MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013198	AACCGG	2	12	319567	319578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507312
6002	NC_013198	AGC	2	6	319673	319678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_013198	GCT	2	6	319686	319691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_013198	T	6	6	319696	319701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_013198	A	6	6	319704	319709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_013198	TAT	2	6	319710	319715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_013198	GGA	2	6	319798	319803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_013198	TGG	2	6	319839	319844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507313
6009	NC_013198	ATC	2	6	319959	319964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507313
6010	NC_013198	AGA	2	6	320011	320016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507313
6011	NC_013198	GATC	2	8	320065	320072	25 %	25 %	25 %	25 %	258507313
6012	NC_013198	TTG	2	6	320081	320086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507313
6013	NC_013198	AAGA	2	8	320120	320127	75 %	0 %	25 %	0 %	258507313
6014	NC_013198	ATT	2	6	320253	320258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507314
6015	NC_013198	TTG	2	6	320329	320334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507314
6016	NC_013198	CAT	2	6	320409	320414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507314
6017	NC_013198	GCCATC	2	12	320500	320511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258507314
6018	NC_013198	TTG	2	6	320561	320566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507314
6019	NC_013198	TTC	2	6	320617	320622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507314
6020	NC_013198	GCT	2	6	320769	320774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507314
6021	NC_013198	TTG	2	6	320813	320818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507314
6022	NC_013198	TAT	2	6	320829	320834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507314
6023	NC_013198	GTT	2	6	320942	320947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507314
6024	NC_013198	ATG	2	6	321155	321160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507314
6025	NC_013198	ACC	2	6	321161	321166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507315
6026	NC_013198	TAA	2	6	321257	321262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507315
6027	NC_013198	GGC	2	6	321339	321344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507315
6028	NC_013198	AAC	2	6	321483	321488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507315
6029	NC_013198	GATTG	2	10	321611	321620	20 %	40 %	40 %	0 %	258507315
6030	NC_013198	TAAA	2	8	321628	321635	75 %	25 %	0 %	0 %	258507315
6031	NC_013198	GTG	2	6	321675	321680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507315
6032	NC_013198	CAC	2	6	321729	321734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507315
6033	NC_013198	AGC	2	6	321791	321796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507315
6034	NC_013198	TAAT	2	8	321861	321868	50 %	50 %	0 %	0 %	258507315
6035	NC_013198	CA	3	6	321872	321877	50 %	0 %	0 %	50 %	258507315
6036	NC_013198	CAT	2	6	321896	321901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507315
6037	NC_013198	CCGC	2	8	321970	321977	0 %	0 %	25 %	75 %	258507315
6038	NC_013198	AAT	2	6	322013	322018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507315
6039	NC_013198	CTT	2	6	322142	322147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507315
6040	NC_013198	CAA	2	6	322171	322176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507315
6041	NC_013198	A	6	6	322175	322180	100 %	0 %	0 %	0 %	258507315
6042	NC_013198	ATTAA	2	10	322197	322206	60 %	40 %	0 %	0 %	258507315
6043	NC_013198	TTG	2	6	322266	322271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507315
6044	NC_013198	A	7	7	322289	322295	100 %	0 %	0 %	0 %	258507315
6045	NC_013198	A	6	6	322306	322311	100 %	0 %	0 %	0 %	258507315
6046	NC_013198	ACTCA	2	10	322313	322322	40 %	20 %	0 %	40 %	258507315
6047	NC_013198	ACG	2	6	322347	322352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507315
6048	NC_013198	TTG	2	6	322376	322381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507315
6049	NC_013198	TTG	2	6	322485	322490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_013198	ATT	2	6	322519	322524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_013198	AGT	2	6	322532	322537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_013198	GCG	2	6	322553	322558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_013198	TTG	2	6	322633	322638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_013198	CG	3	6	322752	322757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_013198	ATG	2	6	322766	322771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_013198	TTA	2	6	322819	322824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507316
6057	NC_013198	ACGCA	2	10	322832	322841	40 %	0 %	20 %	40 %	258507316
6058	NC_013198	GCA	2	6	322924	322929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507316
6059	NC_013198	ATG	2	6	323090	323095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507316
6060	NC_013198	CG	3	6	323104	323109	0 %	0 %	50 %	50 %	258507316
6061	NC_013198	GGC	2	6	323146	323151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507316
6062	NC_013198	TCA	2	6	323162	323167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507316
6063	NC_013198	TGA	3	9	323187	323195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507316
6064	NC_013198	GCC	2	6	323263	323268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507316
6065	NC_013198	GGT	2	6	323269	323274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507316
6066	NC_013198	ATG	2	6	323285	323290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507316
6067	NC_013198	GGT	2	6	323341	323346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507316
6068	NC_013198	ATT	2	6	323562	323567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507317
6069	NC_013198	ATGG	2	8	323714	323721	25 %	25 %	50 %	0 %	258507317
