MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013198	TGT	2	6	131622	131627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507118
2502	NC_013198	GCA	2	6	131637	131642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507118
2503	NC_013198	TGAA	2	8	131673	131680	50 %	25 %	25 %	0 %	258507118
2504	NC_013198	GAA	3	9	131678	131686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507118
2505	NC_013198	ATT	2	6	131699	131704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507118
2506	NC_013198	TCA	3	9	131820	131828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507118
2507	NC_013198	ACT	2	6	131832	131837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507118
2508	NC_013198	GTG	2	6	131961	131966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507118
2509	NC_013198	ATT	2	6	132066	132071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507118
2510	NC_013198	GAC	3	9	132092	132100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507118
2511	NC_013198	GCG	2	6	132111	132116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507118
2512	NC_013198	TGA	2	6	132124	132129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507118
2513	NC_013198	TGAAGT	2	12	132139	132150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507118
2514	NC_013198	CAT	2	6	132151	132156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507118
2515	NC_013198	GAA	2	6	132160	132165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507118
2516	NC_013198	AGA	2	6	132266	132271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_013198	ACAA	2	8	132276	132283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_013198	CTG	2	6	132364	132369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507119
2519	NC_013198	GAT	2	6	132394	132399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507119
2520	NC_013198	GTT	2	6	132439	132444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507119
2521	NC_013198	GAT	2	6	132529	132534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507119
2522	NC_013198	ACA	2	6	132539	132544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507119
2523	NC_013198	T	6	6	132579	132584	0 %	100 %	0 %	0 %	258507119
2524	NC_013198	GAAA	2	8	132597	132604	75 %	0 %	25 %	0 %	258507119
2525	NC_013198	CCA	2	6	132623	132628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507119
2526	NC_013198	GCA	2	6	132651	132656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507119
2527	NC_013198	AAGC	2	8	132662	132669	50 %	0 %	25 %	25 %	258507119
2528	NC_013198	GAT	2	6	132675	132680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507119
2529	NC_013198	TGG	2	6	132683	132688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507119
2530	NC_013198	TTG	2	6	132689	132694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507119
2531	NC_013198	GAT	2	6	132739	132744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507119
2532	NC_013198	CAA	2	6	132765	132770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507119
2533	NC_013198	ACG	2	6	132917	132922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507119
2534	NC_013198	GGT	2	6	132975	132980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507119
2535	NC_013198	TTC	2	6	133003	133008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507119
2536	NC_013198	GGC	2	6	133078	133083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507119
2537	NC_013198	TGA	2	6	133091	133096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507119
2538	NC_013198	ATT	2	6	133133	133138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507119
2539	NC_013198	CAT	2	6	133177	133182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507119
2540	NC_013198	CAGC	2	8	133185	133192	25 %	0 %	25 %	50 %	258507119
2541	NC_013198	ATC	2	6	133249	133254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507119
2542	NC_013198	GGT	2	6	133278	133283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507119
2543	NC_013198	TGA	2	6	133305	133310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507119
2544	NC_013198	CGACTT	2	12	133347	133358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258507119
2545	NC_013198	TGG	2	6	133509	133514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_013198	A	6	6	133539	133544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_013198	CAC	2	6	133599	133604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507120
2548	NC_013198	CAT	2	6	133627	133632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507120
2549	NC_013198	TGG	2	6	133642	133647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507120
2550	NC_013198	ATG	2	6	133669	133674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507120
2551	NC_013198	ATG	2	6	133695	133700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507120
2552	NC_013198	TCA	2	6	133702	133707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507120
2553	NC_013198	TGG	2	6	133750	133755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507120
2554	NC_013198	CGGTTG	2	12	133864	133875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258507120
2555	NC_013198	T	6	6	133981	133986	0 %	100 %	0 %	0 %	258507120
2556	NC_013198	A	6	6	133990	133995	100 %	0 %	0 %	0 %	258507120
2557	NC_013198	CGG	2	6	134008	134013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507120
2558	NC_013198	GGT	2	6	134054	134059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507120
2559	NC_013198	GTTG	3	12	134088	134099	0 %	50 %	50 %	0 %	258507120
2560	NC_013198	GAA	2	6	134180	134185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507120
2561	NC_013198	TGG	2	6	134247	134252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507120
2562	NC_013198	GCT	2	6	134274	134279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507120
2563	NC_013198	ACCGC	2	10	134328	134337	20 %	0 %	20 %	60 %	258507120
2564	NC_013198	GCC	3	9	134342	134350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507120
2565	NC_013198	CA	3	6	134351	134356	50 %	0 %	0 %	50 %	258507120
2566	NC_013198	GCA	2	6	134499	134504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507120
2567	NC_013198	GCC	3	9	134513	134521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507120
2568	NC_013198	GCA	2	6	134539	134544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507120
2569	NC_013198	AAG	2	6	134625	134630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507120
2570	NC_013198	CCG	2	6	134661	134666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507120
2571	NC_013198	GAA	2	6	134671	134676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507120
2572	NC_013198	AGCC	2	8	134709	134716	25 %	0 %	25 %	50 %	258507120
2573	NC_013198	CAG	2	6	134759	134764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507120
