MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 66194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013192	TTC	2	6	38889	38894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_013192	ATT	2	6	38899	38904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013192	AT	3	6	38927	38932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013192	ATC	2	6	38955	38960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_013192	TTA	2	6	38987	38992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_013192	TTC	2	6	38997	39002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_013192	AT	3	6	39099	39104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013192	T	8	8	39157	39164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013192	ATT	2	6	39169	39174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013192	T	6	6	39173	39178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013192	TAT	3	9	39185	39193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013192	T	6	6	39222	39227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013192	TTTC	2	8	39263	39270	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_013192	T	7	7	39279	39285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013192	TTA	3	9	39325	39333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013192	AT	3	6	39334	39339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013192	AT	3	6	39369	39374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013192	T	7	7	39378	39384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013192	T	8	8	39425	39432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013192	T	6	6	39490	39495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013192	ATC	2	6	39561	39566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013192	TTTTAT	2	12	39614	39625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013192	CAG	2	6	39626	39631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013192	ATT	2	6	39696	39701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013192	AAAT	2	8	39729	39736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013192	TCAAA	2	10	39749	39758	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_013192	TTG	2	6	39778	39783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013192	TAA	2	6	39789	39794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013192	CAGG	2	8	39832	39839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_013192	T	6	6	39856	39861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013192	CT	3	6	39867	39872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_013192	TCA	2	6	39925	39930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_013192	T	7	7	39932	39938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013192	ACT	2	6	39939	39944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_013192	GTC	2	6	40011	40016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013192	T	6	6	40024	40029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013192	TA	3	6	40056	40061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013192	GT	3	6	40067	40072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013192	A	6	6	40073	40078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013192	T	7	7	40086	40092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013192	T	6	6	40101	40106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013192	TTC	2	6	40116	40121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013192	T	7	7	40134	40140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013192	GTTCA	2	10	40194	40203	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_013192	T	7	7	40226	40232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013192	TTC	2	6	40236	40241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013192	CT	3	6	40267	40272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_013192	TCG	2	6	40279	40284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013192	TC	3	6	40321	40326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_013192	A	6	6	40412	40417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013192	AAGC	2	8	40428	40435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_013192	TAA	2	6	40473	40478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013192	ATT	2	6	40521	40526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013192	T	6	6	40525	40530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013192	TCT	2	6	40583	40588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013192	CTC	2	6	40614	40619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_013192	T	6	6	40641	40646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013192	ATAA	2	8	40683	40690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013192	ATC	2	6	40707	40712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013192	A	6	6	40728	40733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013192	T	6	6	40810	40815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013192	T	7	7	40935	40941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013192	A	6	6	40953	40958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013192	CATT	2	8	41020	41027	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_013192	T	6	6	41026	41031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013192	CTT	3	9	41099	41107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_013192	ATT	2	6	41136	41141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013192	ATTT	2	8	41147	41154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013192	TCT	2	6	41163	41168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_013192	TCT	2	6	41200	41205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_013192	TAAA	2	8	41234	41241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013192	T	6	6	41254	41259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013192	ATA	2	6	41275	41280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013192	A	8	8	41292	41299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013192	TATTT	2	10	41309	41318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013192	TAC	2	6	41355	41360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_013192	ATA	2	6	41361	41366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013192	TA	3	6	41402	41407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013192	T	6	6	41431	41436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013192	TCAAT	2	10	41438	41447	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_013192	TAA	3	9	41449	41457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013192	AAAAT	2	10	41492	41501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013192	TTCC	2	8	41544	41551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_013192	A	6	6	41571	41576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013192	T	8	8	41595	41602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013192	TA	3	6	41618	41623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013192	AACC	2	8	41639	41646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_013192	TAA	2	6	41660	41665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013192	TTA	2	6	41711	41716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124848
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1093	NC_013192	AAG	2	6	41790	41795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124848
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1099	NC_013192	A	8	8	41978	41985	100 %	0 %	0 %	0 %	257124848
1100	NC_013192	A	6	6	42013	42018	100 %	0 %	0 %	0 %	257124848
1101	NC_013192	AAT	2	6	42066	42071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013192	TGA	2	6	42078	42083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013192	TAC	2	6	42103	42108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_013192	GAA	2	6	42150	42155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013192	T	6	6	42254	42259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013192	GAA	2	6	42260	42265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013192	AG	3	6	42309	42314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013192	AGAA	2	8	42347	42354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013192	TAT	2	6	42393	42398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013192	TTC	2	6	42399	42404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013192	GAA	2	6	42454	42459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013192	A	6	6	42458	42463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013192	AGA	2	6	42496	42501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013192	TAA	2	6	42523	42528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013192	ATTTT	2	10	42631	42640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013192	TAA	2	6	42654	42659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013192	ATAA	2	8	42677	42684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013192	A	7	7	42683	42689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013192	AT	3	6	42713	42718	50 %	50 %	0 %	0 %	257124849
1120	NC_013192	AAAT	2	8	42721	42728	75 %	25 %	0 %	0 %	257124849
1121	NC_013192	CAG	2	6	42770	42775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124849
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1123	NC_013192	AT	4	8	42849	42856	50 %	50 %	0 %	0 %	257124849
1124	NC_013192	TCTT	2	8	42866	42873	0 %	75 %	0 %	25 %	257124849
1125	NC_013192	A	6	6	42907	42912	100 %	0 %	0 %	0 %	257124849
1126	NC_013192	ATT	2	6	42938	42943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124849
1127	NC_013192	TAA	2	6	42955	42960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124849
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1129	NC_013192	ATAAA	2	10	43030	43039	80 %	20 %	0 %	0 %	257124849
1130	NC_013192	TAT	2	6	43041	43046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124849
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1134	NC_013192	ACTTT	2	10	43126	43135	20 %	60 %	0 %	20 %	257124849
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