MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013198	GCC	2	6	293215	293220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507283
5502	NC_013198	T	6	6	293401	293406	0 %	100 %	0 %	0 %	258507284
5503	NC_013198	GGC	2	6	293441	293446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507284
5504	NC_013198	GCT	2	6	293577	293582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507284
5505	NC_013198	GCA	3	9	293592	293600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507284
5506	NC_013198	ATA	2	6	293699	293704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507284
5507	NC_013198	TGG	2	6	293740	293745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507284
5508	NC_013198	ATC	2	6	293876	293881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507284
5509	NC_013198	AAT	2	6	293896	293901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507284
5510	NC_013198	GTTG	2	8	293918	293925	0 %	50 %	50 %	0 %	258507284
5511	NC_013198	CAA	2	6	293941	293946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507284
5512	NC_013198	TCA	2	6	294039	294044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507284
5513	NC_013198	CAC	2	6	294091	294096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507284
5514	NC_013198	ACA	2	6	294132	294137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507284
5515	NC_013198	ATC	2	6	294182	294187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507284
5516	NC_013198	CGG	2	6	294248	294253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507284
5517	NC_013198	CAGT	2	8	294259	294266	25 %	25 %	25 %	25 %	258507284
5518	NC_013198	GT	3	6	294268	294273	0 %	50 %	50 %	0 %	258507284
5519	NC_013198	GGTG	2	8	294349	294356	0 %	25 %	75 %	0 %	258507284
5520	NC_013198	CGT	2	6	294374	294379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507284
5521	NC_013198	AC	3	6	294382	294387	50 %	0 %	0 %	50 %	258507284
5522	NC_013198	GCA	2	6	294417	294422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507284
5523	NC_013198	ATG	2	6	294437	294442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507284
5524	NC_013198	T	6	6	294501	294506	0 %	100 %	0 %	0 %	258507284
5525	NC_013198	CCT	2	6	294541	294546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507284
5526	NC_013198	CAA	2	6	294628	294633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507284
5527	NC_013198	GTT	2	6	294653	294658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507284
5528	NC_013198	ACTG	2	8	294862	294869	25 %	25 %	25 %	25 %	258507284
5529	NC_013198	ATC	2	6	295109	295114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507284
5530	NC_013198	T	6	6	295252	295257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_013198	CAA	2	6	295321	295326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507285
5532	NC_013198	GGT	2	6	295386	295391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507285
5533	NC_013198	A	7	7	295455	295461	100 %	0 %	0 %	0 %	258507285
5534	NC_013198	AAAGA	2	10	295624	295633	80 %	0 %	20 %	0 %	258507285
5535	NC_013198	AAC	2	6	295635	295640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507285
5536	NC_013198	TGG	2	6	295676	295681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507285
5537	NC_013198	ATCA	2	8	295691	295698	50 %	25 %	0 %	25 %	258507285
5538	NC_013198	CCTA	2	8	295699	295706	25 %	25 %	0 %	50 %	258507285
5539	NC_013198	ATT	2	6	295770	295775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507285
5540	NC_013198	TAT	2	6	295792	295797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507285
5541	NC_013198	GTGGA	2	10	295844	295853	20 %	20 %	60 %	0 %	258507285
5542	NC_013198	A	6	6	295906	295911	100 %	0 %	0 %	0 %	258507285
5543	NC_013198	TGA	2	6	295962	295967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507285
5544	NC_013198	CAG	2	6	296002	296007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507285
5545	NC_013198	TCA	2	6	296012	296017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507285
5546	NC_013198	TGA	2	6	296115	296120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507285
5547	NC_013198	ATG	2	6	296122	296127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507285
5548	NC_013198	TGA	2	6	296253	296258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507285
5549	NC_013198	AGA	2	6	296285	296290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507285
5550	NC_013198	AAT	2	6	296296	296301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507285
5551	NC_013198	CCA	2	6	296310	296315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507285
5552	NC_013198	AAT	2	6	296356	296361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507285
5553	NC_013198	T	6	6	296468	296473	0 %	100 %	0 %	0 %	258507286
5554	NC_013198	ATG	3	9	296487	296495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507286
5555	NC_013198	AGC	3	9	296563	296571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507286
5556	NC_013198	AAG	2	6	296582	296587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507287
5557	NC_013198	GGT	2	6	296641	296646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507287
5558	NC_013198	GAA	2	6	296668	296673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507287