2574	NC_013198	ATA	2	6	134784	134789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507120
2575	NC_013198	AGC	2	6	134838	134843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507120
2576	NC_013198	GAT	2	6	134864	134869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507120
2577	NC_013198	GCC	2	6	134870	134875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507120
2578	NC_013198	GCT	2	6	134883	134888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507120
2579	NC_013198	TGG	2	6	134895	134900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507120
2580	NC_013198	CAA	2	6	134929	134934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507120
2581	NC_013198	CCG	2	6	134955	134960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507120
2582	NC_013198	CCG	2	6	135042	135047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507120
2583	NC_013198	TGA	2	6	135067	135072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507120
2584	NC_013198	CAG	2	6	135100	135105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507120
2585	NC_013198	CAT	2	6	135107	135112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507120
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2587	NC_013198	GTTT	2	8	135219	135226	0 %	75 %	25 %	0 %	258507120
2588	NC_013198	CGG	2	6	135256	135261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507120
2589	NC_013198	TTA	2	6	135375	135380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507120
2590	NC_013198	TTC	2	6	135413	135418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507120
2591	NC_013198	T	6	6	135446	135451	0 %	100 %	0 %	0 %	258507120
2592	NC_013198	CCAC	2	8	135540	135547	25 %	0 %	0 %	75 %	258507120
2593	NC_013198	TCT	2	6	135595	135600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507120
2594	NC_013198	TCC	2	6	135604	135609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507121
2595	NC_013198	TTGA	2	8	135648	135655	25 %	50 %	25 %	0 %	258507121
2596	NC_013198	GGT	2	6	135669	135674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507121
2597	NC_013198	CGC	2	6	135726	135731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507121
2598	NC_013198	GCATC	2	10	135757	135766	20 %	20 %	20 %	40 %	258507121
2599	NC_013198	CTG	2	6	135774	135779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507121
2600	NC_013198	AAT	2	6	135780	135785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507121
2601	NC_013198	TGG	2	6	135815	135820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507121
2602	NC_013198	CCA	2	6	135863	135868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507121
2603	NC_013198	GCTG	2	8	135983	135990	0 %	25 %	50 %	25 %	258507121
2604	NC_013198	AGGCT	2	10	136010	136019	20 %	20 %	40 %	20 %	258507121
2605	NC_013198	GCG	2	6	136027	136032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507121
2606	NC_013198	GGC	2	6	136086	136091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507121
2607	NC_013198	TCC	2	6	136162	136167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507121
2608	NC_013198	CAACGG	2	12	136175	136186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507121
2609	NC_013198	AAG	2	6	136331	136336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507121
2610	NC_013198	GTC	2	6	136507	136512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507121
2611	NC_013198	CTTT	2	8	136526	136533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_013198	CAT	2	6	136553	136558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507122
2613	NC_013198	GAATC	2	10	136567	136576	40 %	20 %	20 %	20 %	258507122
2614	NC_013198	TAT	2	6	136710	136715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507122
2615	NC_013198	TGC	2	6	136725	136730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507122
2616	NC_013198	CGGGGA	2	12	136733	136744	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258507122
2617	NC_013198	GGC	2	6	136827	136832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507122
2618	NC_013198	TAC	2	6	136923	136928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507122
2619	NC_013198	GCA	2	6	136994	136999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507122
2620	NC_013198	GTT	2	6	137058	137063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507122
2621	NC_013198	AAAT	2	8	137076	137083	75 %	25 %	0 %	0 %	258507122
2622	NC_013198	GTGC	2	8	137103	137110	0 %	25 %	50 %	25 %	258507122
2623	NC_013198	ATTT	2	8	137115	137122	25 %	75 %	0 %	0 %	258507122
2624	NC_013198	T	7	7	137120	137126	0 %	100 %	0 %	0 %	258507122
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2626	NC_013198	GT	3	6	137273	137278	0 %	50 %	50 %	0 %	258507122
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2635	NC_013198	TGA	2	6	137714	137719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2866	NC_013198	GCAA	2	8	150386	150393	50 %	0 %	25 %	25 %	258507132
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2868	NC_013198	TCT	2	6	150403	150408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507132
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2874	NC_013198	GCT	2	6	150778	150783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2877	NC_013198	GCT	2	6	150865	150870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2881	NC_013198	TGG	2	6	150962	150967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2984	NC_013198	GA	3	6	156476	156481	50 %	0 %	50 %	0 %	258507137
2985	NC_013198	GC	3	6	156491	156496	0 %	0 %	50 %	50 %	258507137
2986	NC_013198	AAAT	2	8	156576	156583	75 %	25 %	0 %	0 %	258507137
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2989	NC_013198	T	7	7	156770	156776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2990	NC_013198	ATA	2	6	156900	156905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2991	NC_013198	GTGTT	2	10	156953	156962	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2992	NC_013198	AGG	2	6	156997	157002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2993	NC_013198	TCAC	2	8	157003	157010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2994	NC_013198	GATG	2	8	157034	157041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_013198	TG	3	6	157133	157138	0 %	50 %	50 %	0 %	258507138
2996	NC_013198	GCT	2	6	157187	157192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507138
2997	NC_013198	GCT	2	6	157217	157222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507138
2998	NC_013198	ATC	2	6	157246	157251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507138
2999	NC_013198	TTTG	2	8	157268	157275	0 %	75 %	25 %	0 %	258507138
3000	NC_013198	GGCTTC	2	12	157288	157299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507138

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