MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013198	CTG	2	6	26270	26275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507023
502	NC_013198	CAA	2	6	26314	26319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507023
503	NC_013198	GCTG	2	8	26489	26496	0 %	25 %	50 %	25 %	258507023
504	NC_013198	AGT	2	6	26521	26526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507023
505	NC_013198	ATCA	2	8	26666	26673	50 %	25 %	0 %	25 %	258507023
506	NC_013198	T	6	6	26792	26797	0 %	100 %	0 %	0 %	258507023
507	NC_013198	CTT	2	6	26869	26874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013198	GGAA	2	8	26943	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013198	GTT	2	6	26985	26990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013198	TCT	2	6	27022	27027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013198	TCA	2	6	27042	27047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013198	AT	3	6	27066	27071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013198	GCG	2	6	27093	27098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013198	ACA	2	6	27120	27125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013198	AAC	2	6	27149	27154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_013198	AAT	2	6	27155	27160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013198	CTG	2	6	27197	27202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013198	GGGC	2	8	27216	27223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
519	NC_013198	CAA	2	6	27232	27237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013198	TGCG	2	8	27257	27264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_013198	TGT	2	6	27302	27307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013198	CAA	2	6	27309	27314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013198	TTG	2	6	27434	27439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013198	TTTG	2	8	27484	27491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013198	GGC	2	6	27528	27533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013198	TTGT	2	8	27581	27588	0 %	75 %	25 %	0 %	258507024
527	NC_013198	GAT	2	6	27606	27611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507024
528	NC_013198	CTG	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507024
529	NC_013198	GTTG	2	8	27710	27717	0 %	50 %	50 %	0 %	258507024
530	NC_013198	TTA	2	6	27751	27756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507024
531	NC_013198	GCA	2	6	27760	27765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507024
532	NC_013198	TCA	2	6	27772	27777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507024
533	NC_013198	CTG	2	6	27782	27787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507024
534	NC_013198	GGT	2	6	27941	27946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507024
535	NC_013198	CGG	2	6	27975	27980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507024
536	NC_013198	GGCA	2	8	28134	28141	25 %	0 %	50 %	25 %	258507024
537	NC_013198	TGGTG	2	10	28236	28245	0 %	40 %	60 %	0 %	258507024
538	NC_013198	TTG	2	6	28258	28263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507024
539	NC_013198	TG	3	6	28274	28279	0 %	50 %	50 %	0 %	258507024
540	NC_013198	TTG	2	6	28334	28339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507024
541	NC_013198	GCA	2	6	28383	28388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507024
542	NC_013198	ATG	2	6	28403	28408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507024
543	NC_013198	GTT	2	6	28453	28458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507024
544	NC_013198	TGA	2	6	28463	28468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507024
545	NC_013198	AGTT	2	8	28586	28593	25 %	50 %	25 %	0 %	258507024
546	NC_013198	TGA	2	6	28625	28630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507024
547	NC_013198	ATG	2	6	28683	28688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507025
548	NC_013198	ATT	2	6	28689	28694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507025
549	NC_013198	GGT	2	6	28695	28700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507025
550	NC_013198	AGC	2	6	28703	28708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507025
551	NC_013198	GGTATC	2	12	28716	28727	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258507025
552	NC_013198	AAC	2	6	28735	28740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507025
553	NC_013198	GAA	2	6	28773	28778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507025
554	NC_013198	ATT	2	6	28949	28954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507025
555	NC_013198	CG	3	6	28990	28995	0 %	0 %	50 %	50 %	258507025
556	NC_013198	ACT	2	6	29013	29018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507025
557	NC_013198	CGT	2	6	29048	29053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507025
558	NC_013198	ACC	2	6	29055	29060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507025
559	NC_013198	ATC	2	6	29110	29115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507025
560	NC_013198	TTG	2	6	29250	29255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507025
561	NC_013198	AGA	2	6	29374	29379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507025
562	NC_013198	GACG	2	8	29436	29443	25 %	0 %	50 %	25 %	258507025
563	NC_013198	ACG	2	6	29451	29456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507025
564	NC_013198	ATT	2	6	29516	29521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507025
565	NC_013198	ATG	2	6	29530	29535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507025
566	NC_013198	TGA	2	6	29558	29563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507025
