MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013198	CAA	2	6	238168	238173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507226
4502	NC_013198	AGA	2	6	238264	238269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507226
4503	NC_013198	AT	4	8	238341	238348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013198	CAT	2	6	238371	238376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013198	AAG	2	6	238406	238411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507227
4506	NC_013198	T	6	6	238415	238420	0 %	100 %	0 %	0 %	258507227
4507	NC_013198	GTG	2	6	238481	238486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507227
4508	NC_013198	CCA	2	6	238548	238553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507227
4509	NC_013198	GTTG	2	8	238580	238587	0 %	50 %	50 %	0 %	258507227
4510	NC_013198	A	6	6	238608	238613	100 %	0 %	0 %	0 %	258507227
4511	NC_013198	GTG	2	6	238689	238694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507227
4512	NC_013198	ATG	3	9	238723	238731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507227
4513	NC_013198	TGC	2	6	238756	238761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507227
4514	NC_013198	AAAT	2	8	238809	238816	75 %	25 %	0 %	0 %	258507227
4515	NC_013198	AAT	2	6	238823	238828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507227
4516	NC_013198	GGT	2	6	238890	238895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507227
4517	NC_013198	GGT	2	6	238905	238910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507227
4518	NC_013198	TCC	2	6	238930	238935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507227
4519	NC_013198	AT	3	6	239129	239134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013198	CAT	2	6	239273	239278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507228
4521	NC_013198	TCA	2	6	239305	239310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507228
4522	NC_013198	TTG	3	9	239311	239319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507228
4523	NC_013198	ACC	2	6	239340	239345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507228
4524	NC_013198	GTT	2	6	239349	239354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507228
4525	NC_013198	AGC	2	6	239360	239365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507228
4526	NC_013198	GAC	2	6	239411	239416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507228
4527	NC_013198	GTT	2	6	239453	239458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507228
4528	NC_013198	AAG	2	6	239506	239511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507228
4529	NC_013198	GAA	2	6	239537	239542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507228
4530	NC_013198	GGC	2	6	239592	239597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507228
4531	NC_013198	CCG	2	6	239662	239667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507228
4532	NC_013198	GCC	2	6	239727	239732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507228
4533	NC_013198	T	6	6	239751	239756	0 %	100 %	0 %	0 %	258507228
4534	NC_013198	TTGT	2	8	239766	239773	0 %	75 %	25 %	0 %	258507228
4535	NC_013198	GGT	2	6	239843	239848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507228
4536	NC_013198	GAA	2	6	239925	239930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507228
4537	NC_013198	CGC	2	6	239932	239937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507228
4538	NC_013198	AGG	2	6	239942	239947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507228
4539	NC_013198	ATC	2	6	240077	240082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507229
4540	NC_013198	TTA	2	6	240144	240149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507229
4541	NC_013198	GGC	2	6	240239	240244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507229
4542	NC_013198	GCG	2	6	240338	240343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507229
4543	NC_013198	ATTG	2	8	240349	240356	25 %	50 %	25 %	0 %	258507229
4544	NC_013198	ATC	2	6	240362	240367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507229
4545	NC_013198	GGCA	2	8	240532	240539	25 %	0 %	50 %	25 %	258507229
4546	NC_013198	TG	3	6	240566	240571	0 %	50 %	50 %	0 %	258507229
4547	NC_013198	ATT	2	6	240580	240585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507229
4548	NC_013198	ATC	2	6	240590	240595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507229
4549	NC_013198	TGC	2	6	240610	240615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507229
4550	NC_013198	CGG	2	6	240630	240635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507229
4551	NC_013198	A	6	6	240724	240729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013198	ACTT	2	8	240935	240942	25 %	50 %	0 %	25 %	258507230
4553	NC_013198	A	7	7	241000	241006	100 %	0 %	0 %	0 %	258507230
4554	NC_013198	CGT	2	6	241049	241054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507230
4555	NC_013198	ATG	2	6	241112	241117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507231
4556	NC_013198	TGG	2	6	241284	241289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507231
4557	NC_013198	CAAA	2	8	241353	241360	75 %	0 %	0 %	25 %	258507231
4558	NC_013198	GAA	2	6	241368	241373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507231
4559	NC_013198	TGCT	2	8	241511	241518	0 %	50 %	25 %	25 %	258507231
4560	NC_013198	GTTGC	2	10	241636	241645	0 %	40 %	40 %	20 %	258507232
4561	NC_013198	AGC	2	6	241676	241681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507232
4562	NC_013198	TGA	2	6	241797	241802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507233
4563	NC_013198	CGG	2	6	241851	241856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507233
4564	NC_013198	GTG	2	6	241909	241914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507233
4565	NC_013198	ATG	2	6	241916	241921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507233
4566	NC_013198	CGG	2	6	242150	242155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507233
4567	NC_013198	GTT	2	6	242278	242283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507233
4568	NC_013198	GCC	2	6	242347	242352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507233
4569	NC_013198	TCG	2	6	242354	242359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507233
4570	NC_013198	ATG	2	6	242363	242368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507233
4571	NC_013198	T	6	6	242458	242463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_013198	ATA	2	6	242500	242505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_013198	ACA	2	6	242559	242564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507234
4574	NC_013198	ATT	2	6	242576	242581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507234
4575	NC_013198	CG	3	6	242600	242605	0 %	0 %	50 %	50 %	258507234
4576	NC_013198	GGC	2	6	242728	242733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507234
4577	NC_013198	GTG	2	6	242810	242815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507234
