MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013198	TTG	2	6	157460	157465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507138
3002	NC_013198	GAC	2	6	157529	157534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507138
3003	NC_013198	AAT	2	6	157566	157571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507138
3004	NC_013198	ACC	2	6	157688	157693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507138
3005	NC_013198	A	6	6	157753	157758	100 %	0 %	0 %	0 %	258507138
3006	NC_013198	ATG	2	6	157790	157795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507138
3007	NC_013198	TTC	2	6	157819	157824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507138
3008	NC_013198	CTT	2	6	157882	157887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507138
3009	NC_013198	AAT	2	6	157982	157987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507138
3010	NC_013198	AAC	2	6	158056	158061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507138
3011	NC_013198	CCG	2	6	158096	158101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507138
3012	NC_013198	GGC	2	6	158134	158139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507138
3013	NC_013198	CAG	2	6	158146	158151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507138
3014	NC_013198	TCA	2	6	158204	158209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507138
3015	NC_013198	AAG	2	6	158213	158218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507138
3016	NC_013198	ATA	2	6	158245	158250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507138
3017	NC_013198	AAGT	2	8	158285	158292	50 %	25 %	25 %	0 %	258507138
3018	NC_013198	CGG	2	6	158327	158332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507138
3019	NC_013198	ATA	2	6	158345	158350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507138
3020	NC_013198	TGCC	2	8	158371	158378	0 %	25 %	25 %	50 %	258507138
3021	NC_013198	AACT	2	8	158380	158387	50 %	25 %	0 %	25 %	258507138
3022	NC_013198	TCA	2	6	158474	158479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507138
3023	NC_013198	TTTC	2	8	158481	158488	0 %	75 %	0 %	25 %	258507138
3024	NC_013198	TGT	2	6	158507	158512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507138
3025	NC_013198	TCC	2	6	158535	158540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_013198	TTTG	2	8	158599	158606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_013198	TTA	2	6	158727	158732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013198	GAA	2	6	158744	158749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_013198	CG	3	6	158911	158916	0 %	0 %	50 %	50 %	258507139
3030	NC_013198	TGA	2	6	158968	158973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507139
3031	NC_013198	ATG	2	6	159014	159019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507139
3032	NC_013198	AAAG	2	8	159124	159131	75 %	0 %	25 %	0 %	258507139
3033	NC_013198	GACCA	2	10	159215	159224	40 %	0 %	20 %	40 %	258507139
3034	NC_013198	GCG	2	6	159402	159407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507139
3035	NC_013198	G	6	6	159422	159427	0 %	0 %	100 %	0 %	258507139
3036	NC_013198	CAT	2	6	159463	159468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507139
3037	NC_013198	CA	3	6	159475	159480	50 %	0 %	0 %	50 %	258507139
3038	NC_013198	GCA	2	6	159495	159500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507139
3039	NC_013198	TTA	2	6	159555	159560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507139
3040	NC_013198	AGGC	2	8	159573	159580	25 %	0 %	50 %	25 %	258507139
3041	NC_013198	CGC	2	6	159643	159648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507139
3042	NC_013198	ACT	2	6	159702	159707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507139
3043	NC_013198	ACA	2	6	159742	159747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_013198	AAG	2	6	159759	159764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_013198	CAA	2	6	159803	159808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_013198	TAGAT	2	10	159914	159923	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013198	GA	3	6	159992	159997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_013198	AAAC	2	8	160094	160101	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_013198	CCAC	2	8	160133	160140	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3050	NC_013198	A	6	6	160155	160160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013198	CACC	2	8	160208	160215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3052	NC_013198	CGGC	2	8	160240	160247	0 %	0 %	50 %	50 %	258507140
3053	NC_013198	CTT	2	6	160259	160264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507140
3054	NC_013198	AGA	2	6	160441	160446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507140
3055	NC_013198	CGC	2	6	160505	160510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507140
3056	NC_013198	CGGA	2	8	160525	160532	25 %	0 %	50 %	25 %	258507140
3057	NC_013198	ATG	2	6	160659	160664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507140
3058	NC_013198	TAA	2	6	160694	160699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507140
3059	NC_013198	TGC	2	6	160813	160818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507140
3060	NC_013198	TTGA	2	8	160863	160870	25 %	50 %	25 %	0 %	258507140
