MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013198	CGATAA	2	12	347110	347121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	258507338
6502	NC_013198	GAA	2	6	347193	347198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507338
6503	NC_013198	CTT	2	6	347200	347205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507338
6504	NC_013198	TCG	2	6	347224	347229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507338
6505	NC_013198	TGA	2	6	347281	347286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507338
6506	NC_013198	AACA	2	8	347438	347445	75 %	0 %	0 %	25 %	258507338
6507	NC_013198	GCA	2	6	347454	347459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507338
6508	NC_013198	ATCC	2	8	347492	347499	25 %	25 %	0 %	50 %	258507338
6509	NC_013198	ATG	2	6	347535	347540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507338
6510	NC_013198	AAT	2	6	347699	347704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507338
6511	NC_013198	TTC	2	6	347732	347737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507338
6512	NC_013198	ATC	2	6	347792	347797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507338
6513	NC_013198	TTGGC	2	10	347800	347809	0 %	40 %	40 %	20 %	258507338
6514	NC_013198	A	6	6	347864	347869	100 %	0 %	0 %	0 %	258507338
6515	NC_013198	TGC	2	6	347915	347920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507338
6516	NC_013198	CAA	2	6	347935	347940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507338
6517	NC_013198	GGCAAT	2	12	348065	348076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258507338
6518	NC_013198	AAC	2	6	348210	348215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507338
6519	NC_013198	CAA	2	6	348235	348240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507338
6520	NC_013198	GAT	3	9	348314	348322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507338
6521	NC_013198	TGC	2	6	348373	348378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507338
6522	NC_013198	CCT	2	6	348381	348386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_013198	TA	3	6	348389	348394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_013198	A	6	6	348407	348412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_013198	AAC	2	6	348462	348467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_013198	TGA	2	6	348473	348478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_013198	ATG	2	6	348500	348505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_013198	T	7	7	348514	348520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_013198	ATT	2	6	348544	348549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_013198	TA	3	6	348554	348559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_013198	ATA	2	6	348613	348618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_013198	TAA	2	6	348642	348647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_013198	GGA	2	6	348716	348721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_013198	GCAAC	2	10	348747	348756	40 %	0 %	20 %	40 %	258507339
6535	NC_013198	AGC	2	6	348893	348898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507339
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6537	NC_013198	GACC	2	8	348953	348960	25 %	0 %	25 %	50 %	258507339
6538	NC_013198	CGA	2	6	348971	348976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507339
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6541	NC_013198	CG	3	6	349123	349128	0 %	0 %	50 %	50 %	258507339
6542	NC_013198	GCT	2	6	349223	349228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507339
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6546	NC_013198	CT	3	6	349774	349779	0 %	50 %	0 %	50 %	258507339
6547	NC_013198	AAG	2	6	349809	349814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507339
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6550	NC_013198	TGG	2	6	349990	349995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507339
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6552	NC_013198	T	6	6	350047	350052	0 %	100 %	0 %	0 %	258507339
6553	NC_013198	ATCAA	2	10	350095	350104	60 %	20 %	0 %	20 %	258507339
6554	NC_013198	TAAA	2	8	350157	350164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_013198	ATA	2	6	350181	350186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_013198	ATG	2	6	350224	350229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_013198	GATG	2	8	350246	350253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_013198	TAT	2	6	350440	350445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507340
6559	NC_013198	GAA	2	6	350546	350551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507340
6560	NC_013198	GA	3	6	350617	350622	50 %	0 %	50 %	0 %	258507340
6561	NC_013198	TTG	2	6	350724	350729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507340
6562	NC_013198	A	6	6	350741	350746	100 %	0 %	0 %	0 %	258507340
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6564	NC_013198	ATTTG	2	10	350916	350925	20 %	60 %	20 %	0 %	258507341
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6568	NC_013198	TTA	2	6	351147	351152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_013198	TGA	2	6	351196	351201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6571	NC_013198	A	6	6	351213	351218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_013198	T	7	7	351233	351239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_013198	CTG	2	6	351319	351324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507342
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6580	NC_013198	GATT	2	8	351695	351702	25 %	50 %	25 %	0 %	258507342
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6584	NC_013198	TGC	2	6	351794	351799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507342
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6589	NC_013198	GGCA	2	8	352004	352011	25 %	0 %	50 %	25 %	258507342
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6591	NC_013198	ATT	2	6	352088	352093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507342
6592	NC_013198	GAT	2	6	352137	352142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507342
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6594	NC_013198	G	6	6	352192	352197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_013198	GA	3	6	352207	352212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_013198	TTA	2	6	352235	352240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_013198	AGAA	2	8	352267	352274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_013198	ATT	2	6	352322	352327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_013198	GATT	2	8	352406	352413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_013198	ATT	2	6	352526	352531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507343
6601	NC_013198	TGAA	2	8	352535	352542	50 %	25 %	25 %	0 %	258507343
6602	NC_013198	TGA	2	6	352652	352657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507343
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6607	NC_013198	T	6	6	353006	353011	0 %	100 %	0 %	0 %	258507343
6608	NC_013198	TGAATG	2	12	353051	353062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507343
6609	NC_013198	GCT	2	6	353088	353093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507343
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6613	NC_013198	TTAA	2	8	353185	353192	50 %	50 %	0 %	0 %	258507343
6614	NC_013198	GTT	2	6	353227	353232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507343
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6617	NC_013198	TTC	2	6	353404	353409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507343
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6621	NC_013198	A	6	6	353563	353568	100 %	0 %	0 %	0 %	258507343
6622	NC_013198	A	6	6	353647	353652	100 %	0 %	0 %	0 %	258507343
6623	NC_013198	A	6	6	353709	353714	100 %	0 %	0 %	0 %	258507343
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6995	NC_013198	CGT	2	6	372455	372460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507358
6996	NC_013198	AGCA	2	8	372490	372497	50 %	0 %	25 %	25 %	258507358
6997	NC_013198	CGC	2	6	372574	372579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507359
6998	NC_013198	GCA	2	6	372758	372763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507359
6999	NC_013198	TGT	2	6	372772	372777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507359
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