6070	NC_013198	ATG	2	6	323732	323737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507317
6071	NC_013198	GAA	2	6	323807	323812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507317
6072	NC_013198	CCGG	2	8	323817	323824	0 %	0 %	50 %	50 %	258507317
6073	NC_013198	AGC	2	6	323883	323888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507317
6074	NC_013198	GCA	2	6	324000	324005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507317
6075	NC_013198	GAT	2	6	324212	324217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507317
6076	NC_013198	GGATG	2	10	324241	324250	20 %	20 %	60 %	0 %	258507317
6077	NC_013198	GCC	2	6	324263	324268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507317
6078	NC_013198	CGATG	2	10	324316	324325	20 %	20 %	40 %	20 %	258507317
6079	NC_013198	ACC	2	6	324378	324383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507317
6080	NC_013198	TTG	2	6	324395	324400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507317
6081	NC_013198	GCG	2	6	324409	324414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507317
6082	NC_013198	CG	3	6	324480	324485	0 %	0 %	50 %	50 %	258507317
6083	NC_013198	CCA	2	6	324570	324575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507317
6084	NC_013198	GTAGTT	2	12	324656	324667	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_013198	CAAT	2	8	324669	324676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_013198	GAT	2	6	324680	324685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_013198	CTTG	2	8	324712	324719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6088	NC_013198	TCA	2	6	324760	324765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507318
6089	NC_013198	TGT	2	6	324806	324811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507318
6090	NC_013198	AT	3	6	324842	324847	50 %	50 %	0 %	0 %	258507318
6091	NC_013198	T	6	6	324857	324862	0 %	100 %	0 %	0 %	258507318
6092	NC_013198	GGGGAT	2	12	324950	324961	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	258507318
6093	NC_013198	TTCAAT	2	12	324965	324976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258507318
6094	NC_013198	ATC	2	6	325088	325093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507318
6095	NC_013198	GACA	2	8	325094	325101	50 %	0 %	25 %	25 %	258507318
6096	NC_013198	GCA	2	6	325102	325107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507318
6097	NC_013198	GCA	2	6	325176	325181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507318
6098	NC_013198	TCT	2	6	325322	325327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507318
6099	NC_013198	GAA	2	6	325392	325397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507318
6100	NC_013198	GAA	2	6	325556	325561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_013198	ATT	2	6	325640	325645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_013198	GGA	2	6	325658	325663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_013198	TACA	2	8	325665	325672	50 %	25 %	0 %	25 %	258507319
6104	NC_013198	TGC	2	6	325719	325724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6105	NC_013198	GGC	2	6	325731	325736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507319
6106	NC_013198	ACC	2	6	325801	325806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507319
6107	NC_013198	CAT	2	6	325820	325825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507319
6108	NC_013198	GCA	2	6	325993	325998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6109	NC_013198	CTG	2	6	326006	326011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6110	NC_013198	CAAGC	2	10	326042	326051	40 %	0 %	20 %	40 %	258507319
6111	NC_013198	GCA	2	6	326071	326076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6112	NC_013198	CAG	2	6	326132	326137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6113	NC_013198	CAG	2	6	326218	326223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6114	NC_013198	CGG	2	6	326259	326264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507319
6115	NC_013198	GCT	2	6	326386	326391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6116	NC_013198	TGC	2	6	326427	326432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6117	NC_013198	CAG	3	9	326441	326449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6118	NC_013198	GCA	2	6	326455	326460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6119	NC_013198	AGC	2	6	326490	326495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6120	NC_013198	GCT	2	6	326506	326511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507319
6121	NC_013198	GGC	2	6	326520	326525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507319
6122	NC_013198	GCA	2	6	326569	326574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507319
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6230	NC_013198	GT	4	8	331807	331814	0 %	50 %	50 %	0 %	258507323
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6233	NC_013198	CAAA	2	8	332155	332162	75 %	0 %	0 %	25 %	258507323
6234	NC_013198	CG	4	8	332163	332170	0 %	0 %	50 %	50 %	258507323
6235	NC_013198	CGGAAA	2	12	332228	332239	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258507323
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6241	NC_013198	GGT	2	6	332618	332623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507323
6242	NC_013198	CTT	2	6	332635	332640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507323
6243	NC_013198	GCT	2	6	332664	332669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507323
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6245	NC_013198	TG	3	6	332811	332816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6371	NC_013198	A	7	7	339391	339397	100 %	0 %	0 %	0 %	258507329
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6486	NC_013198	TCGAT	2	10	345975	345984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6487	NC_013198	GAA	2	6	345985	345990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6488	NC_013198	T	6	6	346074	346079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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