MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_013198	CA	3	6	2978353	2978358	50 %	0 %	0 %	50 %	258509914
55502	NC_013198	CGT	2	6	2978392	2978397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509914
55503	NC_013198	GCCG	2	8	2978411	2978418	0 %	0 %	50 %	50 %	258509914
55504	NC_013198	TA	3	6	2978421	2978426	50 %	50 %	0 %	0 %	258509914
55505	NC_013198	ATCA	2	8	2978433	2978440	50 %	25 %	0 %	25 %	258509914
55506	NC_013198	ATG	2	6	2978514	2978519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509914
55507	NC_013198	AAAC	2	8	2978567	2978574	75 %	0 %	0 %	25 %	258509914
55508	NC_013198	GATT	2	8	2978581	2978588	25 %	50 %	25 %	0 %	258509914
55509	NC_013198	TTA	2	6	2978589	2978594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509914
55510	NC_013198	CAT	2	6	2978689	2978694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509914
55511	NC_013198	GGC	2	6	2978705	2978710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509914
55512	NC_013198	GTC	2	6	2978756	2978761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509914
55513	NC_013198	A	6	6	2978798	2978803	100 %	0 %	0 %	0 %	258509914
55514	NC_013198	ACA	2	6	2978805	2978810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509914
55515	NC_013198	GCG	2	6	2978838	2978843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509914
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55517	NC_013198	ATCA	2	8	2978869	2978876	50 %	25 %	0 %	25 %	258509914
55518	NC_013198	GAT	2	6	2978900	2978905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509914
55519	NC_013198	TCCGGA	2	12	2979018	2979029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509915
55520	NC_013198	GAC	2	6	2979032	2979037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509915
55521	NC_013198	CAT	2	6	2979047	2979052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509915
55522	NC_013198	AT	3	6	2979196	2979201	50 %	50 %	0 %	0 %	258509915
55523	NC_013198	TGG	2	6	2979230	2979235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509915
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55531	NC_013198	ATG	2	6	2979496	2979501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509915
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55541	NC_013198	CCCA	2	8	2980140	2980147	25 %	0 %	0 %	75 %	258509916
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55545	NC_013198	TTGT	2	8	2980396	2980403	0 %	75 %	25 %	0 %	258509916
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55550	NC_013198	TGAT	2	8	2980748	2980755	25 %	50 %	25 %	0 %	258509916
55551	NC_013198	CGG	2	6	2980876	2980881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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55553	NC_013198	CA	3	6	2981030	2981035	50 %	0 %	0 %	50 %	258509917
55554	NC_013198	ATG	2	6	2981043	2981048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509917
55555	NC_013198	ACT	2	6	2981130	2981135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509917
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55569	NC_013198	GCCA	2	8	2982000	2982007	25 %	0 %	25 %	50 %	258509917
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55587	NC_013198	GCG	2	6	2983058	2983063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509918
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55599	NC_013198	ACTTA	2	10	2983740	2983749	40 %	40 %	0 %	20 %	258509918
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55602	NC_013198	AGTT	2	8	2983974	2983981	25 %	50 %	25 %	0 %	258509918
55603	NC_013198	CAT	2	6	2984060	2984065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509918
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55610	NC_013198	TGG	2	6	2984495	2984500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509918
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55612	NC_013198	TAGCT	2	10	2984583	2984592	20 %	40 %	20 %	20 %	258509918
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55617	NC_013198	TGGC	2	8	2984789	2984796	0 %	25 %	50 %	25 %	258509918
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55730	NC_013198	TAA	2	6	2991593	2991598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509920
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55971	NC_013198	AGA	2	6	3003443	3003448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509933
55972	NC_013198	TGA	2	6	3003506	3003511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509933
55973	NC_013198	GCA	2	6	3003533	3003538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509933
55974	NC_013198	CGC	2	6	3003540	3003545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509933
55975	NC_013198	TGTT	2	8	3003571	3003578	0 %	75 %	25 %	0 %	258509933
55976	NC_013198	GAT	2	6	3003585	3003590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509933
55977	NC_013198	AGC	2	6	3003616	3003621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509933
55978	NC_013198	CTGC	2	8	3003677	3003684	0 %	25 %	25 %	50 %	258509933
55979	NC_013198	TGCC	2	8	3003690	3003697	0 %	25 %	25 %	50 %	258509933
55980	NC_013198	T	6	6	3003716	3003721	0 %	100 %	0 %	0 %	258509933
55981	NC_013198	GGT	2	6	3003732	3003737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509933
55982	NC_013198	CAA	2	6	3003758	3003763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509933
55983	NC_013198	TTC	2	6	3003795	3003800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509933
55984	NC_013198	CG	3	6	3003809	3003814	0 %	0 %	50 %	50 %	258509933
55985	NC_013198	CGTC	2	8	3003827	3003834	0 %	25 %	25 %	50 %	258509933
55986	NC_013198	GGCC	2	8	3003892	3003899	0 %	0 %	50 %	50 %	258509933
55987	NC_013198	GCT	2	6	3003959	3003964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509933
55988	NC_013198	GTCAA	2	10	3004195	3004204	40 %	20 %	20 %	20 %	258509933
55989	NC_013198	GC	3	6	3004222	3004227	0 %	0 %	50 %	50 %	258509933
55990	NC_013198	AAT	2	6	3004273	3004278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509933
55991	NC_013198	AATT	2	8	3004316	3004323	50 %	50 %	0 %	0 %	258509933
55992	NC_013198	TCA	2	6	3004381	3004386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509933
55993	NC_013198	AATG	2	8	3004424	3004431	50 %	25 %	25 %	0 %	258509933
55994	NC_013198	TGA	2	6	3004606	3004611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55995	NC_013198	GTTG	2	8	3004627	3004634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55996	NC_013198	A	7	7	3004816	3004822	100 %	0 %	0 %	0 %	258509934
55997	NC_013198	ACT	2	6	3004876	3004881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509934
55998	NC_013198	ATC	2	6	3004901	3004906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509934
55999	NC_013198	AGTT	2	8	3004934	3004941	25 %	50 %	25 %	0 %	258509935
56000	NC_013198	GAC	3	9	3004958	3004966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509935

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