MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 33673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013192	TAT	2	6	33	38	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013192	TAG	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013192	TAA	2	6	87	92	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013192	ATT	2	6	185	190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013192	TTA	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013192	TTA	3	9	279	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013192	CAA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013192	ATT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013192	AGA	2	6	718	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
10	NC_013192	ATA	2	6	796	801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
11	NC_013192	ACA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257124815
12	NC_013192	GAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
13	NC_013192	ATA	2	6	897	902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
14	NC_013192	TTG	2	6	1039	1044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124815
15	NC_013192	AAT	2	6	1188	1193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
16	NC_013192	TAT	2	6	1209	1214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124815
17	NC_013192	GAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
18	NC_013192	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124815
19	NC_013192	GGA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124815
20	NC_013192	ATA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
21	NC_013192	ATG	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124815
22	NC_013192	GAC	2	6	1581	1586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124815
23	NC_013192	GTT	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124815
24	NC_013192	ATG	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124815
25	NC_013192	CGG	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257124815
26	NC_013192	AAG	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
27	NC_013192	TAT	3	9	2048	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013192	CAT	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013192	TGA	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013192	TTA	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013192	AAT	2	6	2211	2216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013192	ATT	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013192	TTG	2	6	2321	2326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013192	ATA	2	6	2351	2356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013192	ATA	2	6	2374	2379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013192	ATA	2	6	2474	2479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013192	TAA	2	6	2492	2497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013192	GAT	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013192	GAA	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124816
40	NC_013192	GTG	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257124816
41	NC_013192	ATG	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124816
42	NC_013192	TGT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124816
43	NC_013192	AGA	2	6	3058	3063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
44	NC_013192	TAA	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124817
45	NC_013192	TTA	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
46	NC_013192	AGA	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
47	NC_013192	AGA	2	6	3229	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
48	NC_013192	GGA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124817
49	NC_013192	CTG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257124817
50	NC_013192	TCT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124817
51	NC_013192	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
52	NC_013192	AAG	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
53	NC_013192	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
54	NC_013192	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
55	NC_013192	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
56	NC_013192	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124817
57	NC_013192	TAT	2	6	3596	3601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
58	NC_013192	TTA	2	6	3696	3701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
59	NC_013192	AAT	2	6	3725	3730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124817
60	NC_013192	GAA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
61	NC_013192	ATG	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
62	NC_013192	GAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
63	NC_013192	CTT	2	6	4106	4111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124817
64	NC_013192	TTA	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
65	NC_013192	CAA	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257124817
66	NC_013192	ATG	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
67	NC_013192	ATT	2	6	4407	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
68	NC_013192	GAA	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
69	NC_013192	ATG	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
70	NC_013192	GTT	2	6	4508	4513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124817
71	NC_013192	AGA	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
72	NC_013192	TTG	2	6	4620	4625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124817
73	NC_013192	GAA	2	6	4685	4690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013192	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124818
75	NC_013192	GAA	2	6	4786	4791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124818
76	NC_013192	AAG	2	6	4859	4864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124818
77	NC_013192	ATT	2	6	4943	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124818
78	NC_013192	AAG	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124818
79	NC_013192	ATT	2	6	5033	5038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124818
80	NC_013192	ATT	2	6	5066	5071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124818
81	NC_013192	GGA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124818
82	NC_013192	TTC	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124818
83	NC_013192	ATT	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124818
84	NC_013192	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124818
85	NC_013192	GAA	2	6	5396	5401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124818
86	NC_013192	TTC	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124818
87	NC_013192	TAA	2	6	5592	5597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124818
88	NC_013192	GAC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124818
89	NC_013192	TGA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124818
90	NC_013192	AAG	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124819
91	NC_013192	GTA	2	6	5977	5982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124819
92	NC_013192	ATG	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124819
93	NC_013192	ATT	2	6	5995	6000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124819
94	NC_013192	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124819
95	NC_013192	TAA	2	6	6503	6508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124819
96	NC_013192	CAG	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124819
97	NC_013192	TAT	2	6	6622	6627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124819
98	NC_013192	AAT	2	6	6873	6878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013192	ATT	2	6	6953	6958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013192	GAA	2	6	7047	7052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124820
101	NC_013192	TAA	2	6	7061	7066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124820
102	NC_013192	TAA	2	6	7110	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124820
103	NC_013192	AAT	2	6	7117	7122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124820
104	NC_013192	ACG	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124820
105	NC_013192	AAT	2	6	7243	7248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124820
106	NC_013192	AGG	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124820
107	NC_013192	AGA	2	6	7348	7353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124820
108	NC_013192	CAG	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124820
109	NC_013192	AAG	2	6	7612	7617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124820
110	NC_013192	TGC	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257124820
111	NC_013192	TGA	2	6	7751	7756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124820
112	NC_013192	TAA	2	6	7827	7832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124820
113	NC_013192	GTA	2	6	7841	7846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013192	GAA	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124821
115	NC_013192	TTA	2	6	7930	7935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124821