4578	NC_013198	ATT	2	6	242829	242834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507234
4579	NC_013198	GTC	2	6	242924	242929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507234
4580	NC_013198	GAT	2	6	243020	243025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507234
4581	NC_013198	AAAC	2	8	243035	243042	75 %	0 %	0 %	25 %	258507234
4582	NC_013198	ATTG	2	8	243052	243059	25 %	50 %	25 %	0 %	258507234
4583	NC_013198	TGT	2	6	243076	243081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507234
4584	NC_013198	GCA	2	6	243187	243192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_013198	CA	3	6	243208	243213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_013198	A	6	6	243218	243223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_013198	TGA	2	6	243225	243230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013198	TCA	2	6	243252	243257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_013198	A	7	7	243314	243320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013198	GTTT	2	8	243336	243343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_013198	TTG	2	6	243349	243354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_013198	CGCT	2	8	243383	243390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_013198	TC	3	6	243436	243441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_013198	TTTG	2	8	243455	243462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_013198	ATC	2	6	243681	243686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507235
4596	NC_013198	GTC	2	6	243713	243718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507235
4597	NC_013198	AGT	2	6	243885	243890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507235
4598	NC_013198	GCC	2	6	243896	243901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507235
4599	NC_013198	CCG	2	6	244002	244007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507235
4600	NC_013198	GTC	2	6	244043	244048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507235
4601	NC_013198	TTG	2	6	244085	244090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507235
4602	NC_013198	T	7	7	244203	244209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013198	TGAT	2	8	244256	244263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013198	AAG	2	6	244280	244285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_013198	AAC	2	6	244306	244311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_013198	AGT	2	6	244437	244442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507236
4607	NC_013198	TTG	2	6	244490	244495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507236
4608	NC_013198	ATG	2	6	244502	244507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507236
4609	NC_013198	GCT	2	6	244565	244570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507236
4610	NC_013198	ACA	2	6	244602	244607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507236
4611	NC_013198	TGG	2	6	244619	244624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507236
4612	NC_013198	T	6	6	244643	244648	0 %	100 %	0 %	0 %	258507236
4613	NC_013198	CTG	2	6	244672	244677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507236
4614	NC_013198	T	7	7	244746	244752	0 %	100 %	0 %	0 %	258507236
4615	NC_013198	TTA	2	6	244776	244781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013198	TG	3	6	244788	244793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_013198	G	6	6	244793	244798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013198	GTG	2	6	245030	245035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_013198	CAC	2	6	245122	245127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_013198	TCCA	2	8	245160	245167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_013198	CTT	2	6	245221	245226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_013198	TGTT	2	8	245336	245343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_013198	A	7	7	245360	245366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_013198	ACC	2	6	245433	245438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507237
4625	NC_013198	CTG	2	6	245511	245516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507237
4626	NC_013198	TGG	2	6	245565	245570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507237
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4713	NC_013198	TCAT	2	8	249754	249761	25 %	50 %	0 %	25 %	258507242
4714	NC_013198	AAG	2	6	249844	249849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507242
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4734	NC_013198	GGC	2	6	250596	250601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507243
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4741	NC_013198	AGA	2	6	250834	250839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_013198	TCT	2	6	250853	250858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4743	NC_013198	T	6	6	250867	250872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4744	NC_013198	TGC	2	6	250876	250881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4745	NC_013198	AAT	2	6	250937	250942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4747	NC_013198	A	7	7	251081	251087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4748	NC_013198	GTA	2	6	251120	251125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4755	NC_013198	TGA	2	6	251416	251421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507244
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4869	NC_013198	CAT	2	6	258022	258027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507251
4870	NC_013198	AGTC	2	8	258110	258117	25 %	25 %	25 %	25 %	258507251
4871	NC_013198	AGC	2	6	258119	258124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507251
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4874	NC_013198	TCA	2	6	258233	258238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4878	NC_013198	GAT	2	6	258648	258653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507252
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4991	NC_013198	TTC	2	6	264317	264322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507256
4992	NC_013198	ATT	2	6	264383	264388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507256
4993	NC_013198	CAG	2	6	264423	264428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507256
4994	NC_013198	GGA	2	6	264439	264444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507256
4995	NC_013198	ACA	2	6	264456	264461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507256
4996	NC_013198	TAA	2	6	264496	264501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507256
4997	NC_013198	ATTT	2	8	264522	264529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_013198	GT	3	6	264573	264578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_013198	TCA	2	6	264632	264637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5000	NC_013198	GGC	2	6	264746	264751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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