5559	NC_013198	TCG	2	6	296691	296696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5560	NC_013198	TCG	2	6	296745	296750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5561	NC_013198	AAGC	2	8	296788	296795	50 %	0 %	25 %	25 %	258507287
5562	NC_013198	AGC	2	6	296828	296833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5563	NC_013198	GAA	2	6	296913	296918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507287
5564	NC_013198	GACCA	2	10	296974	296983	40 %	0 %	20 %	40 %	258507287
5565	NC_013198	GGT	2	6	296989	296994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507287
5566	NC_013198	AAGC	2	8	296996	297003	50 %	0 %	25 %	25 %	258507287
5567	NC_013198	CAG	2	6	297004	297009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5568	NC_013198	GCC	2	6	297079	297084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507287
5569	NC_013198	CAG	2	6	297133	297138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5570	NC_013198	ATG	2	6	297211	297216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507287
5571	NC_013198	ATG	2	6	297242	297247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507287
5572	NC_013198	TTAA	2	8	297371	297378	50 %	50 %	0 %	0 %	258507287
5573	NC_013198	AGA	2	6	297387	297392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507287
5574	NC_013198	AAT	2	6	297394	297399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507287
5575	NC_013198	CAA	2	6	297412	297417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507287
5576	NC_013198	CAG	2	6	297427	297432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507287
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5578	NC_013198	CAA	2	6	297511	297516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507287
5579	NC_013198	TGC	3	9	297524	297532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5580	NC_013198	GTAA	2	8	297565	297572	50 %	25 %	25 %	0 %	258507287
5581	NC_013198	GAA	2	6	297631	297636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507287
5582	NC_013198	CTG	2	6	297654	297659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5583	NC_013198	CGAG	2	8	297662	297669	25 %	0 %	50 %	25 %	258507287
5584	NC_013198	TAC	2	6	297678	297683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507287
5585	NC_013198	ATG	2	6	297707	297712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507287
5586	NC_013198	AGC	2	6	297716	297721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507287
5587	NC_013198	AGCTT	2	10	297875	297884	20 %	40 %	20 %	20 %	258507287
5588	NC_013198	T	6	6	297952	297957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_013198	ACC	2	6	298011	298016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_013198	CGC	2	6	298050	298055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_013198	ACT	2	6	298140	298145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_013198	CCA	2	6	298173	298178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_013198	CTGACA	2	12	298190	298201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_013198	GAA	2	6	298261	298266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_013198	T	6	6	298286	298291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_013198	AGTT	2	8	298301	298308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_013198	TGA	2	6	298309	298314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_013198	TGC	2	6	298374	298379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_013198	ATCA	2	8	298416	298423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_013198	A	6	6	298462	298467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_013198	A	6	6	298491	298496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_013198	CA	3	6	298508	298513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_013198	TAA	2	6	298540	298545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_013198	CAA	2	6	298552	298557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507288
5605	NC_013198	GA	3	6	298728	298733	50 %	0 %	50 %	0 %	258507288
5606	NC_013198	CTTAA	2	10	298791	298800	40 %	40 %	0 %	20 %	258507288
5607	NC_013198	GCC	2	6	298863	298868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507288
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5610	NC_013198	CTG	2	6	298927	298932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507288
5611	NC_013198	AGC	2	6	298985	298990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507288
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5614	NC_013198	ATT	2	6	299174	299179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507288
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5616	NC_013198	ATTTG	2	10	299269	299278	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_013198	GTC	2	6	299317	299322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_013198	TA	3	6	299352	299357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_013198	GT	3	6	299364	299369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_013198	CAT	2	6	299384	299389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_013198	GAA	2	6	299631	299636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_013198	GGT	2	6	299639	299644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_013198	GATG	2	8	299676	299683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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