3061	NC_013198	GAT	2	6	160980	160985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507140
3062	NC_013198	ACAA	2	8	161000	161007	75 %	0 %	0 %	25 %	258507140
3063	NC_013198	ATA	2	6	161022	161027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507140
3064	NC_013198	CAG	2	6	161122	161127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507140
3065	NC_013198	CAA	2	6	161135	161140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507140
3066	NC_013198	CAA	2	6	161158	161163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507140
3067	NC_013198	TCCC	2	8	161222	161229	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3068	NC_013198	GGC	2	6	161357	161362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507141
3069	NC_013198	CTG	2	6	161481	161486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507141
3070	NC_013198	TTG	2	6	161541	161546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507141
3071	NC_013198	TCT	2	6	161608	161613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507141
3072	NC_013198	GAT	2	6	161660	161665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507141
3073	NC_013198	TCG	2	6	161689	161694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507141
3074	NC_013198	GCC	2	6	161736	161741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507141
3075	NC_013198	TGC	2	6	161791	161796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507141
3076	NC_013198	AGTC	2	8	161840	161847	25 %	25 %	25 %	25 %	258507141
3077	NC_013198	GCA	2	6	161920	161925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507141
3078	NC_013198	AAG	2	6	161968	161973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507141
3079	NC_013198	TGG	2	6	162026	162031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507141
3080	NC_013198	TAA	2	6	162077	162082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507141
3081	NC_013198	ATC	2	6	162123	162128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507141
3082	NC_013198	ATG	2	6	162145	162150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507141
3083	NC_013198	AAT	2	6	162218	162223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507141
3084	NC_013198	TCC	2	6	162271	162276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507141
3085	NC_013198	GCA	2	6	162307	162312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507141
3086	NC_013198	T	6	6	162384	162389	0 %	100 %	0 %	0 %	258507141
3087	NC_013198	AATT	2	8	162419	162426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_013198	CTTT	2	8	162438	162445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_013198	T	6	6	162483	162488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013198	TGAT	2	8	162507	162514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_013198	TCT	2	6	162546	162551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_013198	TGAA	2	8	162585	162592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_013198	GGA	2	6	162636	162641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_013198	CTG	2	6	162665	162670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507142
3095	NC_013198	GCCG	2	8	162679	162686	0 %	0 %	50 %	50 %	258507142
3096	NC_013198	CCG	2	6	162709	162714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507142
3097	NC_013198	GT	3	6	162772	162777	0 %	50 %	50 %	0 %	258507142
3098	NC_013198	CAT	2	6	162802	162807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507142
3099	NC_013198	CAT	2	6	162902	162907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_013198	CA	3	6	162955	162960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_013198	GTG	2	6	163167	163172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507143
3102	NC_013198	GTT	2	6	163186	163191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507143
3103	NC_013198	AAG	2	6	163226	163231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507143
3104	NC_013198	TGA	2	6	163298	163303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507143
3105	NC_013198	TGA	2	6	163332	163337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507143
3106	NC_013198	TTC	2	6	163462	163467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507143
3107	NC_013198	TTC	2	6	163519	163524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507143
3108	NC_013198	TG	3	6	163530	163535	0 %	50 %	50 %	0 %	258507143
3109	NC_013198	GCC	2	6	163558	163563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507143
3110	NC_013198	CGC	2	6	163642	163647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507143
3111	NC_013198	CTT	2	6	163674	163679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507143
3112	NC_013198	GTT	2	6	163741	163746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507143
3113	NC_013198	CAC	2	6	163785	163790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507143
3114	NC_013198	TGC	2	6	163860	163865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507143
3115	NC_013198	TTG	2	6	163880	163885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507143
3116	NC_013198	GTCA	2	8	163894	163901	25 %	25 %	25 %	25 %	258507143
3117	NC_013198	CAT	2	6	163941	163946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507143
3118	NC_013198	GCC	2	6	164086	164091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507143
