507173
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3623	NC_013198	AGTA	2	8	190003	190010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3992	NC_013198	GAC	2	6	211335	211340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507194
3993	NC_013198	ATG	2	6	211375	211380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507194
3994	NC_013198	AGC	2	6	211386	211391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507194
3995	NC_013198	TTGC	2	8	211440	211447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3996	NC_013198	TA	3	6	211452	211457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_013198	AAC	2	6	211576	211581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_013198	TTG	2	6	211797	211802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507195
3999	NC_013198	TTA	2	6	211900	211905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507195
4000	NC_013198	TGG	2	6	211949	211954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507195

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