MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013198	GCC	2	6	79183	79188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507065
1502	NC_013198	AATC	2	8	79207	79214	50 %	25 %	0 %	25 %	258507065
1503	NC_013198	GTT	2	6	79287	79292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507065
1504	NC_013198	GAC	2	6	79321	79326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507065
1505	NC_013198	AAT	2	6	79384	79389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507065
1506	NC_013198	GCC	2	6	79405	79410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507065
1507	NC_013198	AAT	2	6	79483	79488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507065
1508	NC_013198	A	6	6	79562	79567	100 %	0 %	0 %	0 %	258507065
1509	NC_013198	CGA	2	6	79587	79592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013198	GCC	2	6	79594	79599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_013198	GAT	4	12	79621	79632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507066
1512	NC_013198	CGC	2	6	79651	79656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507066
1513	NC_013198	CAT	2	6	79745	79750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507066
1514	NC_013198	GAT	2	6	79827	79832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507066
1515	NC_013198	GCC	2	6	79885	79890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507066
1516	NC_013198	CCA	2	6	79894	79899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507066
1517	NC_013198	CAG	2	6	79937	79942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507066
1518	NC_013198	GCGCC	2	10	80024	80033	0 %	0 %	40 %	60 %	258507066
1519	NC_013198	CCTG	2	8	80059	80066	0 %	25 %	25 %	50 %	258507066
1520	NC_013198	TAA	2	6	80067	80072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507066
1521	NC_013198	ATG	2	6	80133	80138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507066
1522	NC_013198	T	6	6	80153	80158	0 %	100 %	0 %	0 %	258507066
1523	NC_013198	GTC	2	6	80163	80168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507066
1524	NC_013198	GC	3	6	80250	80255	0 %	0 %	50 %	50 %	258507066
1525	NC_013198	GC	3	6	80323	80328	0 %	0 %	50 %	50 %	258507066
1526	NC_013198	GGC	2	6	80331	80336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507066
1527	NC_013198	ATT	2	6	80361	80366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507066
1528	NC_013198	TAA	2	6	80383	80388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507066
1529	NC_013198	ATC	2	6	80487	80492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507066
1530	NC_013198	GGT	2	6	80586	80591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507066
1531	NC_013198	GGC	2	6	80613	80618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507066
1532	NC_013198	GTT	2	6	80726	80731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507066
1533	NC_013198	TCG	2	6	80848	80853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507066
1534	NC_013198	TCA	2	6	80999	81004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507067
1535	NC_013198	ATG	2	6	81019	81024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507067
1536	NC_013198	CAA	2	6	81089	81094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507067
1537	NC_013198	GCA	2	6	81145	81150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507067
1538	NC_013198	AAT	2	6	81201	81206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507067
1539	NC_013198	AGC	2	6	81325	81330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507067
1540	NC_013198	GAG	2	6	81351	81356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507067
1541	NC_013198	GCG	2	6	81419	81424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507068
1542	NC_013198	CAT	2	6	81556	81561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507068
1543	NC_013198	CTGGCA	2	12	81582	81593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258507068
1544	NC_013198	AACC	2	8	81651	81658	50 %	0 %	0 %	50 %	258507068
1545	NC_013198	CAT	2	6	81680	81685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507068
1546	NC_013198	AAAT	2	8	81690	81697	75 %	25 %	0 %	0 %	258507068
1547	NC_013198	GCTT	2	8	81740	81747	0 %	50 %	25 %	25 %	258507068
1548	NC_013198	TTG	2	6	81811	81816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507068
1549	NC_013198	GAA	2	6	81866	81871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507068
1550	NC_013198	AGC	2	6	82004	82009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507068
1551	NC_013198	AAT	2	6	82067	82072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507068
1552	NC_013198	A	6	6	82078	82083	100 %	0 %	0 %	0 %	258507068
1553	NC_013198	GACC	2	8	82108	82115	25 %	0 %	25 %	50 %	258507068
1554	NC_013198	AT	3	6	82134	82139	50 %	50 %	0 %	0 %	258507068
1555	NC_013198	TGC	2	6	82160	82165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507068
1556	NC_013198	CCT	2	6	82229	82234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_013198	TAAA	2	8	82274	82281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013198	A	6	6	82295	82300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013198	GTT	2	6	82520	82525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_013198	GGCT	3	12	82614	82625	0 %	25 %	50 %	25 %	258507069
1561	NC_013198	GTGGC	2	10	82648	82657	0 %	20 %	60 %	20 %	258507069
1562	NC_013198	GGT	2	6	82708	82713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507069
1563	NC_013198	GTT	2	6	82724	82729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507069
