MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 1593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013192	AAGTAA	2	12	2853	2864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124816
2	NC_013192	GAAGTT	2	12	4747	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124818
3	NC_013192	ATATAA	2	12	7892	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013192	AAAAAG	2	12	9879	9890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124822
5	NC_013192	ACAATT	2	12	10852	10863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257124823
6	NC_013192	ATTTGC	2	12	12763	12774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124824
7	NC_013192	ATTTTT	2	12	13072	13083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124824
8	NC_013192	TAGGAA	2	12	14245	14256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124825
9	NC_013192	TTGCGA	2	12	14735	14746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257124826
10	NC_013192	TGGAAA	2	12	16483	16494	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124828
11	NC_013192	TTGCTG	2	12	18504	18515	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	257124829
12	NC_013192	TGAAGA	2	12	19327	19338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124830
13	NC_013192	GGAAAA	2	12	19666	19677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124830
14	NC_013192	TGAAAA	2	12	19846	19857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124830
15	NC_013192	AGATTT	2	12	20309	20320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013192	GCACTT	2	12	21268	21279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257124831
17	NC_013192	ATTTTC	2	12	23670	23681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257124833
18	NC_013192	ATCAGA	2	12	23874	23885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257124833
19	NC_013192	AAACTT	2	12	25682	25693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013192	CGATAG	2	12	27524	27535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124837
21	NC_013192	TGACTT	2	12	28147	28158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124838
22	NC_013192	TAAAAA	2	12	28741	28752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013192	ATCAGG	2	12	31275	31286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124841
24	NC_013192	TTTTCC	2	12	32344	32355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124842
25	NC_013192	TTTAAT	2	12	33695	33706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124843
26	NC_013192	TTGTCA	2	12	34955	34966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124844
27	NC_013192	TCAAAA	2	12	36120	36131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257124846
28	NC_013192	CTTTCA	2	12	38081	38092	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013192	TTTTAT	2	12	39614	39625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013192	AAAAAC	2	12	41726	41737	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	257124848
31	NC_013192	TTCAAT	2	12	47464	47475	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124852
32	NC_013192	TCTTTT	2	12	50874	50885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013192	TCCTAC	2	12	50932	50943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257124855
34	NC_013192	ATCATT	2	12	51193	51204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124855
35	NC_013192	TATTTT	2	12	52914	52925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124856
36	NC_013192	ATTGAT	2	12	54660	54671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124859
37	NC_013192	TCAAAA	2	12	58137	58148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013192	AATTGA	2	12	58953	58964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124863
39	NC_013192	GTAAAA	2	12	62968	62979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124866
40	NC_013192	GTTTGT	2	12	67333	67344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013192	TATTTT	2	12	68273	68284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124872
42	NC_013192	TAATTA	2	12	68751	68762	50 %	50 %	0 %	0 %	257124872
43	NC_013192	CATTTC	2	12	72746	72757	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124876
44	NC_013192	ATTCCA	2	12	74317	74328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124877
45	NC_013192	TTTCCA	2	12	77217	77228	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124879
46	NC_013192	ATTTTA	2	12	86772	86783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124894
47	NC_013192	CTTGCA	2	12	90500	90511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257124899
48	NC_013192	CATTTT	2	12	93216	93227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257124903
49	NC_013192	GAAAAA	2	12	93641	93652	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124903
50	NC_013192	TAGGAG	3	18	97818	97835	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257124907
51	NC_013192	ACTTAT	2	12	98114	98125	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124907
52	NC_013192	AGATAA	2	12	99726	99737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124909
53	NC_013192	GTAAAA	2	12	99835	99846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124909
54	NC_013192	TAAAAA	2	12	102933	102944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124914
55	NC_013192	CAATTG	2	12	103518	103529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257124915
56	NC_013192	ATTGAA	2	12	104767	104778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124917
57	NC_013192	TTTTAA	2	12	105685	105696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013192	AAATTA	2	12	107189	107200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013192	TAATGG	2	12	109876	109887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124923
60	NC_013192	AAGTGC	2	12	110056	110067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124923
61	NC_013192	AAGAAT	2	12	110361	110372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124923
62	NC_013192	ATCTGA	2	12	111522	111533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013192	AAAATG	2	12	111560	111571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124925
64	NC_013192	GTGTCA	2	12	117907	117918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013192	TAAGCA	2	12	119047	119058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013192	TTTTAA	2	12	120899	120910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013192	ATTTAG	2	12	121123	121134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124929
68	NC_013192	ATATTT	2	12	125126	125137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013192	TATTCC	2	12	128129	128140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124934
70	NC_013192	AAATAT	2	12	128557	128568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124935
71	NC_013192	ATTTTA	2	12	131080	131091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013192	TACAAA	2	12	135078	135089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257124939
73	NC_013192	ATAATT	2	12	136794	136805	50 %	50 %	0 %	0 %	257124941
74	NC_013192	TTTTCT	2	12	138542	138553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013192	TTCATC	2	12	139014	139025	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124943