567	NC_013198	GCCGG	2	10	29592	29601	0 %	0 %	60 %	40 %	258507025
568	NC_013198	TGA	2	6	29744	29749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507025
569	NC_013198	CTG	2	6	29777	29782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507025
570	NC_013198	AGG	2	6	29800	29805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013198	A	6	6	29876	29881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013198	GTT	2	6	29911	29916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013198	GGGT	2	8	29988	29995	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013198	GCT	2	6	30022	30027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
575	NC_013198	GCC	2	6	30079	30084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507026
576	NC_013198	GCC	2	6	30163	30168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507026
577	NC_013198	CAG	2	6	30180	30185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507026
578	NC_013198	GAT	2	6	30193	30198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507026
579	NC_013198	CTG	2	6	30204	30209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
580	NC_013198	GCT	2	6	30236	30241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
581	NC_013198	TGCC	2	8	30282	30289	0 %	25 %	25 %	50 %	258507026
582	NC_013198	TGC	2	6	30390	30395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
583	NC_013198	GAA	2	6	30425	30430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507026
584	NC_013198	GTTG	2	8	30433	30440	0 %	50 %	50 %	0 %	258507026
585	NC_013198	CTG	2	6	30464	30469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
586	NC_013198	GCT	2	6	30521	30526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
587	NC_013198	GCT	2	6	30554	30559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
588	NC_013198	AACTG	2	10	30895	30904	40 %	20 %	20 %	20 %	258507026
589	NC_013198	CTTT	2	8	30909	30916	0 %	75 %	0 %	25 %	258507026
590	NC_013198	GTT	2	6	30943	30948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507026
591	NC_013198	AGC	2	6	30973	30978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507026
592	NC_013198	TGTT	2	8	31070	31077	0 %	75 %	25 %	0 %	258507026
593	NC_013198	GCT	2	6	31100	31105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
594	NC_013198	TAA	2	6	31117	31122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507026
595	NC_013198	GATGC	2	10	31145	31154	20 %	20 %	40 %	20 %	258507026
596	NC_013198	CTG	2	6	31212	31217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507026
597	NC_013198	TCA	2	6	31227	31232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507026
598	NC_013198	TTAA	3	12	31266	31277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013198	GTT	2	6	31332	31337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013198	A	6	6	31411	31416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013198	CAT	2	6	31538	31543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507027
602	NC_013198	GAATA	2	10	31616	31625	60 %	20 %	20 %	0 %	258507027
603	NC_013198	TGG	2	6	31744	31749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507027
604	NC_013198	TGT	2	6	31780	31785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507027
605	NC_013198	GAC	2	6	31799	31804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507027
606	NC_013198	TGT	2	6	31867	31872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507027
607	NC_013198	GGT	3	9	31889	31897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507027
608	NC_013198	ATG	2	6	31919	31924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507027
609	NC_013198	CAG	2	6	31928	31933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507027
610	NC_013198	CTG	3	9	31955	31963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507027
611	NC_013198	AGC	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507027
612	NC_013198	GTT	2	6	32020	32025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507027
613	NC_013198	AG	3	6	32039	32044	50 %	0 %	50 %	0 %	258507027
614	NC_013198	CGT	2	6	32111	32116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507027
615	NC_013198	TTGG	2	8	32207	32214	0 %	50 %	50 %	0 %	258507027
616	NC_013198	TGC	2	6	32302	32307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507027
617	NC_013198	GGT	2	6	32318	32323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507027
618	NC_013198	GGC	2	6	32336	32341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507027
619	NC_013198	T	6	6	32359	32364	0 %	100 %	0 %	0 %	258507027
620	NC_013198	GGTT	2	8	32384	32391	0 %	50 %	50 %	0 %	258507027
621	NC_013198	CCG	2	6	32508	32513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507027
622	NC_013198	TGAA	2	8	32584	32591	50 %	25 %	25 %	0 %	258507027
623	NC_013198	GCG	2	6	32667	32672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507027
624	NC_013198	CAC	2	6	32696	32701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507027
625	NC_013198	GAT	2	6	32702	32707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507027
626	NC_013198	AGC	2	6	32739	32744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507027
627	NC_013198	GAT	2	6	32855	32860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507027
628	NC_013198	ACC	2	6	32861	32866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507027
629	NC_013198	GCA	2	6	32883	32888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507027
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753	NC_013198	ATC	2	6	38447	38452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_013198	T	6	6	38463	38468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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