3119	NC_013198	TAT	2	6	164130	164135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013198	CAT	2	6	164299	164304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_013198	TAA	2	6	164352	164357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_013198	ATG	2	6	164402	164407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507144
3123	NC_013198	G	6	6	164420	164425	0 %	0 %	100 %	0 %	258507144
3124	NC_013198	TTG	2	6	164427	164432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507144
3125	NC_013198	CGA	2	6	164466	164471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507144
3126	NC_013198	GCT	2	6	164531	164536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507144
3127	NC_013198	TGC	2	6	164544	164549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507144
3128	NC_013198	GTT	2	6	164563	164568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507144
3129	NC_013198	TTG	2	6	164592	164597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507144
3130	NC_013198	TGT	2	6	164617	164622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507144
3131	NC_013198	CCA	2	6	164658	164663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507144
3132	NC_013198	AGA	2	6	164692	164697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_013198	ATA	2	6	164734	164739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_013198	GCC	2	6	164740	164745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_013198	GTT	2	6	164793	164798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_013198	TAA	2	6	164808	164813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_013198	TGT	2	6	164865	164870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_013198	A	7	7	164872	164878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_013198	TTG	2	6	164906	164911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_013198	CAAA	2	8	164989	164996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3141	NC_013198	AATC	2	8	165096	165103	50 %	25 %	0 %	25 %	258507145
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3162	NC_013198	GGT	2	6	165988	165993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507146
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3166	NC_013198	TTGAAG	2	12	166119	166130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507146
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3182	NC_013198	CAGC	2	8	166902	166909	25 %	0 %	25 %	50 %	258507146
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3185	NC_013198	CTG	2	6	167180	167185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3186	NC_013198	GAG	2	6	167214	167219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3187	NC_013198	CGT	2	6	167313	167318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507147
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3209	NC_013198	ATT	2	6	168712	168717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3210	NC_013198	GTA	2	6	168772	168777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507150
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3231	NC_013198	GCG	2	6	170120	170125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507151
3232	NC_013198	ATC	2	6	170183	170188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507151
3233	NC_013198	ATC	2	6	170225	170230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507151
3234	NC_013198	CAT	2	6	170312	170317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507151
3235	NC_013198	TC	3	6	170483	170488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3236	NC_013198	GTT	2	6	170536	170541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_013198	ATA	2	6	170632	170637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_013198	T	6	6	170638	170643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_013198	T	6	6	170656	170661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_013198	GCTT	2	8	170742	170749	0 %	50 %	25 %	25 %	258507152
3241	NC_013198	GAG	2	6	170821	170826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507152
3242	NC_013198	GCAAT	2	10	170840	170849	40 %	20 %	20 %	20 %	258507152
3243	NC_013198	ATT	2	6	170855	170860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507152
3244	NC_013198	TGA	2	6	170939	170944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507152
3245	NC_013198	ACAA	2	8	170972	170979	75 %	0 %	0 %	25 %	258507152
3246	NC_013198	GCA	2	6	170986	170991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507152
3247	NC_013198	ATG	2	6	171049	171054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507152
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3368	NC_013198	T	7	7	176651	176657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3369	NC_013198	T	6	6	176669	176674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3496	NC_013198	TGTT	2	8	183275	183282	0 %	75 %	25 %	0 %	258507168
3497	NC_013198	AAT	2	6	183287	183292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507168
3498	NC_013198	CAC	2	6	183333	183338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507168
3499	NC_013198	GCC	2	6	183347	183352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507168
3500	NC_013198	GTG	2	6	183400	183405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507168

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