76	NC_013192	CATTTT	2	12	139142	139153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257124943
77	NC_013192	TTCCTT	2	12	141799	141810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124945
78	NC_013192	GTCTTT	2	12	142359	142370	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	257124946
79	NC_013192	TTTCAA	2	12	143361	143372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013192	AGCACA	2	12	143796	143807	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257124948
81	NC_013192	GAACCA	2	12	143901	143912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257124948
82	NC_013192	TCAAAA	2	12	145442	145453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013192	AATAAA	2	12	147609	147620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013192	ATAAGT	2	12	149901	149912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124952
85	NC_013192	ATTTTG	2	12	151623	151634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257124953
86	NC_013192	AAAGTA	2	12	152934	152945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124954
87	NC_013192	TTAGAA	2	12	153392	153403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124954
88	NC_013192	TGATAT	2	12	153802	153813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124954
89	NC_013192	AAAATA	2	12	154383	154394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124955
90	NC_013192	AAAATA	2	12	155909	155920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013192	TCTTAG	2	12	156374	156385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124958
92	NC_013192	ATATTG	2	12	156954	156965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124959
93	NC_013192	AACTGG	2	12	157078	157089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124959
94	NC_013192	AGAAAT	2	12	159148	159159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124959
95	NC_013192	GAAAAA	2	12	159266	159277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124959
96	NC_013192	CAATTT	2	12	164118	164129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124964
97	NC_013192	ATACAA	2	12	165635	165646	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013192	AAATAC	2	12	166167	166178	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257124967
99	NC_013192	TAATTG	2	12	168765	168776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124969
100	NC_013192	ATTTAT	2	12	169685	169696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013192	GTAAAA	2	12	169839	169850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013192	AAAAAT	2	12	170995	171006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124971
103	NC_013192	ATGAAA	2	12	172313	172324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124972
104	NC_013192	CAAAAA	2	12	173854	173865	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	257124974
105	NC_013192	CATCAC	2	12	174472	174483	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257124975
106	NC_013192	ATTTTT	2	12	176205	176216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124977
107	NC_013192	TAAAAA	2	12	177136	177147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124979
108	NC_013192	TCATTA	2	12	177277	177288	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124979
109	NC_013192	GTGTCA	2	12	180046	180057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013192	TAAGCA	2	12	181186	181197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013192	ATATTT	2	12	186984	186995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124983
112	NC_013192	AGATGA	2	12	191363	191374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124987
113	NC_013192	CAGATG	2	12	191626	191637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124987
114	NC_013192	ATGGAA	2	12	191824	191835	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124987
115	NC_013192	AATTTT	2	12	194597	194608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124991
116	NC_013192	TGTTTT	2	12	200489	200500	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	257124995
117	NC_013192	TTTGTT	2	12	201841	201852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	257124997
118	NC_013192	TCATTA	2	12	202601	202612	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013192	TGTTCC	2	12	204345	204356	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013192	ATTTAA	2	12	205405	205416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013192	GAAAGA	2	12	205659	205670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013192	GAAAAA	2	12	208394	208405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124999
123	NC_013192	AAAATG	2	12	212062	212073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013192	GGAAGT	2	12	215005	215016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257125004
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127	NC_013192	TAAAAT	2	12	217488	217499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_013192	TTTCCT	2	12	398397	398408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257125178
242	NC_013192	TAGAAA	2	12	398818	398829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_013192	TAAAAG	2	12	403553	403564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
244	NC_013192	GTTTAT	2	12	405998	406009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257125184
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270	NC_013192	CAAATC	2	12	438459	438470	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257125215
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352	NC_013192	GTAAAG	2	12	582504	582515	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257125329
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356	NC_013192	GAAAAG	2	12	591271	591282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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358	NC_013192	CATTTA	2	12	592482	592493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257125335
359	NC_013192	TTTTAT	2	12	599479	599490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257125338
360	NC_013192	ATTCTA	2	12	600812	600823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257125340
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475	NC_013192	TTTCCA	2	12	787902	787913	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257125503
476	NC_013192	GGAATG	2	12	789850	789861	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257125504
477	NC_013192	ATTCAA	2	12	790065	790076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257125504
478	NC_013192	AATTCA	2	12	790643	790654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257125505
479	NC_013192	ATTGCA	2	12	792623	792634	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257125507
480	NC_013192	TGGGAA	2	12	792960	792971	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257125507
481	NC_013192	CTTTTC	2	12	793739	793750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257125508
482	NC_013192	GATTTT	2	12	794294	794305	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257125508
483	NC_013192	TTTCAA	2	12	794591	794602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257125508
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