116	NC_013192	AAG	2	6	7937	7942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124821
117	NC_013192	GAA	2	6	8074	8079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124821
118	NC_013192	TAT	2	6	8269	8274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124821
119	NC_013192	ATG	2	6	8362	8367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124821
120	NC_013192	GGA	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124821
121	NC_013192	AGA	2	6	8535	8540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124821
122	NC_013192	ATT	2	6	8555	8560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124821
123	NC_013192	ATT	2	6	8737	8742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124821
124	NC_013192	AGA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124821
125	NC_013192	GAA	2	6	8982	8987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124822
126	NC_013192	TAA	2	6	9002	9007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124822
127	NC_013192	ATG	2	6	9013	9018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124822
128	NC_013192	TGT	2	6	9068	9073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124822
129	NC_013192	GAA	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124822
130	NC_013192	TAA	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124822
131	NC_013192	TTA	2	6	9223	9228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124822
132	NC_013192	TGA	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124822
133	NC_013192	TTA	2	6	9371	9376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124822
134	NC_013192	GAA	2	6	9480	9485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124822
135	NC_013192	ATG	2	6	9717	9722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124822
136	NC_013192	TAT	2	6	9768	9773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124822
137	NC_013192	TAA	2	6	9901	9906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013192	AAG	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013192	GTT	2	6	9967	9972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013192	TAA	2	6	9980	9985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013192	ATT	2	6	10169	10174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013192	TTA	2	6	10199	10204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013192	TAA	2	6	10215	10220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013192	TAT	2	6	10242	10247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013192	TAT	3	9	10261	10269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013192	TAA	2	6	10504	10509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013192	AAT	2	6	10511	10516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013192	ATT	2	6	10537	10542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013192	ATT	2	6	10583	10588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_013192	TAG	2	6	12467	12472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124823
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172	NC_013192	ATT	2	6	12631	12636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_013192	TTA	2	6	17538	17543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_013192	TAT	2	6	19049	19054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_013192	ATT	2	6	19170	19175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124830
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259	NC_013192	GAA	2	6	19727	19732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124830
260	NC_013192	ATA	2	6	19812	19817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124830
261	NC_013192	ATT	3	9	19880	19888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124830
262	NC_013192	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124830
263	NC_013192	TCA	2	6	20035	20040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124830
264	NC_013192	GAA	2	6	20176	20181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124830
265	NC_013192	ATA	2	6	20423	20428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124831
266	NC_013192	CAG	2	6	20482	20487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124831
267	NC_013192	CGG	2	6	20561	20566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257124831
268	NC_013192	AAT	2	6	20647	20652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124831
269	NC_013192	ATA	2	6	20809	20814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124831
270	NC_013192	GTC	2	6	20850	20855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257124831
271	NC_013192	ATC	2	6	21025	21030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124831
272	NC_013192	ATG	2	6	21352	21357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124831
273	NC_013192	TCC	2	6	21449	21454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257124831
274	NC_013192	AAT	2	6	21594	21599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124831
275	NC_013192	TGG	2	6	21674	21679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257124831
276	NC_013192	GAA	2	6	21717	21722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124831
277	NC_013192	GAC	2	6	21840	21845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_013192	TAT	2	6	21850	21855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013192	ATA	2	6	21906	21911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124832
280	NC_013192	TAC	2	6	21980	21985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124832
281	NC_013192	ATT	2	6	22005	22010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124832
282	NC_013192	AGA	2	6	22082	22087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124832
283	NC_013192	TAA	2	6	22094	22099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124832
284	NC_013192	ATT	2	6	22150	22155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124832
285	NC_013192	GGA	2	6	22185	22190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124832
286	NC_013192	TTA	2	6	22282	22287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124832
287	NC_013192	TAT	2	6	22320	22325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124832
288	NC_013192	AAT	2	6	22410	22415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124832
289	NC_013192	TTC	2	6	22448	22453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124832
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291	NC_013192	CTT	2	6	22510	22515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124832
292	NC_013192	ATT	2	6	22526	22531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124832
293	NC_013192	TAA	2	6	22532	22537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124832
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295	NC_013192	GAA	2	6	22596	22601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124832
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299	NC_013192	ATA	2	6	22818	22823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124832
300	NC_013192	AGA	2	6	22844	22849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124832
301	NC_013192	ATT	2	6	22971	22976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124832
302	NC_013192	TAA	2	6	23042	23047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124832
303	NC_013192	TAG	2	6	23056	23061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124832
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310	NC_013192	AAT	2	6	23384	23389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_013192	TCG	2	6	23440	23445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_013192	ATT	2	6	23492	23497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_013192	ATT	2	6	23499	23504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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317	NC_013192	CAA	2	6	23994	23999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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323	NC_013192	TAC	2	6	24341	24346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124834
324	NC_013192	ACT	2	6	24406	24411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124834
325	NC_013192	TGA	2	6	24416	24421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124834
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328	NC_013192	TGA	2	6	24632	24637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124834
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350	NC_013192	TAA	2	6	26643	26648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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353	NC_013192	TAT	2	6	26855	26860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_013192	TAA	2	6	29525	29530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124839
383	NC_013192	TAA	2	6	29560	29565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124839
384	NC_013192	AAT	2	6	29645	29650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124839
385	NC_013192	TTA	2	6	29685	29690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124839
386	NC_013192	CCA	2	6	29724	29729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257124839
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