1564	NC_013198	GCT	2	6	82741	82746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507069
1565	NC_013198	CAA	2	6	82750	82755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507069
1566	NC_013198	TAA	2	6	82822	82827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013198	CAGT	2	8	82838	82845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_013198	TGAT	2	8	82860	82867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013198	GAA	2	6	82966	82971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013198	A	6	6	82999	83004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013198	A	6	6	83016	83021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013198	GAC	2	6	83022	83027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_013198	GAT	2	6	83207	83212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507070
1574	NC_013198	CCG	2	6	83223	83228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507070
1575	NC_013198	ATG	2	6	83295	83300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507070
1576	NC_013198	GGC	2	6	83366	83371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507070
1577	NC_013198	TGA	2	6	83419	83424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507070
1578	NC_013198	CAA	2	6	83429	83434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507070
1579	NC_013198	ATG	3	9	83490	83498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507070
1580	NC_013198	ACA	2	6	83500	83505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507070
1581	NC_013198	GCCAA	2	10	83583	83592	40 %	0 %	20 %	40 %	258507070
1582	NC_013198	ACTG	2	8	83656	83663	25 %	25 %	25 %	25 %	258507070
1583	NC_013198	TGC	2	6	83703	83708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507070
1584	NC_013198	GTC	2	6	83731	83736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507071
1585	NC_013198	AAT	2	6	83748	83753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507071
1586	NC_013198	TCG	2	6	83804	83809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507071
1587	NC_013198	TTC	2	6	83891	83896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507071
1588	NC_013198	TGT	2	6	83904	83909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507071
1589	NC_013198	GAA	2	6	83938	83943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507071
1590	NC_013198	ATC	2	6	83950	83955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507071
1591	NC_013198	CCGT	2	8	83990	83997	0 %	25 %	25 %	50 %	258507071
1592	NC_013198	CGT	2	6	84039	84044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507071
1593	NC_013198	AAACC	2	10	84045	84054	60 %	0 %	0 %	40 %	258507071
1594	NC_013198	AAATC	2	10	84080	84089	60 %	20 %	0 %	20 %	258507071
1595	NC_013198	CTTT	2	8	84174	84181	0 %	75 %	0 %	25 %	258507071
1596	NC_013198	TGT	2	6	84192	84197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507071
1597	NC_013198	CTT	2	6	84208	84213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507071
1598	NC_013198	CTT	3	9	84216	84224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507071
1599	NC_013198	T	6	6	84289	84294	0 %	100 %	0 %	0 %	258507071
1600	NC_013198	CAT	2	6	84402	84407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507071
1601	NC_013198	ATC	2	6	84413	84418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507071
1602	NC_013198	ACC	2	6	84428	84433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507071
1603	NC_013198	GTT	2	6	84448	84453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507071
1604	NC_013198	GTC	2	6	84461	84466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507071
1605	NC_013198	AGC	2	6	84605	84610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507071
1606	NC_013198	AGT	2	6	84635	84640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507071
1607	NC_013198	CCT	2	6	84665	84670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507072
1608	NC_013198	GC	3	6	84673	84678	0 %	0 %	50 %	50 %	258507072
1609	NC_013198	GGT	2	6	84695	84700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507072
1610	NC_013198	AAC	2	6	84715	84720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507072
1611	NC_013198	CAA	2	6	84725	84730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507072
1612	NC_013198	GAT	2	6	84765	84770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507072
1613	NC_013198	AGC	2	6	84963	84968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507072
1614	NC_013198	GCA	2	6	85025	85030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507072
1615	NC_013198	CAA	2	6	85199	85204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507072
1616	NC_013198	CCT	2	6	85306	85311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507073
1617	NC_013198	GTG	2	6	85344	85349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507073
1618	NC_013198	GTC	2	6	85350	85355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507073
1619	NC_013198	CTGA	2	8	85366	85373	25 %	25 %	25 %	25 %	258507073
1620	NC_013198	GCA	2	6	85389	85394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507073
1621	NC_013198	ATC	2	6	85403	85408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507073
1622	NC_013198	CAA	2	6	85444	85449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507073
1623	NC_013198	T	6	6	85559	85564	0 %	100 %	0 %	0 %	258507073
1624	NC_013198	TCAC	2	8	85593	85600	25 %	25 %	0 %	50 %	258507073
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