MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

< Previous12...101102103104105106107108109110111112113Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_013198	ATTG	2	8	3005008	3005015	25 %	50 %	25 %	0 %	258509935
56002	NC_013198	CG	4	8	3005098	3005105	0 %	0 %	50 %	50 %	258509935
56003	NC_013198	GTTC	2	8	3005106	3005113	0 %	50 %	25 %	25 %	258509935
56004	NC_013198	GGC	2	6	3005137	3005142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509935
56005	NC_013198	ATG	2	6	3005169	3005174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509935
56006	NC_013198	GCT	2	6	3005315	3005320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509935
56007	NC_013198	GTG	2	6	3005409	3005414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509935
56008	NC_013198	GGT	2	6	3005538	3005543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509935
56009	NC_013198	GTT	2	6	3005650	3005655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509935
56010	NC_013198	TCC	2	6	3005714	3005719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56011	NC_013198	GTT	2	6	3005721	3005726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509936
56012	NC_013198	T	6	6	3005746	3005751	0 %	100 %	0 %	0 %	258509936
56013	NC_013198	TTCACG	2	12	3005803	3005814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258509936
56014	NC_013198	CAA	2	6	3005839	3005844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509936
56015	NC_013198	AAC	2	6	3005872	3005877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509936
56016	NC_013198	ATC	3	9	3005942	3005950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509936
56017	NC_013198	GCT	2	6	3005956	3005961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509936
56018	NC_013198	CAT	2	6	3005983	3005988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509936
56019	NC_013198	GAA	2	6	3006095	3006100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509936
56020	NC_013198	TCG	2	6	3006209	3006214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509936
56021	NC_013198	GTTTG	2	10	3006219	3006228	0 %	60 %	40 %	0 %	258509936
56022	NC_013198	T	6	6	3006253	3006258	0 %	100 %	0 %	0 %	258509936
56023	NC_013198	CTG	2	6	3006289	3006294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509936
56024	NC_013198	AAAATC	2	12	3006332	3006343	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	258509936
56025	NC_013198	GAT	2	6	3006364	3006369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509936
56026	NC_013198	CAAA	2	8	3006390	3006397	75 %	0 %	0 %	25 %	258509936
56027	NC_013198	GCCA	2	8	3006401	3006408	25 %	0 %	25 %	50 %	258509936
56028	NC_013198	AGA	2	6	3006497	3006502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509936
56029	NC_013198	CT	3	6	3006571	3006576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56030	NC_013198	TTC	2	6	3006649	3006654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509937
56031	NC_013198	CG	3	6	3006691	3006696	0 %	0 %	50 %	50 %	258509937
56032	NC_013198	A	6	6	3006703	3006708	100 %	0 %	0 %	0 %	258509937
56033	NC_013198	T	6	6	3006801	3006806	0 %	100 %	0 %	0 %	258509937
56034	NC_013198	CTT	2	6	3006917	3006922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509937
56035	NC_013198	T	6	6	3006921	3006926	0 %	100 %	0 %	0 %	258509937
56036	NC_013198	ATG	2	6	3006947	3006952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509937
56037	NC_013198	AACGAC	2	12	3007067	3007078	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56038	NC_013198	CAA	2	6	3007079	3007084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56039	NC_013198	TCAT	2	8	3007146	3007153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56040	NC_013198	A	6	6	3007155	3007160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56041	NC_013198	GATT	2	8	3007242	3007249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56042	NC_013198	AGA	2	6	3007252	3007257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56043	NC_013198	GC	3	6	3007259	3007264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56044	NC_013198	GCTCT	2	10	3007504	3007513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56045	NC_013198	A	8	8	3007514	3007521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56046	NC_013198	ATA	2	6	3007550	3007555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509938
56047	NC_013198	TTGG	2	8	3007655	3007662	0 %	50 %	50 %	0 %	258509938
56048	NC_013198	GAC	2	6	3007684	3007689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56049	NC_013198	CCT	2	6	3007691	3007696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56050	NC_013198	TTA	2	6	3007715	3007720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56051	NC_013198	CAT	2	6	3007741	3007746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56052	NC_013198	AAGC	2	8	3007763	3007770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56053	NC_013198	TAAG	2	8	3007830	3007837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56054	NC_013198	AGA	2	6	3007874	3007879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56055	NC_013198	AGG	2	6	3007888	3007893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56056	NC_013198	GAA	2	6	3007902	3007907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56057	NC_013198	GA	3	6	3007923	3007928	50 %	0 %	50 %	0 %	258509939
56058	NC_013198	AGA	3	9	3007926	3007934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509939
56059	NC_013198	GCA	2	6	3007987	3007992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509939
56060	NC_013198	CAA	2	6	3008097	3008102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509939
56061	NC_013198	TCAT	2	8	3008129	3008136	25 %	50 %	0 %	25 %	258509939
56062	NC_013198	AAAT	2	8	3008145	3008152	75 %	25 %	0 %	0 %	258509939
56063	NC_013198	ACC	2	6	3008191	3008196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509939
56064	NC_013198	A	7	7	3008244	3008250	100 %	0 %	0 %	0 %	258509939
56065	NC_013198	TTCT	2	8	3008255	3008262	0 %	75 %	0 %	25 %	258509939
56066	NC_013198	CCA	2	6	3008279	3008284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509939
56067	NC_013198	CGT	2	6	3008287	3008292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509939
56068	NC_013198	CCCA	2	8	3008393	3008400	25 %	0 %	0 %	75 %	258509939
56069	NC_013198	CGC	2	6	3008490	3008495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509939
56070	NC_013198	TGA	2	6	3008499	3008504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509939
56071	NC_013198	TGT	2	6	3008517	3008522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509939
56072	NC_013198	CGG	2	6	3008523	3008528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509939
56073	NC_013198	CAA	2	6	3008539	3008544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509939
56074	NC_013198	A	6	6	3008647	3008652	100 %	0 %	0 %	0 %	258509939
56075	NC_013198	TGCC	2	8	3008697	3008704	0 %	25 %	25 %	50 %	258509939
56076	NC_013198	TTA	2	6	3008858	3008863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509939
56077	NC_013198	CAA	2	6	3008871	3008876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509939
56078	NC_013198	ATT	2	6	3008956	3008961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509939
56079	NC_013198	GCA	2	6	3008972	3008977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509939
56080	NC_013198	CA	3	6	3009056	3009061	50 %	0 %	0 %	50 %	258509939
56081	NC_013198	TCA	2	6	3009074	3009079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509939
56082	NC_013198	GAC	2	6	3009105	3009110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509939
56083	NC_013198	GAC	2	6	3009112	3009117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509939
56084	NC_013198	A	6	6	3009205	3009210	100 %	0 %	0 %	0 %	258509939
56085	NC_013198	CAAAT	2	10	3009295	3009304	60 %	20 %	0 %	20 %	258509939
56086	NC_013198	GCA	2	6	3009484	3009489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56087	NC_013198	TG	3	6	3009509	3009514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56088	NC_013198	ATC	2	6	3009704	3009709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56089	NC_013198	T	6	6	3009754	3009759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56090	NC_013198	ATG	2	6	3009878	3009883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56091	NC_013198	GCG	2	6	3009901	3009906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56092	NC_013198	TTA	2	6	3010062	3010067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56093	NC_013198	GAG	2	6	3010068	3010073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...101102103104105106107108109110111112113Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.